构建Hippo通路组分敲除细胞并评估重金属毒性
探究Hippo通路在重金属诱导细胞毒性中的作用。
用CRISPR/Cas9构建LATS1/2 DKO、MOB1A/B DKO、NF2 KO、MST1/2 DKO HEK293A细胞,用不同重金属处理,通过结晶紫染色和相对活力定量评估细胞存活。
The Hippo pathway kinases LATS1 and LATS2 attenuate cellular responses to heavy metals through phosphorylating MTF1.
包含细胞模型、小鼠模型、果蝇模型及患者样本分析,并进行了功能验证和机制验证
HEK293A细胞(野生型及LATS1/2 DKO等) Hep3B细胞 MCF10 DCIS细胞 CdCl2染毒小鼠模型
CdCl2和ZnCl2处理浓度:CdCl2 50 μM,ZnCl2 250 μM(细胞活力实验处理12小时) LATS1/2 DKO细胞对Cd/Zn的LC50:Cd ~80 μM,Zn ~280 μM;野生型细胞:Cd ~6 μM,Zn ~170 μM MTF1 S152为LATS1磷酸化位点,S152A增加MTF1转录活性,S152D抑制其活性 小鼠CdCl2腹腔注射剂量5 mg/kg,XMU-MP-1 3 mg/kg,Verteporfin 100 mg/kg ChIP实验中使用S蛋白珠沉淀SFB-MTF1,q-PCR检测MT1F和ZNT2启动子结合
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究Hippo通路在重金属诱导细胞毒性中的作用。
用CRISPR/Cas9构建LATS1/2 DKO、MOB1A/B DKO、NF2 KO、MST1/2 DKO HEK293A细胞,用不同重金属处理,通过结晶紫染色和相对活力定量评估细胞存活。
确定Hippo信号缺陷对重金属响应基因表达的影响。
对野生型和LATS1/2 DKO HEK293A细胞进行Cd/Zn处理,提取RNA进行RNAseq和GO分析,并用q-PCR验证MT、ZNT、ZIP家族基因表达。
明确MTF1是否介导Hippo通路对重金属响应基因的调控。
在LATS1/2 DKO细胞中敲除MTF1,检测细胞活力和重金属响应基因转录;用MRE荧光素酶报告基因检测MTF1转录活性;用ChIP检测MTF1与启动子结合。
确定LATS1磷酸化MTF1的具体位点。
纯化LATS1和MTF1截短体进行体外激酶实验,结合质谱鉴定磷酸化位点,用点突变和磷酸化抗体验证S152位点。
探究S152磷酸化是否抑制MTF1转录活性和重金属响应。
在LATS/MTF1 TKO或MTF1 KO细胞中回补MTF1及其S152A/S152D突变体,检测细胞活力、基因转录和启动子结合。
测试靶向Hippo通路是否能促进重金属解毒。
在Hep3B细胞和小鼠中,使用XMU-MP-1抑制Hippo通路,检测重金属响应基因表达和CdCl2染毒小鼠生存率。
探究重金属是否抑制Hippo通路以及锌是否直接结合LATS。
用Cd/Zn处理细胞,检测LATS磷酸化;用金属珠结合实验和体外激酶实验检测锌与LATS的结合及对激酶活性的影响;用圆二色谱分析锌结合对LATS结构的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Western blot | 抗α-微管蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | T6199-200UL |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | A2228 | |
| 抗Flag(M2)抗体 | Sigma-Aldrich | F3165-5MG | |
| 抗Myc抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-40 | |
| 抗p300抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-585 | |
| 抗血凝素(HA)抗体 | BioLegend | 901503 | |
| 抗泛TEAD抗体 | Cell Signaling Technology | 13295S | |
| 抗磷酸化YAP(Ser127)抗体 | Cell Signaling Technology | 4911S | |
| 抗YAP/TAZ抗体 | Cell Signaling Technology | 8418S | |
| 抗磷酸化LATS1(Ser909)抗体 | Cell Signaling Technology | 9157S | |
| 抗磷酸化LATS1(Thr1079)抗体 | Cell Signaling Technology | 8654S | |
| 抗LATS1抗体 | Cell Signaling Technology | 3477S | |
