经典Wnt调控因子对毛囊干细胞的体内转录调控

In vivo transcriptional governance of hair follicle stem cells by canonical Wnt regulators.

作者信息Wen-Hui Lien, Lisa Polak, Mingyan Lin, Kenneth Lay, Deyou Zheng, Elaine Fuchs
PMID24463605
发布时间2014-02
DOI10.1038/ncb2903

实验完整度

高

包含条件性基因敲除小鼠、过表达转基因小鼠、体内ChIP-seq、RNA-seq、移植实验及体外细胞功能验证等多层级证据。

主要模型

K15CrePGR介导的Ctnnb1条件性敲除小鼠毛囊干细胞 K15CrePGR介导的Tcf7l1/Tcf7l2双敲除小鼠毛囊干细胞 K14rtTA/TRE-mycTcf3和K14rtTA/TRE-Tle4过表达转基因小鼠 Axin2LacZ/+ Wnt报告小鼠毛囊干细胞

重点核对

β-cat cKO HFSCs在体内外均能增殖,但激活后不能生成毛囊而分化为皮脂腺细胞 TCF3/4缺失导致Wnt靶基因上调并引起早发性毛囊周期 TCF3过表达抑制Wnt靶基因表达和HFSC活化 TLE4过表达抑制TCF3/4共靶基因并阻断脱毛诱导的HFSC增殖 TCF3/4与TLE和HDAC1在体内形成复合物并共占据靶基因

摘要

毛囊干细胞(HFSCs)响应Wnt信号而再生毛发。在此,我们展示了β-catenin–TCF3/4–TLE电路的基因组范围转录和染色质景观,并在天然HFSC微环境中对其生物学作用进行了遗传学剖析。我们发现,在HFSC静息期,TCF3、TCF4和TLE(Groucho)协同结合并转录抑制Wnt靶基因。我们还发现,β-catenin对HFSC存活并非必需,并且如果TCF3/4水平充分降低,其对增殖也非必需。然而,β-catenin对于激活启动毛囊命运和抑制皮脂腺细胞命运决定的基因是必需的。TCF3/4缺陷模拟了Wnt–β-catenin依赖的这些毛囊命运靶基因的激活;TCF3过表达则平行于其TLE4依赖的抑制。我们的研究揭示了TCF3/4–TLE组蛋白去乙酰化酶作为一个抑制性变阻器,其作用可被Wnt–β-catenin信号缓解。当TCF3/4和TLE水平高时,HFSCs可维持干性,但保持静息。当这些水平下降或Wnt–β-catenin水平升高时,这种平衡发生偏移,毛发再生启动。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
经典Wnt信号及其下游β-catenin和TCF3/4-TLE复合物如何在天然毛囊干细胞微环境中调控干细胞静息、增殖和命运决定。
核心机制
在静息HFSCs中,TCF3/4招募TLE和HDAC1抑制Wnt靶基因;Wnt–β-catenin信号解除该抑制,激活毛囊命运基因并抑制皮脂腺命运。
主要证据
通过条件性基因敲除、过表达小鼠、体内ChIP-seq、RNA-seq、FACS分析和移植实验,证明β-catenin对HFSC维持和增殖非必需,但对毛囊命运决定必需;TCF3/4-TLE作为抑制性变阻器调控静息与激活的平衡。
研究意义
揭示了TCF3/4-TLE-HDAC1复合物作为Wnt信号调控毛囊干细胞静息和命运决定的抑制性变阻器,为理解成体干细胞如何响应Wnt信号提供机制框架。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

Wnt报告活性与β-catenin缺失对HFSC静息的影响

验证静息HFSCs是否响应Wnt信号以及β-catenin对维持静息状态的作用。

使用Axin2LacZ/+报告小鼠检测毛囊周期中Wnt活性;利用K15CrePGR;Ctnnb1fl/fl;Rosa26-YFP小鼠在第二个静息期通过RU486诱导β-catenin敲除,观察毛发再生和干细胞标志物表达。

2

β-catenin缺失HFSCs的体外增殖能力

检验β-catenin缺失是否影响HFSC体外增殖和长期传代能力。

FACS分选CD34+α6+YFP+ Bu-HFSCs,在富血清和生长因子培养基中培养2周,计数克隆数量和大小,并进行长期传代。

3

β-catenin缺失HFSCs在体内激活后的命运决定

探究β-catenin缺失HFSCs在体内被激活后是否发生命运改变。

将培养的β-cat cKO或对照雄性HFSCs与新生雌性真皮成纤维细胞混合后移植到裸鼠硅胶腔室;或通过脱毛诱导HFSCs激活,进行YFP谱系追踪,检测毛囊和皮脂腺标志物。

4

β-catenin依赖的转录组和Wnt靶基因鉴定

鉴定β-catenin缺失HFSCs中表达改变的基因,特别是Wnt靶基因和毛囊命运基因。

对早期anagen起始的对照和β-cat cKO Bu-HFSCs进行RNA-seq和qPCR验证;用Wnt3a和/或XAV939处理培养的HFSCs 6小时,检测Wnt响应性。

