液体样蛋白相互作用催化内吞囊泡的组装

Liquid-like protein interactions catalyse assembly of endocytic vesicles.

作者信息Kasey J Day, Grace Kago, Liping Wang, J Blair Richter, Carl C Hayden, Eileen M Lafer, Jeanne C Stachowiak
PMID33820972
发布时间2021-04
DOI10.1038/s41556-021-00646-5

实验完整度

高

体外纯化蛋白液滴与膜组装、光控细胞功能验证及FRAP动力学分析,多层级证据且含功能验证

主要模型

纯化Eps15与Fcho1/2蛋白液滴 GUV及脂质多层膜 SUM159 Eps15敲除细胞表达Eps15-Cry2

重点核对

Eps15-Cry2在SUM159 Eps15敲除细胞中的表达及蓝光强度(0、10、50 μW) GUVs中500 nM Fcho1与Eps15的共组装及蛋白富集域判定阈值 溶液液滴实验总蛋白浓度7 μM及Fcho1:Eps15比例(1:70、1:34) FRAP测量液滴与细胞内结构的t1/2及可动分数 内吞结构寿命分类:短寿命<20 s、生产性20-180 s、长寿命>180 s

摘要

在网格蛋白介导的内吞过程中,数十种蛋白质在质膜上组装成相互连接的网路。作为内吞的启动因子,Eps15和Fcho1/2将下游组分聚集,同时允许出芽囊泡内发生动态重排。这些启动蛋白如何满足这些相互竞争的需求?本研究表明,Eps15和Fcho1/2依赖弱液体样相互作用来催化内吞。在体外,这些弱相互作用促进具有液体样性质的蛋白质液滴组装。为了探究这些液体样网络的生理作用,我们利用Eps15的光诱导寡聚化实时调节启动蛋白组装的强度。低光照水平驱动液体样组装,恢复哺乳动物Eps15敲除细胞中正常的内吞速率。相反,较高光照水平下启动蛋白形成固体样组装,阻碍囊泡出芽,可能由于分子重排不足。这些发现提示,启动蛋白的液体样组装为内吞提供了最佳的催化平台。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
启动蛋白Eps15和Fcho1/2的物理性质如何使其成为内吞的有效催化剂?
核心机制
Eps15和Fcho1/2通过弱多价相互作用形成液体样组装,允许分子动态重排;过强的固体样组装限制重排并阻碍囊泡出芽。
主要证据
体外GUV和脂质多层膜显示Eps15/Fcho1形成可融合、FRAP快速恢复的蛋白富集域;溶液液滴具液体样性质;光控Eps15-Cry2在细胞中低光恢复野生型内吞动力学,强光导致长寿命停滞结构。
研究意义
提示启动蛋白的液体样组装为内吞提供了最佳催化平台,可能解释细胞内运输途径中囊泡高效起始和释放的机制。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

体外膜表面蛋白共组装观察

验证Eps15和Fcho1/2能否在膜表面共组装形成蛋白富集域

将荧光标记的Eps15和Fcho1/2加入含PtdIns(4,5)P2的GUVs或脂质多层膜,观察蛋白分布及动态

2

Eps15突变体结构域分析

确定Eps15哪些结构域和多价相互作用是组装所必需的

使用缺失EH、CC、CTD或DPF突变的Eps15变体,与Fcho1在GUVs上共组装,观察蛋白富集域形成

3

溶液液滴组装与相图分析

研究Eps15/Fcho1组装的熱力学性质及液体样特征

在含3% PEG的缓冲液中形成蛋白液滴,观察融合、FRAP恢复,并绘制温度-浓度相图

4

光控Eps15-Cry2体外液滴验证

验证光诱导Eps15组装能否形成液体样液滴并招募Fcho1

将Eps15-Cry2与野生型Eps15及Fcho1混合,蓝光照射后观察液滴形成、融合和FRAP

5

细胞内外吞动力学光控实验

探究启动蛋白组装强度对活细胞内吞结构寿命的影响

在SUM159 Eps15敲除细胞中表达Eps15-Cry2-mCherry,给予无、低、强蓝光,通过TIRF追踪AP-2 σ2-HaloTag标记的内吞结构寿命

6

细胞内FRAP分析分子交换

检测不同组装强度下Eps15和AP-2在内吞结构中的分子交换速率

对细胞中Eps15-mCherry或Eps15-Cry2-mCherry及AP-2-HaloTag:JF646进行光漂白后恢复测量

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
镍-次氮基三乙酸琼脂糖Qiagen30230
Superose 6柱----
Amicon Ultra-15 Ultracell-30K离心过滤单元MilliporeSigma--
谷胱甘肽琼脂糖4BGE Healthcare--
Zeba旋转脱盐柱Thermo Fisher Scientific--
还原型谷胱甘肽Sigma-AldrichG4251
凝血酶Sigma-Aldrich--
人鼻病毒3C蛋白酶Thermo Fisher Scientific--
Atto 594 NHS酯Sigma-Aldrich--
CF488a NHS酯Sigma-Aldrich--
Princeton CentriSpin-20尺寸排阻旋转柱Princeton Separations--
二油酰磷脂酰胆碱Avanti Polar Lipids--
二油酰磷脂酰丝氨酸Avanti Polar Lipids--
磷脂酰肌醇4,5-二磷酸Avanti Polar Lipids--
二棕榈酰-十聚乙二醇-生物素Darryl Sasaki--
德克萨斯红-DHPEThermo Fisher Scientific--
中性亲和素Thermo Fisher Scientific--
Fugene HD转染试剂Promega--
氢化可的松Sigma-AldrichH4001
胰岛素Sigma-AldrichI6634
Janelia Fluor 646-HaloTag配体Luke Lavis--
抗Eps15(D3K8R)兔单克隆抗体Cell Signaling Technology12460
抗EPS15R兔单克隆抗体Abcamab53006
抗GAPDH小鼠单克隆抗体InvitrogenAM4300
抗兔IgG HRP连接抗体Cell Signaling Technology7074
抗小鼠IgG HRP连接抗体Cell Signaling Technology7076
SuperSignal West Pico试剂盒Thermo--
针对人Eps15L1的MISSION esiRNASigma-AldrichEHU036601

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
GUVs蛋白共组装
蛋白浓度500 nM;GUVs脂质组成79% DOPC、15% DOPS、5% PtdIns(4,5)P2、1% DPEG10-biotin;室温22°C;蛋白富集域判定标准(信号差异≥2倍且亮区覆盖≥10%表面)
阅读提示:Methods 'GUV Preparation'及Figure 1图注
溶液液滴组装
总蛋白浓度7 μM;Fcho1:Eps15比例1:70或1:34;缓冲液pH 7.5、150 mM NaCl、3% PEG8000;温度梯度
阅读提示:Methods 'Protein Droplets'及Figure 3图注
光控Eps15-Cry2细胞实验
SUM159 AP-2 σ2-HaloTag/Eps15Δ细胞;Eps15-Cry2-mCherry或Eps15-mCherry表达;蓝光强度0、10、50 μW,每3 s照射500 ms;成像温度37°C
阅读提示:Methods 'Fluorescence Microscopy'及Figure 6图注
内吞结构寿命分析
寿命分类阈值:短寿命<20 s、生产性20-180 s、长寿命>180 s;cmeAnalysis追踪参数;样本量(细胞样本数和pit数)
阅读提示:Methods 'Image Analysis'及Figure 6图注
FRAP分析
漂白区域覆盖整个凝聚体或内吞结构;分析ROI为结构中心5x5像素;t1/2和可动分数计算
阅读提示:Methods 'Image Analysis'及Figure 2、3、4、6图注