建立O-GlcNAc水平调控与S1P诱导收缩的表型关联
验证O-GlcNAc水平是否影响成纤维细胞对S1P的收缩敏感性。
用OGT抑制剂5SGlcNAc或OGA抑制剂Thiamet-G处理NIH3T3细胞,改变O-GlcNAc水平,然后加入S1P,通过明场显微镜观察细胞收缩。
MYPT1 O-GlcNAc modification regulates sphingosine-1-phosphate mediated contraction.
包含NIH3T3细胞、人真皮成纤维细胞BJ-5ta及胶原基质模型,采用化学工具、RNAi、突变体、Western blot和Co-IP进行功能与机制验证
小鼠胚胎成纤维细胞系NIH3T3 稳定表达FLAG-MYPT1及其突变体的NIH3T3细胞系 人真皮成纤维细胞系BJ-5ta BJ-5ta细胞的三维胶原基质收缩模型
5SGlcNAc处理浓度200 μM、时间16 h;Thiamet-G处理浓度10 μM、时间20 h S1P处理浓度范围0.05-5 μM,收缩表型检测时间30 min Western blot检测MLC磷酸化(pT18/S19)和MYPT1磷酸化(pT696、pT853)的时间点0、2、5、10、30 min RNAi敲低内源性MYPT1或S1PR2后,检测S1P诱导的收缩表型 胶原基质收缩实验:BJ-5ta细胞2×10^6 cells/mL,S1P 0.1-5 μM,检测0和30 min基质直径变化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证O-GlcNAc水平是否影响成纤维细胞对S1P的收缩敏感性。
用OGT抑制剂5SGlcNAc或OGA抑制剂Thiamet-G处理NIH3T3细胞,改变O-GlcNAc水平,然后加入S1P,通过明场显微镜观察细胞收缩。
确定S1P通过哪个S1P受体亚型介导收缩。
用RT-PCR检测S1PR1-5 mRNA表达;用选择性拮抗剂(W146、JTE013、TY52156、CYM50358)和激动剂(CYM5220、A971432)处理细胞,以及RNAi敲低S1PR2,观察对S1P诱导收缩的影响。
检验O-GlcNAc是否调控ROCK下游MLC和MYPT1的磷酸化。
用ROCK抑制剂Y27632处理细胞,观察收缩;用Western blot检测S1P刺激后MLC(pT18/S19)和MYPT1(pT696、pT853)磷酸化时间进程,比较DMSO和5SGlcNAc处理。
确认MYPT1是否被O-GlcNAc修饰以及修饰是否动态变化。
利用化学酶标记和生物素富集检测内源性O-GlcNAc修饰蛋白,Western blot检测MYPT1和MLC;用PEG质量迁移法(mass-shifting)和FLAG免疫沉淀检测MYPT1 O-GlcNAc修饰水平变化。
确定MYPT1的O-GlcNAc修饰区域对其调控收缩功能的重要性。
构建MYPT1(S/TtoA)、MYPT1(d564-578)、MYPT1(d588-602)和MYPT1Δ突变体稳定表达细胞系,用RNAi敲低内源性MYPT1,检测S1P诱导的收缩和MLC/MYPT1磷酸化。
检验O-GlcNAc是否抑制MYPT1与ROCK的结合。
用DMSO或5SGlcNAc处理表达FLAG-MYPT1的NIH3T3细胞,进行抗FLAG免疫共沉淀,Western blot检测ROCK,并用考马斯染色归一化。
验证O-GlcNAc水平是否调控人真皮成纤维细胞在三维胶原基质中的收缩。
将BJ-5ta细胞与胶原混合形成三维基质,用5SGlcNAc处理,加入S1P后释放基质,测量基质直径变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Genessee Scientific | -- |
| 胎牛血清 | Atlanta Biologics | -- | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| Medium 199培养基 | ATCC | -- | |
| 胎牛血清 | Atlanta Biologics | -- | |
| 潮霉素B | -- | -- | |
| 药物处理 | 5SGlcNAc | -- | -- |
| Thiamet-G | -- | -- | |
| ST060266 | MilliporeSigma | -- | |
| 鞘氨醇-1-磷酸 | -- | -- | |
| 溶血磷脂酸 | -- | -- | |
| Y27632 | -- | -- | |
| W146 | -- | -- | |
| JTE013 | -- | -- | |
| TY52156 | -- | -- | |
| CYM50358 | -- | -- | |
| CYM5220 | -- | -- | |
| A971432 | -- | -- | |
| Western blot | 抗FLAG标签抗体 | Cell Signaling Technology | 2368S |
| 抗MYPT1抗体 | Cell Signaling Technology | 2634S | |
| 抗MLC2抗体 | Cell Signaling Technology | 3672S | |
| 抗磷酸化T18/S19 MLC抗体 | Cell Signaling Technology | 3674S | |
| 抗磷酸化T696 MYPT1抗体 | Cell Signaling Technology | 5163S | |
| 抗磷酸化T853 MYPT1抗体 | Cell Signaling Technology | 4563S | |
| 抗OGT抗体 | Cell Signaling Technology | 24083S | |
| 抗Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9762 | |
