评估cGAS在囊肿肾组织中的表达
确定cGAS是否在ADPKD囊肿肾中上调,并观察其表达与DNA损伤标志物的关系。
在Pkd1条件敲除小鼠(P35)和人类ADPKD肾标本中,通过RT-qPCR、Western blot和免疫荧光检测cGAS、STING和磷酸化STING表达,同时检测8-OHdG和p-γH2AX。
cGAS Activation Accelerates the Progression of Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease
包含体外细胞模型、条件性基因敲除小鼠模型及患者样本等多个证据层级,并使用药理学抑制、基因敲低/敲除和回补实验进行功能与机制验证。
永生化小鼠集合管细胞系(WT和Pkd1KO) 条件性Pkd1敲除小鼠模型(Pkd1fl/fl;Pax8rtTA;TetOCre) cGas基因敲除小鼠模型(cGas−/−) 人类ADPKD肾标本
Pkd1缺失引起的cGAS表达上调及核转位是否在人和小鼠模型中一致 cGAS抑制剂RU.521(10 μM)处理18小时能否有效抑制炎症因子表达 MitoQ(100 nM)处理3天能否逆转基因毒性应激和cGAS激活 cGas基因敲除能否改善Pkd1缺失小鼠的囊肿表型和肾功能 PC1-CTT回补能否恢复线粒体稳态并降低炎症反应
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定cGAS是否在ADPKD囊肿肾中上调,并观察其表达与DNA损伤标志物的关系。
在Pkd1条件敲除小鼠(P35)和人类ADPKD肾标本中,通过RT-qPCR、Western blot和免疫荧光检测cGAS、STING和磷酸化STING表达,同时检测8-OHdG和p-γH2AX。
在无体内复杂环境下,确认Pkd1缺失直接影响cGAS的表达、核转位及下游信号。
利用永生化小鼠集合管细胞WT和Pkd1KO,通过Western blot检测cGAS、STING和p-STING;免疫荧光观察cGAS核转位;核质分离实验验证亚细胞定位;并检测DNA损伤标志物。
证明cGAS是Pkd1缺失诱导炎症因子的关键介导者。
在WT和Pkd1KO细胞中使用cGAS特异性抑制剂RU.521(10 μM处理18小时)和shRNA敲低cGAS,检测NF-κB和IFN通路报告基因活性及炎症因子(TNFα、IL1β、CCL2、Mx1、IFNβ、IL6)mRNA表达。
探究Pkd1缺失导致的微核和mtDNA释放是否作为cGAS的激活配体。
使用IPTG诱导型shPkd1载体敲低Pkd1,观察微核形成;检测线粒体转录因子TFAM和PGC1α表达及总mtDNA水平;分离胞质DNA,定量mt-Rnr2和mt-CytoB。
明确线粒体ROS和PC1-CTT对cGAS激活和炎症的可逆性。
用MitoQ(100 nM处理3天)处理细胞,检测DNA损伤标志物、微核、cGAS核转位及炎症因子;通过慢病毒表达PC1-CTT-2×HA,观察其对相同表型的逆转。
评估cGAS基因失活是否能减缓ADPKD疾病进展。
将Pkd1条件敲除小鼠与cGas−/−小鼠杂交,获得双敲除小鼠,按相同方案诱导Pkd1缺失至P35,通过组织病理学(PAS染色)、肾重/体重比、囊性指数和血尿素氮(BUN)评估,同时检测炎症因子表达及巨噬细胞和纤维化标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 多西环素补充饮食 | Envigo | TD.08541 |
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Thermo Fisher | 11330-032 |
| 胎牛血清 | CPS Serum | FBS-500HI | |
| L-谷氨酰胺 | Thermo Fisher | 25030-081 | |
| 细胞处理 | RU.521 | Selleckchem | S6841 |
| 线粒体醌 | Selleckchem | S8978 | |
| 异丙基β-D-1-硫代半乳糖苷 | Thermo Fisher | R0391 | |
| 转染 | Amaxa核转染仪 | Lonza | -- |
| 聚乙烯亚胺 | Polysciences | -- | |
| pPAX2(包装质粒) | Addgene | -- | |
| pMD.G2(包膜质粒) | Addgene | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| Bis-Tris凝胶 | -- | -- | |
| 聚偏二氟乙烯膜 | -- | -- | |
| 抗cGAS抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-515777 | |
| 抗PC1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-130554 | |
| β-肌动蛋白-HRP抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-47778 | |
