建立Tet2/Nras双突变小鼠模型
验证Tet2缺失与NrasG12D在造血细胞中是否协同诱导髓系转化。
将Mx1-Cre;Tet2f/f与Mx1-Cre;NrasG12D小鼠杂交生成Tet2−/−NrasG12D小鼠,PIPC注射诱导基因重组,观察生存、血常规、流式免疫表型及组织病理。
Cooperative Epigenetic Remodeling by TET2 Loss and NRAS Mutation Drives Myeloid Transformation and MEK Inhibitor Sensitivity.
包含条件敲入小鼠模型、连续移植、体外细胞系敲低、患者原代样本及Spry2回补功能验证等多层级证据
Mx1-Cre;Tet2f/f;NrasG12D小鼠(Tet2−/−NrasG12D) NrasG12D单突变小鼠及Tet2−/−单突变小鼠 人AML细胞系THP-1、OCI-AML3、MOLM13 NRASG12D突变MDS及TET2/NRAS双突变AML患者骨髓样本
Mx1-Cre;Tet2f/f与Mx1-Cre;NrasG12D小鼠杂交,PIPC注射诱导基因重组,至少3个月后用于实验 连续移植:2×10^6供体脾细胞混合1×10^6竞争骨髓细胞尾静脉注射至致死照射CD45.1宿主 Binimetinib 20 mg/kg BID口服灌胃;selumetinib 25 mg/kg QD;PD-0325901 5 mg/kg QD;5-Aza 5 mg/kg IP每日 体外集落形成实验:10,000细胞/孔,GM-CSF或IL-3浓度0、0.1、1、10 ng/mL,第7天计数 细胞活力实验:脾Mac1+细胞3×10^4细胞/孔,binimetinib系列浓度处理48或72小时,CellTiter Glo检测ATP
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Tet2缺失与NrasG12D在造血细胞中是否协同诱导髓系转化。
将Mx1-Cre;Tet2f/f与Mx1-Cre;NrasG12D小鼠杂交生成Tet2−/−NrasG12D小鼠,PIPC注射诱导基因重组,观察生存、血常规、流式免疫表型及组织病理。
验证双突变细胞能否在受体内传播CMML并增强干细胞竞争能力。
将供体脾细胞或骨髓LSK细胞移植至致死或亚致死照射受体,进行原代、二次移植及竞争性重建实验,监测生存、脾重、供体来源细胞嵌合及病理。
探究双突变是否协同增强Ras-MAPK信号及对GM-CSF的反应。
磁珠分选Mac1+细胞,Western blot检测pErk1/2、pAkt等,磷酸化流式检测pErk、pAkt、pS6,免疫荧光检测肝组织pErk1/2,GM-CSF刺激后检测信号及甲基纤维素集落形成。
明确Tet2缺失是否通过抑制MAPK负调控因子(尤其Spry2)增强Ras信号。
RT-qPCR检测Dusp/Spry家族mRNA,Western blot检测Spry2蛋白,亚硫酸氢盐测序检测Spry2启动子CpG岛甲基化。
验证Spry2沉默对双突变细胞信号、自我更新和白血病起始能力的功能贡献。
在Tet2−/−NrasG12D骨髓细胞中过表达Spry2或对照,检测蛋白、连续再铺板、信号及移植后供体细胞植入;在NrasG12D细胞中敲低Spry2,检测信号与再铺板能力。
验证Tet2/Nras双突变白血病对MEK抑制是否优先敏感。
体外用binimetinib处理双突变与单突变细胞检测活力与IC50;体内用binimetinib、selumetinib、PD-0325901治疗移植白血病小鼠,检测生存、脾重、病理、白血病负荷及血常规。
在人白血病背景下验证TET2失活与NRAS突变协同增强MEK抑制敏感性。
在THP-1、OCI-AML3、MOLM13细胞中敲低TET2,检测信号、分化、生长、凋亡与细胞周期;用患者骨髓单个核细胞进行集落形成实验检测binimetinib敏感性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 流式分析 | FITC抗小鼠CD11b抗体 | BioLegend | 101205 |
| PE抗小鼠Gr-1抗体 | BioLegend | 108407 | |
| PE抗小鼠CD71抗体 | BioLegend | 113807 | |
| APC抗小鼠Ter119抗体 | BioLegend | 116211 | |
| PE抗小鼠CD117/cKit抗体 | BioLegend | 105807 | |
| PE/Cy7抗小鼠Sca-1抗体 | BioLegend | 108113 | |
| PE抗小鼠CD150抗体 | eBioscience | 12-1502-82 | |
| PerCP/Cy5.5抗小鼠CD48抗体 | BioLegend | 103421 | |
| eFluor 450抗小鼠CD16/32抗体 | eBioscience | 48-0161-82 | |
| eFluor 450抗小鼠CD45.1抗体 | eBioscience | 48-0453-82 | |
| PE/Cy7抗小鼠CD45.2抗体 | BioLegend | 109829 | |
| APC/Cy7抗小鼠CD45.2抗体 | BioLegend | 109823 | |
| PerCP/Cy5.5抗人CD14抗体 | eBioscience | 45-0149-42 | |
| APC抗人CD14抗体 | eBioscience | 17-0149-42 | |
| PE抗人CD15抗体 | BD Biosciences | 555402 | |
| 免疫组织化学 | 兔抗小鼠Ki-67抗体 | Abcam | ab16667 |
| Western blot | 兔抗小鼠/人pRaf1抗体 | Cell Signaling | 9427S |
| 兔抗小鼠/人Raf1抗体 | Cell Signaling | 9422S | |
| 兔抗小鼠/人pMek抗体 | Cell Signaling | 9121S | |
| 兔抗小鼠/人Mek抗体 | Cell Signaling | 8727S | |
| 兔抗小鼠/人pErk1/2抗体 | Cell Signaling | 4370S | |
| 兔抗小鼠/人Erk1/2抗体 | Cell Signaling | 9102S | |
