MOB1/NDR2复合物晶体结构解析
在原子水平上阐明MOB1与NDR2的相互作用模式,并与MOB1/LATS1结构比较以鉴定差异结合的关键残基。
纯化人MOB1A(33–216)和NDR2 NTR(25–88),组装复合物,经凝胶过滤纯化后结晶,收集X射线衍射数据并解析结构至2.1 Å;进行结构比较和序列保守性分析。
Stable MOB1 interaction with Hippo/MST is not essential for development and tissue growth control.
研究包含晶体结构解析、ITC生化结合、人癌细胞功能实验和果蝇体内遗传验证等多个独立证据层级。
人乳腺癌MCF-7细胞稳定表达MOB1变体 人HEK293细胞瞬时共表达MOB1与Hippo核心激酶 果蝇mats突变体及成虫盘克隆 果蝇S2R+细胞
MOB1变体D63V丧失与LATS1/2及Wts结合,但保留与NDR1/2、Trc、MST1/2和Hpo结合 MOB1变体K104E/K105E丧失与MST1/2及Hpo结合,但保留与LATS1/2、Wts、NDR1/2和Trc结合 MOB1与LATS1结合依赖于MST1/2对MOB1的磷酸化,MOB1/NDR2结合可被磷酸化增强 果蝇mats突变体拯救实验:MOB1(wt)和MOB1(K104E/K105E)可拯救幼虫致死,MOB1(D63V)和MOB1(D63V/K104E/K105E)不能 软琼脂锚定非依赖生长实验:MOB1(wt)和MOB1(K104E/K105E)抑制生长,MOB1(D63V)和MOB1(D63V/K104E/K105E)不抑制
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在原子水平上阐明MOB1与NDR2的相互作用模式,并与MOB1/LATS1结构比较以鉴定差异结合的关键残基。
纯化人MOB1A(33–216)和NDR2 NTR(25–88),组装复合物,经凝胶过滤纯化后结晶,收集X射线衍射数据并解析结构至2.1 Å;进行结构比较和序列保守性分析。
定量比较MOB1与NDR1/2、LATS1/2的NTR结构域的结合亲和力,并验证关键残基对差异结合的贡献。
用等温滴定量热法(ITC)测定非磷酸化及MST2磷酸化全长MOB1与NDR1、NDR2、LATS1、LATS2 NTR及其突变体的解离常数(Kd);用凝胶过滤色谱分析全长MOB1变体与NDR2、LATS1、MST2的复合物形成。
获得仅丧失与特定Hippo核心激酶结合的MOB1变体,以便在细胞和体内研究中解析各相互作用的功能。
在人HEK293细胞和果蝇S2R+细胞中共表达myc标记的MOB1变体与HA标记的激酶,进行低严谨性条件共免疫沉淀和免疫印迹;并用凝胶过滤和ITC验证全长MOB1变体的结合特性;检测MOB1变体的Thr12/Thr35磷酸化。
确定MOB1与不同Hippo核心激酶的相互作用对肿瘤抑制相关细胞功能(增殖、集落形成、锚定非依赖生长)的必要性。
构建稳定表达HA-MOB1(wt)、HA-MOB1(D63V)、HA-MOB1(K104E/K105E)、HA-MOB1(D63V/K104E/K105E)或空载体的MCF-7细胞池,进行二维增殖(IncuCyte)、集落形成和软琼脂锚定非依赖生长实验;在HCT116细胞中瞬时表达变体并进行增殖和集落形成实验。
在复杂多细胞生物体中验证MOB1与Hpo/Wts/Trc的相互作用对发育、组织生长控制和Yki活性调控的体内重要性。
利用PhiC31介导的定点整合生成在ubi-63E启动子下表达myc-MOB1变体的转基因果蝇,在mats突变背景下检测幼虫致死拯救、成虫眼过度生长拯救(eyFLP/FRT系统)以及wing imaginal disc中mats克隆的Ex表达(hsFLP/FRT系统)。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白纯化 | pET28a载体 | Novagen | -- |
| BL21(DE3)感受态细胞 | New England BioLabs | -- | |
| Ni2+-NTA亲和层析 | Qiagen | -- | |
| HiLoad 16/60 Superdex 200凝胶过滤柱 | GE Healthcare | -- | |
| 异丙基-β-D-硫代半乳糖苷 | -- | -- | |
| 二硫苏糖醇 | -- | -- | |
| 结晶 | 聚乙二醇3350 | -- | -- |
| HEPES | -- | -- | |
| X射线衍射 | ADSC Quantum 315r CCD面探测器 | ADSC | -- |
| ITC | ITC200系统 | MicroCal | -- |
| 免疫印迹 | Immobilon-P膜 | Millipore | -- |
| 抗HA抗体12CA5 | -- | -- | |
| 抗myc抗体9E10 | -- | -- | |
| 抗α-微管蛋白抗体YL1/2 | -- | -- | |
| 抗GAPDH抗体 | GeneTex | GTX100118 | |
| 抗HA抗体 | Cell Signaling | C29F4 | |
| 抗HA抗体 | Roche | 3F10 | |
| 抗myc抗体 | Cell Signaling | 71D10 | |
| 抗MST1抗体 | Cell Signaling | 3682 | |
| 抗MST2抗体 | Cell Signaling | 3952 | |
| 抗磷酸化Thr12抗体 | Cell Signaling | 8843 | |
| 抗磷酸化Thr35抗体 | Cell Signaling | 8699 | |
| 抗肌动蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-1616 | |
| 抗GAPDH抗体 | Millipore | Mab374 | |
| 抗麦芽糖结合蛋白抗体 | New England BioLabs | E8032 | |