| 抗组蛋白H3抗体 | Abcam | ab1791 | |
| 抗cofilin抗体 | Cell Signaling | 5175 | |
| 抗HA抗体 | Cell Signaling | 3724 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling | 2118 | |
| 抗STING抗体 | Proteintech | 19851-1-AP | |
| 抗PGC1α抗体 | Proteintech | 66369-1-Ig | |
| 抗磷酸化STING(ser366)抗体 | Thermo Fisher | PA5-105674 | |
| 抗TFAM抗体 | Thermo Fisher | PA5-80107 | |
| Supersignal West Femto底物 | Thermo Fisher | 34096 | |
| 组织染色 | 抗原修复液 | Vector Laboratories | H3300 |
| BLOXALL封闭液 | Vector Laboratories | SP-6000 | |
| 抗F4/80抗体 | Proteintech | 28463-1-AP | |
| 抗p-γH2AX抗体 | Abcam | ab81299 | |
| 抗8-OHdG抗体 | Abcam | ab48508 | |
| 抗α-SMA抗体 | Abcam | ab5694 | |
| DAPI | -- | -- | |
| Fluoromount-G封片剂 | Southern Biotech | 0100-01 | |
| 免疫组化 | Vectastain Elite ABC试剂盒 | Vector Laboratories | PK-6101 |
| ImmPACT DAB底物 | Vector Laboratories | SK-4105 | |
| 基因表达分析 | Trizol试剂 | Thermo Fisher | -- |
| Direct-Zol RNA小提试剂盒 | Zymo Research | R2070 | |
| NanoDrop One分光光度计 | Thermo Fisher | -- | |
| RNA至cDNA EcoDry预混液 | Takara | 639549 | |
| 2x SYBR Green qPCR预混液 | Bimake | B21703 | |
| QuantStudio5实时荧光定量PCR系统 | Thermo Fisher | -- | |
| 细胞免疫荧光 | 抗TOMM20抗体 | Thermo Fisher | PA5-52843 |
| 显微成像 | Zeiss Z2M显微镜 | Zeiss | -- |
| LSM880 Airyscan共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| LI-COR成像系统 | LI-COR Biotechnology | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | Pkd1条件敲除小鼠的诱导时间(P10开始,多西环素饮食至P35),以及cGas−/−小鼠的遗传背景(B6(C)-Cgastm1d(EUCOMM)Hmgu/J)。 阅读提示:Methods: Animals and Chemical Reagents;Figure 7 legend |
| 细胞培养 | WT和Pkd1KO细胞系的构建(mTert永生化,Cre介导Pkd1敲除),培养基成分(DMEM/F12含5% FBS和2 mM L-谷氨酰胺)。 阅读提示:Methods: Cell Cultures and Plasmids |
| 药物处理 | RU.521浓度(10 μM)和处理时间(18小时);MitoQ浓度(100 nM)和处理时间(3天);IPTG浓度(1 mM)和诱导时间(3-5天)。 阅读提示:Methods: Animals and Chemical Reagents;Figure 3, 4, 5 legends |
| 基因操作 | shRNA靶向序列(cGas、Pkd1、Luciferase),载体(VIRHD/P、VISP、VEAVY),以及筛选标记(嘌呤霉素、潮霉素)。 阅读提示:Methods: Cell Cultures and Plasmids;Supplemental Table 1 |
| 分子检测 | RT-qPCR内参基因(Rps11),Western blot抗体列表和稀释度(见Methods),以及DNA损伤标志物(8-OHdG, p-γH2AX)检测条件。 阅读提示:Methods: Gene Expression Analysis;Western Blots and Antibodies |
| 胞质DNA定量 | 细胞裂解液成分(0.02% saponin),离心速度和温度,以及扩增的线粒体基因(mt-Rnr2, mt-CytoB)和内参(β2-microglobulin)。 阅读提示:Methods: Analysis of Cytosolic DNA and Total mtDNA |