鞘脂代谢通路基因在EAE和MS中的表达分析
确定LacCer生物合成通路成员在EAE进展期和MS病灶中的表达变化。
在NOD EAE进展期分离星形胶质细胞,用qPCR检测B4galt6、Ugcg、Cers1、Cers2、Cers4、Cers5、Cers6表达;在MS病灶、NAWM和对照脑组织中检测相应基因表达。
Metabolic Control of Astrocyte Pathogenic Activity via cPLA2-MAVS.
包含体外原代星形胶质细胞、HEK293过表达、EAE动物模型、MS患者样本及多组学分析,并有功能与机制验证。
NOD/ShiLtJ小鼠EAE模型 C57BL/6J小鼠EAE模型 原代小鼠星形胶质细胞 人胎儿星形胶质细胞 MS患者脑组织样本
星形胶质细胞特异性shRNA(B4galt6、Ugcg、Cers5、Cers6、Pla2g4a、Mavs、Bsg)在EAE小鼠中的敲低效率及对EAE进展的影响 LacCer处理浓度(10 μM)及cPLA2抑制剂Pyrrophenone(500 nM或1 μM)预处理时间 TNFα/IFNγ刺激浓度(10 ng/ml和100 ng/ml)及作用时间 Miglustat口服剂量600 mg/kg及给药起始时间(EAE诱导后第23天) MAVS缺失或敲低对NF-κB核转位、靶基因启动子招募及促炎基因表达的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定LacCer生物合成通路成员在EAE进展期和MS病灶中的表达变化。
在NOD EAE进展期分离星形胶质细胞,用qPCR检测B4galt6、Ugcg、Cers1、Cers2、Cers4、Cers5、Cers6表达;在MS病灶、NAWM和对照脑组织中检测相应基因表达。
验证LacCer生物合成通路基因在星形胶质细胞中对EAE进展和CNS病理的作用。
用GFAP启动子驱动的shRNA慢病毒在星形胶质细胞中敲低B4galt6、Ugcg、Cers1、Cers2、Cers4、Cers5、Cers6,观察EAE临床评分、轴突丢失、脱髓鞘、炎性单核细胞浸润及星形胶质细胞基因表达。
验证鞘脂代谢基因敲低是否直接影响星形胶质细胞的促炎和神经毒性功能。
在原代小鼠星形胶质细胞中敲低B4galt6、Ugcg、Cers5、Cers6,用TNFα/IFNγ激活,检测条件培养基对单核细胞迁移和神经毒性的影响,以及与微胶质细胞共培养时的基因表达。
验证LacCer是否通过cPLA2增强NF-κB驱动的促炎转录。
在无细胞体系和星形胶质细胞中检测LacCer对cPLA2酶活性的影响;用cPLA2抑制剂处理激活的鼠和人星形胶质细胞,检测促炎基因表达、NF-κB核转位及NF-κB在Ccl2、Csf2、Nos2启动子上的招募。
确定cPLA2与MAVS是否直接相互作用以及介导互作的结构域。
在原代星形胶质细胞和HEK293过表达系统中进行CoIP和western blot;使用MAVS CARD结构域突变体(W56A、AAA、M2-6L、M2)和cPLA2截短体(dPL、dC2)分析互作;用SDD-AGE检测MAVS寡聚化,用荧光素酶报告基因检测NF-κB活化。
验证MAVS在星形胶质细胞中调控NF-κB促炎程序和EAE进展。
在WT和Mavs敲除星形胶质细胞中检测LacCer诱导的NF-κB核转位、启动子招募和靶基因表达;在NOD EAE小鼠星形胶质细胞中敲低Mavs,观察EAE进展、单核细胞浸润和基因表达。
研究cPLA2-MAVS信号如何影响星形胶质细胞的糖代谢、线粒体呼吸和乳酸释放。
用代谢组学分析cPLA2抑制后的代谢物变化;检测乳酸释放、线粒体丙酮酸水平、线粒体呼吸(Mito Stress test)、HK酶活性;通过CoIP分析MAVS与HK2的相互作用及cPLA2的竞争性置换。
评估Miglustat是否能抑制cPLA2-MAVS信号并改善慢性进展型EAE。
在NOD EAE小鼠进展期前口服Miglustat(600 mg/kg),检测CNS药物浓度、EAE临床评分、轴突丢失、脱髓鞘、炎性单核细胞浸润和星形胶质细胞基因表达;在体外检测Miglustat对鼠和人星形胶质细胞促炎基因、神经毒性、单核细胞迁移、微胶质细胞活化、乳酸释放和cPLA2活性的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 多聚-L-赖氨酸 | Sigma-Aldrich | P4707 |
| 层粘连蛋白 | Sigma-Aldrich | L2020 | |
| DMEM/F12培养基 | Gibco | 10565018 | |
| 药物处理 | 乳糖神经酰胺 | Matreya | 1507 |
| 米格鲁司特 | BOC Sciences | 72599-27-0 | |
| 盐酸米格鲁司特 | MedChemExpress | HY-17020A | |
| 细胞因子刺激 | 小鼠TNFα重组蛋白 | R&D Systems | 410-MT-010 |
| 小鼠IFNγ重组蛋白 | R&D Systems | 485-MI-100 | |