| 抗GST抗体 | Abcam | ab6613 | |
| HRP标记二抗 | GE Healthcare | NA931 | |
| HRP标记二抗 | GE Healthcare | NA934 | |
| HRP标记二抗 | GE Healthcare | NA935 | |
| HRP标记二抗 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2020 | |
| 免疫荧光 | 兔抗Expanded抗体 | -- | -- |
| 鼠抗β-半乳糖苷酶抗体 | Promega | Z3781 | |
| 罗丹明红X标记抗兔抗体 | Jackson ImmunoResearch | -- | |
| FITC标记抗鼠抗体 | Jackson ImmunoResearch | -- | |
| 激酶实验 | pMal-c2载体 | New England BioLabs | -- |
| 淀粉糖树脂 | New England BioLabs | E8021 | |
| GST-MST1重组蛋白 | Sigma | M9697 | |
| GST-MST2重组蛋白 | Sigma | S6573 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Sigma | D6429 |
| 胎牛血清 | Sigma | F7524 | |
| Schneider果蝇培养基 | Invitrogen | 217200024 | |
| 热灭活胎牛血清 | Invitrogen | 10082147 | |
| 转染 | Fugene 6转染试剂 | Promega | E2692 |
| nucleofector试剂盒V | Lonza | VCA-1003 | |
| Effectene转染试剂 | Qiagen | 301425 | |
| Lipofectamine 2000 | Invitrogen | 11668 | |
| 细胞培养 | 聚凝胺 | -- | -- |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 软琼脂实验 | 琼脂糖 | Thermo Fisher Scientific | 16520050 |
| 噻唑蓝四氮唑蓝 | Sigma | -- | |
| 果蝇遗传学 | pKC26w-pUbiq载体 | -- | -- |
| pENTR-3C质粒 | Invitrogen | -- | |
| pLEX目的载体 | Invitrogen | -- | |
| pCMV-R-neo质粒 | -- | -- | |
| pAW载体 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | Vectashield封片剂 | Vector Labs | -- |
| DAPI | -- | -- | |
| Western blot | Laemmli上样缓冲液 | Bio-Rad | 1610737 |
| PCR基因分型 | 基因组DNA提取试剂盒 | Qiagen | 69506 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| MOB1/NDR2晶体结构解析 | 蛋白构建体边界(MOB1A 33–216,NDR2 25–88)、结晶条件(17% PEG 3350、0.1 M HEPES pH 7.5、150 mM MgCl2、14°C)、衍射数据分辨率2.10 Å 阅读提示:Methods 'Protein purification for structural and biochemical analyses' 和 'Crystallization and data collection' 小节;Table 1 |
| ITC结合亲和力测定 | MOB1浓度约240 μM、NTR蛋白浓度约24 μM、缓冲液组成(25 mM HEPES pH 7.5、200 mM NaCl、1 mM EDTA)、温度25°C、注射次数20次每次2 μl 阅读提示:Methods 'Isothermal titration calorimetry assays' 小节;Fig. 2c–f;Supplementary Fig. 3 |
| MOB1变体共免疫沉淀 | 细胞系(HEK293、S2R+)、转染试剂、低严谨性缓冲液组成、抗体(anti-HA 12CA5、anti-myc 9E10)、MOB1变体列表 阅读提示:Methods 'Antibodies for immunoblotting and immunoprecipitations' 和 'Cell culture and transient transfections' 小节;Supplementary Figs. 5–9 |
| MCF-7稳定细胞池功能实验 | 慢病毒包装质粒用量(pMD.G 2.4 μg、p8.91 0.8 μg、pLEX 4.8 μg)、选择抗生素浓度(嘌呤霉素2.5 μg/ml,维持0.6 μg/ml)、增殖实验细胞密度(5×10^4/孔)、集落形成细胞数(1,000/孔)、软琼脂细胞数(1×10^4/孔)及琼脂糖浓度(0.6%和1%) 阅读提示:Methods 'Generation of stable cell line pools'、'Proliferation and colony formation assays' 和 'Soft agar assays for anchorage-independent growth' 小节;Fig. 4 |
| 果蝇体内拯救实验 | mats无效等位基因(matsroo/matse235)、转基因整合位点(89E11)、启动子(ubi-63E)、热激条件(37°C 1小时,产卵后3天)、果蝇培养温度25°C 阅读提示:Methods 'Drosophila melanogaster genetics' 小节;Supplementary Fig. 16;Fig. 5和Fig. 6的图注及基因型列表 |