临床样本分析
检测OSA、动脉粥样硬化合并OSA患者及健康对照中外周血HMGB1和RAGE表达差异
收集外周血样本,ELISA检测血清HMGB1,Western blot检测白细胞中RAGE蛋白表达。
Activation of the High Mobility Group Box 1/Receptor for Advanced Glycation Endproducts /NOD-like Receptor Family Pyrin Domain-Containing 3 Axis Under Chronic Intermittent Hypoxia Induction Promotes the Progression of Atherosclerosis in ApoE-/- Mice
包含临床患者样本、THP-1细胞与HUVEC细胞实验、ApoE-/-小鼠CIH模型等至少两个独立证据层级,并明确包含功能验证和机制验证。
THP-1人单核细胞系 人脐静脉内皮细胞(HUVEC) CIH诱导的ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化模型 OSA患者及动脉粥样硬化合并OSA患者外周血样本
CIH处理条件:O2浓度在0%和21%之间每30分钟循环,5% CO2,持续48小时 HMGB1抑制剂甘草酸(glycyrrhizin)浓度:20 μmol/L RAGE抑制剂FPS-ZM1浓度:1 μmol/L 小鼠造模:8周龄雄性ApoE-/-小鼠,高脂饮食,CIH处理1个月后给药,持续30天 细胞分组:明确了CIH、HMGB1、FPS-ZM1、glycyrrhizin及过表达NLRP3等处理组合
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测OSA、动脉粥样硬化合并OSA患者及健康对照中外周血HMGB1和RAGE表达差异
收集外周血样本,ELISA检测血清HMGB1,Western blot检测白细胞中RAGE蛋白表达。
探讨CIH对THP-1细胞和HUVECs中HMGB1表达及RAGE/NLRP3轴的影响
在Vivo 400低氧工作站中,将细胞暴露于间歇性低氧(O2在0-21%间每30分钟循环)48小时,并检测HMGB1甲基化、蛋白表达及下游通路。
验证HMGB1对RAGE/NLRP3轴的激活作用及抑制剂的影响
使用HMGB1、FPS-ZM1、glycyrrhizin处理或过表达NLRP3,Western blot检测RAGE、NLRP3、pro-caspase-1、cleaved caspase-1、ASC等蛋白表达。
评估HMGB1/RAGE/NLRP3轴对单核细胞趋化、黏附、跨内皮迁移及凋亡的影响
通过Transwell实验检测趋化,钙黄绿素标记检测黏附,跨内皮迁移实验评估迁移能力,流式细胞术检测细胞凋亡。
验证巨噬细胞来源泡沫细胞形成是否受HMGB1/RAGE/NLRP3轴调控
THP-1细胞经PMA诱导分化为巨噬细胞,用ox-LDL、CIH、HMGB1、glycyrrhizin或oe-NLRP3处理,油红O染色观察泡沫细胞形成。
验证HMGB1/RAGE/NLRP3轴在CIH诱导的ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化进展中的作用
建立CIH诱导的ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化模型,给予glycyrrhizin、FPS-ZM1、oe-NLRP3等处理,检测主动脉脂质沉积、凋亡、巨噬细胞浸润等指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | BioWhittaker; Lonza | -- |
| 内皮生长培养基 | Clonetics | -- | |
| 细胞处理 | 佛波酯 | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞外HMGB1 | Absin Bioscience | abs04694 | |
| FPS-ZM1 | R&D Systems | 6237/10 | |
| 甘草酸 | MCE | HY-N0184 | |
| 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | D2650 | |
| 低氧模型 | Vivo 400低氧工作站 | Biotrace | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 甲基化检测 | Takara MiniBEST通用基因组DNA提取试剂盒5.0版 | Takara | -- |
| EpiTect快速亚硫酸氢盐转化试剂盒 | Qiagen | 59824 | |
| MeltDoctor高分辨率熔解试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 4425557 | |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| PrimeScript逆转录试剂盒 | Takara | RR047A | |
| FAST SYBR Green PCR试剂盒 | Applied Biosystems | -- | |
| ABI PRISM 7500实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Solarbio | R0010 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce | 23225 | |
