微流控电生理平台构建与表征
建立可实时监测和调控肿瘤-神经相互作用的平台
设计集成微电极阵列的PDMS微流控芯片,实现肿瘤与神经细胞分隔共培养,并实时记录电生理信号;使用LSTM等机器学习方法解码信号。
A Machine Learning-Driven Electrophysiological Platform for Real-Time Tumor-Neural Interaction Analysis and Modulation.
体外微流控共培养、MEA记录、光遗传/电刺激、钙成像、Western blot和RT-qPCR等多层证据,含功能与机制验证
U87 MG胶质瘤细胞系 U251胶质瘤细胞系 E18大鼠海马神经元原代培养 微流控共培养芯片
胶质瘤细胞与神经元的共培养比例(通常1:1,10,000细胞接种) 神经信号刺激参数:持续整个实验期,频率和波形基于劫持信号模拟 MEA记录采样率30 kHz,滤波3 kHz低通 迁移监测时长7天,每日成像,CMC量化 LSTM模型参数:两层128单元,dropout 0.3,学习率0.001,50 epochs
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立可实时监测和调控肿瘤-神经相互作用的平台
设计集成微电极阵列的PDMS微流控芯片,实现肿瘤与神经细胞分隔共培养,并实时记录电生理信号;使用LSTM等机器学习方法解码信号。
验证特定神经网络活动能否驱动胶质瘤高侵袭
在微流控芯片中共培养GFP标记的胶质瘤细胞与海马神经元,7天连续监测细胞迁移,计算细胞迁移中心(CMC)量化侵袭。
区分神经元和胶质瘤细胞的电生理特征,并解码神经信号编码
使用MEA记录神经和肿瘤信号,提取时域和频域特征,训练ResNet-18等模型分类信号;从46,519个神经信号中提取波形,通过LSTM生成模拟信号。
验证被胶质瘤劫持的神经信号是否能单独诱导高侵袭
从高侵袭共培养中提取被改变的神经信号,模拟后直接电刺激纯胶质瘤细胞,观察侵袭变化;并检测EMT相关分子标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 微流控芯片制备 | Sylogard 184硅弹性体基料 | Dow Corning Corporation | -- |
| 电极制备 | 磁控溅射仪ISC-150 | SuPro Instruments | -- |
| 电生理记录 | RHD-2000前置放大器 | -- | -- |
| 表面处理 | 氧等离子清洗机PT-BT10Plus | Sanhoptt Instruments Co., Ltd | -- |
| 细胞培养 | 多聚-L-赖氨酸 | Thermo Fisher Scientific | A3890401 |
| 层粘连蛋白 | Sigma-Aldrich | L2020 | |
| 信号校准 | 信号发生器DG1002 | Rigol Technologies | -- |
| 显微镜观察 | 显微镜BDS400 | Optec Instrument Co., Ltd | -- |
| 电阻测量 | 万用表34465A | Keysight | -- |
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco | C11330500BT |
| 胎牛血清 | Gibco | 10270-106 | |
| L-谷氨酰胺 | Thermo Fisher Scientific | 25030081 | |
| 青霉素-链霉素 | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 免疫荧光 | NeuN抗体 | Cell Signaling | 12943T |
| Cy3标记二抗 | Servicebio | GB21303 | |
| DAPI | Beyotime | C1002 | |
| 钙成像 | Fluo-8 AM钙染料 | Abcam | ab142773 |
| 免疫印迹 | RIPA裂解液 | Epizyme | PC101 |
| 蛋白酶抑制剂 | Epizyme | GRF101 | |
| PVDF膜 | Vazyme | E802-01 | |
| E-钙粘蛋白抗体 | CST | 3195 | |
| 波形蛋白抗体 | CST | 5741 | |
| Snail抗体 | CST | 3879 | |
| ZEB1抗体 | CST | 70512 | |
| GAPDH抗体 | Abbkine | A01020 | |
| RT-qPCR | FastPure细胞/组织总RNA提取试剂盒V2 | Vazyme | RC112-01 |
| PrimeScript RT试剂盒(含gDNA Eraser) | Accurate Biology | AG11706 | |
| SYBR Green Premix Pro Taq HS qPCR试剂盒 | Accurate Biology | AG11701 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 微流控芯片制备与电极表征 | PDMS固化温度和时间、电极尺寸、电极电阻一致性、噪声水平 阅读提示:Methods中“Fabrication of microfluidic electrode array chip”和“Characterization of microfluidic electrode array chip performance”小节,以及图2h |
| 细胞培养与共培养 | 细胞系来源、培养基组成、血清批次、接种密度、共培养比例、神经元原代培养方法 阅读提示:Methods中“Cell culture and immunofluorescence characterization”小节 |
| 电生理记录与信号处理 | 采样率、滤波参数、记录时长、稳定时间、信号检测阈值算法 阅读提示:Methods中“Multi-channel electrode array recording and waveform classification”小节,以及补充图S3、S13 |
| 神经信号刺激实验 | 刺激信号来源(劫持或自发)、刺激持续时间、刺激频率组成、刺激电极位置 阅读提示:Methods中“Glioma invasion assay under neural stimulation”和“Extraction and application of hijacked neural electrophysiological signals”小节 |
| 侵袭量化与分子验证 | CMC计算公式、成像频率、Western blot抗体稀释比例、RT-qPCR引物序列 阅读提示:Methods中“Glioma invasion assay under neural stimulation”、“Immunoblotting”、“Quantitative RT-PCR”小节,以及表S1 |