肠道淋巴引流成像与示踪
验证不同gLNs引流特定肠道片段且淋巴保持区室化
对溶剂透明化组织进行LYVE-1抗体染色3D成像,向gLN或肠肌层注射Fast Green染料追踪引流
Compartmentalized gut lymph node drainage dictates adaptive immune responses.
包含体内小鼠模型、体外细胞分选RNA-seq、3D成像、手术切除、感染模型及功能验证
SPF与GF C57BL/6小鼠 CD45.1 OT-II TCR转基因小鼠 SFB特异性7B8tg CD4+ T细胞过继转移模型 S. venezuelensis感染小鼠模型
gLN引流区域划分:D、I、C-gLN分别对应十二指肠、回肠、结肠引流 OT-II细胞过继转移数量:1×10^6个naïve CD45.1+ OT-II细胞 OVA灌胃剂量:50 mg OVA(grade III)于200 μl PBS,间隔24 h两次 SFB单定植后8天检测gLN中RORγt+CD4+ T细胞频率 S. venezuelensis感染剂量:700条幼虫皮下注射,感染后8天取材
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证不同gLNs引流特定肠道片段且淋巴保持区室化
对溶剂透明化组织进行LYVE-1抗体染色3D成像,向gLN或肠肌层注射Fast Green染料追踪引流
探究不同gLN引流区域基质细胞和DC的基因表达差异
从D、I、C-gLN分选LECs、FRCs及CD103+CD11b+和CD103+CD11b– DC进行RNA-seq和PCA分析
检测不同gLN中CD4+ T细胞极化的差异
过继转移naïve CD45.1+ OT-II细胞后OVA灌胃,分析gLN中FOXP3+ pTreg和RORγt+细胞频率
验证十二指肠与回肠注射抗原诱导不同T细胞应答及对病原体感染的影响
手术将OVA或OVA+CT注射入十二指肠或回肠,随后进行Stm-OVA感染并监测体重和细菌播散
验证远端gLN在SFB特异性TH17应答中的作用
手术切除I-和C1-gLN,过继转移SFB特异性7B8tg细胞,分析gLN和肠道中RORγt+细胞
验证十二指肠感染是否破坏局部pTreg诱导和系统性口服耐受
S. venezuelensis感染后过继转移OT-II细胞并OVA灌胃,分析D-gLN中FOXP3+细胞;随后进行OVA-alum免疫和气道挑战,检测BALF嗜酸性粒细胞和OVA特异性IgG1
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 组织透明化和染色 | 苄醚 | Sigma | 108014 |
| 染料示踪 | 固绿FCF | Sigma | F7252 |
| 视黄醇生物分布 | Pluronic L-81 | Sigma | 435430 |
| 口服抗原给药 | 卵清蛋白(III级) | Sigma | A5378 |
| 卵清蛋白(VI级) | Sigma | A2512 | |
| 肠道抗原注射 | 霍乱毒素 | List Biological Laboratories | 100B |
| 流式细胞术 | 抗CD25抗体 | BD | 563061 |
| 抗CD45.1抗体 | BD | 563982 | |
| 抗CD45.2抗体 | BD | 560693 | |
| 抗CD103抗体 | BD | 557495 | |
| 抗RORγt抗体 | BD | 562894 | |
| 抗FOXP3抗体 | eBioscience | 12-5773-82 | |
| 抗GATA3抗体 | eBioscience | 12-9966-42 | |
| 抗MHCII抗体 | eBioscience | 46-5321-82 | |
| 抗CD11b抗体 | Biolegend | 101236 | |
| 抗TCRβ抗体 | Biolegend | 109220 | |
| Aqua LIVE/DEAD可固定Aqua死细胞染色试剂盒 | Life Technologies | L-34965 | |
| 细胞增殖检测 | Cell Trace CFSE细胞增殖试剂盒 | Life Technologies | C34554 |
| Cell Trace Violet细胞增殖试剂盒 | Life Technologies | C34557 | |
| DC分选 | 泛树突状细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-100-875 |
| RALDH活性检测 | Aldefluor试剂盒 | STEMCELL Technologies | -- |
| RNA-seq文库制备 | RNAClean XP磁珠 | Agentcourt | A63987 |
| Nextera XT DNA文库制备试剂盒 | Illumina | FC-131-1002 | |
| SFB定植检测 | Quick-DNA粪便/土壤微生物微量制备试剂盒 | Zymo Research | D6010 |
| Power SYBR Green PCR预混液 | Applied Biosystems | 4367659 | |
| 免疫接种 | Imject明矾佐剂 | Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| gLN引流区域划分 | D、I、C-gLN的解剖定位标准:D-gLN通过灌胃橄榄油后观察乳糜包围最靠近胃的淋巴结确定;I和C-gLN通过追踪连接肠道与淋巴结的淋巴管确定 阅读提示:Methods 'Segmentation of gut-draining lymph nodes'小节及Extended Data Fig. 1 |
| OT-II细胞过继转移与OVA灌胃 | 细胞数量1×10^6、转移途径(眼后静脉注射)、OVA剂量50 mg/200 μl PBS、灌胃两次间隔24 h、分析时间64 h 阅读提示:Methods 'Adoptive T cell transfer'和'Oral antigen administration'小节,Fig. 2f图注 |
| 肠道原位CT-OVA注射 | OVA 50 mg+CT 5 μg于100 μl PBS、注射位点(十二指肠距幽门5 mm,回肠距最远端Peyer结5 mm)、针头28½ G、手术麻醉和术后护理方案 阅读提示:Methods 'Intestinal CT-OVA injection'小节,Fig. 3a图注 |
| SFB定植与7B8tg细胞转移 | SFB定植方式(两次灌胃0.4 ml盲肠内容物,间隔24 h)、7B8tg细胞数量4×10^5、转移后64 h分析、gLN切除术后19天进行转移 阅读提示:Methods 'SFB colonization'和'Lymph node surgery'小节,Fig. 3f,g图注 |
| S. venezuelensis感染与口服耐受 | 感染剂量700条幼虫皮下注射、感染后8天进行OT-II转移和OVA灌胃、OVA-alum免疫方案(4 μg OVA吸附40 μl明矾佐剂i.p.,两次间隔7天)、气道挑战剂量10 μg OVA grade VI鼻内给药于第14、17、21天 阅读提示:Methods 'S. venezuelensis passage and infection'和'Alum immunization and airway challenge'小节,Fig. 4j-m图注 |