TIP60 在有丝分裂中的功能分析
验证 TIP60 乙酰转移酶活性对染色体分离的必要性。
使用 TIP60 shRNA 敲低或 TIP60 抑制剂(NU9056、MG149)处理 HeLa 细胞,通过活细胞延时成像和固定细胞免疫荧光观察染色体分离缺陷。
Acetylation of Aurora B by TIP60 ensures accurate chromosomal segregation.
使用 HeLa 细胞、活细胞成像、shRNA 敲低、乙酰化位点突变体、体外激酶/乙酰化/磷酸酶实验及重组蛋白,进行功能与机制验证
HeLa 细胞 HEK293T 细胞 重组 Aurora B 与 TIP60 蛋白
TIP60 shRNA 敲低与回补实验(野生型 vs 乙酰转移酶缺陷型) TIP60 抑制剂 NU9056(20 μM)和 MG149(100 μM)处理 Aurora B K215Q/K215R 突变体在 TIP60 敲低细胞中的回补 体外 PP2A 磷酸酶实验检测 Thr232 去磷酸化 CDK1 抑制剂 Roscovitine(20 μM)处理及 TIP60 S90D/S90A 突变体回补
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证 TIP60 乙酰转移酶活性对染色体分离的必要性。
使用 TIP60 shRNA 敲低或 TIP60 抑制剂(NU9056、MG149)处理 HeLa 细胞,通过活细胞延时成像和固定细胞免疫荧光观察染色体分离缺陷。
确定 TIP60 是否在动粒调控 Aurora B 活性。
免疫荧光共定位 TIP60 与 Hec1、pT232-Aurora B;凝胶过滤和免疫共沉淀检测 TIP60 与 Aurora B 复合物;检测 TIP60 敲低或抑制对 pT232 和 pS7-CENP-A 水平的影响。
确定 TIP60 直接乙酰化 Aurora B 的位点及其对激酶活性的影响。
体外乙酰化实验结合质谱鉴定 Aurora B 乙酰化位点;构建 K215Q/K215R 突变体,进行体外激酶实验和细胞内回补实验;制备 acK215-AurB 抗体检测乙酰化水平。
验证 K215 乙酰化是否保护 Thr232 免受 PP2A 去磷酸化。
在 TIP60 抑制细胞中使用 okadaic acid 处理;体外 PP2A 磷酸酶实验比较野生型与乙酰化 Aurora B 的 Thr232 磷酸化水平;免疫共沉淀检测 Aurora B 与 PP2A 亚基 PR65 的相互作用。
确定 CDK1 是否通过磷酸化 TIP60 S90 调控 Aurora B 乙酰化。
制备 pS90-TIP60 抗体;同步化细胞检测 pS90 时序;使用 CDK1 抑制剂 Roscovitine 处理;TIP60 S90D/S90A 突变体回补实验;体外乙酰转移酶活性检测。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Advanced DMEM 培养基 | Invitrogen | -- |
| 胎牛血清 | HyClone | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Invitrogen | -- | |
| 细胞同步化 | 胸苷 | Sigma | -- |
| 转染 | Lipofectamine 2000 转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 药物处理 | 诺考达唑 | Sigma | -- |
| Monastrol | Sigma | -- | |
| MG132 | Sigma | -- | |
| 冈田酸 | Sigma | -- | |
| Roscovitine | Sigma | -- | |
| MG149 | Axon | -- | |
| NU9056 | Tocris Bioscience | -- | |
| GSK923295 | Selleckchem | -- | |
| Western blot | 抗 TIP60 #1(H-93)抗体 | Santa Cruz | -- |
| 抗 α-微管蛋白抗体(ab80779) | Abcam | ab80779 | |
| 抗 FLAG 标签抗体(M2) | Sigma | -- | |
| 抗乙酰化赖氨酸抗体(9441) | Cell Signaling Technology | 9441 | |
| 抗 pS7-CENP-A 抗体(2187) | Cell Signaling Technology | 2187 | |
| 抗 Aurora B 抗体(AIM-1) | BD Biosciences | -- | |
| 抗 pT232-Aurora B 抗体(600-401-677) | Rockland | 600-401-677 | |
| 抗 pS90-TIP60 抗体 | YenZym LLC | -- | |
| 抗 acK215-Aurora B 抗体 | YenZym LLC | -- | |
| 体外激酶实验 | 荧光激酶实验试剂盒(31001) | ATT Bioquest | 31001 |
| 体外磷酸酶实验 | PP2A 磷酸酶 | Millipore | -- |
| 凝胶过滤 | Superose 6, 10/300 GL 层析柱 | GE Healthcare Life Sciences | -- |
| 免疫荧光 | DAPI | Sigma | -- |
| 活细胞成像 | 玻璃底培养皿 | MatTek | -- |
| CO2 非依赖培养基 | Gibco | -- | |
| 质粒构建 | 定点突变试剂盒(C212) | Vazyme | C212 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| TIP60 敲低与抑制剂处理 | TIP60 shRNA 序列、NU9056 浓度(20 μM)、MG149 浓度(100 μM)、处理时间(有丝分裂进入后立即) 阅读提示:Methods 中 RNA interference 和 Inhibitors and treatments 小节;Figure 1 legend |
| Aurora B 乙酰化位点鉴定 | 质谱鉴定到的 4 个乙酰化位点(K31、K115、K215、K231)、K215Q/K215R 突变体构建 阅读提示:Results 中 K215 acetylation by TIP60 promotes Aurora B activity 小节;Supplementary Fig. 5d |
| 体外 PP2A 磷酸酶实验 | PP2A 磷酸酶用量、反应时间(30 min 或 2 h)、okadaic acid 浓度(500 nM) 阅读提示:Methods 中 In vitro PP2A phosphatase assay 小节;Figure 4 legend |
| CDK1 抑制剂处理 | Roscovitine 浓度(20 μM)、MG132 浓度(10 μM)、处理时间(20 min) 阅读提示:Methods 中 Inhibitors and treatments 小节;Figure 5 legend |
| TIP60 乙酰转移酶活性检测 | 14C-Ac-CoA 浓度范围(未明确)、反应时间(未明确)、NU9056 浓度(10 μM)和处理时间(10 min) 阅读提示:Methods 中 In vitro acetylation assay and characterization of TIP60 kinetics 小节;Figure 5e |