建立MI模型并检测Caspase-8/Gsdmd通路激活
验证MI后心肌中Caspase-8及其下游Gsdmd是否被激活。
雄性C57BL/6小鼠行LAD结扎24 h,TTC染色评估梗死面积,检测梗死边缘区Caspase-8 mRNA和蛋白(含Caspase-8-p18)、Gsdmd/Gsdmd-N蛋白及Caspase-8免疫荧光。
Loss of DNA methyltransferase 3a enhances Caspase-8 transcription and promotes cardiomyocyte pyroptosis during myocardial infarction.
包含小鼠MI模型、NMVCs体外缺氧/基因操作、AAV9体内过表达、Gsdmd-CKO小鼠、Co-IP、ChIP、BSP/MSP等多层功能与机制验证
雄性C57BL/6小鼠LAD结扎24 h心肌梗死模型 新生小鼠心室心肌细胞(NMVCs) 心肌细胞特异性Gsdmd敲除(Gsdmd-CKO)小鼠
MI模型:雄性C57BL/6小鼠(6-8周龄,22-25 g)LAD结扎24 h,以ECG ST段抬高和局部心肌苍白确认缺血 AAV9体内过表达:6周龄小鼠尾静脉注射1×10^11 vg/只,Caspase-8于注射后4周、Dnmt3a于6周后行MI手术 Caspase-8抑制:Z-IETD-fmk 4 mg/kg与necrostatin-1 3.5 mg/kg经尾静脉注射,MI前0.5 h和1 h给药 NMVCs处理:5aza 10 μM处理24 h;缺氧条件1% O2、99% N2、37°C处理24 h;si-Dnmt3a序列GCACAACAGAGAAACCTAA,si-Caspase-8序列GCGCAGACCACAAGAACAA 检测终点:超声心动图EF/FS、TTC梗死面积、H&E、电镜超微结构、ELISA检测LDH/IL-1β/IL-18、Western blot、Co-IP、ChIP、BSP/MSP
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证MI后心肌中Caspase-8及其下游Gsdmd是否被激活。
雄性C57BL/6小鼠行LAD结扎24 h,TTC染色评估梗死面积,检测梗死边缘区Caspase-8 mRNA和蛋白(含Caspase-8-p18)、Gsdmd/Gsdmd-N蛋白及Caspase-8免疫荧光。
验证Caspase-8过表达是否通过Gsdmd诱导心肌细胞焦亡和心功能障碍。
AAV9-CMV-GFP-Caspase-8尾静脉注射小鼠,4周后检测心功能、组织形态、超微结构、血清LDH/IL-1β/IL-18、Gsdmd-N膜定位;在Gsdmd-CKO小鼠中重复Caspase-8过表达。
验证抑制Caspase-8/Gsdmd轴能否减轻MI损伤。
MI小鼠联合给予Z-IETD-fmk和necrostatin-1,评估心功能、H&E、电镜、血清LDH、Gsdmd-N/IL-1β/IL-18及Gsdmd-N膜定位;Gsdmd-CKO小鼠行LAD结扎后评估心功能和炎症因子。
探究Caspase-8在MI后上调是否由启动子低甲基化及Dnmt3a减少所致。
BSP检测MI心脏Caspase-8 CpG岛甲基化;NMVCs给予5aza;检测MI心脏Dnmt1/3a/3b蛋白;ChIP检测Dnmt3a与Caspase-8启动子结合;NMVCs过表达或敲低Dnmt3a后检测Caspase-8 mRNA/蛋白及MSP甲基化。
验证Dnmt3a过表达是否通过抑制Caspase-8减轻MI后焦亡。
AAV9-Dnmt3a尾静脉注射小鼠,6周后行LAD结扎24 h,检测心功能、H&E、电镜、血清LDH/IL-1β/IL-18、Caspase-8 mRNA/蛋白、Gsdmd-N/IL-1β/IL-18及Gsdmd-N膜定位。
验证Dnmt3a缺失通过Caspase-8/Gsdmd通路诱导心肌细胞焦亡。
NMVCs转染si-Dnmt3a和/或si-Caspase-8(加Nec-1 10 μM),检测Gsdmd-N蛋白、LDH释放及Hoechst33342/PI染色。
探究MI后Dnmt3a蛋白减少是否由泛素-蛋白酶体降解增强所致。
检测MI心脏Dnmt3a mRNA;缺氧NMVCs检测Dnmt3a蛋白/mRNA;CHX追踪实验、MG132处理、Co-IP检测Dnmt3a泛素化;3-MA处理验证自噬溶酶体途径。
筛选并验证Dnmt3a介导的低甲基化通过Hes1增强Caspase-8转录。
UCSC/JASPAR/甲基化敏感SELEX预测候选转录因子;ChIP验证Tfec、Mycn、Hes1、Zbtb33与Caspase-8启动子结合;NMVCs过表达Hes1并联合Dnmt3a过表达或敲低,检测Caspase-8 mRNA/蛋白。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| TTC染色 | 2,3,5-氯化三苯基四氮唑 | Solarbio | G3005 |
| 细胞培养 | II型胶原酶 | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞处理 | 5-氮杂胞苷 | -- | -- |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | -- | -- | |
| 坏死他汀-1 | -- | -- | |
| Z-IETD-fmk | -- | -- | |
| MG132 | -- | -- | |
| 3-甲基腺嘌呤 | -- | -- | |
| ELISA | 乳酸脱氢酶ELISA试剂盒 | Bio Tek | 14092214 |
| IL-1β ELISA试剂盒 | MEIMIAN | MM-0040M1 | |
| IL-18 ELISA试剂盒 | MEIMIAN | MM-0169M1 | |
| Hoechst/PI染色 | Hoechst/PI染色试剂盒 | Solarbio | CA1120 |
