前脂肪细胞纤毛动态与ERK瞬态激活的观察
明确脂肪生成过程中初级纤毛组装/解聚与ERK激活的时间关系。
FACS分选小鼠脂肪前体细胞,培养至Day -1、Day 0、Day 8,免疫荧光检测ARL13B和Ac-tubulin标记的纤毛,RNA-seq分析纤毛相关基因和MAPK通路,免疫印迹检测ERK、JNK、p38、AKT磷酸化。
Transient activation of ciliary CCR2 signaling promotes the initiation of adipogenesis.
含体外3T3-L1和原代前脂肪细胞、体内Ift88敲除小鼠模型、RNA-seq及功能与机制验证
3T3-L1前脂肪细胞系 小鼠原代脂肪前体细胞及SVF Ift88fl/fl;Ubc-Cre/ERT2全身诱导性敲除小鼠 高脂饮食喂养小鼠模型
3T3-L1及SVF在0.25×分化培养基中经CCL2(100 ng/mL)处理前48小时 IFT88敲低或敲除阻断纤毛组装,HDAC6敲低或AurkA D274A突变阻止纤毛解聚 U0126(10 µM)在诱导后12–72小时处理以抑制ERK INCB3344(100 nM)处理前48小时或体内35 mg/kg/day局部注射2周 BrdU(1 mg/mL饮水)标记增殖前体细胞并追踪成熟脂肪细胞核
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确脂肪生成过程中初级纤毛组装/解聚与ERK激活的时间关系。
FACS分选小鼠脂肪前体细胞,培养至Day -1、Day 0、Day 8,免疫荧光检测ARL13B和Ac-tubulin标记的纤毛,RNA-seq分析纤毛相关基因和MAPK通路,免疫印迹检测ERK、JNK、p38、AKT磷酸化。
验证纤毛组装和解聚是否通过调控ERK瞬态激活影响脂肪生成启动。
siRNA敲低IFT88或HDAC6,或用CytoD处理细胞,检测纤毛数量/长度、BODIPY脂滴、p-ERK水平;用TBHQ或U0126在特定时间窗处理,结合罗格列酮 rescue。
验证高脂饮食脂肪组织SVF来源的分泌因子是否通过前脂肪细胞纤毛促进脂肪生成。
收集HFD或SD小鼠sWAT SVF条件培养基,处理3T3-L1和SVF,在0.25× DM条件下检测ORO、BODIPY、PPARγ/C/EBPα表达;用CilioD或IFT88敲低/敲除阻断纤毛。
确定脂肪微环境中经纤毛促进脂肪生成的关键炎症因子及其受体。
对HFD和SD小鼠vWAT/sWAT SVF进行qRT-PCR筛选炎症因子,结合RNA-seq受体表达和Venn分析;用CCL2或IL-13处理3T3-L1,检测ORO和BODIPY;用IFT88/HDAC6敲低或AurkA D274A阻断纤毛动态,检测CCL2效应和ERK磷酸化。
验证CCR2是否定位于前脂肪细胞初级纤毛,以及该定位是否增强CCL2/CCR2–ERK信号。
免疫荧光检测内源和GFP-CCR2在3T3-L1及原代前脂肪细胞纤毛的定位,TULP3敲低检测纤毛转运;INCB3344处理检测脂肪生成;免疫沉淀检测CCR2酪氨酸磷酸化和Y152F突变;IFT88或TULP3敲低检测CCR2磷酸化。
在体内验证CCR2信号促进脂肪生成依赖于前脂肪细胞初级纤毛。
构建Ift88fl/fl;Ubc-Cre/ERT2小鼠,他莫昔芬诱导全身Ift88敲除,sWAT局部注射INCB3344 2周,HFD喂养8周,BrdU标记前体细胞,检测脂肪细胞大小、BrdU+脂肪细胞核、Pparg和Cebpa表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | T-5648 |
| INCB3344 | MCE | HY-50674 | |
| 溴脱氧尿苷 | Merck | 203806 | |
| 标准饲料 | Research Diets | D12450J | |
| 高脂饲料 | Research Diets | D12492 | |
| SVF分离 | Medium 199培养基 | Sigma-Aldrich | M4530 |
| II型胶原酶 | Sigma-Aldrich | C6885 | |
| DNA酶 | Worthington | LS006344 | |
| 泊洛沙姆188 | Sigma-Aldrich | P5556 | |
| 流式分选 | CD45 APC-Cy7抗体 | BioLegend | 103116 |
| CD31 FITC抗体 | BioLegend | 102406 | |
| CD34 PE抗体 | BioLegend | 128610 | |
| CD29 Alexa Fluor 700抗体 | BioLegend | 102218 | |
| Sca1 Pacific Blue抗体 | BioLegend | 108120 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Thermo Fisher | 11995065 |
| 牛小牛血清 | Sigma-Aldrich | 12133C | |
| 青霉素/链霉素 | Thermo Fisher | 15140163 | |
| GlutaMAX添加剂 | Thermo Fisher | 35050061 | |
