营养状态对肌肉MLL4表达的调控
验证MLL4表达是否响应营养可获得性变化
对小鼠进行光照期6或12小时禁食及暗期6或12小时复食,检测腓肠肌MLL4蛋白;并检测1周HFD后MLL4蛋白与mRNA水平
Enhancer regulator MLL4 controls skeletal muscle metabolic efficiency by limiting AMPK-mediated fuel catabolism.
含肌肉特异性敲除小鼠、C2C12与LHCN-M2细胞、AAV增益/失功能、代谢组与13C示踪、ChIP-seq及人肌肉样本
骨骼肌特异性Mll4敲除(Mll4SETf/fHSA-Cre)小鼠 C2C12小鼠成肌细胞分化肌管 LHCN-M2人骨骼肌细胞肌管 年轻与年老久坐受试者骨骼肌活检样本
骨骼肌特异性Mll4敲除小鼠在CD/HFD下的体重、GTT、ITT、能量消耗与AMPK磷酸化 C2C12肌管中慢病毒shMLL4敲低后AMP/ATP比值、13C-葡萄糖示踪与AMPK磷酸化 AAV介导Nt5c1a和Ampd3敲低或过表达对骨骼肌AMPK磷酸化的影响 MyoAAV介导AMPKα2 DN(K45R)在Mll4SET MKO小鼠肌肉中过表达对代谢表型的逆转 Pentostatin 0.6 mg/kg隔日腹腔注射4个月HFD小鼠的体重、GTT、ITT与能量消耗
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证MLL4表达是否响应营养可获得性变化
对小鼠进行光照期6或12小时禁食及暗期6或12小时复食,检测腓肠肌MLL4蛋白;并检测1周HFD后MLL4蛋白与mRNA水平
确定肌肉MLL4缺失对饮食诱导肥胖、能量消耗和葡萄糖稳态的影响
Mll4SETf/fHSA-Cre雄鼠与WT同窝对照在CD或60% kcal脂肪HFD下饲养,检测体重、体重增长、体成分、CLAMS能量消耗、GTT、ITT、HOMA-IR及胰岛素刺激AKT磷酸化
评估肌肉MLL4缺失对HFD诱导肝脂肪变性的影响及肝脏基因表达变化
对HFD饲养Mll4SET MKO与WT小鼠肝脏进行大体解剖、H&E与Oil Red O染色、肝脏甘油三酯测定,并对肝脏mRNA进行RNA-seq和GO分析
验证MLL4缺失是否促进骨骼肌燃料分解代谢
对CD和HFD条件下Mll4SET MKO与WT肌肉进行CE-MS和LC-MS代谢组学,检测TCA中间体、酰基肉碱、脂肪酸;并在C2C12肌管中敲低MLL4后进行代谢组和13C-葡萄糖示踪
检验肌肉AMPK激活是否介导Mll4SET MKO小鼠的代谢改善
用MyoAAV-1A在Mll4SET MKO小鼠肌肉中过表达AMPKα2 DN(K45R),HFD饲养后检测体重、iWAT重量、GTT、ITT、肝脏重量、肝组织学和肝脏甘油三酯
鉴定MLL4调控肌肉AMPK的直接靶基因及分子通路
整合肌肉RNA-seq与MLL4 ChIP-seq数据鉴定直接靶基因,检测Mll4SET MKO肌肉AMP/ATP与ADP/ATP比值;在C2C12和LHCN-M2细胞中敲低MLL4或AMPD3,并用AAV在体内敲低或过表达Nt5c1a和Ampd3
明确MLL4激活Nt5c1a和Ampd3转录是否依赖MEF2
分析MLL4与MEF2D ChIP-seq在Nt5c1a和Ampd3位点的共定位,ChIP-qPCR验证MEF2结合,鉴定Ampd3内含子1中保守MEF2结合位点,并用AAV过表达MEF2C检测AMPD3蛋白
检验MLL4-MEF2-AMPD3-AMPK轴在人体骨骼肌中的相关性
分析29名年轻与23名年老久坐受试者肌肉活检RNA-seq,检测MLL4、MEF2、AMPD3、NT5C1A表达与空腹血糖、BMI的相关性;在LHCN-M2肌管中敲低MLL4检测AMPD3、p-AMPK和葡萄糖消耗
验证药理学抑制AMP代谢通路能否激活肌肉AMPK并改善代谢
C2C12与LHCN-M2肌管用Pentostatin处理检测AMP/ATP、腺苷和AMPK磷酸化;6周龄雄性C57BL/6小鼠HFD 4个月期间隔日腹腔注射Pentostatin,检测体重、iWAT、摄食、能量消耗、GTT和ITT
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 喷司他丁 | Selleckchem | 53910-25-1 |
| 高脂饲料 | Research Diets | D12492 | |
| 代谢组学 | L-甲硫氨酸砜与D-樟脑-10-磺酸内标 | Human Metabolome Technologies | H3304-1002 |
| 5-kDa截留滤器 | Millipore | UFC3LCCNB-HMT | |
| 毛细管电泳仪 | Agilent | G7100A | |
| 飞行时间质谱仪 | Agilent | G6224A | |
| ACQUITY超高效液相色谱系统 | Waters | -- | |
| tripleTOF 5600 plus质谱仪 | AB SCIEX | -- | |
| 熔融石英毛细管 | HMT | -- | |
| [U-13C6]葡萄糖 | Cambridge Isotope Laboratories | -- | |
| 动物实验 | 综合实验室动物监测系统 | Columbus Instruments | -- |
| 体成分分析 | Lunar PIXImus II骨密度仪 | GE Healthcare | -- |
| MiniSpec LF50核磁共振体成分分析仪 | Bruker Optics | -- | |
| 血糖检测 | OneTouch超小型血糖仪 | OneTouch | -- |
| 胰岛素检测 | 胰岛素ELISA试剂盒 | Millipore | -- |
| 肌肉甘油三酯测定 | 游离甘油试剂 | Sigma-Aldrich | F6428 |
