ZNRF1在巨噬细胞中对LPS诱导炎症的调控
验证ZNRF1是否调节TLR4触发的促炎和抗炎细胞因子产生。
在RAW264.7和THP-1细胞中用shRNA敲低ZNRF1,在Znrf1Δ小鼠BMDMs中敲除ZNRF1,LPS刺激后检测细胞因子mRNA和蛋白水平。
The ubiquitin ligase ZNRF1 promotes caveolin-1 ubiquitination and degradation to modulate inflammation.
包含体外细胞模型、体内小鼠脓毒症模型及多种分子机制验证(共免疫沉淀、体外泛素化等)
RAW264.7巨噬细胞系 THP-1细胞衍生巨噬细胞 Znrf1Δ小鼠(造血细胞特异性Znrf1敲除) Cav1−/− BMDMs
LPS处理浓度100 ng ml−1及处理时间 LPS体内注射剂量15 mg kg−1体重 CLP模型手术操作(21-gauge针穿刺) MG132预处理浓度10 μM siRNA电转浓度100 nM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证ZNRF1是否调节TLR4触发的促炎和抗炎细胞因子产生。
在RAW264.7和THP-1细胞中用shRNA敲低ZNRF1,在Znrf1Δ小鼠BMDMs中敲除ZNRF1,LPS刺激后检测细胞因子mRNA和蛋白水平。
评估ZNRF1对LPS诱导的内毒素血症和CLP诱导的多微生物脓毒症的影响。
对Znrf1Δ和对照小鼠腹腔注射致死剂量LPS或进行CLP手术,监测生存率、血清细胞因子、肺组织病理和MPO活性。
确定ZNRF1是否通过泛素-蛋白酶体途径调节CAV1蛋白降解。
在RAW264.7、BMDMs和HEK293T细胞中过表达或敲低ZNRF1,使用MG132、NH4Cl和chloroquine处理,检测CAV1蛋白水平。
验证ZNRF1是否直接结合并泛素化CAV1,并确定泛素化位点。
共免疫沉淀、结构域截短突变体、体外泛素化实验、赖氨酸突变体(CAV1(K39R))以及细胞水平泛素化检测。
确定ZNRF1–CAV1轴是否通过Akt–GSK3β通路调节细胞因子产生。
在Znrf1Δ BMDMs和CAV1过表达RAW264.7细胞中检测Akt、GSK3β、CREB磷酸化以及NF-κB p65核转位,并测定PP2A活性。
验证ZNRF1的效应是否依赖于CAV1。
在Znrf1F/F和Znrf1Δ BMDMs及小鼠中用siRNA敲低CAV1,检测LPS或CLP后的细胞因子和信号通路变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Hyclone | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| L929细胞条件培养基 | -- | -- | |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | -- | |
| 佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯 | -- | -- | |
| 药物处理 | 脂多糖(大肠杆菌0111:B4) | Sigma-Aldrich | -- |
| MG132蛋白酶体抑制剂 | -- | -- | |
| 氯化铵 | -- | -- | |
| 氯喹 | -- | -- | |
| 聚肌胞苷酸 | InvivoGen | -- | |
| 转染 | Turbofect转染试剂 | Fermentas | -- |
| 聚凝胺 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Neon电转系统 | Invitrogen | -- | |
| 体内jetPEI转染试剂 | Polyplus-transfection | -- | |
| RNA提取与qPCR | RNeasy迷你试剂盒 | Qiagen | -- |
| RevertAid H Minus第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Scientific | -- | |
| Maxima SYBR Green/Fluorescein qPCR预混液 | Thermo Scientific | -- | |
| Western blot | 抗ZNRF1多克隆抗体 | -- | -- |
| 抗p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8642 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| 抗H3抗体 | Cell Signaling Technology | 4499 | |
| 抗磷酸化IKKα/β抗体 | Cell Signaling Technology | 2697 | |
| 抗磷酸化p38抗体 | Cell Signaling Technology | 9211 | |
| 抗磷酸化JNK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9251 | |
| 抗磷酸化ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| 抗p38抗体 | Cell Signaling Technology | 8690 | |
| 抗JNK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 554285 | |
