建立模拟微重力动物与细胞模型并验证衰老样转化
确认模拟微重力是否诱导颈动脉VSMC衰老样转化。
建立大鼠HU模型和MOVAS二维旋转SM模型,通过病理染色、超声、RT-qPCR、Western blot、免疫荧光、β-Gal染色及细胞收缩实验检测VSMC表型。
SREBP1-mediated lipogenesis promotes dedifferentiation and senescence of vascular smooth muscle cells through epigenetic remodeling.
含大鼠HU模型、小鼠AAV模型、MOVAS/HASMC/RCA-SMCs体外模型及RNA-seq、ATAC-seq、脂质组学等多层验证
大鼠后肢去负荷(HU)颈动脉模型 小鼠HU颈动脉模型 MOVAS小鼠主动脉平滑肌细胞 RCA-SMCs大鼠原代颈动脉平滑肌细胞
HU大鼠4周、30°头低位尾悬吊,以比目鱼肌湿重/体重比验证模型 SM细胞模型为二维旋转48 h、0.01 g,对照为1 g静止培养 LXR-623激活SREBP1的浓度与处理时间:文中未明确说明 NaAc 120 mM、DaIC 1:100处理48 h Lv-sh-Srebf1滴度1.5×10^8 TU/mL、AAV滴度3×10^12 Vg/mL,经Laponite水凝胶局部递送
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认模拟微重力是否诱导颈动脉VSMC衰老样转化。
建立大鼠HU模型和MOVAS二维旋转SM模型,通过病理染色、超声、RT-qPCR、Western blot、免疫荧光、β-Gal染色及细胞收缩实验检测VSMC表型。
探究衰老样转化是否伴随脂质代谢紊乱及SREBP激活。
通过TEM、Nile Red/BODIPY染色、脂质组学、ELISA检测脂质;通过GSEA、IHC、IF、Western blot、RT-qPCR检测SREBP1/2表达与核转位。
明确SREBP1而非SREBP2是否直接驱动VSMC衰老样转化。
使用LXR-623激活SREBP1、siRNA敲低Srebf1或Srebf2,检测收缩基因、衰老基因、脂质积累和细胞收缩力。
验证SREBP1激活是否通过上调Ac-CoA池增加组蛋白乙酰化。
检测Ac-CoA和柠檬酸水平,IP-MS分析乙酰化蛋白,Western blot检测H3K9Ac/H3K18Ac/H3K27Ac;使用NaAc和DaIC干预。
探究Ac-CoA升高如何改变收缩基因和衰老基因的染色质可及性。
对DMSO、LXR-623、DMSO+DaIC、LXR-623+DaIC处理的MOVAS进行ATAC-seq,结合RNA-seq分析TF富集及SRF/MYOCD核转位。
确认靶向Srebf1能否减轻模拟微重力诱导的VSMC衰老和血管重塑。
在RCA-SMCs中使用Lv-sh-Srebf1,在大鼠和小鼠颈动脉外膜局部递送Lv-sh-Srebf1或AAV-Tagln-sh-Srebf1,检测收缩力、cIMT、弹性纤维、Ac-CoA及基因表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 超声成像 | Vevo 3100 LAZR超声系统 | FUJIFILM Visual Sonics | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Sigma | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 平滑肌细胞培养基 | ScienCell | 1101 | |
| 内皮细胞培养基 | ScienCell | 1001 | |
| I型胶原酶 | BioFROXX | -- | |
| siRNA转染 | TSnanofect V2转染试剂 | Tsingke Biotechnology Co., Ltd. | TSV405 |
| 衰老检测 | 衰老β-半乳糖苷酶检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 细胞收缩实验 | 细胞收缩实验试剂盒 | Cell Biolabs, Inc. | CBA-021 |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | Beyotime | C1062S |
| 透射电子显微镜 | JEM-1400透射电子显微镜 | Japan Electron Optics Laboratory | -- |
| 共聚焦显微镜 | Nikon A1 PLUS共聚焦显微镜 | Nikon | -- |
| 脂质检测 | BODIPY脂质荧光探针 | MCE | HY-W090090 |
| 尼罗红 | MCE | HY-D0718 | |
| 衰老检测 | SPiDER-βGal衰老荧光探针 | Dojindo | SG02 |
| 免疫荧光 | SREBP1抗体 | Proteintech | 66875-1-Ig |
| SREBP2抗体 | Proteintech | 28212-1-AP | |
| α-SMA抗体 | Proteintech | 14395-1-AP | |
| 泛乙酰化抗体 | Proteintech | 66289-1-Ig | |
| CD31抗体 | Servicebio | GB113151-100 | |
