肠道微生物来源的谷氨酰胺通过巨噬细胞代谢重编程减轻肝脏缺血/再灌注损伤

Gut Microbiota-Derived Glutamine Attenuates Liver Ischemia/Reperfusion Injury via Macrophage Metabolic Reprogramming

作者信息Tianfei Lu, Qing Li, Weiwei Lin, Xianzhe Zhao, Fu Li, Jianmei Ji, Yu Zhang, Ning Xu
PMID36706918
发布时间2023
DOI10.1016/j.jcmgh.2023.01.004

实验完整度

包含体内小鼠模型(抗生素预处理、FMT、药物干预)、体外BMDM细胞实验、多组学分析(16S rRNA、代谢组学)及功能机制验证。

主要模型

C57BL/6小鼠肝脏缺血/再灌注模型 无菌小鼠粪菌移植模型 小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDM)体外模型

重点核对

抗生素混合物(万古霉素、氨苄青霉素、卡那霉素、甲硝唑)处理时间及剂量 粪菌移植的粪便剂量、灌胃时间点与天数 DM-αKG(6 mg/kg或60 mg/kg)和寡霉素A(0.5 mg/kg)的给药剂量、途径与时间 肝脏I/R模型的缺血时限(90分钟)和再灌注时间点(0、1、3、6小时) BMDM的极化诱导条件(IL-4 20 ng/mL、LPS 10 ng/mL)及αKG(1 μmol/L)和寡霉素A(5 μmol/L)浓度

摘要

背景与目的:许多研究揭示了肠道微生物及其代谢物在肝脏疾病进展中的关键作用。然而,它们对肝脏缺血/再灌注(I/R)损伤影响的机制仍 largely 未知。在此,我们研究了肠道微生物及其代谢物在肝脏 I/R 损伤中的功能。方法:C57BL/6 小鼠用抗生素混合物预处理。然后,我们使用多组学检测方法,包括 16s rRNA 测序、超高效液相色谱-串联质谱(UPLC–MS/MS),探索粪便和门静脉血中肠道微生物和代谢物的变化,以揭示它们在肝脏 I/R 损伤中的保护机制。结果:我们发现抗生素预处理(ABX)能显著降低 I/R 诱导的肝损伤严重程度,且这种效应可通过粪菌移植(FMT)转移至无菌小鼠,表明肠道微生物耗竭具有保护作用。在 I/R 期间,ABX 小鼠中肠道微生物来源的谷氨酰胺下游产物——血清 α-酮戊二酸(αKG)生成率和谷氨酸减少率更为显著。然后,我们证明 αKG 能通过氧化磷酸化促进替代性(M2)巨噬细胞活化,而寡霉素 A 能抑制 M2 巨噬细胞极化并逆转这种保护效应。结论:这些发现表明,肠道微生物及其代谢物通过调节巨噬细胞代谢重编程在肝脏 I/R 损伤中发挥关键作用。针对巨噬细胞代谢的潜在疗法,包括抗生素疗法和新型免疫代谢调节剂,可用于治疗肝脏 I/R 损伤。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
肠道微生物及其代谢物在肝脏缺血/再灌注损伤中发挥的作用及其潜在机制是什么?
核心机制
肠道微生物来源的谷氨酰胺经肠道吸收后,通过谷氨酰胺分解产生αKG进入血清,αKG通过促进氧化磷酸化(OXPHOS)代谢途径驱动巨噬细胞向M2表型极化,从而减轻肝脏I/R损伤。
主要证据
抗生素预处理减少粪便微生物并升高粪便谷氨酰胺及血清αKG,FMT转移保护表型;αKG补充剂量依赖性(60 mg/kg)降低血清ALT并增加CD68+/CD163+ M2巨噬细胞;寡霉素A抑制OXPHOS逆转抗生素保护效应及M2极化的增加。
研究意义
揭示了肠道微生物-代谢物-巨噬细胞代谢重编程在肝脏I/R损伤中的关键作用,为靶向巨噬细胞代谢(包括抗生素疗法和新型免疫代谢调节剂)治疗肝脏I/R损伤提供潜在策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

构建抗生素预处理模型

验证肠道微生物耗竭对肝脏I/R损伤的影响

C57BL/6小鼠饮用含万古霉素、氨苄青霉素、卡那霉素和甲硝唑各1 g/L的饮用水4周,随后进行肝脏I/R手术,检测血清ALT、炎症因子表达及肝脏组织病理变化。

2

粪菌移植验证肠道微生物作用

排除抗生素直接作用,验证改变的肠道微生物能否转移保护效应

收集抗生素预处理小鼠(D-ABX)和对照小鼠(D-WT)的粪便,通过灌胃移植至无菌小鼠(R-ABX和R-WT),7天内第1天和第3天灌胃200 μL细菌上清,后进行肝脏I/R手术,评估肝损伤指标。

3

多组学分析检测微生物和代谢物变化

鉴定抗生素处理后肠道微生物组成和粪便、血清代谢物的变化

通过16S rRNA测序分析粪便微生物组成和多样性;通过UPLC-MS/MS进行靶向代谢组学,检测粪便、血清中氨基酸、有机酸等代谢物水平,关注谷氨酰胺和αKG。

4

谷氨酰胺补充实验

验证谷氨酰胺是否单独足以模拟抗生素的保护效应

对小鼠进行不同时间(1、3、5、7天)的谷氨酰胺灌胃(25 mg/kg),后进行肝脏I/R手术,检测血清ALT水平。

5

αKG剂量效应实验

评估外源性αKG对肝脏I/R损伤的保护作用及对巨噬细胞极化的影响

在I/R手术前1小时,腹腔注射DM-αKG(6或60 mg/kg)或PBS,检测血清ALT、肝脏病理、M2巨噬细胞(CD68+/CD163+)数量及M1/M2标志物表达。