| 甘油标准品 | Sigma-Aldrich | G7793 | |
| 肌肉糖原测定 | 葡萄糖己糖激酶试剂盒 | Wako | 298-65701 |
| 线粒体呼吸测定 | Oxygraph 2K呼吸测定仪 | Oroboros Inc. | -- |
| 棕榈酰-L-肉碱氯化物 | -- | -- | |
| 组织学分析 | 抗MHC1抗体BA-D5 | Developmental Studies Hybridoma Bank | BA-D5 |
| 抗MHC2b抗体BF-F3 | Developmental Studies Hybridoma Bank | BF-F3 | |
| RNA提取与逆转录 | RNAiso Plus总RNA提取试剂 | Takara Bio | -- |
| 逆转录 | PrimeScript含gDNA Eraser逆转录试剂盒 | Takara Bio | -- |
| ChIP | 抗MLL4抗体 | Sigma-Aldrich | ABE1867 |
| 抗MEF2C抗体 | Abcam | ab211493 | |
| ChIP-qPCR | Taq Pro通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme Bio | -- |
| Western blot | 抗AMPKα Thr172磷酸化抗体 | Cell Signaling Technology | 2535 |
| 抗AMPKα抗体 | Cell Signaling Technology | 5831 | |
| 抗p-AKT Ser473抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 抗p-AKT Thr308抗体 | Cell Signaling Technology | 13038 | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 抗p-ACC Ser79抗体 | Cell Signaling Technology | 11818 | |
| 抗ACC抗体 | Cell Signaling Technology | 3676 | |
| 抗AMPD3抗体 | Proteintech | 23997-1-AP | |
| 抗AMPD1抗体 | Proteintech | 19780-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 抗HSP90抗体 | Proteintech | 13171-1-AP | |
| 抗NT5C1A抗体 | AssaybioTech | C15296 | |
| 抗肌脂蛋白抗体 | Millipore | ABT13 | |
| Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | ThermoFischer Scientific | -- | |
| 细胞培养 | C2C12小鼠成肌细胞 | American Type Culture Collection | CRL-1772 |
| HEK293T细胞 | American Type Culture Collection | CRL-3216 | |
| LHCN-M2人骨骼肌细胞 | Applied Biological Materials Inc. | T0756 | |
| 葡萄糖消耗检测 | 葡萄糖检测试剂盒 | Wako | 298-65701 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 肌肉特异性Mll4敲除小鼠代谢表型 | 小鼠性别与月龄(雄性2–5月龄)、HFD配方(60% kcal脂肪,D12492)、GTT葡萄糖剂量1.5 g/kg与ITT胰岛素剂量1 U/kg、图注各组样本量n=6–15 阅读提示:Methods 的 Animal studies、Glucose and insulin tolerance testing 及 Fig. 1 图注 |
| C2C12与LHCN-M2细胞MLL4敲低 | shRNA序列、慢病毒包装比例2:1.5:1、感染后48–72小时嘌呤霉素筛选、分化5天 阅读提示:Methods 的 Cell culture and lentivirus infection |
| 13C-葡萄糖代谢示踪 | [U-13C6]葡萄糖终浓度25 mM、饥饿30分钟、示踪时间10和40分钟、每组n=5 阅读提示:Methods 的 13C6-glucose flux 及 Fig. 2f–h 图注 |
| AAV介导Nt5c1a和Ampd3增益/失功能 | AAV血清型与载体(pAAV-CAG、pAAV2/9)、滴度1×10^13病毒颗粒/mL、P3和P5腹腔30 μL或6周龄GC肌肉50 μL、每组n=5–8 阅读提示:Methods 的 AAV injection |
| MyoAAV-AMPK DN体内验证 | MyoAAV-1A载体、剂量5×10^12 VG/mL尾静脉100 μL、6周龄雄性、每组n=11–13、HFD 11周 阅读提示:Methods 的 AAV injection 及 Fig. 3b 图注 |
| Pentostatin体内药理学实验 | C57BL/6雄性6周龄、HFD 4个月、0.6 mg/kg隔日腹腔注射、每组n=9 阅读提示:Methods 的 Animal studies 及 Fig. 8d 图注 |
| 人骨骼肌样本分析 | 年轻组18–30岁与年老组65–80岁久坐受试者人数与性别构成、活检部位股外侧肌约350 mg、3天等热量饮食(20%蛋白、50%碳水、30%脂肪)、运动停止72小时 阅读提示:Methods 的 Human studies 及 Supplementary Table 2 |