AD患者和5xFAD小鼠中OSCP水平检测
验证AD中F1FO-ATP合酶亚基是否发生选择性改变。
用免疫印迹比较非AD、MCI和AD患者颞叶皮层蛋白提取物中F1FO-ATP合酶主要亚基的表达;用免疫组化检测AD患者脑切片中OSCP在神经元中的表达;分离5xFAD小鼠突触和非突触线粒体,用免疫印迹检测OSCP水平。
Deregulation of mitochondrial F1FO-ATP synthase via OSCP in Alzheimer's disease.
包含AD患者脑组织、5xFAD小鼠、原代神经元、人神经干细胞分化神经元,并进行功能与机制验证
AD患者及MCI患者颞叶脑组织 5xFAD转基因AD小鼠模型 原代培养小鼠皮层/海马神经元 人神经干细胞分化神经元
5xFAD小鼠年龄4月龄和9月龄,每组n=5-7,比较突触与非突触线粒体 原代小鼠神经元OSCP敲低使用shRNA lentivirus MOI=5,感染后7天检测 Aβ1–42寡聚体处理浓度500 nM,处理时间24小时(小鼠神经元)或4天(人神经元) mPTP检测使用ionophore 2 μM触发,CsA 1 μM抑制 AD患者脑组织分组:非AD 6例、MCI 6例、AD 4例(免疫印迹)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证AD中F1FO-ATP合酶亚基是否发生选择性改变。
用免疫印迹比较非AD、MCI和AD患者颞叶皮层蛋白提取物中F1FO-ATP合酶主要亚基的表达;用免疫组化检测AD患者脑切片中OSCP在神经元中的表达;分离5xFAD小鼠突触和非突触线粒体,用免疫印迹检测OSCP水平。
确定OSCP缺失是否直接导致线粒体功能障碍。
用OSCP shRNA lentivirus敲低原代培养小鼠神经元中的OSCP,检测线粒体膜电位(TMRM)、ATP产生、线粒体超氧化物(MitoSox Red)、神经突线粒体分布以及mPTP形成(calcein AM-cobalt chloride淬灭实验)。
验证OSCP是否与Aβ直接结合以及该结合是否影响OSCP功能。
在AD患者脑组织和5xFAD小鼠脑组织中用抗OSCP抗体进行免疫共沉淀检测OSCP/Aβ复合物;用GST-OSCP进行体外pull-down实验检测Aβ1–42与OSCP的结合;构建OSCP缺失突变体(OSCPΔ107–121)定位Aβ结合区域;检测Aβ对OSCP与α/β亚基结合的影响。
确定Aβ是否破坏F1FO复合物完整性并抑制其活性。
将Aβ1–42暴露于分离的脑线粒体,用BN-PAGE检测F1FO复合物解离(游离F1),检测ATP合成和F1FO-ATP合酶活性,以及线粒体复合物I-IV活性。
在体内验证OSCP失调是否导致F1FO-ATP合酶功能障碍。
检测5xFAD小鼠突触线粒体的呼吸控制比、ATP合成、F1FO-ATP合酶催化活性、寡霉素不敏感呼吸、寡霉素敏感性以及F1解离(BN-PAGE)。
验证恢复OSCP是否能改善Aβ引起的线粒体和突触功能障碍。
在培养的小鼠神经元中过表达OSCP,用寡聚Aβ1–42处理,检测线粒体膜电位、ATP产生、神经突线粒体分布、mPTP形成以及突触密度和mEPSC。
验证OSCP恢复是否对人神经元具有保护作用。
用人神经干细胞分化神经元,过表达OSCP,用寡聚Aβ1–42处理,检测OSCP水平、OSCP/Aβ复合物、ATP产生、线粒体膜电位、神经突线粒体分布和mPTP形成。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫印迹 | 小鼠单克隆抗ATP5A抗体 | Life Technologies | 459240 |
| 兔多克隆抗ATP5B抗体 | Santa Cruz | sc-33618 | |
| 小鼠单克隆抗OSCP抗体 | Santa Cruz | sc-365162 | |
| 山羊多克隆抗亚基c抗体 | Santa Cruz | sc-132636 | |
| 山羊多克隆抗亚基b抗体 | Santa Cruz | sc-162552 | |
| 山羊多克隆抗亚基a抗体 | Proteintech | 55313-1-AP | |
| 兔多克隆抗TOM40抗体 | Santa Cruz | sc-11414 | |
| 兔多克隆抗Aβ抗体 | CST | 8243 | |
| 小鼠抗β-actin抗体 | Sigma-Aldrich | 5441 | |
| 小鼠抗亲环素D抗体 | Millipore | AP1035 | |
| 兔抗VDAC抗体 | CST | 4661 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG | Life Technologies | 626520 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Life Technologies | 656120 | |
| 免疫荧光 | 抗Aβ抗体 | CST | 8243 |
| 抗COXIV抗体 | CST | 4844 | |
| 抗MAP2抗体 | Sigma-Aldrich | M4403 | |
| 抗OSCP抗体 | Santa Cruz | sc-365162 | |
| 尼氏染色 | Life Technologies | N21479 | |
| Alexa Fluor 488荧光染料 | Life Technologies | -- | |
| Alexa Fluor 594荧光染料 | Life Technologies | -- | |
| Alexa 488标记的山羊抗小鼠IgG | Invitrogen | A11029 | |
| Alexa 594标记的山羊抗兔IgG | Invitrogen | A11037 | |
| Alexa 647标记的山羊抗豚鼠IgG | Invitrogen | A21450 | |
| 兔抗PSD95抗体 | Cell Signaling | 3450 | |
| 豚鼠抗vGlut1抗体 | Synaptic System | 135304 | |
| 抗βIII微管蛋白抗体 | CST | D71G9 | |
| Alexa Fluor 594二抗 | Life Technology | A-11037 | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A/G琼脂糖 | Pierce | -- |
