BLyS受体表达谱分析
确定脾脏和骨髓B细胞亚群中BR3、TACI和BCMA的表达模式。
通过流式细胞术和实时定量PCR检测骨髓Hardy各组分及脾脏过渡期、滤泡和边缘区B细胞表面BR3、TACI、BCMA表达。
Tonic B cell antigen receptor signals supply an NF-kappaB substrate for prosurvival BLyS signaling.
包含NIH3T3细胞系、原代小鼠脾脏B细胞及TACI缺陷/Bcl-xL转基因小鼠模型,并进行p100/p52免疫印迹、存活及基因表达功能验证
NIH3T3成纤维细胞系(稳定表达BR3或TACI) 原代小鼠脾脏CD43−及CD23+ B细胞 TACI缺陷小鼠及Bcl-xL转基因小鼠B细胞 C57BL/6或BALB/cJ小鼠过渡期B细胞亚群(T1、T2、T3)
BLyS处理浓度与时间:100 ng/ml或60 ng/ml,0–24 h或72 h 抗IgM F(ab′)2刺激浓度:10 μg/ml Syk抑制剂I 10 μM、Syk抑制剂IV 50 nM、PP1 10 μM 放线菌酮处理浓度:10 μg/ml 细胞存活检测:TO-PRO-3排除法培养72 h
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定脾脏和骨髓B细胞亚群中BR3、TACI和BCMA的表达模式。
通过流式细胞术和实时定量PCR检测骨髓Hardy各组分及脾脏过渡期、滤泡和边缘区B细胞表面BR3、TACI、BCMA表达。
在缺乏其他NF-κB激活介导因子的背景下,单独评估BR3和TACI激活经典与非经典NF-κB通路的能力。
将BR3或TACI全长cDNA克隆入MigR1逆转录病毒载体,感染NIH3T3细胞,用BLyS或APRIL刺激后免疫印迹检测p100加工和经典NF-κB激活。
确定BR3信号在原代B细胞中激活非经典NF-κB通路的动力学及对p100的依赖。
CD43−脾脏B细胞用BLyS处理0–24 h,核质分离后免疫印迹检测p52、p65、p100;用放线菌酮阻断蛋白合成,或去除BLyS后追踪p100和p52变化。
验证BCR交联或tonic BCR信号是否是p100新合成的主要来源。
CD23+滤泡B细胞用抗IgM F(ab′)2刺激,或与BLyS共处理,免疫印迹检测p100和p52;使用Syk抑制剂I/IV和Src抑制剂PP1阻断BCR信号,检测p100维持及p52核积累。
验证BCR信号维持的p100是否为BLyS介导的长期存活和促存活基因表达所必需。
CD23+ B细胞在BLyS或抗CD40存在下,加或不加Syk/Src抑制剂培养72 h,TO-PRO-3排除法检测存活;实时PCR检测Pim2和Bcl-xL mRNA。
确定BCR诱导p100的能力是否随过渡期B细胞分化而获得。
分选T1、T2/T3和滤泡B细胞,抗IgM或BLyS刺激后免疫印迹检测p100;对T1细胞增加胆固醇处理,检测BCR诱导p100能力。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养与刺激 | 重组人BLyS | Human Genome Sciences | -- |
| 抗IgM F(ab′)2抗体 | Jackson ImmunoResearch | 115-006-020 | |
| 抗CD40抗体(克隆3/23) | BD Biosciences | -- | |
| APRIL | Peprotech | 315-13 | |
| BCR信号抑制 | Syk抑制剂I | Calbiochem | 574711 |
| Syk抑制剂IV(BAY 61-3606) | Calbiochem | 574714 | |
| PP1 | Biomol International | EI-275 | |
| 经典NF-κB通路抑制 | InSolution IKK-2抑制剂(SC-514) | Calbiochem | -- |
| 转染 | FuGENE 6转染试剂 | Roche | -- |
| 细胞培养 | OptiMEM I培养基 | Gibco | -- |
| Fetalplex血清 | Gemini Bio-Products | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素溶液 | Gibco | -- | |
| 免疫印迹 | 兔抗p100抗体 | Cell Signaling Technology | 4882 |
| 抗RelB抗体(C-19) | Santa Cruz Biotechnology | sc-226 | |
| 抗p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3034 | |
| 抗IκBα抗体(C-21) | Santa Cruz Biotechnology | sc-371 | |
| 抗TBP抗体(1TBP18) | Abcam | -- | |
| β-actin单克隆抗体(AC-15) | Sigma | -- | |
| 磷酸化酪氨酸单克隆抗体(4G10) | Upstate | -- | |
| 流式细胞术 | PE标记抗人BR3抗体(8A7) | eBioscience | -- |
| PE标记抗TACI抗体(FAB1041P) | R&D Systems | -- | |
| PE标记抗TACI抗体(166010) | R&D Systems | -- | |
| FITC标记抗BCMA抗体(161616) | R&D Systems | -- | |
| 未标记抗BR3抗体(7H22-E16) | Axxora | ALX-804-824-c100 | |
| FITC或PE标记小鼠抗大鼠IgG1抗体(KLH-G1-2-2) | Southern Biotechnology | 0116-02 | |
| 磁珠分选 | 生物素标记抗CD3ε抗体(145-2c11) | BD Biosciences | -- |
| 生物素标记抗CD43抗体(5-7) | BD Biosciences | -- | |
| 链霉亲和素偶联微珠 | Miltenyi Biotech | -- | |
| RNA提取与逆转录 | RNAeasy试剂盒 | Qiagen | -- |
| SuperScript II逆转录酶 | Invitrogen | -- | |
| 实时定量PCR | 实时PCR预混液及小鼠GAPDH、Bcl-xL、Pim2、BR3、TACI和BCMA引物/探针集 | Applied Biosystems | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce | -- |
| 免疫印迹 | Immobilon-P聚偏二氟乙烯膜 | Millipore | -- |
| 硝酸纤维素膜 | Protran | -- | |
| Complete蛋白酶抑制剂迷你片剂 | Roche | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 原代B细胞BLyS刺激与p100/p52检测 | BLyS浓度(100 ng/ml或60 ng/ml)、处理时间(0–24 h)、细胞类型(CD43−或CD23+脾脏B细胞) 阅读提示:Methods中Cell culture and B cell enrichment小节;Figure 2和Figure 3图注 |
| BCR信号抑制实验 | Syk抑制剂I浓度(10 μM)、Syk抑制剂IV浓度(50 nM)、PP1浓度(10 μM)、抗IgM浓度(10 μg/ml)、处理时间(24 h或72 h) 阅读提示:Methods中Cell culture and B cell enrichment小节;Figure 4、Figure 5和Figure 6图注 |
| 过渡期B细胞亚群分选与刺激 | 分选标记(T1:B220+AA4.1+CD23−;T2/T3:B220+AA4.1+CD23+)、抗IgM刺激时间(24 h)、胆固醇处理浓度(5 mM甲基-β-环糊精) 阅读提示:Methods中Real-time PCR和Cholesterol augmentation小节;Figure 7图注 |
| 细胞存活检测 | 培养时间(72 h)、BLyS浓度(100 ng/ml)、抗CD40浓度(10 μg/ml)、TO-PRO-3排除法 阅读提示:Methods中BLyS receptor expression and cell viability小节;Figure 5图注 |
| 放线菌酮阻断蛋白合成 | 放线菌酮浓度(10 μg/ml)、处理时间点(0–10 h)、细胞类型(CD43−脾脏B细胞) 阅读提示:Methods中Cell culture and B cell enrichment小节;Figure 2c,d图注 |