构建MYCN过表达的人神经上皮干细胞模型
验证MYCN能否转化人iPSC来源NES和原代hbNES细胞。
用慢病毒过表达MYCNT58A或MYCNWT,经Blasticidin筛选,qRT-PCR检测MYCN表达。
Humanized Stem Cell Models of Pediatric Medulloblastoma Reveal an Oct4/mTOR Axis that Promotes Malignancy.
包含体外细胞模型、原位移植瘤模型、PDX及组学分析,并有POU5F1功能验证和mTOR抑制体内验证
人iPSC来源NES细胞(NES-1、NES-2) 人胚胎后脑来源hbNES细胞(hbNES-1、hbNES-2) 原位移植瘤小鼠模型 SHH髓母细胞瘤PDX模型
MYCNT58A或MYCNWT慢病毒过表达后表达水平为亲本细胞的15–30倍(qRT-PCR,n=3) 原位移植100,000个细胞至小脑,监测肿瘤潜伏期和生物发光 POU5F1过表达后检测p-4E-BP1及肿瘤潜伏期和转移 INK128 1 mg/kg或0.5 mg/kg每日腹腔注射,监测肿瘤生长和生存 mTOR抑制剂体外处理72小时,检测细胞活力、迁移和p-4E-BP1
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证MYCN能否转化人iPSC来源NES和原代hbNES细胞。
用慢病毒过表达MYCNT58A或MYCNWT,经Blasticidin筛选,qRT-PCR检测MYCN表达。
比较不同来源细胞转化后的肿瘤潜伏期和转移表型。
将表达MYCN的细胞注射到裸鼠小脑,用荧光素酶成像监测肿瘤,组织学检查脑和脊髓。
确认肿瘤具有SHH髓母细胞瘤的组织学和分子特征。
H&E、免疫组化检测Ki67、caspase-3、V5、Synaptophysin等;RNA测序和甲基化谱分析。
验证Oct4是否促进肿瘤恶性及mTOR激活。
在NES-2和hbNES-1肿瘤细胞中过表达POU5F1,检测p-4E-BP1,原位移植观察潜伏期和转移。
评估mTOR抑制对SHH MB生长、转移和生存的影响。
体外用AZD2014、GDC-0084、INK128处理肿瘤细胞;体内用INK128腹腔注射治疗原位移植瘤小鼠。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 重组人EGF | Peprotech | AF-100-15 |
| 重组人碱性FGF | Peprotech | AF-100-18B | |
| 层粘连蛋白 | Sigma-Aldrich | L2020-1MG | |
| 多聚-L-鸟氨酸 | Sigma-Aldrich | P3655-500MG | |
| 病毒转导 | 线性聚乙烯亚胺MW 25,000 | Polysciences | 23966-2 |
| 药物处理 | INK128 | Selleckchem | S2811 |
| AZD2014 | Selleckchem | S2783 | |
| GDC-0084 | Selleckchem | S8163 | |
| JQ1 | From James Bradner Lab | Gift | |
| SAG | Selleckchem | S7779 | |
| SANT-1 | Selleckchem | S7092 | |
| 细胞活力检测 | 刃天青 | Sigma-Aldrich | R7017 |
| Western blot | 兔抗4E-BP1单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 9644 |
| 兔抗磷酸化4E-BP1单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 2855 | |
| 免疫组化 | 兔抗Ki67抗体 | Abcam | ab16667 |
| 兔抗切割型Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 | |
| 免疫荧光 | 兔抗Oct-4抗体 | Cell Signaling Technology | 2750 |
| 流式细胞分析 | FxCycle PI/RNase染色液 | Thermo Fisher Scientific | F10797 |
| qRT-PCR | SYBR Green PCR预混液 | Thermo Fisher Scientific | 4368706 |
| SuperScript VILO cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 11754050 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| MYCN过表达细胞模型建立 | 慢病毒载体类型(pLenti6.3/TO/V5-MYCN-T58A或WT)、感染复数(文中未明确说明)、Blasticidin筛选浓度(文中未明确说明)及筛选时间72h 阅读提示:Methods “Viral Constructs and Cell Transductions”小节 |
| 原位移植瘤模型 | 小鼠品系(Athymic Nude)、周龄6-7周、性别雌性、细胞数量100,000、注射坐标和角度、监测终点 阅读提示:Methods “Model Establishment”小节及“Animals”小节 |
| POU5F1过表达功能验证 | POU5F1慢病毒滴度(文中未明确说明)、过表达效率验证方法、移植前传代数3代 阅读提示:Methods “Viral Constructs and Cell Transductions”及Results对应段落 |
| mTOR抑制剂体内治疗 | INK128剂量1mg/kg或0.5mg/kg、给药途径腹腔注射、给药持续时间8天或30天、随机分组依据生物发光信号、每组n=5-6 阅读提示:Methods “In Vivo Inhibition of mTOR Signaling”小节及Figure 7图注 |
| 体外药物敏感性检测 | 细胞接种密度10,000/孔、药物浓度500nM、处理时间72h、活力检测试剂resazurin、复孔数三复孔 阅读提示:Methods “Cell Proliferation, Migration and Inhibition Assays”小节 |