建立衰老细胞模型并验证凋亡抵抗
确认衰老细胞对内外源性凋亡刺激的抵抗性
用etoposide诱导DNA损伤性衰老(DIS)、长期传代诱导复制性衰老(RS)、H-RasV12诱导致癌基因性衰老(OIS),分别用TNF-α/CHX或UV照射诱导凋亡,检测细胞存活及凋亡标志物切割。
Directed elimination of senescent cells by inhibition of BCL-W and BCL-XL.
包含体外细胞模型(IMR-90、MEF)、小鼠体内模型(辐射诱导肺衰老、转基因皮肤衰老)及机制验证(siRNA、IRES活性、多聚核糖体分析)
人IMR-90成纤维细胞 小鼠胚胎成纤维细胞(MEF) 电离辐射诱导肺衰老小鼠模型 K5-rtTA/tet-p14转基因皮肤衰老小鼠模型
衰老诱导方式:etoposide 50 μM处理48 h(DIS)、长期传代至40个群体倍增(RS)、H-RasV12逆转录病毒感染(OIS) ABT-737处理浓度与时间:体外10 μM处理24 h;体内75 mg/kg腹腔注射2或4天 凋亡检测:TNF-α(75 ng/ml)和CHX(10 μg/ml)处理10 h,或UV-C 80 J/m2照射,检测PARP、ICAD、caspase-3切割 siRNA转染浓度与时间:50 nM,过夜转染,转染后4天检测细胞活力 动物模型:8 Gy全身照射后7天给药;或3周龄小鼠doxycycline诱导p14ARF表达2-4周后给药
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认衰老细胞对内外源性凋亡刺激的抵抗性
用etoposide诱导DNA损伤性衰老(DIS)、长期传代诱导复制性衰老(RS)、H-RasV12诱导致癌基因性衰老(OIS),分别用TNF-α/CHX或UV照射诱导凋亡,检测细胞存活及凋亡标志物切割。
探究衰老细胞中抗凋亡蛋白的表达变化
在人和小鼠衰老细胞及对照细胞中检测BCL-W、BCL-XL、BCL-2、MCL-1及衰老标志物p16、p21、p53的蛋白水平。
验证BCL-2家族成员抑制是否特异性诱导衰老细胞死亡
用ABT-737(抑制BCL-2、BCL-W、BCL-XL)、Obatoclax(抑制BCL-2、BCL-W、BCL-XL及MCL-1)、ABT-199(抑制BCL-2)处理衰老和对照细胞,检测细胞存活;用z-VAD-fmk验证凋亡依赖性。
明确BCL-W和BCL-XL在维持衰老细胞存活中的相对贡献
用siRNA单独或联合敲低BCL-W、BCL-XL、BCL-2,检测DIS细胞存活及蛋白水平。
阐明衰老细胞中BCL-W和BCL-XL蛋白积累的转录和翻译调控机制
检测BCL-W变体1/2和BCL-XL的mRNA水平;用CHX追踪蛋白降解;用多聚核糖体分析检测翻译效率;用双荧光素酶报告基因检测BCL-XL IRES活性;用雷帕霉素抑制mTOR。
验证ABT-737在体内清除DNA损伤诱导的衰老细胞的效果
小鼠全身照射8 Gy,7天后腹腔注射ABT-737或溶剂2天,检测肺组织SA-β-Gal、γH2AX、p53、p21及caspase-3切割。
验证ABT-737在体内清除p53激活诱导的衰老细胞并评估对干细胞的影响
在K5-rtTA/tet-p14小鼠中诱导p14ARF表达4周,腹腔注射ABT-737或溶剂4天,检测表皮衰老细胞、p14ARF表达、凋亡及毛囊干细胞增殖。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| L-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 衰老诱导 | 依托泊苷 | Sigma | E1383 |
| 凋亡诱导 | 肿瘤坏死因子α | R&D Systems | 210-TA-020 |
| 细胞存活检测 | PrestoBlue试剂 | Life Technologies Ltd. | A13262 |
| 药物处理 | ABT-737 | Selleck Chemicals | S1002 |
| Obatoclax | Selleck Chemicals | S1057 | |
| ABT-199 | ChemieTek | CT-A199 | |
| Z-VAD-FMK | Santa Cruz Biotechnology | SC-311561A | |
| Western blot | Immobilon P膜 | Millipore | IPVH00010 |
| 抗切割PARP抗体 | Cell Signaling | #9541 | |
| 抗切割ICAD抗体 | Cell Signaling | #9731 | |
| 抗切割caspase-3抗体 | Cell Signaling | #9661 | |
| 抗BCL-W抗体 | Cell Signaling | #2724 | |
| 抗BCL-XL抗体 | Cell Signaling | #2764 | |