| 抗磷酸化MST(Thr180/Thr183)抗体 | Cell Signaling Technology | 3681S | |
| 抗MST1抗体 | Cell Signaling Technology | 3682S | |
| 抗磷酸化MOB1(Thr35)抗体 | Cell Signaling Technology | 8699S | |
| 抗MOB1抗体 | Cell Signaling Technology | 3863S | |
| 抗NF2抗体 | Cell Signaling Technology | 12896S | |
| 抗KIBRA抗体 | Cell Signaling Technology | 8774S | |
| 抗SP1抗体 | Cell Signaling Technology | 9389S | |
| 抗CBP抗体 | Cell Signaling Technology | 7389S | |
| 抗C/EBPα抗体 | Cell Signaling Technology | 8178T | |
| 抗MTF1抗体 | Novus Biologicals | NBP1-86380 | |
| 体外激酶实验 | ATP-γ-S激酶底物 | Abcam | ab138911 |
| 对硝基苄基甲磺酸酯 | Abcam | ab138910 | |
| Western blot | 抗硫代磷酸酯抗体 | Abcam | ab92670 |
| 抗MAP4K4/HGK抗体 | Bethyl Laboratories | A301-502A-M | |
| 抗磷酸化MAP4K2(Ser170)抗体 | Kinexus | AB-PK646 | |
| 免疫荧光染色 | 抗YAP抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-101199 |
| 抗MTF1抗体 | Novus Biologicals | NBP1-86380 | |
| 免疫组织化学染色 | 抗MT1A抗体 | Novus Biologicals | NBP1-97493 |
| 抗切割型caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9579S | |
| 抗YAP抗体 | Cell Signaling Technology | 14074S | |
| 抗MTF1抗体 | Abcam | ab236401 | |
| 细胞处理 | 氯化钙 | Sigma-Aldrich | C7902 |
| 氯化镁 | Sigma-Aldrich | M8266 | |
| 氯化锰 | Sigma-Aldrich | M3634 | |
| 硫酸锌 | Sigma-Aldrich | Z0251 | |
| 氯化钠 | Fisher Scientific | S271-3 | |
| 硫酸铜 | Acros Organics | 7758-98-7 | |
| 硝酸银 | Alfa Aesar | 11414 | |
| 维替泊芬 | Sigma-Aldrich | SML0534 | |
| TPEN | Sigma-Aldrich | P4413 | |
| 四硫代钼酸铵 | Sigma-Aldrich | 323446 | |
| 卡铂 | Sigma-Aldrich | C2538 | |
| XMU-MP-1 | Tocris | 6482 | |
| 顺铂 | Adipogen | AG-CR1-3590 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞活力检测 | 重金属处理浓度(CdCl2 50 μM,ZnCl2 250 μM,其他金属250 μM,AgNO3 50 μM)、处理时间(12小时)、细胞接种密度(相同数量细胞接种于12孔板) 阅读提示:Methods细胞活力检测部分;图1图注 |
| 基因表达分析 | Cd/Zn处理浓度(CdCl2 50 μM,ZnCl2 250 μM)、处理时间(4小时)、q-PCR内参(GAPDH)、RNA提取试剂(TRIzol) 阅读提示:Methods RNA提取与q-PCR部分;图2图注 |
| ChIP实验 | SFB-MTF1诱导表达条件(~50 ng/mL doxycycline)、Cd/Zn处理时间(2小时)、交联条件(1%甲醛10分钟)、S蛋白珠用量 阅读提示:Methods ChIP部分;图3n和图5e图注 |
| 小鼠CdCl2染毒与治疗 | 小鼠品系(C57BL/6,雌性,5周龄)、CdCl2剂量(5 mg/kg,腹腔注射)、XMU-MP-1剂量(3 mg/kg)、Verteporfin剂量(100 mg/kg)、给药时间点(CdCl2后1小时) 阅读提示:Methods小鼠Cd染毒实验部分;图6e图注 |
| 体外激酶实验 | 激酶纯化方法(S蛋白珠或免疫沉淀)、底物(GST-YAP、MBP-MTF1-R2、MBP-LATS1-C3)、ATP浓度(500 μM)、反应时间(30分钟,30°C) 阅读提示:Methods体外激酶实验部分 |