| 兔抗小鼠/人pAkt抗体 | Cell Signaling | 4060S | |
| 兔抗小鼠/人Akt抗体 | Cell Signaling | 4691S | |
| 兔抗小鼠/人pS6抗体 | Cell Signaling | 2211S | |
| 兔抗小鼠/人S6抗体 | Cell Signaling | 2217S | |
| 兔抗小鼠/人Spry2抗体 | Cell Signaling | 13264 | |
| 兔抗小鼠/人Vinculin抗体 | Cell Signaling | 4650S | |
| 免疫荧光 | 兔抗小鼠CD11b(Mac1)抗体 | Abcam | ab133357 |
| 别藻蓝蛋白AffiniPure F(ab’)2片段驴抗兔IgG (H+L) | Jackson ImmunoResearch | 711-136-152 | |
| 山羊抗兔IgG与Alexa Fluor 488酪胺 | Invitrogen | T20922 | |
| 山羊抗小鼠IgG与Alexa Fluor 568酪胺 | Invitrogen | T20914 | |
| 药物处理 | Binimetinib | ChemieTek | CT-A162 |
| Selumetinib | ChemieTek | CT-A6244 | |
| PD-0325901 | ChemieTek | CT-PD03 | |
| 5-阿扎胞苷 | Sigma | A2385 | |
| 细胞培养与集落形成 | MethoCult GF M3434甲基纤维素培养基 | StemCell Technologies | 03434 |
| 集落形成 | MethoCult M3231甲基纤维素培养基 | StemCell Technologies | 03231 |
| MethoCult H4230甲基纤维素培养基 | StemCell Technologies | 04230 | |
| 细胞因子刺激 | 重组小鼠GM-CSF | Peprotech | 315-03 |
| 重组小鼠IL-3 | Peprotech | 213-13 | |
| 重组小鼠SCF | Peprotech | 250-03 | |
| 重组人GM-CSF | Peprotech | 300-03 | |
| 重组人IL-6 | Peprotech | 200-06 | |
| 流式分析 | 固定/透化溶液试剂盒 | BD Biosciences | 554714 |
| 细胞周期分析 | PE小鼠抗Ki-67抗体套装 | BD Biosciences | 556027 |
| 细胞周期与凋亡分析 | FIX & PERM细胞透化试剂盒 | Invitrogen | GAS004 |
| 凋亡分析 | PE Annexin V凋亡检测试剂盒I | BD Biosciences | 559763 |
| Mac1+细胞分选 | EasySep小鼠PE阳性选择试剂盒 | StemCell Technologies | 18554 |
| 活性Ras检测 | 活性Ras Pull-Down与检测试剂盒 | Fisher | 16117 |
| RNA提取 | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | 74104 |
| RNeasy Micro试剂盒 | Qiagen | 74004 | |
| cDNA合成 | Verso cDNA合成试剂盒 | Fisher | AB1453A |
| DNA/RNA提取 | AllPrep DNA/RNA Micro试剂盒 | Qiagen | 80284 |
| 亚硫酸氢盐转换 | EZ DNA甲基化试剂盒 | Zymo Research | D5001 |
| 亚硫酸氢盐测序克隆 | TOPO TA测序克隆试剂盒 | Invitrogen | 450071 |
| 细胞活力检测 | CellTiter-Glo发光法细胞活力检测 | Promega | G7571 |
| RT-qPCR | VeriQuest Fast SYBR Green qPCR预混液 | Affymetrix | 75675 |
| 病毒转导 | 聚凝胺 | American Bio | AB01643 |
| 基因重组诱导 | 聚肌苷酸-聚胞苷酸 | Amersham | 27-4732-01 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型建立与基因重组 | 小鼠品系背景(C57BL/6)、PIPC注射周龄(4–6周)、重组确认时间(注射后2周)、实验起始时间(至少3个月后)及性别 阅读提示:STAR Methods中Transgenic Animals小节 |
| 骨髓移植与连续移植 | 供体细胞类型与数量、竞争细胞数量、照射剂量(2×550 Rad或600 rads或450 rads)、受体品系与周龄、移植途径及二次移植时间点 阅读提示:STAR Methods中Bone Marrow Transplantation小节 |
| MEK抑制剂体内治疗 | 药物剂量(binimetinib 20 mg/kg BID;selumetinib 25 mg/kg QD;PD-0325901 5 mg/kg QD)、给药途径(口服灌胃)、载体组成、治疗起始时间与持续时间 阅读提示:STAR Methods中In Vivo Treatment Studies小节及图5、图6、图S5图注 |
| 体外集落形成与细胞活力检测 | 细胞接种密度(10,000细胞/孔或3×10^4细胞/孔)、细胞因子浓度(GM-CSF或IL-3 0、0.1、1、10 ng/mL)、药物浓度范围、培养天数(7天或14天)、检测方法(ATP或计数)及重复数(三复孔) 阅读提示:STAR Methods中In Vitro Colony Forming Assays与Cell Viability Assay小节 |
| Spry2回补与敲低功能实验 | 载体系统(MIGR1-GFP或pMSCV.miRE.LEPG)、shRNA序列、转导方法、GFP+分选、移植细胞数量及宿主照射条件 阅读提示:STAR Methods中Vector Construction and Viral Transduction小节及图4图注 |