寄生虫分离与鉴定
从野生小鼠获得自然感染小鼠的隐孢子虫并鉴定物种。
从美国乔治亚州雅典农场收集小鼠粪便,纯化卵囊,经漂白处理后在隔离环境中经口灌胃感染成年C57BL/6小鼠,连续传代三次,并通过18S rRNA测序和系统发育分析鉴定为C. tyzzeri UGA55。
A Genetically Tractable, Natural Mouse Model of Cryptosporidiosis Offers Insights into Host Protective Immunity.
包含体外寄生虫培养、免疫健全及基因敲除小鼠体内感染模型、CRISPR基因编辑、流式细胞术和疫苗实验,具备功能与机制验证。
免疫健全C57BL/6小鼠 Ifng-/-小鼠 Rag1-/-小鼠 Cryptosporidium tyzzeri UGA55株
C57BL/6小鼠经口灌胃接种10,000个C. tyzzeri卵囊 Ifng-/-小鼠接种10,000个C. tyzzeri卵囊后早期寄生虫负荷较野生型高约100倍 Rag1-/-和Foxn1nu裸鼠感染后无法清除寄生虫,呈慢性感染 初次感染后4周以100,000个转基因C. tyzzeri卵囊进行二次攻击 300 Gy伽马辐照减毒卵囊疫苗可诱导与活感染相当的免疫保护
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从野生小鼠获得自然感染小鼠的隐孢子虫并鉴定物种。
从美国乔治亚州雅典农场收集小鼠粪便,纯化卵囊,经漂白处理后在隔离环境中经口灌胃感染成年C57BL/6小鼠,连续传代三次,并通过18S rRNA测序和系统发育分析鉴定为C. tyzzeri UGA55。
获得C. tyzzeri基因组序列并比较其与人类感染相关物种的相似性。
对C. tyzzeri UGA55进行全基因组测序、de novo组装和注释,并与C. parvum、C. hominis和C. muris基因组比较,分析共线性、SNP密度和系统发育关系。
评估C. tyzzeri感染引起的肠道病理变化是否类似人类疾病。
C57BL/6小鼠感染C. tyzzeri后,通过qPCR检测肠道各段寄生虫负荷,并通过H&E染色组织学评分分析小肠病理变化。
构建可追踪的转基因寄生虫以用于体内免疫学研究。
利用CRISPR/Cas9驱动的同源重组策略,将包含新霉素磷酸转移酶、红移萤火虫荧光素酶和mCherry的报告基因盒插入C. tyzzeri胸苷激酶位点,经巴龙霉素体内筛选获得转基因株Ct-LC。
确定IFN-γ和T细胞在控制C. tyzzeri感染中的作用。
比较C57BL/6野生型、Ifng-/-、Rag1-/-、μMt-和Foxn1nu小鼠感染C. tyzzeri后的寄生虫负荷和清除能力,并通过流式细胞术分析感染肠上皮细胞的MHC表达。
测试初次感染和减毒疫苗是否能诱导对二次攻击的抵抗力。
小鼠经活卵囊或热灭活卵囊初次感染,4周后以转基因Ct-LC进行二次攻击;另用伽马辐照减毒卵囊疫苗免疫,并在野生型、Rag1-/-和Ifng-/-小鼠中评估保护效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 粪便DNA提取 | 粪便/土壤微生物DNA快速提取试剂盒 | Zymo Research | D6010 |
| 卵囊纯化 | 抗隐孢子虫磁珠 | Thermofisher | 73011 |
| 组织DNA提取 | DNeasy血液与组织DNA提取试剂盒 | Qiagen | 69504 |
| 流式细胞术 | 抗I-A/I-E抗体 | BioLegend | Clone M5/114.15.2; RRID: AB_2565976 |
| 抗EpCAM抗体 | BioLegend | Clone G8.8; RRID: AB_1134105 | |
| 抗H-2Db抗体 | BioLegend | Clone KH95; RRID: AB_313510 | |
| 抗CD45.2抗体 | eBioscience | Clone 104; RRID: AB_2534956 | |
| 抗H-2Kb抗体 | BD Biosciences | Clone AF6-88.5; RRID: AB_394927 | |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488鬼笔环肽 | Thermofisher | A12379; RRID: AB_2315147 |
| 大鼠单克隆抗mCherry抗体 | Thermofisher | Clone 16D7; RRID: AB_2536611 | |
| 山羊抗大鼠多克隆Alexa Fluor 594抗体 | Thermofisher | A-11007; RRID: AB_10561522 | |
| 活体成像 | D-荧光素 | Gold Biotechnology | -- |
| IVIS Lumina II活体成像系统 | Caliper Life Sciences | Lumina II | |
| qPCR | SsoAdvanced通用探针预混液 | BioRad | -- |
| ViiA 7实时荧光定量PCR系统 | Thermofisher | -- | |
| 流式细胞术 | LSRFortessa流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 寄生虫减毒 | 137-Cs辐照仪 | J.L Shepard | Mark1-30 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠感染模型 | 小鼠品系(C57BL/6、Ifng-/-、Rag1-/-、μMt-、Foxn1nu)、性别(雌性)、年龄(4-8周)、感染剂量(10,000或50,000个卵囊)、感染途径(经口灌胃) 阅读提示:STAR Methods中Experimental Model and Subject Details及图注Figure 3、5 |
| 转基因寄生虫构建 | 电转染程序(EH100)、质粒用量(每种50 μg)、巴龙霉素筛选浓度(16 mg/mL饮水)、宿主(Ifng-/-小鼠) 阅读提示:STAR Methods中Generation of Transgenic Parasites |
| 二次攻击实验 | 初次感染剂量(文中未明确说明)、二次攻击剂量(100,000个转基因卵囊)、攻击间隔(4周)、监测方法(活体成像) 阅读提示:Figure 6图注及Results中“Primary Infection and Vaccination Induce Resistance to Subsequent Challenge” |
| 疫苗实验 | 辐照剂量(200、300 Gy及以上)、免疫次数(单次或多次)、攻击剂量(100,000个转基因卵囊)、评估小鼠品系(C57BL/6、Rag1-/-、Ifng-/-) 阅读提示:Figure 6图注及Results中疫苗接种部分 |
| 免疫细胞功能验证 | 流式抗体克隆号及荧光标记、组织消化条件(37°C 25分钟,5 mM EDTA和1 mM DTT)、检测指标(EpCAM、MHC I、MHC II) 阅读提示:STAR Methods中Flow Cytometry及图注Figure 4F和4G |