| Trans-Blot Turbo转印系统 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| HMGB1一抗 | Abcam | ab18256 | |
| RAGE一抗 | Abcam | ab37647 | |
| NLRP3一抗 | Abcam | ab263899 | |
| ASC一抗 | Abcam | ab151700 | |
| pro-caspase-1一抗 | Abcam | ab179515 | |
| cleaved caspase-1一抗 | Cell Signaling Technologies | #98033 | |
| ICAM-1一抗 | Abcam | ab109361 | |
| MCP-1一抗 | Abcam | ab9669 | |
| CCR2一抗 | Cell Signaling Technologies | #12199 | |
| VCAM-1一抗 | Abcam | ab134047 | |
| β-actin一抗 | Abcam | ab8226 | |
| HRP标记兔抗鼠IgG | Abcam | ab6728 | |
| HRP标记山羊抗兔IgG | Abcam | ab6721 | |
| 增强化学发光试剂 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| Transwell | Transwell小室(孔径8 μm) | Costar | -- |
| 黏附实验 | 钙黄绿素-AM | Invitrogen | -- |
| 跨内皮迁移 | 大鼠尾胶原 | BD Biosciences | -- |
| ELISA | HMGB1 ELISA试剂盒 | IBL | REHM120 |
| IL-1β ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY410 | |
| TNF-α ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY410 | |
| 流式细胞术 | FACS Calibur流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| BD LSR II流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 凋亡检测 | Alexa Fluor 488 Annexin V/碘化丙啶凋亡检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 动物实验 | OxyCycle A84低氧系统 | BioSpherix | -- |
| ApoE基因敲除小鼠 | HFKBIO Co., Ltd. | -- | |
| 扫描电镜 | 扫描电子显微镜 | Hitachi | -- |
| 苏丹IV染色 | 正置金相显微镜 | Leica Biosystems | -- |
| 油红O染色 | 油红O | Sigma | -- |
| 异丙醇 | Sinopharm | -- | |
| 光学显微镜 | Olympus | -- | |
| 免疫荧光 | CD11b抗体 | Proteintech Group | -- |
| F4/80抗体 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| FITC标记二抗 | Beyotime | -- | |
| Cy3标记二抗 | Beyotime | -- | |
| DAPI | Beyotime | -- | |
| TUNEL染色 | 蛋白酶K | 文中未明确说明 | -- |
| 统计分析 | SPSS 21.0统计软件 | IBM | -- |
| G power 3.1.9.7软件 | 文中未明确说明 | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | 患者诊断标准(OSA经多导睡眠监测,AS经冠脉造影等)、年龄、性别比例、样本量 阅读提示:Methods: Clinical Sample Collection |
| 细胞培养 | 培养基类型、血清浓度、培养条件(37°C,5% CO2)、细胞系来源 阅读提示:Methods: Cell Culture and Treatment |
| CIH细胞模型 | O2浓度循环(0-21%每30分钟)、处理时间(48小时)、CO2浓度(5%) 阅读提示:Methods: Construction of the In Vitro CIH Cell Model |
| 药物处理 | HMGB1浓度(50 ng/mL)、FPS-ZM1浓度(1 μmol/L)、glycyrrhizin浓度(20 μmol/L)、溶剂(ddH2O或DMSO)、处理时间(24小时) 阅读提示:Methods: Cell Culture and Treatment |
| 动物模型 | 小鼠品系(ApoE-/-,8周龄雄性)、饲养条件(高脂饮食,温度、湿度)、CIH循环参数(FiO2降至5-6%,每180秒循环,每日9am-9pm)、给药方案(glycyrrhizin 30 mg/kg腹腔注射,FPS-ZM1 1 mg/kg腹腔注射,oe-NLRP3 20 μg静脉注射,每天一次,持续30天) 阅读提示:Methods: Construction of a CIH Mouse Model and Animal Grouping |