6

体外BMDM极化实验

证明αKG直接促进巨噬细胞M2极化和抑制M1极化,并验证OXPHOS机制

分离小鼠BMDM,用IL-4(20 ng/mL)诱导M2或LPS(10 ng/mL)诱导M1,同时加入αKG(0.1、1、10 μmol/L)或寡霉素A(5 μmol/L),检测ATP水平和M1/M2标志物表达。

7

寡霉素A抑制OXPHOS验证机制

验证αKG通过OXPHOS通路促进M2极化并介导保护效应

WT或ABX小鼠在I/R手术前1小时腹腔注射0.5 mg/kg寡霉素A,检测OXPHOS标志物表达、ADP/ATP比值、NAD+/NADH比值、肝损伤指标及M1/M2标志物表达。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
万古霉素Sigma Aldrich1404-93-9
卡那霉素Sigma Aldrich25389-94-0
甲硝唑Sigma Aldrich443-48-1
谷氨酰胺Sigma Aldrich1294808
二甲基α-酮戊二酸Sigma Aldrich349631
寡霉素AMedChemExpress1404-19-9
Dulbecco改良Eagle培养基(DMEM)----
胎牛血清----
L929细胞ATCCCCL1
脂多糖Sigma AldrichL2630
白细胞介素-4Bioconcept214-14
α-酮戊二酸Sigma Aldrich75890
CellTiter-Glo发光检测试剂盒PromegaG7570
TRIzol试剂Sigma Aldrich93289
PrimeScript逆转录试剂盒TakaraRR037Q
SYBR Premix Ex Taq试剂盒TakaraDRR420A
TUNEL检测试剂盒Abcamab66108
DAPITocris5748
MPO一抗Abcamab109116
cleaved caspase-3一抗Cell Signaling Technology9661
生物素化山羊抗兔IgGCell Signaling Technology7074
链霉亲和素-辣根过氧化物酶Sigma Aldrichab205718
CD68抗体Abcamab53444
CD163抗体Abcamab182422
CD86抗体Cell Signaling Technology19589
Alexa Fluor 488二抗Cell Signaling Technology4416
Alexa Fluor 546二抗Thermo Fisher ScientificA-21430
GLS2抗体Abcamab113509
GLUD抗体Cell Signaling Technology12793
Cy3二抗Abcamab97075
Alexa Fluor 488二抗Abcamab150077
QIAamp Fast DNA粪便微型试剂盒Qiagen51604
NanoDrop 2000分光光度计Thermo Scientific--
AxyPrep DNA凝胶提取试剂盒Axygen BiosciencesAP-GX-250
QuantiFluor-ST荧光计Promega--
Illumina MiSeq系统Illumina--
ACQUITY UPLC-Xevo TQ-SWaters Corp--
ACQUITY HPLC BEH C18 1.7 μm VanGuard预柱Waters--
ACQUITY HPLC BEH C18 1.7 μm分析柱Waters--
Biomek 4000工作站Beckman Coulter--
Eppendorf epMotion工作站Eppendorf--
Allegra X-15R离心机Beckman Coulter--
共聚焦显微镜LSM-710Zeiss--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
小鼠模型与抗生素处理
抗生素种类及浓度(万古霉素、氨苄青霉素、卡那霉素、甲硝唑各1 g/L),处理时长(4周),小鼠品系(C57BL/6JGpt雄性8-10周龄)
阅读提示:Methods中的Mice部分
肝脏I/R手术
缺血时长(90分钟),再灌注时间点(0、1、3、6小时),麻醉及手术细节
阅读提示:Methods中的Liver Ischemia and Reperfusion Surgery部分
粪菌移植
粪便用量(100 mg/mL),灌胃体积(200 μL),灌胃时间(第1、3天),受体为无菌小鼠
阅读提示:Methods中的Mice部分和FMT描述
药物干预
DM-αKG剂量(6、60 mg/kg),寡霉素A剂量(0.5 mg/kg),给药途径(腹腔注射),给药时间(术前1小时)
阅读提示:Methods中的Liver Ischemia and Reperfusion Surgery部分
体外BMDM极化
BMDM分化条件(DMEM+10%FBS+20%L929上清,7天),极化刺激(IL-4 20 ng/mL或LPS 10 ng/mL,6小时),αKG浓度(0.1、1、10 μmol/L),寡霉素A浓度(5 μmol/L)
阅读提示:Methods中的Cell部分
代谢组学检测
样本制备步骤,UPLC-MS/MS型号(ACQUITY UPLC-Xevo TQ-S),色谱柱,梯度洗脱程序,质谱参数
阅读提示:Methods中的Metabolomics和UPLC-MS/MS部分
统计分析
各组样本量(具体在图例中,如WT Sham n=4, WT IRI n=10等),统计方法(Student t检验、Wilcoxon检验、Kruskal-Wallis H检验、ANOSIM)
阅读提示:Methods中的Quantification and Statistical Analysis部分及各个图例