| 抗切割Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| 抗Nup62抗体 | BD Biosciences | 610497 | |
| 抗RL2抗体 | ThermoFisher Scientific | MA1-072 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | MilliporeSigma | A5441 | |
| 抗ROCK1/2抗体 | MilliporeSigma | 07-1458 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | Jackson ImmunoResearch | -- | |
| OneBlock Western-CL封闭液 | Genesee Scientific | 20-313 | |
| PVDF膜 | Bio-Rad | -- | |
| Trans-Blot SD半干转印槽 | Bio-Rad | -- | |
| ECL化学发光试剂 | Bio-Rad | -- | |
| ChemiDoc XRS+分子成像仪 | Bio-Rad | -- | |
| RNAi | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | ThermoFisher Scientific | 13778030 |
| 小鼠OGT siRNA | Genscript | -- | |
| S1PR2 siRNA | MilliporeSigma | SASI_Mm01_00082880 | |
| MYPT1 siRNA | ThermoFisher Scientific | s70342 | |
| 化学酶标记 | UDP-GalNAz | -- | -- |
| GalT(Y289L)酶 | -- | -- | |
| DBCO-PEG5000 | -- | -- | |
| DBCO-PEG2000 | -- | -- | |
| 炔基偶氮生物素 | Click Chemistry Tools | -- | |
| 链霉亲和素磁珠 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 免疫沉淀 | 抗FLAG-M2磁珠 | MilliporeSigma | -- |
| 免疫共沉淀 | Catch and Release系统 | ThermoScientific | -- |
| 胶原基质收缩实验 | 胶原凝胶收缩实验试剂盒 | Cell Biolabs | CBA-201 |
| 质粒构建 | PiggyBac转座子载体系统 | System Biosciences | -- |
| PiggyBac转座酶启动子 | -- | PB531A-1 | |
| 细胞裂解 | cOmplete迷你蛋白酶抑制剂混合物 | MilliporeSigma | -- |
| PhosSTOP磷酸酶抑制剂 | MilliporeSigma | -- | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce, ThermoScientific | -- |
| RT-PCR | RNeasy迷你试剂盒 | Qiagen | -- |
| Superscript IV一步法RT-PCR系统 | Invitrogen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| O-GlcNAc水平调控与收缩表型 | OGT抑制剂5SGlcNAc浓度200 μM、处理16 h;OGA抑制剂Thiamet-G浓度10 μM、处理20 h;S1P浓度范围0.05-5 μM,处理30 min;细胞接种密度1×10^5 cells/6-well 阅读提示:Methods: General procedure for 2D contraction assay; 5SGlcNAc/DMSO/Thiamet-G S1P concentration course |
| S1PR2受体鉴定 | 拮抗剂浓度1 μM预处理10 min;S1P 100 nM;S1PR2激动剂CYM5220 1或5 μM;S1PR5激动剂A971432 1 μM;RNAi敲低S1PR2的转染条件 阅读提示:Methods: S1PR1-4 antagonist screen; S1PR2 and S1PR5 agonist screen; S1PR2 knockdown with RNAi |
| MLC/MYPT1磷酸化检测 | S1P高浓度5 μM或低浓度100 nM;Western blot时间点0、2、5、10、30 min;抗体稀释比例1:1,000(anti-pT18/S19 MLC、anti-pT696 MYPT1、anti-pT853 MYPT1) 阅读提示:Methods: MYPT1 and MLC phosphorylation Western blot time course; General procedure for Western blotting |
| MYPT1 O-GlcNAc修饰检测 | 5SGlcNAc 200 μM;Thiamet-G 10 μM;葡萄糖浓度1或9 g/L;化学酶标记UDP-GalNAz浓度0.5 mM;GalT(Y289L)用量7.5 μL/100 μg蛋白 阅读提示:Methods: General procedure for chemoenzymatic labeling; Mass-shift of MYPT1; FLAG-IP for RL2 detection of MYPT1 |
| 胶原基质收缩实验 | BJ-5ta细胞浓度2×10^6 cells/mL;胶原与细胞悬液比例4:1;基质培养30 h后5SGlcNAc 200 μM处理16 h;S1P 0.1-5 μM;收缩测量0和30 min 阅读提示:Methods: Collagen gel contraction assay |