Dpp4缺失对AML细胞BM空间分布及LSC功能的影响
验证Dpp4缺失是否改变AML细胞在BM内的空间分布并影响LSC干性维持。
将Dpp4+/+或Dpp4−/−原代AML细胞移植入C57/B6受体,对BM切片进行GFP/endomucin/DAPI染色并按PM、CM、DM分区定量;流式检测L-GMP比例、细胞周期与凋亡;CFU系列再铺板检测自我更新。
Longitudinal localization of leukaemic stem cells between the metaphysis and central marrow governs their behaviour.
包含MA9和AE9小鼠AML移植模型、条件性基因敲除小鼠、scRNA-seq、bulk RNA-seq、免疫荧光、流式及Western blot功能与机制验证
MLL-AF9(MA9)小鼠AML移植模型 AML-ETO9a(AE9)小鼠AML移植模型 N-cad-CreER; Cxcl12fl/fl条件性敲除小鼠 N-cad-CreER; Gpc3fl/fl条件性敲除小鼠
Dpp4+/+与Dpp4−/−原代AML细胞移植后按外周血GFP+细胞约30%进行肿瘤负荷匹配,比较BM内PM、CM、DM分布 PM、CM、DM来源L-GMP各500个移植入二次受体,Kaplan–Meier生存分析与极限稀释分析TIC频率 N-cad-CreER; Cxcl12fl/fl与N-cad-CreER; Gpc3fl/fl小鼠在tamoxifen注射14天后移植500个L-GMP CXCL12在BMEF与血浆中的ELISA定量及重组CXCL12(0–500 ng)静脉注射后17 h外周血GFP+细胞动员检测 Transwell迁移实验中上室0 ng/ml、下室100 ng/ml CXCL12,37 °C、5% CO2孵育4 h
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Dpp4缺失是否改变AML细胞在BM内的空间分布并影响LSC干性维持。
将Dpp4+/+或Dpp4−/−原代AML细胞移植入C57/B6受体,对BM切片进行GFP/endomucin/DAPI染色并按PM、CM、DM分区定量;流式检测L-GMP比例、细胞周期与凋亡;CFU系列再铺板检测自我更新。
确定不同BM解剖分区是否构成功能不同的LSC微环境。
在对照AML小鼠中按PM、CM、DM分选L-GMP,比较比例与细胞分裂;将等量分区来源L-GMP移植入二次受体评估白血病进展,并用极限稀释分析评估干性。
验证Dpp4缺失是否通过改变趋化因子梯度而非归巢或血管接近性将AML细胞限制在BM内。
比较Dpp4+/+与Dpp4−/−AML细胞在BM、PB、脾、肝的植入与16 h归巢;免疫荧光测量AML细胞与血管距离;LEGENDplex与ELISA检测BMEF和血浆细胞因子;外源CXCL12动员实验及Transwell迁移实验。
确定BM内CXCL12的细胞来源并验证其在LSC空间定位中的作用。
对移植后3周AML小鼠PM和DM非造血细胞进行scRNA-seq;在N-cad-TdT报告小鼠中测量LSC与N-cad+细胞距离;条件性删除N-cad+细胞Cxcl12并移植L-GMP评估分布。
验证两种空间重分布模型是否具有趋同的分子重编程。
对分选的BM AML细胞进行bulk RNA-seq,PCA、热图与GSEA比较Dpp4−/−与N-cad; Cxcl12−/−及其对照;Western blot检测p-STAT3、p-ERK、p-p38和p-p65。
验证N-cad+细胞来源GPC3通过抑制DPP4维持CXCL12并吸引LSC。
比较N-cad+与N-cad−细胞GPC3表达及与DPP4共定位;重组GPC3结合与DPP4酶活实验;条件性删除N-cad+细胞Gpc3并移植L-GMP,评估CXCL12水平、AML分布、LSC周期、凋亡与生存。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 流式分析 | 抗CD3e-PE/Cyanine5抗体(克隆17A2) | BioLegend | 100310 |
| 抗Ly6G/Ly6C(Gr-1)-PE/Cyanine5抗体(克隆RB6-8C5) | BioLegend | 108410 | |
| 抗CD117(c-Kit)-APC抗体(克隆2B8) | BioLegend | 105812 | |
| 抗Sca-1-PE-Cy7抗体(克隆D7) | BioLegend | 108114 | |
| Annexin V | BioLegend | 640941 | |
