检测蚊唾液中的sfRNA
验证正黄病毒感染蚊唾液是否分泌sfRNA
对口腔感染或胸腔接种WNV的库蚊、胸腔接种ZIKV的伊蚊收集唾液腺和唾液,用Northern blot、减式RT-qPCR绝对定量及SL-RT-PCR检测gRNA和sfRNA
Multiple orthoflaviviruses secrete sfRNA in mosquito saliva to promote transmission by inhibiting MDA5-mediated early interferon response.
含蚊唾液sfRNA检测、人细胞与皮肤外植体功能验证、小鼠体内验证及MDA5机制验证
西尼罗病毒感染的口服/胸腔接种库蚊唾液 寨卡病毒胸腔接种伊蚊唾液 人皮肤外植体 C57BL/6J小鼠皮内共注射模型
口腔感染库蚊唾液sfRNA:gRNA比值分组为低(<15)、中(15–350)、高(>350) 人细胞感染时以等gRNA拷贝数(如1000拷贝)接种并用未感染唾液补足体积 sfRNA转染剂量为1010拷贝,WNV感染MOI为0.005或0.5 小鼠皮内注射103 PFU WNV与1010拷贝sfRNA或对照RNA,总体积4 µl MDA5沉默使用5 pmol siRNA,MRT67307使用10 µM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证正黄病毒感染蚊唾液是否分泌sfRNA
对口腔感染或胸腔接种WNV的库蚊、胸腔接种ZIKV的伊蚊收集唾液腺和唾液,用Northern blot、减式RT-qPCR绝对定量及SL-RT-PCR检测gRNA和sfRNA
验证唾液sfRNA是否受脂质膜保护并区别于病毒粒子
在Triton X-100去垢剂处理前后用MNase(WNV)或RNase A/T1(ZIKV)处理唾液,检测sfRNA和gRNA降解情况
检验不同sfRNA浓度唾液对人间细胞和皮肤外植体感染的影响
按sfRNA:gRNA比值分组唾液,以等gRNA拷贝数感染Huh7细胞和人皮肤外植体,检测WNV感染强度
确认sfRNA本身足以增强感染
在Huh7、HFF1、U937细胞中转染sfRNA或对照RNA后感染WNV,并在人皮肤外植体中共注射sfRNA与WNV
评估sfRNA对皮肤感染和疾病严重程度的影响
小鼠皮内共注射WNV与sfRNA或对照RNA,检测注射部位皮肤感染、临床评分、体重和生存
确定sfRNA增强感染是否依赖IFN及MDA5信号
检测IFN-β、CXCL10、MX1、IFI6表达;用MRT67307抑制IFN诱导、Huh7.5细胞缺失RIG-I、siRNA沉默MDA5后检测sfRNA效应
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Dulbecco改良Eagle培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Eurobio | -- | |
| 青霉素/链霉素混合液 | Invitrogen | -- | |
| 蚊虫饲养 | TetraMin鱼饲料 | Tetra | -- |
| 蚊虫人工感染 | Hemotek喂血系统 | Discovery Workshops | -- |
| 三磷酸腺苷 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 蚊虫接种 | Nanoject II显微注射器 | Drummond Scientific Company | -- |
| 唾液收集 | Erioglaucine蓝染料 | Sigma-Aldrich | -- |
| 唾液腺匀浆 | Fast-Prep珠磨匀浆器 | MP | -- |
| sfRNA体外转录 | Megascript T7试剂盒 | Ambion | -- |
| RNA提取 | E.Z.N.A.总RNA提取试剂盒I | Omega | -- |
| Northern blot | NorthernMax试剂盒 | Ambion | -- |
| TRIzol试剂 | Invitrogen | -- | |
| Hybond-N+尼龙膜 | Merck | -- | |
| Trans-Blot Turbo转膜仪 | Bio-Rad | -- | |
| 生物素-16-dUTP | Roche | -- | |
| Odyssey封闭液 | LI-COR | -- | |
| IRDYE 800cw链霉亲和素 | LI-COR | -- | |
| ChemiDoc成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| RT-qPCR | iTaq Universal SYBR Green一步法RT-qPCR试剂盒 | Bio-Rad | -- |
| iTaq Universal探针一步法RT-qPCR试剂盒 | Bio-Rad | -- | |
| LightCycler 96热循环仪 | Roche | -- | |
| RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | -- | |
| M-MLV逆转录酶 | Promega | -- | |
| AriaMx热循环仪 | Agilent | -- | |
| EvaGreen qPCR预混液 | Euromedex | -- | |
| SL-RT-PCR | T4 DNA连接酶 | NEB | -- |
| RNase OUT抑制剂 | Thermo Scientific | -- | |
| 无RNase DNase I | Thermo Scientific | -- | |
| GelRed核酸染料 | -- | -- | |
| T4多核苷酸激酶 | NEB | -- | |
