比较三种JAK抑制剂在DSS结肠炎中的疗效
评估托法替尼、Upadacitinib和Filgotinib对野生型和PTPN2-ΔM小鼠结肠炎严重程度的影响。
野生型和PTPN2-ΔM小鼠给予2% DSS饮水7天,同时每日两次口服灌胃三种JAK抑制剂,监测体重、疾病活动度、内镜和组织学评分,并检测结肠组织培养上清细胞因子。
Indirect inhibition of the NLRP3-interleukin-1β axis contributes to the efficacy of JAK1 inhibitors in experimental colitis and human ulcerative colitis.
采用DSS和T细胞转移性结肠炎小鼠模型、Casp1和Nlrp3缺陷小鼠、患者来源巨噬细胞、单细胞RNA测序及患者活检免疫组化,并进行了功能与机制验证。
DSS诱导的野生型和PTPN2-ΔM小鼠结肠炎模型 Rag1-/-小鼠T细胞转移性结肠炎模型 Casp1缺陷和Nlrp3缺陷小鼠DSS结肠炎模型 溃疡性结肠炎患者肠道活检及外周血单核细胞来源巨噬细胞
三种JAK抑制剂均为50 mg/kg体重,每日两次口服灌胃,于DSS或naïve T细胞注射前3天开始给药 DSS结肠炎采用2% DSS饮水7天;T细胞转移模型每只Rag1-/-小鼠注射0.25×10^6 naïve T细胞 体外炎症小体激活:LPS 50 ng/ml处理24 h,MSU 150 ng/ml 6 h,TiO2 150 ng/ml 12 h,Nigericin 200 ng/ml 6 h,Flagellin 500 ng/ml 2 h,poly(dA:dT) 1 μg/ml 2 h 体外JAK抑制剂终浓度50 μM;MCC950 1 μM;剂量反应使用1 nM至100 μM 患者活检来自16例UC患者,Upadacitinib治疗8–12周前后取乙状结肠组织,按IL-1β表达中位数分为高、低组
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估托法替尼、Upadacitinib和Filgotinib对野生型和PTPN2-ΔM小鼠结肠炎严重程度的影响。
野生型和PTPN2-ΔM小鼠给予2% DSS饮水7天,同时每日两次口服灌胃三种JAK抑制剂,监测体重、疾病活动度、内镜和组织学评分,并检测结肠组织培养上清细胞因子。
在第二种结肠炎模型中比较三种JAK抑制剂的保护作用。
Rag1-/-小鼠注射WT供体来源naïve T细胞诱导结肠炎,给予JAK抑制剂并评估疾病表现。
识别不同JAK抑制剂处理后与疗效差异相关的基因和通路。
DSS结肠炎小鼠第5天处死,每组4只小鼠结肠免疫细胞混合,FACS分选CD11b+和/或CD11c+细胞与CD4+ T细胞按1:1混合,进行10x单细胞RNA测序,比较托法替尼与JAK1i的差异表达基因和通路。
验证JAK1抑制剂是否在蛋白水平抑制Caspase-1和IL-1β的活化。
取JAK抑制剂处理的DSS结肠炎小鼠结肠组织裂解物,Western blot检测活化Caspase-1和IL-1β;结肠组织块培养24 h后ELISA检测上清IL-1β和IL-18。
评估JAK抑制剂对患者来源巨噬细胞炎症小体活化的直接影响。
从IBD患者外周血分离单核细胞,M-CSF诱导分化为巨噬细胞,LPS处理24 h后MSU晶体激活NLRP3,检测上清细胞因子和Western blot活化IL-1β/Caspase-1。
验证Upadacitinib和Filgotinib的保护作用是否依赖炎症小体信号。
在Casp1缺陷小鼠和Nlrp3缺陷小鼠中诱导DSS结肠炎,给予JAK抑制剂,评估体重、疾病活动度、内镜和组织学评分。
确定JAK1抑制剂是否特异性靶向NLRP3炎症小体。
健康志愿者单核细胞来源巨噬细胞LPS处理后,分别用MSU、TiO2、Nigericin激活NLRP3,Flagellin激活NLRC4,poly(dA:dT)激活AIM2,检测IL-1β和IL-18分泌及炎症小体受体mRNA。
判断JAK1抑制剂是否直接结合NLRP3,以及其作用是否依赖经典JAK1信号。
使用NLRP3 NanoBRET Target Engagement assay检测JAK抑制剂与NLRP3的结合,MCC950为阳性对照;在人巨噬细胞中用siRNA敲低JAK1或NLRP3后检测IL-1β分泌。
在人体中验证Upadacitinib对IL1B表达的影响及其与临床应答的关系。
对4例UC患者Upadacitinib治疗8–12周前后的乙状结肠固有层免疫细胞进行单细胞RNA测序;对16例患者治疗前后活检进行IL-1β免疫组化,并按基线IL-1β中位数分组分析Mayo评分。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| T细胞分离 | EasySep™小鼠CD4+ T细胞分离试剂盒 | Stemcell Technologies | 19852 |
| T细胞分选 | Aria III分选仪 | BD | -- |
| 小鼠内镜 | IMAGE1 STM小鼠内镜 | Karl Storz | -- |
| 细胞因子检测 | 小鼠23重细胞因子检测 | BioRad | -- |
| T细胞激活 | 抗CD3/抗CD28磁珠 | Thermo Fisher Scientific | 10131D |
| 炎症小体激活 | 超纯脂多糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| 尿酸钠 | Invivogen | -- | |
| 二氧化钛 | Invivogen | -- | |
| 鞭毛蛋白 | Invivogen | -- | |
| poly(dA:dT) | Invivogen | -- | |
| 核酸转染 | DOTAP转染试剂 | -- | -- |
| NLRP3抑制 | MCC950 | Sigma-Aldrich | -- |
