质膜曲率调控内质网-质膜接触的形成

Plasma membrane curvature regulates the formation of contacts with the endoplasmic reticulum.

作者信息Yang Yang, Luis A Valencia, Chih-Hao Lu, Melissa L Nakamoto, Ching-Ting Tsai, Chun Liu, Huaxiao Yang, Wei Zhang, Zeinab Jahed, Wan-Ru Lee, Francesca Santoro, Jen Liou, Joseph C Wu, Bianxiao Cui
PMID39289582
发布时间2024-11
DOI10.1038/s41556-024-01511-x

实验完整度

高

包含iPSC-CMs、U2OS、HEK293T、HeLa、大鼠胚胎CMs及多种功能验证,如FIB-SEM、ExM、敲低、共免疫沉淀等。

主要模型

人诱导多能干细胞来源心肌细胞(iPSC-CMs) U2OS细胞 大鼠胚胎心肌细胞 HEK293T和HeLa细胞

重点核对

纳米柱/纳米条诱导质膜曲率(直径200–300 nm,高度2 μm) JPH2/JPH3等蛋白在纳米条末端的富集比值(end-to-side ratio) EHD1/2/4三基因敲低对JPH3曲率偏好的抑制 甲基-β-环糊精(MβCD)处理破坏EHD定位并降低JPH3曲率偏好 共免疫沉淀验证EHD4与8MORN_LCR相互作用

摘要

内质网(ER)与质膜(PM)之间的接触位点在钙调节和脂质稳态中起关键作用。尽管其重要性显著,但调控其在质膜上空间分布的因素仍不清楚。受心肌细胞中观察到的现象启发——ER-PM接触位点集中于称为横小管的管状质膜内陷上——我们假设质膜曲率在ER-PM接触形成中发挥作用。通过精确控制质膜内陷,我们证明质膜曲率在心肌细胞中局部诱导ER-PM接触的形成。有趣的是,特异性表达于可兴奋细胞中的亲联蛋白家族ER-PM拴系蛋白是这一过程中的关键角色,而普遍表达的延伸突触结合蛋白2则未表现出对质膜曲率的偏好。在机制层面,我们发现亲联蛋白的低复杂度区域(LCR)和膜占据与识别Nexus(MORN)基序可以独立结合质膜,但LCR和MORN基序均为靶向质膜曲率所必需。通过检测亲联蛋白相互作用组,我们鉴定出一类曲率感应蛋白——含Eps15同源结构域的蛋白——它们与MORN_LCR基序相互作用并促进亲联蛋白优先拴系至弯曲质膜。这些发现突显了质膜曲率在心肌细胞ER-PM接触形成中的关键作用,并揭示了一种通过质膜曲率调控实现ER-PM接触空间调控的机制。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
质膜曲率是否以及如何调控内质网-质膜接触位点的空间分布?
核心机制
质膜曲率通过JPH的MORN_LCR基序与曲率感应蛋白EHDs相互作用,促进JPH介导的ER-PM接触在弯曲质膜处优先形成。
主要证据
利用垂直纳米结构在iPSC-CMs和U2OS细胞中诱导质膜曲率,结合FIB-SEM、ExM和免疫荧光显示JPH2/JPH3在弯曲质膜富集;EHD敲低或胆固醇去除破坏该富集;共免疫沉淀证实EHD4与8MORN_LCR结合。
研究意义
揭示了质膜曲率调控ER-PM接触空间分布的机制,为理解T小管富集ER-PM接触及相关钙信号异常疾病提供线索。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

纳米结构诱导质膜曲率

模拟T小管形态,精确控制质膜曲率。

制备垂直石英纳米柱(直径200–300 nm,高2 μm,间距2.5 μm)和纳米条(高2 μm,宽200–300 nm,长5 μm,间距10 μm),培养细胞于其上,诱导质膜内陷。

2

验证ER-PM接触组分在弯曲质膜的富集

检测JPH2、RyR2、Cav1.2等dyad组分是否在纳米柱/条诱导的弯曲质膜处富集。

在iPSC-CMs和U2OS细胞中进行免疫荧光染色,共表达GFP-Sec61β、BFP-CAAX等标记,量化纳米柱/条与平坦区域的荧光强度比值。

3

FIB-SEM和ExM直接观察ER-PM接触

在纳米尺度直接可视化弯曲质膜处的ER-PM接触。

使用聚焦离子束扫描电子显微镜(FIB-SEM)和膨胀显微镜(ExM)对纳米柱周围的ER-PM接触进行成像和定量。

4

JPH与E-Syt2的曲率偏好比较

确定JPH家族是否特异性地偏好弯曲质膜,而E-Syt2不偏好。

在U2OS、HEK293T和HeLa细胞中表达GFP-JPH2/3/4或GFP-E-Syt2,量化纳米条末端的富集比值。

5

STIM1/ORAI1在弯曲质膜ER-PM接触的定位

验证弯曲质膜处形成的ER-PM接触是否具有功能性钙信号组分。

在U2OS细胞中共表达GFP-JPH3与mCherry-STIM1或GFP-ORAI1,使用2 μM毒胡萝卜素(Tg)耗竭ER钙,观察STIM1和ORAI1在纳米条末端的聚集。

