体外单核细胞转化为MDSC模型建立
验证S100A9和HMGB1是否能将健康供体来源的单核细胞转化为MDSC。
健康供体CD14+单核细胞与GM-CSF共培养,并用S100A9或HMGB1处理72小时,通过T细胞增殖抑制实验评估免疫抑制功能,通过流式细胞术检测MDSC标志物(PD-L1、ROS、IDO-1、CD86、HLA-DR)。
S100A9 and HMGB1 orchestrate MDSC-mediated immunosuppression in melanoma through TLR4 signaling
包含体外单核细胞处理、T细胞抑制实验、抑制剂干预、scRNA-seq、ELISA及临床样本分析等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
健康供体来源的CD14+单核细胞(体外诱导MDSC) 患者来源的M-MDSC 晚期黑色素瘤患者外周血样本
S100A9和HMGB1处理单核细胞的浓度(5 μg/mL)及处理时间(72小时) TLR4抑制剂resatorvid(5 μM)和RAGE抑制剂FPS-ZM1(30 nM)的预处理及浓度 T细胞增殖抑制实验中T细胞与单核细胞共培养的时间(96小时) 患者队列的样本量(n=42)、基线特征及ICI治疗信息 血浆S100A8/9水平的cut-off值(834.9 ng/mL)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证S100A9和HMGB1是否能将健康供体来源的单核细胞转化为MDSC。
健康供体CD14+单核细胞与GM-CSF共培养,并用S100A9或HMGB1处理72小时,通过T细胞增殖抑制实验评估免疫抑制功能,通过流式细胞术检测MDSC标志物(PD-L1、ROS、IDO-1、CD86、HLA-DR)。
确定TLR4和RAGE信号在单核细胞转化中的相对贡献。
在S100A9或HMGB1处理前,用TLR4抑制剂resatorvid(5 μM)或RAGE抑制剂FPS-ZM1(30 nM)预处理单核细胞1小时,随后检测T细胞抑制能力及下游信号分子的磷酸化水平。
验证TLR4信号对已生成MDSC免疫抑制功能的必要性。
使用GM-CSF和IL-6体外诱导MDSC(genMDSC),与T细胞共培养;在共培养体系中加入resatorvid或tasquinimod,检测对T细胞增殖的影响;并检测共培养上清中S100A8/9和HMGB1水平。
比较体外生成的MDSC与患者来源的M-MDSC对TLR4抑制的响应差异。
从黑色素瘤患者外周血中分选M-MDSC(CD33+HLA-DR−/low),与T细胞共培养,加入resatorvid检测对T细胞增殖的影响;同时检测M-MDSC与T细胞共培养上清中的S100A8/9和HMGB1水平。
比较黑色素瘤患者与健康供体循环单核细胞的转录差异,识别MDSC相关特征。
对2例未治疗黑色素瘤患者和2例健康供体的CD14+单核细胞进行scRNA-seq,分析差异表达基因、聚类和通路富集,并用流式验证HLA-DR表达。
评估血浆S100A8/9和HMGB1水平与黑色素瘤患者临床结局的关系。
通过ELISA检测患者血浆中S100A8/9和HMGB1水平,并分析与M-MDSC PD-L1表达、ICI治疗反应和PFS的相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞分离 | Pancoll分离液 | PanBiotech | -- |
| 磁性细胞分选 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 单核细胞处理 | 瑞沙托维(TAK-242) | Sigma Aldrich | 243984-11-4 |
| FPS-ZM1 | Sigma Aldrich | 553030 | |
| 重组HMGB1 | Abcam | ab167718 | |
| 重组S100A9 | Abcam | ab287938 | |
| 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | Miltenyi Biotec | 130-093-865 | |
| MDSC生成 | 白细胞介素-6 | Miltenyi Biotec | 130-093-931 |
| 流式细胞术 | Fc受体阻断剂 | Miltenyi Biotec | -- |
| 可固定活力染料700 | BD Biosciences | 564997 | |
| 抗人CD14-FITC抗体 | BD Biosciences | 347493 | |
| PD-L1-BV421抗体 | BD Biosciences | 563738 | |
| 同型对照IgG1 BV421 | BD Biosciences | 659453 | |
| HLA-DR-V500抗体 | BD Biosciences | -- | |
| CD33-PE抗体 | BD Biosciences | 555450 | |
| CD66b-PerCPCy5.5抗体 | BD Biosciences | 5562254 | |
| 谱系混合物(CD3、CD19、CD20、CD56)-APC | BD Biosciences | 363601 | |
| CD80-PE-Cy7抗体 | BD Biosciences | 561135 | |
| CD86-APC抗体 | BD Biosciences | 560956 | |
| TLR4-PE抗体 | BD Biosciences | 564215 | |
| IgG1-PE同型对照 | BD Biosciences | 554680 | |
| RAGE-PE抗体 | Abcam | ab237363 | |
| IgG-PE同型对照 | Abcam | ab209478 | |
| CellROX深红试剂 | Thermo Fisher | C10422 | |
| Phosflow固定缓冲液I | BD Biosciences | 557870 | |
| Phosflow透化缓冲液III | BD Biosciences | 558050 | |
| 抗人p38 MAPK (pT180/pY182)-PE抗体 | BD Biosciences | 562065 | |
| NFκB (pS529)-PE抗体 | BD Biosciences | 558423 | |
| STAT3 (Py705)-PE抗体 | BD Biosciences | 562072 | |
