人退变髓核组织与单细胞转录组分析
确认IDD伴随氧化还原失衡、铁死亡激活和炎症应激。
分析GSE165722人NP组织scRNA-seq数据并行铁死亡驱动/抑制评分与功能富集;对轻度和重度退变人NP组织行IHC、qPCR及GSH、MDA、IL1B、IL6检测。
Targeting the ROS-ferroptosis-inflammation cycle with a nanozyme-functionalized hydrogel for intervertebral disc repair.
含人NP组织scRNA-seq与免疫组化、体外NPC功能与机制验证、大鼠尾椎IDD模型体内影像与力学评估
人髓核组织(轻度与重度退变样本) TBHP诱导的退变髓核细胞(NPCs) 大鼠尾椎穿刺诱导的IDD模型 大鼠腰椎IDD模型
TBHP诱导NPC氧化应激模型中PG@MBC对ROS、LPO、Fe2+及GPX4/ACSL4的调控 PG@MBC经HuR泛素化降解降低Il6 mRNA稳定性(ActD、RIP、RNA pull-down、CHX、MG132/CQ) 重组IL6回补实验验证IL6/STAT3轴介导的抗铁死亡与抗炎作用 大鼠尾椎IDD模型注射10 μL PG@MBC后6周和12周的X-ray、MRI、组织学与压缩力学评估 大鼠尾椎NP过表达HuR(AAV-HuR)对PG@MBC疗效的逆转验证
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认IDD伴随氧化还原失衡、铁死亡激活和炎症应激。
分析GSE165722人NP组织scRNA-seq数据并行铁死亡驱动/抑制评分与功能富集;对轻度和重度退变人NP组织行IHC、qPCR及GSH、MDA、IL1B、IL6检测。
构建具有持久抗氧化活性的纳米酶并提高NPC靶向摄取。
液相剥离制备BP纳米片,原位生成CeOx得到BP@CeOx,再以NPC膜包覆制备MBC;行TEM、HRTEM、SAED、EDS、AFM、XRD、XPS、FTIR、Raman、UV-vis、TGA、DLS、zeta电位及ESR表征,并行DFT计算。
构建可注射、自愈合、具组织黏附性并匹配髓核力学的递送载体。
合成UPy-Gel并与PVA、硼砂混合形成PG水凝胶,掺入BP@CeOx或MBC得PG@BC和PG@MBC;检测孔结构、溶胀、接触角、自愈合、流变、压缩/拉伸力学、组织黏附、体外与体内降解及抗氧化能力。
验证水凝胶在氧化应激NPC中清除ROS、抑制铁死亡并恢复ECM代谢。
以TBHP诱导退变NPC,与PG@BC或PG@MBC共培养,检测活/死染色、DCFH-DA、MitoSOX、JC-1、LPO、FerroOrange、GPX4/ACSL4免疫荧光与Western blot及ACAN、MMP3、MMP13。
鉴定PG@MBC作用的关键靶点并验证IL6对铁死亡和炎症的调控。
对TBHP与TBHP+PG@MBC组NPC行RNA-seq、GO/KEGG/GSEA及PPI分析;以IL6刺激、IL6敲低、GPX4/ACSL4敲低及重组IL6回补实验检测ROS、LPO、Fe2+、STAT3核转位及IL-1β、TNF-α。
阐明PG@MBC降低IL6表达转录取向的具体分子通路。
ActD mRNA衰减实验、CHX chase、RIP、RNA pull-down、HuR敲低与过表达、MG132/CQ处理、HuR泛素化IP及HuR与β-TrCP Co-IP。
评估PG@MBC在体内促进椎间盘结构与功能修复并验证HuR/IL6/STAT3机制。
建立大鼠尾椎穿刺IDD模型,术后1周注射PG@MBC;行X-ray、MRI、SO/FG染色、ACAN/GPX4 IHC、MDA/GSH、Il6与IL6时序检测、HuR/p-STAT3免疫荧光及压缩力学测试;并以AAV-HuR过表达验证机制。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 纳米酶合成 | 氯化铈 | -- | -- |
| 油胺 | -- | -- | |
| 二甲苯 | -- | -- | |
| 细胞培养 | 0.25%胰蛋白酶 | -- | -- |
| DMEM/F-12培养基 | Gibco | C11330500BT | |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099-141 | |
| 青霉素/链霉素 | Beyotime | C0222 | |
| 40 μm尼龙细胞筛网 | Corning | 352340 | |
| 水凝胶制备 | 聚乙烯醇 | Aladdin | -- |
| 明胶(A型,猪源) | Aladdin | -- | |
| 2-氨基-4-羟基-6-甲基嘧啶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 四硼酸钠 | -- | -- | |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| 体内降解追踪 | Cy5.5-NHS酯 | -- | -- |
| 抗氧化检测 | 过氧化氢检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- |
| MDA与GSH检测 | 脂质过氧化MDA检测试剂盒 | Beyotime | S0131S |
| 谷胱甘肽检测试剂盒 | Beyotime | S0053 | |
| RNA提取与qPCR | RNA提取试剂盒 | BioFlux | BSC52S1 |
| NanoDrop One分光光度计 | Thermo Fisher | 840-317400 | |
| 逆转录预混液 | Thermo Fisher | M16325 | |
| SYBR Green qPCR预混液 | Invitrogen | 11744500 | |
| LightCycler 96系统 | Roche | -- | |
| 慢病毒转导 | 聚凝胺 | -- | -- |
| 活/死细胞检测 | 活/死细胞成像试剂盒 | Invitrogen | R37601 |
| ROS与铁死亡检测 | DCFH-DA探针 | Beyotime | S0033S |
| MitoSOX Red探针 | Beyotime | S0061S | |
| Liperfluo探针 | Dojindo | L248 | |