| Ki-67抗体 | abcam | ab16667 | |
| P21抗体 | Servicebio | GB115313-100 | |
| SRF抗体 | Proteintech | 16821-1-AP | |
| MYOCD抗体 | Affinity Biosciences | DF2434 | |
| H3K9Ac抗体 | ABclonal | A7255 | |
| H3K27Ac抗体 | Beyotime | AF5620 | |
| ELISA | 乙酰辅酶A ELISA试剂盒 | Sangon Biotech | D751001 |
| 脂肪酸ELISA试剂盒 | Meimian Industrial Co., Ltd. | MM-71779R2 | |
| 甘油三酯ELISA试剂盒 | Meimian Industrial Co., Ltd. | MM-0610R2 | |
| 柠檬酸检测 | 柠檬酸含量检测试剂盒 | Sorlarbio | BC2155 |
| Western blot | 核质蛋白提取试剂盒 | Yeasen | 20126ES50 |
| RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B | |
| SDS-PAGE凝胶 | Beyotime | P0012AC | |
| β-Tubulin抗体 | Abways | AB0057 | |
| β-Actin抗体 | Sigma | A5316 | |
| H3K18Ac抗体 | PTM BIO | PTM-114RM | |
| H3抗体 | Proteintech | 17168-1-AP | |
| LaminA/C抗体 | Proteintech | 10298-1-AP | |
| p-AKT抗体 | abcam | ab38449 | |
| AKT抗体 | abcam | ab8805 | |
| mTOR抗体 | abcam | ab134903 | |
| p-mTOR抗体 | abcam | ab109268 | |
| RNA提取 | Axypre多源总RNA小量制备试剂盒 | Axygen | -- |
| RT-qPCR | PrimeScript RT Mix with gDNA eraser | Takara | -- |
| SYBR Premix Ex Taq II | Takara | -- | |
| 7500实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 免疫组化 | 柠檬酸抗原修复缓冲液 | Servicebio | G1203 |
| HRP标记二抗 | Servicebio | GB23303 | |
| RNA-seq | NEBNext Ultra RNA文库构建试剂盒 | New England Biolabs | 7530 |
| Agilent 2100生物分析仪 | Agilent Technologies | -- | |
| Illumina Novaseq6000测序仪 | Illumina | -- | |
| 脂质组学 | SPLASH LIPIDOMIX质谱标准品 | AVANTI | 330707-1EA |
| LC-30A超高效液相色谱系统 | Shimadzu | -- | |
| QTRAP 6500+质谱仪 | Sciex | -- | |
| Luna NH2色谱柱 | Phenomenex | -- | |
| Kinetex C18色谱柱 | Phenomenex | -- | |
| IP-MS | 细胞裂解缓冲液 | CST | 9803S |
| iST样品制备试剂盒 | PreOmics | -- | |
| ATAC-seq | TTE mix V5 | Vazyme Biotech | TD711 |
| 索引引物 | Vazyme Biotech | TD202 | |
| CAM(2×) | Vazyme Biotech | TD711 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| HU动物模型 | 大鼠品系、周龄、体重、悬吊角度、持续时间及模型验证指标 阅读提示:Methods中Animal experiments与Hindlimb unloading (HU) models小节 |
| SM细胞模型 | 二维旋转装置来源、转速、处理时间、g值及对照条件 阅读提示:Methods中Two-dimensional rotation-simulated microgravity cell models小节 |
| SREBP1药理学激活 | LXR-623浓度、溶剂、处理时间:文中未明确说明 阅读提示:Results中SREBP1 directly promotes...小节及Fig. 4 legend |
| Ac-CoA干预 | NaAc浓度120 mM、DaIC稀释比1:100、处理时间48 h 阅读提示:Results中Upregulated Ac-CoA pool...小节及Fig. 5 legend |
| 体内Srebf1敲低递送 | Lv/AAV滴度、注射体积、Laponite水凝胶混合比例及取材时间 阅读提示:Methods中In situ transfection of the carotid arteries...小节及Fig. 7 legend |