体内感染模型建立与表型分析
验证caspase-12在WNV感染体内模型中的作用
用WNV感染Casp12−/−和野生型小鼠,监测存活率、神经症状、病毒载量和细胞死亡
Caspase-12 controls West Nile virus infection via the viral RNA receptor RIG-I.
涵盖Casp12−/−小鼠体内感染模型、原代神经元和MEFs体外模型,并验证TRIM25介导RIG-I泛素化机制。
Casp12−/−小鼠与C57BL/6野生型小鼠 小鼠胚胎成纤维细胞(MEFs) 原代皮层神经元
Casp12−/−小鼠与野生型小鼠在WNV感染后的存活率、病毒载量和I型干扰素水平 MEFs中caspase-12缺失对WNV复制和I型干扰素产生的影响 RIG-I泛素化水平在Casp12−/−与野生型MEFs中的差异 TRIM25介导的RIG-I CARDs泛素化在Casp12−/−细胞中的降低 SeV(RIG-I激活病毒)与EMCV(Mda5激活病毒)感染在Casp12−/−MEFs中的差异应答
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证caspase-12在WNV感染体内模型中的作用
用WNV感染Casp12−/−和野生型小鼠,监测存活率、神经症状、病毒载量和细胞死亡
验证caspase-12对WNV感染后I型干扰素产生的影响
检测WNV感染小鼠血浆、外周组织和CNS中IFN-β蛋白及Ifna/Ifnb mRNA水平
在MEFs和原代神经元中验证caspase-12对WNV复制和I型干扰素应答的调控
WNV感染Casp12−/−和野生型MEFs及原代皮层神经元,检测病毒载量、IFN-β产生和RIG-I表达
验证caspase-12特异性调控RIG-I而非Mda5信号通路
用SeV(RIG-I激活)和EMCV(Mda5激活)感染Casp12−/−和野生型MEFs,检测病毒载量和IFN-β产生
验证caspase-12与RIG-I的物理互作及其对TRIM25介导RIG-I泛素化的调控
GST pull-down、免疫共沉淀、免疫荧光共定位、泛素化检测和TRIM25过表达实验
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Western blot | 兔抗GRP94抗体 | Cell Signaling Technology | 2104 |
| 兔抗PDI抗体 | Cell Signaling Technology | 2446 | |
| 兔抗ISG15抗体 | Cell Signaling Technology | 2743 | |
| 兔抗STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 9172 | |
| 兔抗RIG-I抗体 | Cell Signaling Technology | 3743 | |
| 抗Flag-辣根过氧化物酶 | Cell Signaling Technology | 2044 | |
| 抗β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 4968 | |
| 兔抗IRF7抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-9083 | |
| GST precipitation | 山羊抗GST抗体 | GE Healthcare | 27-4577-01 |
| Western blot | 兔抗TRIM25抗体 | Proteintech Group | 12573-1-AP |
| 抗V5标签-辣根过氧化物酶 | Invitrogen | R961-25 | |
| 山羊抗NS2b和NS3抗体 | R&D Systems | AF2907 | |
| 兔抗caspase-12抗体 | R&D Systems | AF1456 | |
| ELISA | IFN-β ELISA试剂盒 | R&D Systems | 41410 |
| 细胞处理 | 重组IFN-β | R&D Systems | 12400 |
| 细胞转染 | Neocleofector试剂盒 | Lonza | -- |
| 泛素化蛋白富集 | 多聚泛素化蛋白富集试剂盒 | EMD Biosciences | -- |
| 免疫荧光 | TRITC偶联抗WNV-E抗体 | L2 Diagnostics | -- |
| TUNEL检测 | TUNEL试剂盒 | Promega | -- |
| Caspase-3活性检测 | Caspase-3比色法检测试剂盒 | BioVision | -- |
| 细胞因子检测 | Bio-Plex珠基检测 | Bio-Rad | -- |
| 免疫沉淀 | M2琼脂糖珠 | Sigma-Aldrich | -- |
| GST沉淀 | 谷胱甘肽琼脂糖珠 | GE Healthcare | -- |
| 免疫沉淀洗脱 | Flag多肽 | Sigma-Aldrich | -- |
| 空斑试验 | 中性红 | Sigma-Aldrich | -- |
| Western blot | SuperSignal底物 | ThermoFisher Scientific | -- |
| 细胞处理 | MG132 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物感染模型 | 小鼠品系(C57BL/6和Casp12−/−)、年龄(8-12周)、性别匹配、WNV剂量(200 PFU皮下或1,500 PFU腹腔)、观察时间(20天) 阅读提示:Methods 'Animals and infection' 及 Figure 1a legend |
| 体外MEFs感染 | MEFs来源(胚胎day 14)、WNV MOI(1)、感染时间(0-48小时) 阅读提示:Results 'Caspase-12 facilitates the type I interferon response' 及 Figure 3 legend |
| 原代神经元感染 | 原代皮层神经元来源(胚胎day 16-18)、WNV MOI(1) 阅读提示:Methods 'Animals and infection' 及 Figure 2d legend |
| SeV和EMCV感染 | SeV MOI(1)、EMCV感染条件(文中未明确说明MOI) 阅读提示:Results 'Caspase-12 facilitates the type I interferon response' 及 Figure 3f legend |
| 泛素化检测 | MG132处理浓度(10 µM)和时间(0.5小时)、转染后感染时间(24小时) 阅读提示:Methods 'Biochemical assays' 及 Figure 6 legend |