hPSCs来源CCOs的诱导分化
建立具有稳定腔室结构的腔室样心脏类器官。
将hPSCs经多阶段分化,依次加入FGF、BMP4、CHIR99021、LY294002、Activin A、IWP2、胰岛素、PD173074、SB431542和视黄酸等分子,诱导形成CCOs。
Self-assembled chamber-like cardiac organoids for modeling cardiac chamber formation and cardiotoxicity assessment.
包含体外类器官模型、单细胞转录组、基因敲除功能验证及药物处理功能验证等多个独立证据层级。
H9人胚胎干细胞来源的腔室样心脏类器官 H1人胚胎干细胞来源的腔室样心脏类器官 UiPSC来源的腔室样心脏类器官 CRISPR/Cas9基因敲除CCOs(TFAP2B、NR2F2、NR2F1、HAND1、NKX2-5、ETS1)
CCOs培养至day 11.5形成单一腔室,day 90.5后仍稳定,成功率95%(N=8,n>600) 免疫荧光证实TNNT2+心肌层在外、CDH5+内皮层在内,形成腔室结构 scRNA-seq显示87.4%细胞为TNNT2+心肌细胞,其中76.2%表达NR2F2、11.5%表达MYL3 AA和RA浓度组合(A4R50、A4R500、A50R500)影响腔室形成时间和稳定性 DOX(5 μM)处理24/48 h导致腔室面积减小、细胞活力降低和LDH释放升高
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立具有稳定腔室结构的腔室样心脏类器官。
将hPSCs经多阶段分化,依次加入FGF、BMP4、CHIR99021、LY294002、Activin A、IWP2、胰岛素、PD173074、SB431542和视黄酸等分子,诱导形成CCOs。
验证CCOs是否形成腔室结构及心肌/内皮分层。
通过明场成像、免疫荧光、lightsheet 3D成像和单细胞RNA测序分析腔室形态、TNNT2+心肌层、CDH5+内皮层及细胞类型组成。
探究FGF信号在腔室形态发生中的作用。
在早期分化阶段使用FGFR1抑制剂PD173074或PD166866,以及FGFR4抑制剂H3B-6527处理,观察腔室形成和基因表达变化。
确定AA和RA在腔室形成和稳定性中的作用及最佳浓度。
测试三种AA和RA浓度组合(A4R50、A4R500、A50R500),通过明场成像和腔室面积测量评估腔室形成时间、大小和稳定性。
验证TFAP2B、NR2F2、NR2F1、HAND1和NKX2-5在腔室形成中的作用。
利用CRISPR/Cas9生成各转录因子敲除的hESC系,分化形成CCOs后通过明场成像、免疫荧光和搏动率测量评估腔室形态和功能。
验证CCOs平台用于心脏毒性和致畸性筛选的可行性。
使用ISO、DOX、DNR、沙利度胺、阿维A酸和阿司匹林处理CCOs,通过明场成像、运动分析、钙成像、CCK-8、LDH释放和qPCR评估药物效应。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | mTeSR1培养基 | Stemcell Technologies | 85850 |
| 基质胶 | Corning | 354230 | |
| TrypLE Express酶 | Thermo Fisher | 12563029 | |
| Accutase细胞消化液 | Stemcell Technologies | 07920 | |
| Y-27632 | TargetMol | T1725 | |
| 类器官培养 | 超低吸附U型底96孔板 | Corning | 7007 |
| 超低吸附U型底96孔板 | Thermo Fisher | 174929 | |
| 类器官分化 | IMDM培养基 | Gibco | 12440053 |
| F-12营养混合物 | Thermo Fisher | 11765054 | |
| 转铁蛋白 | Sigma-Aldrich | T8158 | |
| 单硫代甘油 | Sigma-Aldrich | M6145 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | SRE0098 | |
| 人BMP4 | R&D systems | 314-BP-500 | |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | Peprotech | 100-18B | |
| 激活素A | Peprotech | 120-14-1000 | |
| CHIR99021 | Tocirs | 4423 | |
| LY294002 | Selleck | S1105 | |
| IWP2 | Selleck | S7085 | |
| SB431542 | Selleck | S1067 | |
| PD-173074 | AbMole | M1875 | |
| H3B-6527 | Macklin | H881517 | |
| 视黄酸 | Selleck | S1653 | |
| 胰岛素 | Selleck | S6955 | |
| 基因敲除筛选 | 嘌呤霉素 | Beyotime | ST551 |