| BD FACSLyric流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| FACSuite软件 | BD Biosciences | -- | |
| FlowJo V.10软件 | BD Biosciences | -- | |
| FACS分选 | BD FACSAria IIU细胞分选仪 | BD Biosciences | -- |
| T细胞抑制实验 | 细胞增殖染料eFluor 450 | eBioscience | 65-0842-85 |
| 用于SILAC的RPMI培养基 | Thermo Fisher | 88365 | |
| L-精氨酸 | Sigma Aldrich | A5006 | |
| L-赖氨酸盐酸盐 | Sigma Aldrich | L5626 | |
| 热灭活胎牛血清 | Thermo Fisher | 16140071 | |
| 青霉素/链霉素 | Sigma Aldrich | 15140122 | |
| 抗CD3抗体(克隆OKT-3) | eBioscience | 16-0037-85 | |
| 抗CD28抗体(克隆CD28.2) | Beckman Coulter | IM1376 | |
| 他喹莫德 | MedChemExpress | HY-10528 | |
| ELISA | S100A8/9 ELISA试剂盒 | R&D Systems | DS8900 |
| HMGB1 ELISA试剂盒 | Novus Biologicals | NBP2-62766 | |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | Sigma Aldrich | 20-199 |
| 蛋白酶抑制剂 | Promega | G6521 | |
| Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 | |
| 抗IDO抗体 | Cell Signaling Technology | D5J4E | |
| 抗pSTAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 4113S | |
| 抗STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9139S | |
| 抗p-p38抗体 | Cell Signaling Technology | 8690S | |
| 抗p38抗体 | Cell Signaling Technology | 4511S | |
| 抗p-p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3033S | |
| 抗p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242S | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 2118S | |
| SuperSignal West Pico PLUS化学发光底物 | Thermo Fisher | 34580 | |
| FUSION-SL-Advance化学发光成像仪 | PEQLAB Biotechnologie | -- | |
| ImageJ软件 | NIH | -- | |
| 微阵列分析 | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | -- |
| Tecan Infinite M200酶标仪 | Tecan | -- | |
| Affymetrix Clariom S人全转录组表达芯片 | Thermo Fisher | -- | |
| scRNA-seq | 10x Genomics Chromium单细胞3'文库 | 10x Genomics | -- |
| Chromium单细胞3'文库、凝胶珠和多重试剂盒及芯片试剂盒(V.3.1) | 10x Genomics | -- | |
| NextSeq 550测序仪 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 单核细胞分离和处理 | CD14+单核细胞分离方法(MACS),处理条件(S100A9或HMGB1 5 μg/mL,GM-CSF 40 ng/mL,72小时),抑制剂预处理(resatorvid 5 μM,FPS-ZM1 30 nM,1小时) 阅读提示:Methods部分:Isolation and treatment of CD14+ monocytes |
| T细胞抑制实验 | T细胞增殖染料eFluor 450浓度(10 μM),共培养时间(96小时),抗CD3和抗CD28抗体浓度(1 μg/mL和2 μg/mL),培养基成分(RPMI for SILAC补充L-Arg、L-Lys、FBS、双抗) 阅读提示:Methods部分:T-cell suppression assay |
| 体外MDSC生成 | GM-CSF(50 ng/mL)和IL-6(50 ng/mL)处理时间(96小时),处理细胞类型(健康供体CD14+单核细胞) 阅读提示:Methods部分:Isolation and treatment of CD14+ monocytes |
| 患者M-MDSC分离 | 患者样本纳入标准(III-IV期,未治疗至少3个月),M-MDSC分选标志物(CD33+HLA-DR−),FACS分选方法 阅读提示:Methods部分:Flow cytometry 和 Human sample collection |
| scRNA-seq | 样本量(2例患者,2例健康供体),细胞数量(10^3 cells/mL),文库构建方法(10x Genomics),测序平台(NextSeq 550) 阅读提示:Methods部分:Single-cell RNA sequencing 和 Reads processing and quality control |
| 血浆生物标志物分析 | 患者血浆样本量(n=40),ELISA试剂盒(R&D Systems和Novus Biologicals),cut-off值(S100A8/9 834.9 ng/mL),ICI治疗反应评估标准 阅读提示:Methods部分:Plasma S100A8/9 and HMGB1 determination 和 Human sample collection |