6

JPH3结构域截短与突变分析

鉴定JPH3中负责质膜结合和曲率感知的基序。

构建JPH3截短体(Δ8MORNΔLCR、Δ8MORN、LCR、LCR-KRtoA、LCR-TM、ΔLCR、8MORN、8MORN-αHelix、8MORN_LCR等)并转染U2OS细胞,量化纳米条末端富集。

7

EHD家族在JPH曲率偏好中的作用验证

确定EHD蛋白是否介导JPH的曲率感知。

shRNA敲低EHD1/2/4、clathrin、CAVIN1或CAV1/2,或用10 mM甲基-β-环糊精处理,检测JPH3在纳米条末端的富集变化;共免疫沉淀验证EHD4与8MORN_LCR结合。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基Gibco11965-092
胎牛血清Sigma–AldrichF4135
RPMI培养基Gibco11875-093
B27添加剂Gibco17504-044
基质胶Corning356231
Accutase细胞解离液Sigma–Aldrich--
Y-27632 ROCK抑制剂Selleck Chemicals--
CHIR-99021Selleck Chemicals--
IWR-1Selleck Chemicals--
多聚-L-赖氨酸----
人血浆纤连蛋白Sigma–Aldrich341635
DMEM/F-12 + GlutaMAX培养基Gibco10565-018
KnockOut血清替代物GibcoA31815-01
HBSS缓冲液Gibco14025126
TrypLE Select 10×GibcoA12177-01
抗亲联蛋白-2抗体Sigma–AldrichHPA052646
抗RyR2抗体Novus BioNB1202827
抗Cav1.2抗体Sigma–AldrichC1103
抗α-辅肌动蛋白抗体Sigma–AldrichA7811
抗钙网蛋白抗体InvitrogenPA3-900
抗EHD4抗体Thermo Fisher Scientific50-172-7111
抗EHD2抗体CusabioCSB-PA873710LA01HU-20UG
抗小窝蛋白-1抗体Santa Cruz Biotechnologysc-70516
抗小窝蛋白-2抗体CusabioCSB-PA004572LA01HU-20UG
抗EHD1抗体CusabioCSB-PA884470LA01HU-20UG
抗网格蛋白抗体InvitrogenMA1-065
抗BIN1抗体Sigma–AldrichSAB1408547
Alexa Fluor 594-山羊抗兔IgGInvitrogenA11012
Alexa Fluor 647-山羊抗小鼠IgGInvitrogenA32728
抗GFP抗体InvitrogenA-11122
抗mCherry抗体Sigma–AldrichSAB2702291
HRP标记山羊抗兔IgG (H+L)抗体Cell Signaling Technology7074
HRP标记山羊抗小鼠IgG (H+L)抗体Cell Signaling Technology7076
甲基-β-环糊精Sigma–AldrichC4555
毒胡萝卜素Sigma–AldrichT9033
Lipofectamine 2000转染试剂Invitrogen11668-019
Nucleofector II电转仪Lonza Amaxa Biosystems--
RIPA裂解液----
蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物Roche04693159001 and 04906837001
Trans-Blot Turbo转膜系统Bio-Rad1704150
Triton X-100----
牛血清白蛋白----
Acryloyl-X, SEInvitrogenA20770
丙烯酸钠----
蛋白酶K----
GFP-Trap磁珠琼脂糖ChromoTek--
cOmplete蛋白酶抑制剂Roche--
PhosSTOP磷酸酶抑制剂Roche--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
纳米结构诱导质膜曲率
纳米柱/条的直径、高度、间距、材质(石英),细胞接种密度和培养时间
阅读提示:Methods中'Nanopillar and nanobar fabrication'和'Cell culture on nanochips'小节,以及图1a、1j和3a的图注。
JPH2/JPH3在弯曲质膜的富集量化
荧光强度比值计算中纳米柱/条末端与侧壁或平坦区域的掩膜定义,表达水平筛选标准(排除过低或过高表达),背景扣除方法
阅读提示:Methods中'Nanopillar and nanobar averaging and end-to-side ratio quantification'小节,图1g、1l、3e、5l的图注。
EHD敲低实验
shRNA序列、敲低效率验证(Western blot)、敲低后检测时间(第3天),以及EHD1/2/4三基因同时敲低的组合
阅读提示:Methods中'shRNA interference experiments'和'Western blotting'小节,Extended Data Fig. 5c的图注。
甲基-β-环糊精处理
MβCD浓度(10 mM)、处理温度(37°C)和时间(30分钟)
阅读提示:Methods中'Antibodies and reagents'小节,图6d、6e和Extended Data Fig. 6a的图注。
共免疫沉淀验证EHD4与8MORN_LCR相互作用
交联剂浓度(0.5 mM DSP)、裂解缓冲液、抗体用量、孵育时间
阅读提示:Methods中'Co-immunoprecipitation assay'小节,图6i的图注。