| NLRP3结合实验 | NLRP3 NanoBRET™靶点结合 | Promega | CS1810C523 |
| NLRP3-Nanoluc®融合构建体 | Promega | N1341 | |
| GloMax® Discover发光检测仪 | Promega | GM3000 | |
| Western blot | M-PER蛋白抽提试剂 | Thermo Fisher Scientific | 23225 |
| LDS上样缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | 84788 | |
| ECL化学发光液 | Thermo Fisher Scientific | 32106 | |
| 抗人IL-1β抗体 | R&D Systems | -- | |
| 抗小鼠IL-1β抗体 | R&D/bio-Techne | -- | |
| 抗人/小鼠Caspase-1抗体 | AdipoGen | -- | |
| 抗人STAT1和STAT3抗体 | Cell Signaling Technologies | -- | |
| 抗小鼠STAT1和STAT3抗体 | Cell Signaling Technologies | -- | |
| siRNA敲低 | siJAK1 | Dharmacon | M-003145-02-0005 |
| siNLRP3 | Dharmacon | M-017367-00-0005 | |
| 单细胞RNA测序 | Chromium Next GEM Chip K | 10x Genomics | -- |
| Chromium单细胞5′v2试剂盒 | 10x Genomics | -- | |
| Illumina NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| FACS | 可固定活性染料eFluor™ 506 | eBioscience | -- |
| 抗CD45-BV785抗体 | Biolegend | -- | |
| 抗CD3-BV650抗体 | Biolegend | -- | |
| 抗CD4-PE-Cy7抗体 | Biolegend | -- | |
| 抗CD11b-PE抗体 | Biolegend | -- | |
| 抗CD11c-PE抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 抗CD19-APC-Cy7抗体 | Biolegend | -- | |
| 人细胞分离 | 抗人CD45 PE-Cy7抗体 | Biolegend | -- |
| 组织消化 | DNase I | Roche | -- |
| 胶原酶 | Roche | -- | |
| 免疫组化 | 抗人IL-1β抗体 | R&D Systems | AF-201-SP |
| 抗山羊IgG VisUCyte HRP聚合物抗体 | R&D Systems | VC004 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| DSS结肠炎模型与JAK抑制剂给药 | DSS浓度2%、饮水7天;JAK抑制剂50 mg/kg体重、每日两次口服灌胃、DSS前3天开始;每组n=6;PTPN2-ΔM与WT同窝对照 阅读提示:Methods“Mice and colitis induction”及Fig. 1a、Fig. 1 legend |
| T细胞转移性结肠炎 | Rag1-/-受体;每只注射0.25×10^6 naïve T细胞;JAK抑制剂注射前3天开始、每日两次;具体给药剂量文中未在Methods中单独列出 阅读提示:Methods“Mice and colitis induction”及Supplementary Fig. 1 |
| 单细胞RNA测序样本制备 | DSS第5天取样;每组4只小鼠细胞混合;CD11b+和/或CD11c+与CD4+ T细胞1:1混合;10x Genomics Chromium Single-Cell 5′v2;质控标准200–2500 unique features、线粒体<5% 阅读提示:Methods“Preprocessing and analysis of single-cell RNA-seq”及Fig. 2 legend |
| 体外炎症小体激活与JAK抑制剂处理 | LPS 50 ng/ml 24 h;MSU 150 ng/ml 6 h;TiO2 150 ng/ml 12 h;Nigericin 200 ng/ml 6 h;Flagellin 500 ng/ml 2 h;poly(dA:dT) 1 μg/ml 2 h;JAK抑制剂50 μM;MCC950 1 μM 阅读提示:Methods“In vitro assay and inflammasome activation”及Fig. 6 legend |
| Casp1/Nlrp3缺陷小鼠验证 | Casp1缺陷与WT共居至少3周;2% DSS 7天;JAK抑制剂50 mg/kg每日两次、DSS前3天开始;Casp1实验每组n=4;Nlrp3缺陷实验细节见Supplementary Fig. 6 阅读提示:Methods“Mice and colitis induction”及Fig. 5、Supplementary Fig. 6 |
| UC患者Upadacitinib治疗前后取样 | 16例UC患者,6女10男,30–62岁;Upadacitinib治疗8–12周;乙状结肠活检;Mayo评分;按IL-1β中位数分组;部分低IL-1β组患者使用Budesonide泡沫剂或Prednisone 阅读提示:Methods“Patient samples”、Fig. 7 legend及Supplementary Table 1 |