| RNase抗性试验 | Triton X-100 | Sigma | -- |
| 微球菌核酸酶 | Thermo Scientific | -- | |
| RNase A/T1 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| RNA提取 | QIAamp病毒RNA试剂盒 | Qiagen | -- |
| 病毒滴定 | 羧甲基纤维素 | Sigma-Aldrich | -- |
| 结晶紫溶液 | VWR | -- | |
| 人皮肤外植体培养 | 两性霉素B | Biowest | -- |
| HEPES缓冲液 | Gibco | -- | |
| 细胞培养插板(Thincert) | -- | -- | |
| 无动物成分皮肤培养基(MIL215C) | Biopredic | -- | |
| 逆转录 | PrimeScript逆转录试剂盒 | Takara Bio Inc. | -- |
| 实时定量PCR | Takyon ROX SYBR预混液blue dTTP | Eurogentec | -- |
| Applied Biosystems QuantStudio 5实时PCR仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞转染 | TransIT-mRNA转染试剂盒 | Mirus | -- |
| 化学抑制干扰素信号 | MRT67307 | MedChemExpress | -- |
| MDA5沉默 | 多重siRNA | Qiagen | SI05130608 |
| Allstars多重siRNA | Qiagen | SI91027281 | |
| Lipofectamine RNAiMax转染试剂 | ThermoFisherScientific | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Biotech | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物(cOmplete) | Roche | -- | |
| Qubit蛋白定量试剂 | ThermoFisherScientific | -- | |
| 抗MDA5抗体 | Proteintech | 21775-1-AP | |
| 抗肌动蛋白抗体 | Invitrogen | MA5-11869 | |
| HRP标记抗兔IgG抗体 | Cell Signaling | -- | |
| SuperSignal West Pico PLUS化学发光底物 | ThermoScientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 蚊虫感染与唾液收集 | 蚊种与株系(Cx. quinquefasciatus SLAB、Ae. aegypti Bora-Bora);感染途径(口腔感染8×10^5 PFU/ml WNV或胸腔接种100 PFU WNV、50 PFU ZIKV);采样时间(口腔感染10天、接种7天);唾液收集条件 阅读提示:Methods的Mosquito oral infection、Mosquito inoculation、Salivary glands dissection and saliva collection小节 |
| sfRNA绝对定量 | 减式RT-qPCR引物、标准曲线及sfRNA检测率计算方式;gRNA与3’UTR+sfRNA联合定量条件 阅读提示:Methods的Absolute quantification of sfRNA copies小节及Supplementary Note |
| 脂质囊泡保护性检测 | Triton X-100浓度与处理时间;MNase或RNase A/T1用量与孵育条件;唾液池样本量(40个唾液) 阅读提示:Methods的RNase resistance assay小节及Fig. 2图注 |
| 感染性唾液感染人细胞和皮肤外植体 | 唾液按sfRNA:gRNA比值分组阈值(<15、15–350、>350);接种gRNA拷贝数(Huh7 1000拷贝、外植体760拷贝);用未感染唾液补足体积;24和48 hpi检测 阅读提示:Methods的Infection of human cells with WNV infectious Culex saliva、Injection of WNV infectious Culex saliva into human skin explants小节及Fig. 3图注 |
| sfRNA转染与WNV感染 | 转染1010拷贝sfRNA;MOI 0.005或0.5;转染2 h后感染1 h;细胞类型Huh7、HFF1、U937、Huh7.5 阅读提示:Methods的Infection of human cells post sfRNA transfection小节及Fig. 3、Fig. 4图注 |
| 小鼠皮内共注射模型 | 小鼠品系与周龄(C57BL/6J雄性5–7周龄);WNV 103 PFU与sfRNA 1010拷贝;总体积4 µl;24 h皮肤活检、4 dpi RNAemia、临床评分标准与观察终点 阅读提示:Methods的Co-injection of sfRNA and WNV in mice小节及Fig. 3图注 |
| MDA5与IFN机制验证 | MRT67307 10 µM处理1 h;MDA5 siRNA 5 pmol转染过夜、48 h后二次转染;Huh7.5细胞RIG-I缺陷背景 阅读提示:Methods的Chemical inhibition of interferon signaling、MDA-5 silencing小节及Fig. 5图注 |