建立大鼠OA模型并筛选差异代谢物
鉴定与OA及衰老相关的关键代谢物
建立DMM手术和衰老两种大鼠OA模型,进行micro-CT、组织学染色与软骨代谢组学分析,并在人血清和滑液中检测LA水平
Linoleic acid accelerates osteoarthritis progression in male rats by targeting iron-sulfur clusters to drive ferroptosis in chondrocytes.
含大鼠DMM与衰老模型、软骨细胞及人软骨外植体、DARTS/SPR/CETSA靶点验证、铁硫簇体外组装及AAV/重组蛋白体内验证
雄性SD大鼠DMM模型 雄性SD大鼠衰老模型 大鼠原代软骨细胞 人胫骨软骨外植体
LA关节腔注射剂量1或10 mg/kg,DMM术后2周开始,每周两次至终点 AAV-ISCU(1×10^12 VG)或ISCU重组蛋白于DMM术后2周关节腔注射 moderate treadmill运动方案30 min/d、5 d/wk、6 wk,术后2周开始 LA体外处理软骨细胞浓度梯度0–800 μM,处理24 h 关键结合位点为ISCU第75位赖氨酸(LYS-75),SPR测得KD为4.78×10^-5
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定与OA及衰老相关的关键代谢物
建立DMM手术和衰老两种大鼠OA模型,进行micro-CT、组织学染色与软骨代谢组学分析,并在人血清和滑液中检测LA水平
明确LA是否诱导软骨细胞铁死亡及基质分解
用浓度梯度LA处理软骨细胞,检测活力、脂滴、线粒体形态、铁死亡标志物及脂质过氧化和GSH水平,并用多种细胞死亡抑制剂区分死亡形式
在人软骨组织中验证LA的促退变与铁死亡作用
取人胫骨外侧软骨外植体,用LA及Fer-1处理2周后进行组织学与免疫荧光检测
寻找LA在软骨细胞中的直接结合蛋白及关键结合位点
采用DARTS蛋白质组学筛选靶点,结合分子动力学模拟、SPR、CETSA及氨基酸缺失突变体验证LA与ISCU的结合
阐明LA降低ISCU蛋白并影响铁硫簇合成的途径
用CHX、MG-132、CQ处理检测ISCU降解途径,免疫荧光检测ISCU与LAMP2共定位,并在体外重组体系检测铁硫簇组装
确定ISCU减少后激活IRP1并驱动铁死亡的机制
通过蛋白质组学、Co-IP、PLA及si-IRP1敲低检测ISCU与IRP1互作及铁死亡相关蛋白表达变化
评估上调或补充ISCU对DMM大鼠OA进展的影响
通过AAV-ISCU或ISCU重组蛋白关节腔注射,结合micro-CT、组织学、免疫组化与步态分析评估疗效
考察适度运动联合ISCU上调对LA加剧OA模型的协同作用
在高剂量LA诱导的DMM模型中进行适度跑台运动及联合AAV-ISCU治疗,检测影像学、组织学及铁死亡标志物
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 亚油酸 | MedChemExpress (MCE) | HY-N0729 |
| Fer-1 | MedChemExpress (MCE) | HY-100579 | |
| Nec-1s | MedChemExpress (MCE) | HY-14622A | |
| Z-VAD-FMK | MedChemExpress (MCE) | HY-16658B | |
| 氯喹 | MedChemExpress (MCE) | HY-17589A | |
| PRGL493 | MedChemExpress (MCE) | HY-139180 | |
| MG-132 | MedChemExpress (MCE) | HY-13259 | |
| DARTS | 链霉蛋白酶 | Roche | PRON-RO |
| 铁硫簇组装 | 重组IscS蛋白 | FineTest | P8370 |
| 细胞处理及铁硫簇组装 | 重组ISCU蛋白 | MCE | HY-P72066 |
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| ELISA | 亚油酸竞争性ELISA检测试剂盒 | Enzymatics | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8细胞活力检测试剂盒 | Beyotime | C0037 |
| 铁死亡检测 | C11-BODIPY探针 | Thermo Fisher Scientific | D3861 |
| 丙二醛检测试剂盒 | Beyotime | S0131S | |
| 谷胱甘肽检测试剂盒 | Beyotime | S0053 | |
| 亚铁离子检测试剂盒 | Beyotime | C1190S | |
| 免疫荧光 | 多重免疫荧光试剂盒 | Huilanbio Biological Technology | -- |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| ECL化学发光底物 | Fude Biological Technology | FD8020 | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Takara Bio Inc. | -- |
| RT-qPCR | 逆转录酶试剂盒 | TransGen | -- |
| Co-IP | 蛋白A磁珠 | Thermo Fisher Scientific | 88804 |
| PLA | Duolink原位PLA抗兔PLUS和抗小鼠MINUS探针 | Merck | DUO92101 |
| micro-CT | micro-CT 50系统 | Scanco Medical | -- |
| 机械应力加载 | ElectroForce 3200装置 | -- | -- |
| 细胞应力刺激 | 细胞应力测试系统 | Naturethink | NKP40 |
| SPR | Series S CM5传感芯片 | -- | -- |
| PlexArray HT系统 | Plexera | -- | |
| 分子动力学模拟 | Desmond/Maestro | -- | 2022.1 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| LA关节腔注射大鼠OA模型 | LA剂量1或10 mg/kg;DMM术后2周开始,每周两次至终点;每组n=8 阅读提示:Methods动物实验及Fig. 3a图注 |
| AAV-ISCU或ISCU重组蛋白治疗 | AAV-ISCU剂量1×10^12 VG;DMM术后2周关节腔注射,每周两次至终点;每组n=8 阅读提示:Methods动物实验及Fig. 7a图注 |
| 适度跑台运动 | 30 min/d、5 d/wk、6 wk;DMM术后2周开始 阅读提示:Methods动物实验 |
| 软骨细胞LA处理 | LA浓度梯度0–800 μM;处理24 h;细胞实验重复至少3次 阅读提示:Methods细胞培养与处理、Fig. 2b图注 |
| DARTS靶点鉴定 | pronase 1:400稀释、室温30 min;LA或溶剂孵育1 h 阅读提示:Methods DARTS and CETSA、Supplementary Fig. 4c |
| 铁硫簇体外组装 | ISCU 50 μM、IscS 30 μM、DTT 2 mM、Fe(NH4)2(SO4)2 400 μM、L-cysteine 50 μM、GSH 10 mM;37°C;每5 min采集光谱 阅读提示:Methods Iron-sulfur cluster assembly and synthesis、Fig. 5i |
| 人软骨外植体处理 | LA与Fer-1处理2周;外植体n=6;外侧软骨为对照 阅读提示:Results及Fig. 2l–p图注 |