| 人TNFα重组蛋白 | R&D Systems | 210-TA-020 | |
| 人IFNγ重组蛋白 | R&D Systems | 285-IF-100 | |
| Western blot | 抗NF-κB p65兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 8242S |
| 抗MAVS兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 4983 | |
| 抗cPLA2(4-4B-3C)小鼠单克隆抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-454 | |
| 抗HK2兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 2867 | |
| 免疫荧光 | 线粒体红色荧光探针 | Thermo Fisher Scientific | M7512 |
| DAPI荧光封片剂 | SouthernBiotech | 0100-20 | |
| RNA提取与反转录 | RNeasy迷你试剂盒 | QIAGEN | 74106 |
| 高容量cDNA反转录试剂盒 | Life Technologies | 4368813 | |
| qPCR | Taqman快速通用PCR预混液 | Life Technologies | 4367846 |
| 快速SYBR Green预混液 | Thermo Fisher Scientific | 4385612 | |
| 乳酸测定 | L-乳酸检测试剂盒 | Biomedical Research Service & Clinical Application | A-108 |
| HK活性测定 | 己糖激酶比色检测试剂盒 | BioVision | K789 |
| 线粒体呼吸 | Seahorse XF细胞线粒体压力测试试剂盒 | Agilent Technologies | 103015-100 |
| 慢病毒包装 | FuGENE HD转染试剂 | Promega | E2311 |
| ViraPower包装混合物 | Thermo Fisher Scientific | K497500 | |
| EAE诱导 | MOG35-55肽 | Genemed Synthesis | 110582 |
| 百日咳毒素 | List Biological Laboratories | 180 | |
| 不完全弗氏佐剂 | BD Bioscience | 263910 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| EAE诱导与Miglustat给药 | 小鼠品系(NOD/ShiLtJ或C57BL/6J)、性别和年龄(8-10周龄雌性)、MOG35-55剂量(150 μg)、百日咳毒素剂量(200 ng,第0和2天)、Miglustat口服剂量(600 mg/kg)及起始时间(EAE诱导后第23天) 阅读提示:STAR Methods中“EAE induction and treatment”小节 |
| 星形胶质细胞特异性shRNA敲低 | 慢病毒载体(pLenti-GFAP-EGFP-mir30-shRNA)、注射时间点(NOD EAE第37和44天)、注射剂量(10 μL,10^7 IU)、注射坐标(侧脑室) 阅读提示:STAR Methods中“In vivo knockdown with shRNA lentivirus”小节 |
| 体外星形胶质细胞刺激与抑制剂处理 | LacCer浓度(10 μM)、cPLA2i Pyrrophenone浓度(500 nM或1 μM)、Miglustat浓度(100 μM)、TNFα/IFNγ浓度(10 ng/ml和100 ng/ml)、预处理时间(30分钟)和刺激时间(18小时) 阅读提示:STAR Methods中“Mouse astrocyte stimulation”和“Human astrocyte stimulation”小节 |
| MAVS寡聚化与CoIP分析 | MAVS寡聚化检测方法(SDD-AGE)、CoIP所用抗体(anti-MAVS rabbit mAb #4983)、过表达质粒转染比例(cPLA2:MAVS=1:1或4:1) 阅读提示:STAR Methods中“Co-immunoprecipitation (Co-IP)”和“SDD-AGE”小节 |
| 乳酸释放与线粒体代谢测定 | 培养基葡萄糖浓度(1 mM)、预处理时间(30分钟)、刺激时间(1小时)、乳酸检测试剂盒(L-lactate assay kit #A-108)、Seahorse分析细胞数(70,000/24孔或30,000/96孔) 阅读提示:STAR Methods中“Lactate release measurement”和“Oxygen consumption”小节 |