构建MiMSBiT系统监测线粒体-黑素体接触
建立活细胞中可逆线粒体-黑素体接触的定量方法
在B16F10细胞中稳定表达线粒体外膜靶向LgBiT(TOMM20 1-33aa融合)和黑素体靶向SmBiT(MST标签融合),通过发光检测接触;并用免疫印迹和免疫荧光验证定位。
STIM1-Mitofusin2 interactions tether mitochondria and melanosome contacts that promote melanosome maturation.
包含体外细胞模型、蛋白质相互作用、活细胞动态监测、电镜及斑马鱼体内验证,具备功能与机制验证。
B16F10小鼠黑色素瘤细胞 MNT1人黑色素瘤细胞 斑马鱼胚胎
MiMSBiT发光检测线粒体-黑素体接触:α-MSH或Forskolin处理3小时,n=3 triplicate MFN2或STIM1敲低对接触、酸化、PMEL纤维化的影响;回补实验使用WT及GTPase失活突变体 黑素体腔内pH检测:MELOPS荧光,α-MSH刺激后3小时达峰 斑马鱼胚胎MFI8处理20μM,受精后数小时至3dpf,对照组n=17,MFI8组n=15
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立活细胞中可逆线粒体-黑素体接触的定量方法
在B16F10细胞中稳定表达线粒体外膜靶向LgBiT(TOMM20 1-33aa融合)和黑素体靶向SmBiT(MST标签融合),通过发光检测接触;并用免疫印迹和免疫荧光验证定位。
检测黑素体成熟刺激下线粒体-黑素体接触的动态变化
用α-MSH或Forskolin处理MiMSBiT细胞,测量发光;并用免疫染色分析TOMM20与TRP1共定位。
检验MFN2及其GTPase活性、线粒体定位对接触和色素生成的作用
siRNA敲低Drp1、Opa1、Mfn1、Mfn2,检测MiMSBiT发光;回补WT或GTPase失活MFN2、线粒体或ER靶向MFN2;检测黑色素含量和酪氨酸酶表达。
阐明MFN2是否通过酸化影响PMEL纤维化
用MELOPS检测黑素体腔内pH动力学;用抗PMEL纤维抗体和1% Triton X-100不溶性组分免疫印迹检测PMEL纤维化;bafilomycin A1验证。
寻找与MFN2相互作用并定位于黑素体的拴系蛋白
使用TurboID-MFN2邻近标记结合质谱鉴定候选互作蛋白;免疫染色验证STIM1与TRP1共定位;免疫共沉淀检测STIM1-MFN2结合;敲低STIM1检测接触。
检测STIM1在黑素体成熟中的功能
敲低STIM1,检测MELOPS荧光、黑色素含量、PMEL纤维化;电镜分析含纤维黑素体数量。
验证黑素体钙减少诱导STIM1聚集并与MFN2结合
BN-PAGE检测MFN2-STIM1大复合物;BAPTA-AM处理检测结合和接触;黑素体靶向RCaMP检测腔内钙变化。
确定线粒体ATP供应在成熟中的作用
oligomycin抑制线粒体ATP合成,检测黑色素、MELOPS和PMEL纤维化;黑素体靶向iATPSnFR2检测ATP;2-DG抑制糖酵解。
评估MFN2-STIM1互作在体内的生理意义
使用MFN2 HR2结构域缺失突变体和mitofusin抑制剂MFI8检测STIM1结合和酸化;斑马鱼胚胎用MFI8处理,观察色素。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养与转染 | FuGENE HD转染试剂 | Promega | -- |
| Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| siRNA敲低 | 非靶向siRNA | Qiagen | 1027281 |
| 靶向小鼠Mfn1的siRNA | Qiagen | SI01304387 | |
| 靶向小鼠Opa1的siRNA | Qiagen | SI01365721 | |
| 靶向小鼠Drp1的siRNA | Qiagen | SI00982226 | |
| 靶向小鼠Stim1的siRNA #1 | Qiagen | SI02710736 | |
| 靶向小鼠Stim1的siRNA #2 | Qiagen | 02735068 | |
| 靶向小鼠Tmem33的siRNA | Qiagen | SI01451366 | |
| 靶向小鼠Mff的siRNA | Qiagen | SI00855932 | |
| 靶向小鼠酪氨酸酶的siRNA | Qiagen | 02739107 | |
| 靶向人STIM1的siRNA | Qiagen | SI04251709 | |
| 质粒构建 | PX459载体 | Addgene | #48139 |
| Sleeping Beauty转座子载体 | Addgene | #108352 | |
| pCAG-SB100X质粒 | Addgene | #127909 | |
| pH检测 | MELOPS pH指示剂 | addgene | #80151 |
| 荧光标记 | GFP (Gamillus) | addgene | #124837 |
| 钙检测 | RCaMP钙指示剂 | addgene | #105013 |
| ATP检测 | iATPSnFR2 ATP传感器 | Addgene | #209652 |
| Janelia Fluor JFX554 HaloTag配体 | Promega | HT1030 | |
| 药物处理 | α-促黑素细胞激素 | Peptide Institute | 4057-v |
| 毛喉素 | TGI | F0855 | |
| 黑色素 | sigma | M0418 | |
| 巴弗洛霉素A1 | Adipogen Life Sciences | BVT-0252-C100 | |
| 生物素 | nacarai | 04822-04 | |
| BAPTA-AM钙螯合剂 | nacarai | 3731-24 | |
| 寡霉素 | cayman | 11342 | |
| 2-脱氧-D-葡萄糖 | FUJIFILM | 046-06483 | |
| 免疫印迹 | myc抗体 | Cell Signaling Technology | 2276 |
| V5抗体 | MBL | PM003 | |
| FLAG抗体 | Sigma-Aldrich | F3165 | |