| GST pulldown | 谷胱甘肽琼脂糖高容量高性能树脂 | Pierce | -- |
| BL21 (DE3) pLysS大肠杆菌 | Promega | -- | |
| pGEX-4t-1质粒 | GE Healthcare | -- | |
| 异丙基-β-D-硫代半乳糖苷 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞培养 | Neurobasal A培养基 | Life Technologies | -- |
| B27添加剂 | Life Technologies | -- | |
| 多聚-D-赖氨酸 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Lab-Tek腔室载玻片 | Nunc | 177445 | |
| StemPro神经干细胞 | Life Technologies | A10509-01 | |
| 多聚鸟氨酸 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 层粘连蛋白 | Life Technologies | -- | |
| 氟脱氧尿苷 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 尿苷 | Sigma-Aldrich | -- | |
| OSCP敲低 | 慢病毒shRNA构建体克隆TRCN0000076166 | Sigma-Aldrich | TRCN0000076166 |
| 慢病毒shRNA构建体克隆TRCN0000076228 | Sigma-Aldrich | TRCN0000076228 | |
| 包装载体psPAX2 | Addgene | -- | |
| 包膜载体pMD2.G | Addgene | -- | |
| 表达非靶向shRNA的慢病毒对照 | Sigma-Aldrich | SHC002 | |
| OSCP过表达 | 含人多聚泛素启动子C的慢病毒载体 | Addgene | -- |
| 线粒体膜电位检测 | 四甲基罗丹明甲酯 | Sigma-Aldrich | -- |
| 线粒体超氧化物检测 | MitoSox Red线粒体超氧化物荧光探针 | Life Technologies | -- |
| mPTP检测 | 钙黄绿素 | Life Technologies | -- |
| 离子载体A23187 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 环孢素A | -- | -- | |
| ATP合成检测 | ATP发光检测试剂盒 | Abcam | -- |
| 线粒体分离 | Percoll密度梯度介质 | GE Healthcare | -- |
| Dounce匀浆器 | Wheaton | -- | |
| Optima XPN-90超速离心机 | Beckman Coulter | -- | |
| 蛋白定量 | Bio-Rad DC蛋白定量试剂盒 | Bio-Rad Laboratories | -- |
| ATP合酶活性检测 | Ultrospect 2100分光光度计 | Amersham Biosciences | -- |
| 免疫印迹 | PVDF膜 | Bio-Rad Laboratories | -- |
| SDS-PAGE Bis-Tris凝胶 | Life Technologies | -- | |
| BN-PAGE | NativePAGE Novex凝胶 | Life Technologies | -- |
| NativePAGE样品缓冲液 | Life Technologies | -- | |
| Mini-PROTEAN Tetra电泳系统 | Bio-Rad | -- | |
| Native Mark分子量标准 | Life Technologies | -- | |
| 抗F1抗体 | Abcam | ab109867 | |
| 电生理 | Axon Multiclamp 700B放大器 | Molecular Devices | -- |
| 气动药物喷射系统 | NPI Instruments | -- | |
| Aβ寡聚体制备 | Aβ1–42肽 | GenicBio | -- |
| ELISA | 人Aβ1–40和Aβ1–42 ELISA试剂盒 | Life Technologies | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| AD患者和5xFAD小鼠OSCP水平检测 | AD患者分组和样本量(非AD 6例、MCI 6例、AD 4例);5xFAD小鼠年龄(4月龄和9月龄)和每组样本量(n=5-7);突触线粒体分离方法(Percoll梯度离心) 阅读提示:Methods 'Human samples'和'Mice'部分,Figure 1图注 |
| OSCP敲低实验 | shRNA序列(TRCN0000076166);慢病毒感染MOI=5;感染时间(培养3天后感染,再培养7天后检测) 阅读提示:Methods 'OSCP knockdown in mouse primary neurons'部分 |
| Aβ处理实验 | Aβ1–42寡聚体浓度(500 nM);处理时间(小鼠神经元24小时,人神经元4天) 阅读提示:Methods 'OSCP overexpression in neurons'和'Preparation and treatment of OSCP OE human neurons'部分,Figure 6和8图注 |
| mPTP检测 | ionophore浓度(2 μM);CsA浓度(1 μM);calcein浓度(1 μM);氯化钴浓度(1 mM) 阅读提示:Methods 'Calcein AM-cobalt chloride quenching assay'部分,Figure 2f和6f图注 |
| 线粒体功能检测 | TMRM浓度(200 nM);MitoSox Red浓度(2 μM);ATP合成检测中ADP浓度(500 μM) 阅读提示:Methods 'Mitochondrial membrane potential assay'、'Mitochondrial superoxide assay'和'ATP synthesis assay'部分 |