UBXN9调控GLUT4介导的RIG-I样受体空间禁锢与信号传导

UBXN9 governs GLUT4-mediated spatial confinement of RIG-I-like receptors and signaling.

作者信息Andrew G Harrison, Duomeng Yang, Jason G Cahoon, Tingting Geng, Ziming Cao, Timofey A Karginov, Youjia Hu, Xin Li, Conner C Chiari, Yibing Qyang, Anthony T Vella, Zhichao Fan, Sivapriya Kailasan Vanaja, Vijay A Rathinam, Carol A Witczak, Jonathan S Bogan, Penghua Wang
PMID39567760
发布时间2024-12
DOI10.1038/s41590-024-02004-7

实验完整度

高

包含C2C12、iPSC-CMs、3T3-L1等多种体外模型,Ubxn9和Slc2a4敲除小鼠体内模型,以及患者RNA-seq数据,并进行了功能与机制验证。

主要模型

C2C12小鼠成肌细胞 人iPSC来源心肌细胞 3T3-L1脂肪细胞 Ubxn9和Slc2a4基因敲除小鼠

重点核对

Ubxn9−/−和Slc2a4−/− C2C12细胞中3p-hpRNA或poly(I:C)刺激后Ifnb1 mRNA和IFN-β蛋白水平 EMCV感染后病毒滴度、病毒RNA载量及小鼠生存曲线 GLUT4与RIG-I共免疫沉淀及质膜组分中共定位 GLUT4缺失或UBXN9缺失对RIG-I-MAVS结合和MAVS寡聚化的影响 患者肌肉RNA-seq中SLC2A4表达与ISGs的相关性

摘要

细胞质RIG-I样受体(RLRs)识别病毒RNA并启动先天抗病毒免疫。RLR信号还通过葡萄糖转运体(GLUTs)触发糖酵解重编程,但其在抗病毒免疫中的作用尚不清楚。在此,我们揭示胰岛素响应性GLUT4在脂肪和肌肉组织中独立于葡萄糖摄取抑制RLR信号。在稳态下,GLUT4被泛素调节X结构域蛋白9(UBXN9,TUG)束缚在高尔基体基质上。RNA病毒感染后,GLUT4被释放并转位至细胞表面,在那里它空间隔离了大量胞质RLR,阻止它们激活IFN-β应答。UBXN9缺失促使GLUT4组成性转位、RLR隔离和抗病毒免疫减弱,而GLUT4缺失则增强RLR信号。值得注意的是,GLUT4表达降低独特地与以干扰素应答过度活跃为特征的人类炎性肌病相关。总之,我们的结果证明了一个非经典的UBXN9-GLUT4轴通过将胞质RLR系留于质膜来控制抗病毒免疫。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
GLUT4及其调控蛋白UBXN9是否以及如何调控RLR介导的抗病毒免疫应答。
核心机制
UBXN9将GLUT4束缚在高尔基体基质;病毒感染或胰岛素刺激后UBXN9被切割,GLUT4转位至质膜,通过其C端和loop 6与RLR的CARD结构域直接结合,将RLR系留在质膜,从而抑制RLR-MAVS信号和IFN-β产生。
主要证据
在C2C12、iPSC-CMs、3T3-L1及原代肌细胞中,UBXN9缺失或GLUT4缺失分别减弱或增强RLR信号;GLUT4与RIG-I共免疫沉淀和质膜共定位;GLUT4 ΔC42和ΔL6突变体丧失结合并抑制RLR的能力;RIG-I/MDA5 ΔCARD突变体丧失与GLUT4结合;EMCV感染小鼠中Ubxn9−/−小鼠病毒载量更高、IFN-β更低、生存率下降。
研究意义
揭示GLUT4独立于葡萄糖转运的非经典免疫功能,提出空间禁锢是调控RLR信号的主要策略;并提示GLUT4降低与人类炎性肌病中干扰素签名升高相关。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