5

TCF3/4和TLE在HFSC基因组上的共占据分析

确定TCF3、TCF4和TLE在HFSC中的基因组结合位点及其与β-catenin依赖基因的重叠。

对FACS分选的Bu-HFSCs进行TCF3、TCF4和pan-TLE的ChIP-seq,分析峰重叠、基序富集和靶基因。

6

TCF3/4和TLE水平改变对HFSC活化和增殖的功能验证

验证TCF3/4和TLE水平变化是否影响HFSC静息、活化和增殖。

使用多西环素诱导的K14rtTA/TRE-mycTcf3和K14rtTA/TRE-Tle4小鼠改变HFSC中TCF3或TLE4水平,通过EdU掺入和克隆形成实验检测增殖;利用K15CrePGR介导的Tcf7l1/Tcf7l2条件性敲除小鼠检测HFSC活化和毛囊周期。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
TCF3抗体Fuchs laboratory--
TCF4抗体Cell Signaling Technology2569
LEF1抗体Cell Signaling Technology2230
TCF1抗体Cell Signaling Technology2203
CD34抗体eBiosciences13-0341
SOX9抗体Fuchs laboratory--
β-catenin抗体BDclone 14
GFP抗体Abcamab13970
角蛋白5抗体CovancePRB-160P
角蛋白10抗体CovancePRB-159P
整合素β4抗体BD553745
PPARγ抗体Santa Cruz BiotechnologyH-100, sc-7196
TCF3抗体Santa Cruz BiotechnologyV-17, sc-12491
TCF4抗体Santa Cruz BiotechnologyN-20, sc-8631
TLE抗体Santa Cruz BiotechnologyC-19, sc-13373
HDAC1抗体Abcamab7028
β-catenin抗体SigmaC7207
α-微管蛋白抗体Millipore05829
整合素α6抗体(PE偶联)eBiosciences12-0495
整合素α6抗体(PE-Cy7偶联)eBiosciences25-0495
CD34抗体(Alexa Fluor 660偶联)eBiosciences50-0341
Sca1抗体(PerCP-Cy5.5偶联)eBiosciences45-5981
TCF3抗体Fuchs laboratory--
TCF4抗体Santa Cruz BiotechnologyN-20
pan-TLE抗体Santa Cruz BiotechnologyC-19
J2 3T3小鼠成纤维饲养层细胞----
Wnt3a重组蛋白R&D Systems--
XAV939Selleckchem--
Direct-zol RNA迷你制备试剂盒Zymo Research--
RNeasy微型试剂盒Qiagen--
SuperScript III第一链合成系统Invitrogen--
SYBR Green qPCR检测----
Applied Biosystems 7900HT快速实时PCR系统Applied Biosystems--
Illumina TrueSeq mRNA样品制备试剂盒Illumina--
Illumina HiSeq 2000测序仪Illumina--
Agilent 2100生物分析仪Agilent--
Pierce IP裂解缓冲液Thermo Scientific--
Dynabeads蛋白G磁珠Invitrogen--
蛋白酶抑制剂Roche--
磷酸酶抑制剂Roche--
LDS样品缓冲液Invitrogen--
FluoReporter lacZ流式细胞术试剂盒Molecular Probes--
Trizol LS试剂Invitrogen--
dispaseGibco--
Cy3 Star*FISH检测试剂盒Cambio--
Click-iT成像试剂盒Invitrogen--
RU486----
多西环素----
EdU----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
β-catenin条件性敲除
RU486给药方案(1%腹腔注射和4%局部乙醇处理)、观察时间点5个月、小鼠基因型K15CrePGR;Ctnnb1fl/fl;Rosa26-YFPfl/stop/fl
阅读提示:Methods 'Mice, doxycycline induction, and in utero injections'及Figure 1c图注
HFSC体外培养与克隆形成
培养基钙浓度0.3 mM、饲养层为丝裂霉素C处理的J2 3T3、接种细胞数100,000分三孔、培养14天
阅读提示:Methods 'Cell culture and growth factor treatment'和'Colony-formation assay and statistical analysis'
Wnt3a和XAV939处理
Wnt3a浓度100 ng/ml、XAV939浓度5 μM、处理时间6小时、饥饿处理16小时(0.1% FBS)
阅读提示:Methods 'Cell culture and growth factor treatment'及Figure 5c图注
ChIP-seq
每反应10^7细胞、抗体品牌和货号(TCF3:Fuchs实验室;TCF4:Santa Cruz N-20;pan-TLE:Santa Cruz C-19)、峰调用软件MACS、测序深度
阅读提示:Methods 'ChIP-seq and data analyses'及Supplementary Methods
体内过表达和敲除实验
多西环素剂量(饮食和0.5 mg/鼠腹腔注射)、EdU剂量50 μg/g、RU486给药方案、皮肤移植时间点(g58、g65)
阅读提示:Methods 'Mice, doxycycline induction, and in utero injections'和'Skin grafting'及Figure 7d,e图注