| 胰蛋白酶-EDTA | Thermo Fisher | 25200072 | |
| 质粒转染 | ClonExpress II一步克隆试剂盒 | Vazyme | C112-01 |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | L3000150 | |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | 13778100 |
| 油红O染色 | 油红O | Sigma-Aldrich | O0625 |
| 免疫荧光 | BODIPY染料 | Thermo Fisher | D3922 |
| DAPI染料 | Thermo Fisher | D3571 | |
| Fluoromount-G封片剂 | SouthernBiotech | 0100-01 | |
| 乙酰化微管蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | T7451 | |
| pericentrin抗体 | Abcam | ab220784 | |
| CD24抗体 | proteintech | 10600-1-AP | |
| Ki67抗体 | Abcam | ab15580 | |
| CCR2抗体 | NOVUS | NBP2-67700 | |
| Flag抗体 | Abcam | ab205606 | |
| BrdU抗体 | Abcam | ab6326 | |
| caveolin-1抗体 | Cell Signaling Technology | 3238 | |
| Alexa Fluor 488标记的山羊抗大鼠IgG | Thermo Fisher | A11006 | |
| Alexa Fluor 568标记的驴抗兔IgG | Thermo Fisher | A10042 | |
| 流式分析 | CellMask Orange染料 | Invitrogen | C10045 |
| Fix/Perm试剂 | eBioscience | 00-512343 | |
| 流式细胞术BrdU FITC染色试剂盒 | Invitrogen | 8811-6600 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013 |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Thermo Scientific | 78440 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Scientific | 23227 | |
| ECL化学发光试剂 | Millipore | WBULS0100 | |
| 免疫沉淀 | 抗Flag M2亲和凝胶 | Sigma-Aldrich | A2220 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Thermo Scientific | 87786 | |
| qRT-PCR和RNA测序 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| RNeasy脂质组织迷你试剂盒 | Qiagen | 74804 | |
| 无RNase DNA酶I | Thermo Fisher | EN0521 | |
| SuperScript III第一链cDNA合成试剂盒 | Invitrogen | 11754250 | |
| Power SYBR Green预混液 | Applied Biosystems | 4367659 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与脂肪分化 | 3T3-L1细胞代数(30代以内)、分化培养基组成(1 μg/mL胰岛素、1 μM地塞米松、0.5 mM IBMX)及0.25× DM配方 阅读提示:Methods 'Cell culture and adipogenic differentiation' |
| CCL2处理 | CCL2浓度100 ng/mL、处理时间窗(前48小时或≤8/12/24小时脉冲) 阅读提示:Methods 'Cell culture and adipogenic differentiation'及Supplementary Fig. 4o |
| 纤毛扰动 | IFT88或HDAC6 siRNA浓度25 nM、转染试剂Lipofectamine RNAiMAX、AurkA D274A突变体表达 阅读提示:Methods 'Plasmid and siRNA transfection'及Fig. 2、Fig. 4 |
| ERK抑制时间窗 | U0126浓度10 μM、处理窗口(12–72小时或从指定时间点至48小时) 阅读提示:Fig. 2k、Fig. 4m及Supplementary Fig. 2g |
| 体内实验 | 他莫昔芬剂量(20 mg/mL,100 μL/天,连续5天)、INCB3344剂量(35 mg/kg/day,2周)、HFD喂养8周、BrdU 1 mg/mL饮水 阅读提示:Methods 'Animal models'及Fig. 6a |