| Western blot | 兔抗Dnmt3a抗体 | Abcam | ab188470 |
| 兔抗Caspase-8抗体 | Cell Signaling Technology | 4790 | |
| 兔抗Cleaved Caspase-8抗体 | Cell Signaling Technology | 8592S | |
| 兔抗Gsdmd抗体 | Abcam | ab219800 | |
| 兔抗IL-1β抗体 | Proteintech | 16806-1-AP | |
| 兔抗IL-18抗体 | Proteintech | 10663-1-AP | |
| 兔抗泛素抗体 | SANTA CRUZ | sc-8017 | |
| 鼠抗β-actin抗体 | Affinity | AF7018 | |
| IRDye 800CW山羊抗鼠IgG | LI-COR | 925-32210 | |
| IRDye 800CW山羊抗兔IgG | LI-COR | 925-32211 | |
| Co-IP | Protein A/G磁珠 | Sigma | HY-K0202 |
| Dnmt3a抗体 | proteintech | 20954-1-AP | |
| DNA甲基化检测 | 基因组DNA提取试剂盒 | TIAGEN | DP304-02 |
| CpGenome Turbo亚硫酸氢盐修饰试剂盒 | Merck | S7847 | |
| 甲基化特异性PCR试剂盒 | TIAGEN | EM101 | |
| 免疫荧光 | Caspase-8抗体 | ABclonal | A0215 |
| Gsdmd-N抗体 | Abcam | ab215203 | |
| α-actinin抗体 | Sigma-Aldrich | A7811 | |
| ChIP | Pierce琼脂糖ChIP试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 26156 |
| Dnmt3a抗体 | Novus | IMG-268A | |
| Hes1抗体 | Novus | NBP1-47791 | |
| Mycn抗体 | Novus | NB200-109 | |
| Tfec抗体 | Proteintech | 13547-1-AP | |
| Zbtb33抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-110588 | |
| RT-qPCR | 逆转录试剂盒 | TOYOBO | -- |
| SYBR Green PCR预混液 | TOYOBO | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| MI动物模型 | 小鼠品系(雄性C57BL/6,6-8周龄,22-25 g)、LAD结扎持续时间(24 h)、缺血确认标准(ECG ST段抬高和局部心肌苍白)、麻醉剂(2% 2,2,2-三溴乙醇,0.1 mL/10 g腹腔注射) 阅读提示:Methods—Animals和Mouse experiments |
| AAV9体内过表达 | AAV9血清型(AAV9)、启动子(CMV)、注射剂量(正文Methods为1×10^11 vg/只,Results中Caspase-8部分写10×10^10 vg/mouse,存在差异)、注射途径(尾静脉)、注射后至MI手术时间(Caspase-8为4周,Dnmt3a为6周) 阅读提示:Methods—Mouse experiments;Results—Forced overexpression of Caspase-8和Dnmt3a exerts cardioprotective effects部分 |
| Caspase-8药理学抑制 | Z-IETD-fmk剂量(4 mg/kg)、necrostatin-1剂量(3.5 mg/kg)、给药途径(尾静脉)、给药时间点(MI前0.5 h和1 h) 阅读提示:Results—Targeted inhibition of Caspase-8/Gsdmd axis部分 |
| NMVCs体外实验 | NMVCs来源(新生C57BL/6小鼠1-3天)、5aza浓度(10 μM)和处理时间(12 h和24 h)、缺氧条件(1% O2、99% N2、37°C、24 h)、siRNA序列(Dnmt3a: GCACAACAGAGAAACCTAA;Caspase-8: GCGCAGACCACAAGAACAA)、Nec-1浓度(10 μM) 阅读提示:Methods—Neonatal mouse ventricular cardiomyocytes culture and treatment;Results—DNA hypomethylation和Dnmt3a suppresses cardiomyocyte pyroptosis部分 |
| Gsdmd-CKO小鼠构建 | Gsdmdflox/flox与Myh6-Cre杂交策略、对照组(Gsdmdflox/flox)、基因型鉴定方法 阅读提示:Methods—Mouse experiments;Fig. 3A |
| DNA甲基化检测 | BSP和MSP的引物序列(MSP引物已在Methods列出)、亚硫酸氢盐修饰试剂盒(CpGenome Turbo Bisulfite Modification Kit,S7847)、MSP试剂盒(EM101) 阅读提示:Methods—DNA extraction and DNA methylation-specific PCR (MSP) |
| ChIP实验 | 交联条件(1%甲醛,室温10 min)、抗体(Dnmt3a IMG-268A;Hes1 NBP1-47791;Mycn NB200-109;Tfec 13547-1-AP;Zbtb33 PA5-110588)、Caspase-8启动子qPCR引物序列 阅读提示:Methods—Chromatin immunoprecipitation (ChIP) |