确定P-选择素与衰老样细胞及纤维化的关联
验证P-选择素是否标记纤维化组织中的衰老样细胞。
对人肝、肺纤维化组织芯片及小鼠CCl4、博来霉素纤维化模型进行IHC、mIF和SA-β-gal检测,分析P-选择素与p21、Ki67、LaminB1、α-SMA的关系。
Senescence-directed nanotherapy ameliorates fibrosis and overcomes immune exclusion in cancer.
含人肝肺纤维化及肿瘤组织芯片、小鼠CCl4/博来霉素纤维化模型、scRNA-seq、离体分选细胞杀伤实验及纤维化肿瘤ICB联合治疗模型,具备功能与机制验证。
人肝、肺纤维化及HCC/LUAD组织芯片与患者样本 CCl4诱导小鼠肝纤维化及博来霉素诱导小鼠肺纤维化模型 纤维化肝/肺癌小鼠模型(MPS、KPS细胞) 分选的小鼠及人P+sen+巨噬细胞与内皮细胞
SMNP静脉给药剂量:Navitoclax 15 mg/kg、dBET6 25 mg/kg、Paclitaxel 20 mg/kg,每周一次 纤维化诱导:CCl4 1 ml/kg 每周两次共12次;博来霉素1.5 U/kg气管内给药 ICB方案:肝肿瘤anti-PD-L1 5 mg/kg联合anti-VEGF-A 50 μg/小鼠;肺肿瘤anti-PD-L1 5 mg/kg联合顺铂3 mg/kg P+sen+定义:P-选择素阳性联合SPiDER/C12RG SA-β-gal活性,巨噬细胞为CD45+F4/80+(肝)或CD45+CD64+(肺) 离体SMNP处理浓度1:200、30分钟,检测终点为IncuCyte细胞死亡或BRD4免疫荧光
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证P-选择素是否标记纤维化组织中的衰老样细胞。
对人肝、肺纤维化组织芯片及小鼠CCl4、博来霉素纤维化模型进行IHC、mIF和SA-β-gal检测,分析P-选择素与p21、Ki67、LaminB1、α-SMA的关系。
确认SMNPs能否选择性递送至纤维化器官中的衰老样细胞。
通过纳米沉淀法合成包载Navitoclax、dBET6或Paclitaxel的岩藻聚糖纳米颗粒及 dextran 对照颗粒,表征粒径、电荷、稳定性和载药,并进行体内分布及细胞富集分析。
验证SMNPs是否在保留抗纤维化疗效的同时降低系统毒性。
在已建立的小鼠肝、肺纤维化模型中给予SMNPs、对照纳米颗粒、游离药物或游离岩藻聚糖,检测衰老细胞、胶原沉积、α-SMA、门静脉血流、ALT/AST、血常规、体重和生存。
明确SMNPs在体内的功能性靶细胞及选择性基础。
对纤维化肝肺组织进行FACS分选P-选择素/SPiDER四象限细胞并行scRNA-seq,离体处理分选巨噬细胞和内皮细胞,检测细胞死亡、BRD4降解、摄取和亚细胞定位。
验证SMNP介导的微环境重塑能否逆转纤维化相关免疫排斥和ICB耐药。
在CCl4或博来霉素诱导的纤维化小鼠中分别原位移植MPS肝癌或静脉接种KPS肺癌细胞,给予FiNav或对照纳米颗粒联合一线ICB方案,监测肿瘤体积、生存和免疫标志物。
确认MΦP+sen+群体在人类肿瘤中的保守性及其与免疫治疗应答的关系。
将人源化MΦP+sen+签名映射至公开HCC和NSCLC scRNA-seq数据,对HCC、LUAD组织芯片及NSCLC活检进行mIF,分选人NSCLC细胞离体给予FiNav。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 纳米颗粒合成 | 岩藻聚糖 | Sigma-Aldrich | F8190 |
| 硫酸葡聚糖 | Sigma-Aldrich | D8906 | |
| 吲哚菁绿 | Thermo Scientific | 412541000 | |
| 碳酸氢钠缓冲液 | Fisher | S233 | |
| 0.9%生理盐水 | Sigma-Aldrich | S8776 | |
| 纳米颗粒表征 | Zetasizer Nano ZS粒径分析仪 | Malvern | -- |
| Nanowizard V原子力显微镜 | JPK-Bruker | -- | |
| Acquity C18色谱柱 | Waters Corporation | -- | |
| HPLC C18分析柱 | Agilent Technologies | -- | |
| RNA提取与qPCR | RNeasy迷你试剂盒 | Qiagen | -- |
| TaqMan逆转录试剂 | Applied Biosystems | -- | |
| SYBR green PCR预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| ViiA 7实时PCR系统 | Invitrogen | -- | |
| 组织固定与包埋 | 10%福尔马林 | Epredia | 5705 |
| Tissue Plus O.C.T.包埋剂 | Fisher HealthCare | 4585 | |
| 免疫荧光与组化 | 柠檬酸基抗原修复液 | Vector Laboratories | H-3300 |
| Tris基抗原修复液 | Vector Laboratories | H-3301 | |
| ImmEdge疏水屏障笔 | Vector Laboratories | H-4000 | |
| ProLong Gold抗淬灭封片剂 | Invitrogen | P36930 | |
| 天狼星红染色 | 天狼星红/固绿胶原染色试剂盒 | Chondrex | 9046 |