| 抗Bcl-2抗体 | Cell Signaling | #2870 | |
| 抗Mcl-1抗体 | Epitomics | 1239-1 | |
| 抗p16抗体 | Santa Cruz | sc-1207 | |
| 抗β-Tubulin抗体 | Santa Cruz | sc-9104 | |
| 抗p21抗体 | BD Bioscience | 556431 | |
| 抗p53抗体(DO-1和PAb1801混合) | -- | -- | |
| 抗β-Actin抗体 | Sigma | A5441 | |
| 化学发光检测 | Thermo Fisher Scientific | 34080 | |
| 蛋白降解分析 | MG-132 | Enzo | BML-PI102-0005 |
| siRNA转染 | 靶向Bcl-2的ON-TARGETplus SMARTpool siRNA | Thermo Scientific | L-003307-00-0005 |
| 靶向BCL-W的ON-TARGETplus SMARTpool siRNA | Thermo Scientific | L-004384-00-0005 | |
| 靶向BCL-XL的ON-TARGETplus SMARTpool siRNA | Thermo Scientific | L-0030458-00-0005 | |
| 非靶向siRNA pool | Thermo Scientific | D-001810-10-20 | |
| RNA提取 | RNeasy试剂盒 | Qiagen | 74104 |
| 实时定量PCR | Platinum SYBR Green qPCR SuperMix | Life Technologies | 11744-500 |
| StepOnePlus实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 多聚核糖体分析 | TRI-Reagent | Sigma | -- |
| Direct-zol RNA MiniPrep试剂盒 | Zymo Research | R2050 | |
| NanoDrop 2000c分光光度计 | Thermo | -- | |
| 双荧光素酶实验 | TurboFect转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- | |
| Veritas发光仪 | Promega | -- | |
| 动物实验 | 多西环素 | Sigma | -- |
| ABT-737 | -- | -- | |
| 免疫组化 | 抗p14ARF抗体 | Abcam | ab3642 |
| 抗CC3抗体 | Cell Signaling | #9661 | |
| 抗Ki67抗体 | Labvision | RM-9106 | |
| 抗K14抗体 | Progen | GP-CK14 | |
| 抗K15抗体 | Santa Cruz | sc-56520 | |
| 流式细胞术 | 抗CD34抗体 | BD Bioscience | 562608 |
| 抗CD49f抗体 | eBioscience | 17-0495-80 | |
| 抗Sca1抗体 | Biolegend | 108113 | |
| C12FDG | Invitrogen | D-2893 | |
| MACSQuant流式细胞分选仪 | Miltenyi | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 衰老细胞模型建立 | 衰老诱导方式及时间:etoposide 50 μM处理48 h后7天;长期传代至40个群体倍增;H-RasV12逆转录病毒感染后7天 阅读提示:Methods 'Cell culture' |
| 凋亡诱导与检测 | TNF-α 75 ng/ml和CHX 10 μg/ml处理10 h;UV-C 80 J/m2照射后24 h检测;PrestoBlue检测存活 阅读提示:Methods 'Apoptosis assay'和'UV sensitivity assay' |
| ABT-737体外处理 | ABT-737浓度梯度及处理24 h;z-VAD-fmk 100 μM预处理4 h 阅读提示:Methods 'Cell survival assays' |
| siRNA敲低 | siRNA浓度50 nM,过夜转染,转染后4天检测细胞活力 阅读提示:Methods 'siRNA' |
| 小鼠体内ABT-737处理 | ABT-737剂量75 mg/kg,腹腔注射,连续2或4天;辐射模型8 Gy照射后7天给药 阅读提示:Methods 'Mice' |
| 多聚核糖体分析 | 蔗糖梯度10-50%,离心260,173g 100 min;CHX 100 μg/ml处理5 min 阅读提示:Methods 'Polysome profiling' |