构建肝脏特异性GCN5L1敲除小鼠并验证敲除效率
验证GCN5L1在肝脏中的特异性缺失及其对线粒体蛋白乙酰化的影响。
将GCN5L1 flox/flox小鼠与albumin-Cre小鼠杂交获得LKO小鼠;免疫印迹检测心、脑、肾、肝组织及肝脏线粒体组分中GCN5L1表达;检测线粒体和胞质蛋白乙酰化水平。
GCN5L1 modulates cross-talk between mitochondria and cell signaling to regulate FoxO1 stability and gluconeogenesis.
包含肝脏特异性敲除小鼠在体实验、原代肝细胞体外功能验证、分子机制验证(蛋白酶体降解、ERK磷酸化、ROS测量)
GCN5L1肝脏特异性敲除小鼠(LKO) 原代小鼠肝细胞 HeLa细胞
GCN5L1 LKO小鼠:8-10周龄雄性,正常饲料,禁食6或16小时测血糖(n=7) 原代肝细胞:100 nM胰高血糖素处理6小时,检测PEPCK和G6Pase蛋白 原代肝细胞:10 μM U0126或SB203580处理8小时,检测FoxO1、G6Pase/PEPCK RNA和葡萄糖生成 原代肝细胞:0.5 μM DPI或5 μM MitoTEMPO处理30分钟,检测ROS和p-ERK 原代肝细胞:MG132(5 μM)处理18小时,检测FoxO1泛素化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证GCN5L1在肝脏中的特异性缺失及其对线粒体蛋白乙酰化的影响。
将GCN5L1 flox/flox小鼠与albumin-Cre小鼠杂交获得LKO小鼠;免疫印迹检测心、脑、肾、肝组织及肝脏线粒体组分中GCN5L1表达;检测线粒体和胞质蛋白乙酰化水平。
确定GCN5L1缺失对空腹血糖和肝葡萄糖生成的影响。
检测禁食6或16小时血糖;检测丙酮酸耐量试验(PTT);检测胰岛素和葡萄糖耐量试验;检测血清胰岛素和胰高血糖素水平;检测肝糖原含量。
验证GCN5L1缺失对肝细胞葡萄糖生成和糖异生关键酶表达的影响。
分离原代肝细胞,检测糖原合成和分解关键酶转录水平;检测PC、PEPCK、G6Pase的RNA和蛋白水平;检测基础和胰高血糖素刺激下的葡萄糖生成。
确认GCN5L1缺失导致的糖异生酶下调依赖于GCN5L1。
在LKO原代肝细胞中腺病毒过表达WT GCN5L1或线粒体靶向GCN5L1(Mt-GCN5L1),检测PEPCK和G6Pase转录水平;在HeLa细胞中验证Mt-GCN5L1的线粒体定位。
明确GCN5L1缺失降低FoxO1蛋白水平的机制。
检测FoxO1转录水平;用放线菌酮(CHX)追踪FoxO1降解速率;用溶酶体抑制剂(巴弗洛霉素A1、氯喹)和蛋白酶体抑制剂(lactacystin、MG132)处理,检测FoxO1水平;免疫沉淀检测FoxO1泛素化。
确认FoxO1下调是GCN5L1缺失导致糖异生减弱的功能性中介。
在LKO原代肝细胞中过表达FoxO1,检测PEPCK和G6Pase转录水平及葡萄糖生成。
确定GCN5L1缺失引起的FoxO1过度磷酸化及其上游激酶。
对WT和LKO原代肝细胞过表达的Flag-FoxO1进行质谱磷酸化分析;用p38抑制剂SB203580和ERK抑制剂U0126处理LKO肝细胞,检测FoxO1蛋白、糖异生酶转录和葡萄糖生成;检测ERK磷酸化水平。
验证GCN5L1缺失是否通过增加线粒体ROS激活ERK并抑制糖异生。
用CM-H2DCFDA流式检测细胞ROS;用Amplex Red检测线粒体H2O2;用DPI或MitoTEMPO处理,检测ROS、p-ERK、PEPCK/G6Pase转录和葡萄糖生成;过表达WT或Mt-GCN5L1检测ROS和葡萄糖生成。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | I型胶原酶 | Worthington | -- |
| Percoll | Sigma | -- | |
| 胶原 | Sigma | -- | |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 降解途径研究 | 巴弗洛霉素A1 | -- | -- |
| 氯喹 | -- | -- | |
| lactacystin | -- | -- | |
| MG132 | -- | -- | |
| ERK和p38抑制 | U0126 | Sigma | -- |
| SB203580 | Sigma | -- | |
| PD98059 | Sigma | -- | |
| ROS抑制 | 二苯基碘鎓 | Sigma | -- |
| MitoTEMPO | Sigma | -- | |
| 葡萄糖生成测定 | 葡萄糖氧化酶测定试剂盒 | Sigma | -- |
| 质粒构建 | pShuttle-CMV载体 | Agilent | -- |
| 腺病毒包装 | Adeasy腺病毒系统 | Agilent | -- |
| Ad-293包装细胞系 | -- | -- | |
| 免疫印迹 | FoxO1抗体 | Cell Signaling Technology | 2880 |