| SA-β-gal检测 | X-gal | Invitrogen | 15520018 |
| ImaGene Red C12RG lacZ基因表达试剂盒 | Invitrogen | I2906 | |
| SPiDER-βgal试剂盒 | Dojindo | SG04 | |
| Fluoromount-G封片剂 | SouthernBiotech | 0100-01 | |
| 流式分析 | LIVE/DEAD近红外可固定死细胞染色试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | L34994 |
| LIVE/DEAD Aqua可固定死细胞染料 | Thermo Fisher Scientific | L34957 | |
| 抗小鼠Fc抗体 | BD Biosciences | 553142 | |
| Cytek Aurora光谱分析仪 | Cytek | -- | |
| 组织解离 | 链霉蛋白酶 | Sigma | P5147 |
| 胶原酶D | Roche | 11088874103 | |
| DNA酶I | Roche | 10104159001 | |
| Nycodenz密度分离液 | -- | -- | |
| 中性蛋白酶 | Corning | 354235 | |
| IV型胶原酶 | Thermo Fisher Scientific | 17104019 | |
| DNA酶I | StemCell Technologies | 07900 | |
| ACK裂红缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | A1049201 | |
| 离体纳米颗粒处理 | DMEM培养基 | Gibco | 11995-065 |
| 离体细胞死亡检测 | 碘化丙啶 | Thermo Fisher Scientific | P1304MP |
| BRD4免疫荧光 | 抗BRD4抗体 | Abcam | ab128874 |
| Alexa Fluor 647标记抗兔二抗 | Invitrogen | A32795 | |
| scRNA-seq建库 | Chromium GEM-X单细胞3'试剂盒v4 | 10x Genomics | 1000691 |
| 体内免疫治疗 | 抗PD-L1抗体 | BioXCell | BE0101 |
| 抗VEGF-A抗体 | BioXCell | BE0399 | |
| 顺铂 | Selleck Chemicals | S1166 | |
| 免疫细胞清除 | 抗CD4抗体 | BioXCell | BE0003-1 |
| 抗CD8抗体 | BioXCell | BE0061 | |
| 抗NK1.1抗体 | BioXCell | BE0036 | |
| 大鼠IgG同型对照抗体 | BioXCell | BE0090 | |
| 血液分析 | Element HT5血液分析仪 | Heska | -- |
| 细胞因子检测 | Proteome Profiler小鼠XL细胞因子阵列 | R&D Systems | ARY022B |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人纤维化组织与肿瘤组织分析 | 组织芯片来源与分组:肝健康21、纤维化/肝硬化30;肺健康21、纤维化28;HCC 16例、LUAD 48例;NSCLC新辅助治疗队列19例 阅读提示:Methods的Patient samples及Fig. 1、Fig. 6图注 |
| 小鼠肝、肺纤维化模型建立 | CCl4 1 ml/kg腹腔注射每周两次共12次;博来霉素1.5 U/kg气管内给药;模型建立时间点分别为6周和7天 阅读提示:Methods的In vivo induction of mouse liver and lung fibrosis models及Fig. 2A-B图注 |
| SMNP体内给药 | FiNav 15 mg/kg、FidBET6 25 mg/kg、FiPax 20 mg/kg静脉给药,肝纤维化每周一次共4周,肺纤维化每周一次共3周 阅读提示:Methods的In vivo induction of mouse liver and lung fibrosis models |
| 纤维化肿瘤模型及ICB联合治疗 | MPS 2.5×10^5细胞原位移植、KPS 1.5×10^5细胞静脉注射;anti-PD-L1 5 mg/kg、anti-VEGF-A 50 μg/小鼠、顺铂3 mg/kg;免疫清除抗体剂量200–250 μg/小鼠 阅读提示:Methods的Fibrotic liver cancer model and treatment、Fibrotic lung cancer model and treatment及Fig. 5A-B图注 |
| 离体SMNP处理与分选 | 四象限分选策略(P+sen+、P+sen-、P-sen+、P-sen-);SMNP 1:200处理30分钟;Navitoclax组检测细胞死亡终点18小时,dBET6组检测BRD4降解 阅读提示:Methods的Nanoparticle Ex Vivo Assays及Fig. 3I-L图注 |
| scRNA-seq样本与分组 | 小鼠纤维化肝肺FACS分选四群细胞;人HCC n=79、NSCLC n=12公开数据集;小鼠数据已存GEO GSE319261 阅读提示:Methods的Single Cell RNA-sequencing部分及Data availability |