| 抗ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9102 | |
| 抗CAV1抗体 | Cell Signaling Technology | 3267 | |
| 抗磷酸化GSK3β (Ser9)抗体 | Cell Signaling Technology | 5558 | |
| 抗磷酸化AKT (Ser473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 抗GSK3β抗体 | Cell Signaling Technology | 12456 | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 1691 | |
| 抗c-Jun抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc7694 | |
| 抗IKKα/β抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc7607 | |
| 抗磷酸化CREB (Ser129)抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc101662 | |
| 抗β-actin抗体 | Millipore | MAB1501 | |
| 抗泛素抗体 | Covance | MMS258R | |
| 抗ZNRF2抗体 | Abcam | ab156011 | |
| 抗V5抗体 | Bethyl Laboratories | A190-120P | |
| 抗HA抗体 | Bethyl Laboratories | A190-108P | |
| 免疫沉淀 | 抗Flag偶联琼脂糖珠 | Bethyl Laboratories | S190-101 |
| Western blot | 抗Flag抗体 | BioLegend | 637301 |
| 免疫组化 | 抗CD68抗体 | Proteintech | 25747-1-AP |
| ELISA | DuoSet ELISA系统 | R&D Systems | -- |
| MPO活性检测 | MPO比色检测试剂盒 | BioVision | -- |
| 蛋白定量 | Bradford蛋白定量试剂 | Bio-Rad | -- |
| Western blot | Western Lighting Plus-ECL化学发光试剂 | PerkinElmer | -- |
| 体外泛素化 | 镍-次氮基三乙酸树脂 | Macherey-Nagel | -- |
| 泛素 | Boston Biochem | -- | |
| His-Ube1(E1酶) | Enzo Life Sciences | -- | |
| His-UbcH5c(E2酶) | Enzo Life Sciences | -- | |
| PP2A活性检测 | PP2A免疫沉淀磷酸酶活性检测试剂盒 | Millipore | -- |
| 体内siRNA递送 | Ambion体内siRNA | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 质粒构建 | QuickChange II定点突变试剂盒 | Stratagene | -- |
| pcDNA3载体 | Invitrogen | -- | |
| pLKO-AS2慢病毒载体 | National RNAi Core Facility, Academia Sinica | -- | |
| pcDNA-HA-泛素质粒 | Addgene | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| LPS诱导炎症模型 | LPS剂量(100 ng ml−1体外;15 mg kg−1体内)、处理时间、细胞类型(RAW264.7、BMDMs、THP-1衍生巨噬细胞) 阅读提示:Methods 'Animal models of endotoxemia and polymicrobial sepsis' 及 Figure 1、2图注 |
| CLP脓毒症模型 | CLP手术操作(21-gauge针穿刺、结扎位置)、术后监测时间点(生存7天;细胞因子4/8小时;组织学8小时) 阅读提示:Methods 'Animal models of endotoxemia and polymicrobial sepsis' 及 Figure 2图注 |
| ZNRF1敲低/敲除 | shRNA靶序列、siRNA序列、敲除小鼠基因型(Znrf1F/F、Mx1-Cre、poly(I:C)给药方案) 阅读提示:Methods 'shRNA-mediated gene silencing and lentiviral infection'、'Mice' 及 Supplementary Fig. 1、3 |
| CAV1泛素化检测 | MG132浓度(10 μM)、LPS刺激时间、免疫沉淀抗体、体外泛素化反应条件(30°C 3小时) 阅读提示:Methods 'In vitro ubiquitination assay' 及 Figure 3、4、5图注 |
| CAV1敲低体内实验 | siRNA剂量(40 μg/小鼠)、递送试剂(in vivo-jetPEI)、CLP后采血时间(8小时) 阅读提示:Methods 'In vivo administration of siRNAs' 及 Figure 7d图注 |