| 免疫荧光 | O.C.T.包埋剂 | Sakura | 4583 |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T9284 | |
| 封闭液 | Beyotime | P0102 | |
| 一抗稀释液 | Beyotime | P0103 | |
| 二抗稀释液 | Beyotime | P0108 | |
| DAPI | Abcam | ab104139 | |
| HAND1抗体 | R&D Systems | AF3168 | |
| HAND1抗体 | Genetex | GTX56230 | |
| NKX2-5抗体 | CST | 8792 | |
| WT1抗体 | Abcam | ab89901 | |
| VIM抗体 | CST | 5741S | |
| VE-cadherin/CDH5抗体 | CST | 2500S | |
| TNNT2抗体 | Abcam | ab8295 | |
| NR2F2抗体 | R&D Systems | PP-H7147-00 | |
| CASP3抗体 | CST | 9961 T | |
| Ki-67抗体 | BD Bioscience | 556003 | |
| NR2F2抗体 | Abcam | ab211777 | |
| MYL3抗体 | Abcam | ab108923 | |
| LAMA2抗体 | Thermo Fisher | PA549929 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG | Beyotime | A0216 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Beyotime | A0208 | |
| HRP标记的驴抗山羊IgG | Beyotime | A0516 | |
| 钙成像 | Fluo-4 AM钙指示剂 | Beyotime | S1060 |
| Pluronic F-127 | Beyotime | St501 | |
| 玻璃底培养板 | Cellvis | P96-1.5H-N | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂 | Beyotime | C0038 |
| 细胞毒性检测 | LDH释放检测试剂盒 | LabLead | L0117 |
| RNA提取 | RNA-easy提取试剂 | Vazyme | 701 |
| RT-qPCR | HiScript II Q逆转录预混液 | Vazyme | R222 |
| ChamQ SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q711 | |
| 单细胞解离 | STEMdiff心肌细胞解离试剂盒 | Stemcell Technologies | 05025 |
| 电生理 | Axopatch 700 A放大器 | Axon Instruments | -- |
| Digidata 1550B数模转换器 | Axon Instruments | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| CCOs诱导分化 | 各阶段小分子和生长因子浓度及处理时间(FGF 30 ng/mL、BMP4 3 ng/mL、CHIR99021 5 μM、LY294002 5 μM、Activin A 10 ng/mL、IWP2 5 μM、PD173074 0.5 μM、SB431542 0.5 μM、RA 0.5 μM、胰岛素10 μg/mL);PD173074在24 h后去除 阅读提示:Methods 'Generation of self-assembled chamber-like cardiac organoids'及Fig. 1b |
| AA和RA浓度优化 | AA和RA浓度组合(A4R50、A4R500、A50R500)及最终选择A10R500的依据 阅读提示:Results 'Activin A and RA are essential for chamber formation or stability'及Fig. 4 |
| 基因敲除CCOs | sgRNA序列、敲除细胞系来源(H1或H9)、转染程序(Nucleofector 2b,program B16)及嘌呤霉素筛选浓度0.1 ng/mL 阅读提示:Methods 'Generation of NR2F2, NR2F1, TFAP2B, ETS1, HAND1 and NKX2-5 knock out cell lines'及Table 1 |
| 心脏毒性药物处理 | ISO 1 μM 30 min、普萘洛尔2.5 μM 30 min预处理、DOX/DNR 5 μM 24/48 h、CCK-8和LDH检测时间点 阅读提示:Methods 'Doxorubicin or daunorubicin treatment for viability and toxicity assays'及Fig. 6 |
| 致畸性药物处理 | 沙利度胺10 μg/mL、阿维A酸50 nM、阿司匹林30 μM,从day 0加入;沙利度胺从day 15.5加入的后期暴露实验 阅读提示:Results 'Drug screening for teratogenicity with CCOs'及Fig. 7 |