| 免疫印迹/免疫荧光 | TRP1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-166857 |
| 免疫印迹 | ATP5a抗体 | Abcam | ab14748 |
| α-微管蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | T9026 | |
| OPA1抗体 | BD Biosciences | 612606 | |
| mitofusin1抗体 | BioLegend | 831101 | |
| mitofusin2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-100560 | |
| 酪氨酸酶抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-20035 | |
| 链霉亲和素-辣根过氧化物酶 | Vector Laboratories | SA5004 | |
| 免疫印迹/免疫荧光 | STIM1抗体 | Cell Signaling Technology | 4916S |
| 免疫印迹 | GAPDH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-32233 |
| SDHA抗体 | Cell Signaling Technology | 5839S | |
| TOMM20抗体 | Proteintech | 11802-1-AP | |
| 抗PMEL纤维抗体 | -- | -- | |
| Immobilon PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| Chemi-Lumi One L化学发光底物 | Nacalai Tesque | 07880-70 | |
| Immobilon Western化学发光HRP底物 | Millipore | WBKLS0500 | |
| LuminoGraph I成像仪 | ATTO | -- | |
| 免疫荧光 | 荧光封片剂 | Dako | S3023 |
| FV3000共聚焦激光扫描显微镜 | Olympus | -- | |
| 免疫共沉淀 | Protein G Sepharose | GE Healthcare | 17–0618-01 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Nacalai Tesque | 25955-11 | |
| MiMSBiT发光检测 | Nano-Glo活细胞底物 | Promega | N205B |
| NanoBiT缓冲液 | Promega | N206B | |
| Nano-Glo Endurazine | Promega | N2570 | |
| Synergy LX或HTX多功能读板仪 | BioTek | -- | |
| 电镜 | 硫代碳酰肼 | Sigma-Aldrich | 223220 |
| 天冬氨酸 | Sigma-Aldrich | A9256 | |
| Plain Resin | Nisshin EM | 395 | |
| JSM-IT800SHL扫描电子显微镜 | JEOL | -- | |
| BN-PAGE | 洋地黄皂苷 | wako | 043-21371 |
| NativePAGE凝胶 | Invitrogen | -- | |
| 邻近标记 | Dynabeads MyOne链霉亲和素C1磁珠 | Invitrogen | 65001 |
| 质谱 | Ultimate 3000 RSLCnano系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Q Exactive混合四极杆-Orbitrap质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 胰蛋白酶/Lys-C混合物 | Promega | -- | |
| 斑马鱼实验 | MFI8 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| MiMSBiT系统构建与验证 | 质粒构建、转染比例、筛选浓度和单克隆筛选方法;文中未明确说明转染试剂用量和单克隆筛选的具体稀释倍数。 阅读提示:Methods中“Plasmids and Reagents”、“Generation of MiMSBiT system stably expressing cells”和Figure 1 legend。 |
| α-MSH/Forskolin刺激实验 | 处理浓度:α-MSH在MiMSBiT实验中为10 μM(biotin labeling部分),其他实验未明确说明;Forskolin浓度未明确说明;处理时间3小时。 阅读提示:Methods中“Biotin labeling and organelle membrane fraction purified by digitonin”和Figure 1、2 legend。 |
| MFN2/STIM1敲低与回补实验 | siRNA转染浓度和具体序列(除Mfn2 custom siRNA外,其余为Qiagen目录号);回补实验转染时间和用量未明确说明。 阅读提示:Methods中“Small Interfering RNA”和“Plasmids and Reagents”;Figure 2、4、5 legend。 |
| 黑素体pH和钙检测 | MELOPS和RCaMP转染量、检测时间间隔(5分钟)、α-MSH刺激时长;MELOPS荧光定量方法。 阅读提示:Methods中“Kinetic fluorescent probe measurements”和Figure 3、5 legend。 |
| PMEL纤维化检测 | 1% Triton X-100不溶性组分提取条件(125,000g,30分钟,4°C);抗PMEL纤维抗体稀释比例1:2000。 阅读提示:Methods中“Immunoblotting”和Figure 3 legend。 |
| 斑马鱼体内实验 | MFI8浓度20 μM,处理起始时间(受精后数小时),对照组和MFI8组样本量分别为17和15。 阅读提示:Methods中“Zebrafish maintenance and live imaging”和Figure 8 legend。 |