| FerroOrange探针 | Dojindo | F374 | |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1探针试剂盒 | Beyotime | C2003S |
| 免疫荧光与组化 | Triton X-100 | Beyotime | P0096 |
| 封闭液 | Beyotime | P0260 | |
| 抗GPX4抗体 | Proteintech | 67763-1-Ig | |
| 抗ACAN抗体 | Proteintech | 13880-1-AP | |
| 抗STAT3抗体 | Proteintech | 10253-2-AP | |
| 抗HuR抗体 | Proteintech | 11910-1-AP | |
| 抗CA3抗体 | Proteintech | 15197-1-AP | |
| Western blot | 裂解液 | Beyotime | P0013 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0010 | |
| SurePage凝胶 | GenScript | M00656 | |
| PVDF膜 | Beyotime | FFP26 | |
| 封闭液 | Beyotime | P0252 | |
| 抗ACSL4抗体 | Santa Cruz | sc-365230 | |
| 抗MMP3抗体 | Proteintech | 17873-1-AP | |
| 抗MMP13抗体 | Proteintech | 18165-1-AP | |
| 抗IL-1β抗体 | CST | 12242 | |
| 抗IL6抗体 | Proteintech | 21865-1-AP | |
| 抗p-STAT3抗体 | Santa Cruz | sc-8059 | |
| 抗FTH1抗体 | ABclonal | A19544 | |
| 抗β-TrCP抗体 | CST | 4394 | |
| 抗β-actin抗体 | Beyotime | AF0003 | |
| SuperSignal底物 | Thermo Fisher | 34580 | |
| 免疫沉淀 | Dynabeads Protein G免疫沉淀试剂盒 | Thermo Fisher | 10007D |
| MG132 | Beyotime | S1748 | |
| RNA免疫沉淀 | RNA结合蛋白免疫沉淀试剂盒 | GENECREATE | JKR23003 |
| RNA pull-down | T7高产率RNA合成试剂盒 | APExBIO | K1047 |
| F2-RNA pull-down试剂盒 | Fitgene | FI8701 | |
| 组织学 | 番红O-固绿染液 | Solarbio | G1371 |
| DAB显色试剂盒 | ZSGB-BIO | ZLI-9018 | |
| 慢病毒构建 | 慢病毒载体 | Tsingke Biotechnology | TSK036 |
| 慢病毒载体 | Tsingke Biotechnology | TSK038 | |
| 慢病毒载体 | Tsingke Biotechnology | TSK039 | |
| 慢病毒载体 | Genechem | 5004357 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 纳米酶BP@CeOx合成 | BP与CeOx比例(1.2 mg BP与3 mg CeOx)、室温反应4 h、超声10 min 阅读提示:Methods-Synthesis of BP@CeOx and membrane-coated BP@CeOx (MBC) |
| MBC膜包覆 | NPC膜挤出30次、BP@CeOx浓度5 mg/mL、混合体积0.5 mL 阅读提示:Methods-Synthesis of BP@CeOx and membrane-coated BP@CeOx (MBC) |
| 动态水凝胶制备与浓度选择 | UPy-Gel 10 mg/mL、PVA 10% w/v、硼砂2%、BP@CeOx浓度50 mg/mL及其浓度筛选依据 阅读提示:Methods-Preparation of dynamic hydrogel及Supplementary Fig. 27a |
| 体外抗氧化检测 | 四种微环境条件(正常、酸性、ROS富集、酸性/ROS富集)、H2O2 100 μM、检测时间点1–28天 阅读提示:Methods-Antioxidative performance measurement |
| TBHP诱导NPC模型与处理 | TBHP预处理浓度与时间:文中未明确说明;NPC代次为第二;探针浓度DCFH-DA 10 μM、MitoSOX 5 μM、Liperoferro 10 μM、FerroOrange 1 μM 阅读提示:Methods-Cell culture、Detection of intracellular ROS, lipid peroxidation (LPO), and ferrous ion |
| IL6与HuR机制实验 | ActD 5 μg/mL、CHX 0.5 μg/mL、MG132 10 μM 8 h、IL6处理浓度梯度:文中未明确说明 阅读提示:Methods-Determination of mRNA stability、Cycloheximide (CHX) chase assay、Western blot and immunoprecipitation |
| 大鼠尾椎IDD模型 | 8周龄SD大鼠、21G针穿刺Co7/8并旋转360°保持15 s、术后1周注射10 μL PG@MBC、6周和12周终点 阅读提示:Methods-Rat IDD model |
| HuR体内过表达验证 | AAV-HuR注射量10 μL、术后即刻注射、6周评估 阅读提示:Methods-Rat IDD model及Supplementary Fig. 32 |
| 力学性能检测 | 水凝胶压缩0.1 mm/s、30 N传感器;IVD压缩0.2 mm/s、300 N传感器;疲劳测试15循环、8%应变 阅读提示:Methods-Measurement of mechanical property与Measurement of IVD mechanical properties |