| 碘化丙啶 | BioLegend | 421301 | |
| Foxp3/转录因子染色试剂盒 | eBioscience | -- | |
| 免疫荧光 | 抗Endomucin(山羊多克隆)抗体 | R&D Systems | AF4666 |
| 抗GPC3(兔多克隆)抗体 | Abcam | ab216606 | |
| 通用封闭试剂 | BioGenex | -- | |
| Shandon Immu-Mount封片剂 | Fisher Scientific | -- | |
| 细胞因子检测 | LEGENDplex多指标流式检测试剂盒 | BioLegend | -- |
| 小鼠SDF-1α ELISA试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| 迁移实验 | Transwell小室(8 μm孔径) | Corning | -- |
| 集落形成实验 | 甲基纤维素培养基M3534 | STEMCELL Technologies | M3534 |
| DPP4活性检测 | H-Ala-Pro-AFC底物 | Bachem Americas | I-1680 |
| RT-qPCR | QIAGEN一步法RT-PCR试剂盒 | Qiagen | 210210 |
| RNA-seq | miRNeasy迷你试剂盒 | QIAGEN | -- |
| Qubit RNA高灵敏度检测试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| TruSeq链特异性mRNA文库制备试剂盒 | Illumina | -- | |
| Western blot | 磷酸化p44/42 MAPK(Erk1/2)(Thr202/Tyr204)抗体(克隆20G11) | Cell Signaling Technology | 75796S |
| 磷酸化NF-κB p65抗体(克隆93H1) | Cell Signaling Technology | 3039S | |
| 磷酸化STAT3(Tyr705)抗体(克隆D3A7) | Cell Signaling Technology | 9145S | |
| 磷酸化p38 MAPK抗体(克隆D3F9) | Cell Signaling Technology | 4092S | |
| β-actin抗体(克隆C4) | Santa Cruz Biotechnology | sc-47778 | |
| 动物实验 | 他莫昔芬 | Sigma | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| AML细胞移植与BM分布分析 | AML细胞剂量(2×10^5 Lin−细胞或1×10^6原代AML细胞)、受体照射剂量(1,000 cGy或500 cGy)、肿瘤负荷匹配(外周血GFP+约30%)、BM分区(PM/CM/DM)定义与切片采集时间 阅读提示:Methods的AML transplantation小节及Fig. 1图注 |
| N-cad+细胞条件性敲除模型 | tamoxifen剂量(75 mg/kg体重,腹腔注射)、注射后移植时间(14天)、L-GMP移植数量(500个)、亚致死照射剂量(500 cGy)、小鼠周龄(6–10周) 阅读提示:Methods的Mice与AML transplantation小节及Fig. 4j、Fig. 7a图注 |
| CXCL12动员与迁移实验 | 重组CXCL12剂量(0–500 ng)、注射后检测时间(17 h)、Transwell上下室CXCL12浓度(0 vs 100 ng/ml)、孵育时间(4 h) 阅读提示:Methods的Migration assay小节及Fig. 3k、Fig. 3m,n图注 |
| GPC3–DPP4结合与酶活实验 | 重组His-GPC3浓度(100 nM)、孵育条件(25 °C、3 h)、DPP4底物浓度(200 mM H-Ala-Pro-AFC)、酶活孵育时间(室温10 min) 阅读提示:Methods的Ligand binding assay与DPP4 activity assay小节及Fig. 6f,g图注 |
| LSC干性与功能评估 | CFU每孔细胞数(L-GMP 500 cells/well;GFP+/Gr1+ 2,000 cells/well)、系列再铺板轮次、二次移植每只受体L-GMP数量(500个)、各组小鼠数量 阅读提示:Methods的Colony assays小节及Fig. 1g、Fig. 2e,f、Fig. 5d,e图注 |