| VDAC抗体 | Cell Signaling Technology | 4661 | |
| Tubulin抗体 | Cell Signaling Technology | 2146 | |
| 免疫荧光 | Tom20抗体 | Cell Signaling Technology | 42406 |
| 免疫印迹 | p-ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 9101 |
| 总ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 9102 | |
| p-IRβ (Y1146)抗体 | Cell Signaling Technology | 3021 | |
| p-AKT (S473)抗体 | Cell Signaling Technology | 9271 | |
| AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| ACK抗体 | Cell Signaling Technology | 9441 | |
| 泛素抗体 | Cell Signaling Technology | 3936 | |
| G6Pase抗体 | Santa Cruz | sc-32840 | |
| Actin抗体 | Santa Cruz | sc-1615 | |
| PEPCK抗体 | Santa Cruz | sc-74825 | |
| 总IR抗体 | Millipore | 07-724 | |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488驴抗小鼠IgG | Life Technologies | -- |
| Alexa Fluor 488驴抗兔IgG | Life Technologies | -- | |
| 免疫沉淀 | Protein A/G plus琼脂糖珠 | Santa Cruz | -- |
| 质谱 | 抗FLAG树脂 | Sigma | -- |
| 实时定量PCR | RNeasy纯化试剂盒 | Qiagen | -- |
| cDNA逆转录试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| SYBR green混合液 | Roche | -- | |
| Roche Light-Cycler Q-PCR系统 | Roche | -- | |
| ROS检测 | CM-H2DCFDA | Invitrogen | -- |
| Amplex Red过氧化氢测定试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| 流式分析 | LSRII流式细胞仪 | BD | -- |
| 免疫荧光 | DAPI | Molecular Probes | -- |
| LSM 710共聚焦显微镜 | -- | -- | |
| 质谱 | LTQ Orbitrap Fusion质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠代谢表型 | 小鼠周龄(8-10周)、性别(雄性)、禁食时间(6或16小时)、丙酮酸钠剂量(2 g/kg)、样本量(n=7-18) 阅读提示:Methods 'Animal studies';Figure 2图注 |
| 原代肝细胞分离与培养 | 小鼠周龄(8-12周)、灌流缓冲液成分、胶原酶浓度(7000 IU/小鼠)、铺板密度(6×10^5细胞/孔) 阅读提示:Methods 'Cell culture studies' |
| 葡萄糖生成测定 | 无糖DMEM含20 mM乳酸钠和2 mM丙酮酸钠、过夜消耗糖原、胰高血糖素浓度(100 nM)、处理时间(5小时) 阅读提示:Methods 'Glucose production assay';Figure 4图注 |
| FoxO1降解途径 | 抑制剂浓度(巴弗洛霉素A1 10 nM、氯喹25 μM、lactacystin 5 μM、MG132 5 μM)、处理时间(18小时) 阅读提示:Methods 'Cell culture studies';Figure 6d图注 |
| ERK和p38抑制 | 抑制剂浓度(U0126 10 μM、SB203580 10 μM、PD98059 50 μM)、处理时间(8小时) 阅读提示:Methods 'Cell culture studies';Figure 7图注 |
| ROS检测与抑制 | CM-H2DCFDA浓度(10 μM)、DPI浓度(0.5 μM)、MitoTEMPO浓度(5 μM)、处理时间(30分钟或15小时) 阅读提示:Methods 'Measurement of reactive oxygen species in hepatocytes';Figure 8图注 |
| 腺病毒过表达 | 感染剂量(20 p.f.u./细胞)、检测时间(36小时) 阅读提示:Methods 'Plasmid constructs and adenovirus production';Figure 4c、6b图注 |