建立UBXN9与RLR信号的功能关联

验证UBXN9是否调控RLR介导的IFN-β应答。

在C2C12细胞中敲除Ubxn9,用3p-hpRNA或poly(I:C)刺激,检测Ifnb1 mRNA、IFN-β分泌和IRF3磷酸化;在GLUT4阴性的BMDM和A549细胞中验证UBXN9效应。

2

验证GLUT4对RLR信号的抑制作用

确定GLUT4是否独立于UBXN9影响RLR信号。

在C2C12中敲除Slc2a4,在hiPSC-CMs中敲低SLC2A4,用3p-hpRNA、poly(I:C)或病毒感染,检测IFN-β应答和病毒复制。

3

排除葡萄糖摄取和乳酸的中介作用

检验GLUT4对RLR的抑制是否依赖其葡萄糖转运功能或乳酸积累。

检测Ubxn9−/−小鼠血糖和乳酸水平、细胞2-DG摄取;在Ldha+/+和Ldha−/−细胞中过表达GLUT4或敲低Ubxn9;使用葡萄糖转运抑制剂fasentin。

4

解析GLUT4将RLR系留于质膜的空间机制

确定GLUT4是否通过直接结合将RLR隔离在质膜。

用胰岛素或3p-hpRNA促进GLUT4转位,进行质膜分离、共免疫沉淀和共定位成像;构建GLUT4缺失突变体和RLR结构域突变体进行结合实验。

5

验证体内UBXN9对病毒感染的调控

评估UBXN9缺失对小鼠抗病毒免疫和病毒复制的影响。

用EMCV或ONNV感染Ubxn9+/+和Ubxn9−/−小鼠,监测生存率、病毒载量和IFN-β水平。

6

分析患者肌病中GLUT4与干扰素签名的关系

探究GLUT4表达降低是否与人类炎性肌病干扰素签名相关。

分析CIM和DM患者骨骼肌RNA-seq数据,比较SLC2A4表达与ISGs的相关性。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
他莫昔芬----
Choice Taq Blue MastermixDenville ScientificCB4065-8
基质胶Corning354234
II型胶原酶Gibco17101015
TransIT-X2动态递送系统Mirus BioMIR6005
5'三磷酸发夹RNAInvivoGentlrl-hprna
高分子量聚肌苷酸-聚胞苷酸InvivoGentlrl-pic
LumiKine Xpress小鼠IFN-β 2.0 ELISA检测试剂盒InvivoGenluex-mifnbv2
Pierce抗Myc磁珠Thermo Fisher Scientific88842
抗FLAG M2磁珠Sigma-AldrichM8823
CellBrite Fix 555质膜染料Biotium30088-T
Hoechst 33342Thermo Fisher Scientific62249
DAPIThermo Fisher ScientificD1306
2-NBDGCayman Chemical600470
Lactate-Glo检测试剂盒PromegaJ5021
SeaPlaque琼脂糖Lonza50100
fasentinR&D Systems6100/10
NativePAGE凝胶InvitrogenBN1004BOX
外表面GLUT4抗体(克隆LM048)Integral Molecular--
抗GLUT4抗体Thermo Fisher ScientificPA5-23052

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
RLR刺激与IFN-β检测
3p-hpRNA或poly(I:C)的转染浓度和刺激时间(图中标为12 h或6 h)
阅读提示:Methods“Ligand treatments”及图1、2、3图注
病毒感染
EMCV或VSV的MOI(0.1、0.5或1)和感染时间(12–48 h)
阅读提示:Methods“Cell culture and viruses”及各图图注
小鼠感染与生存分析
EMCV接种剂量(100 PFU/只用于生存,1,000 PFU/只用于IFN-β检测)和给药途径(腹腔注射)
阅读提示:Methods“Mouse infection and disease monitoring”及图1h–l图注
GLUT4转位诱导
胰岛素浓度(200 nM)和处理时间(10–20 min)
阅读提示:图4a、b及Extended Data Fig. 6图注
质膜分离与共免疫沉淀
质膜分离的离心条件及共免疫沉淀裂解缓冲液(2% DDM或1% Triton X-100)
阅读提示:Methods“Plasma membrane fractionation”和“Co-immunoprecipitation”