构建并验证线粒体报告探针
建立可高灵敏度追踪线粒体的工具
构建NLuc-HA-OMP25和COX8a-NLuc-HA质粒,转染HeLa细胞,通过免疫荧光和免疫印迹验证定位与完整性
Quantitative cellular characterization of extracellular mitochondria uptake and delivery.
包含体外细胞模型、条件培养基分离线粒体、定量摄取、蛋白保护、分裂NLuc互补及共聚焦成像多层级功能与机制验证
HeLa细胞 A431细胞 SKOV3细胞 瞬时或稳定表达NLuc-HA-OMP25/COX8a-NLuc-HA的供体细胞
HeLa受体细胞与F4、F4′、F16组分孵育24小时,输入NLuc活性设为100%,检测摄取比例 F4/F4′摄取动力学和剂量反应,使用50,000 NLuc活性单位及不同时间点 4°C与37°C孵育4小时的温度阻断实验 蛋白保护实验使用0.2 mg/mL Proteinase K和/或0.1% β-OG处理3小时 分裂NLuc互补实验使用HiBiT-OMP25、HiBiT-COX8与LgBiT-OMP25、LgBiT-COX8、胞质LgBiT组合
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立可高灵敏度追踪线粒体的工具
构建NLuc-HA-OMP25和COX8a-NLuc-HA质粒,转染HeLa细胞,通过免疫荧光和免疫印迹验证定位与完整性
确定条件培养基中线粒体的存在形式和性质
收集条件培养基,离心去除细胞碎片,浓缩后用SEC分离,检测NLuc活性和蛋白浓度,NTA分析粒径,免疫印迹检测EV、ER和线粒体标志物,蛋白保护实验区分游离线粒体与EV包裹线粒体
评估摄取效率和动力学,并探索摄取机制
将等量NLuc活性的F4、F16、F4′加入HeLa受体细胞,孵育24小时检测NLuc活性;进行动力学、剂量反应和4°C温度阻断实验;在HeLa、A431、SKOV3细胞中验证
确定线粒体进入细胞后的运输途径
用共聚焦显微镜观察内化线粒体与早期内体标志物EEA1、溶酶体标志物LAMP1和液相摄取标志物dextran的共定位
验证线粒体是否逃逸内体到达胞质并整合入线粒体网络
使用HiBiT/LgBiT分裂NLuc互补实验检测供体与受体线粒体蛋白互补;使用Galectin-3-GFP报告内体膜破裂,LLOMe作为阳性对照
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 稳定细胞系筛选 | 遗传霉素 | Gibco | -- |
| 条件培养基浓缩 | Amicon Ultra-15 100 kDa超滤管 | Millipore | UFC9100 |
| SEC分离 | qEVoriginal/70 nm Gen 2尺寸排阻柱 | Izon | -- |
| 线粒体分离 | 培养细胞线粒体分离试剂盒 | Abcam | ab110170 |
| 免疫印迹 | Micro BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Scientific | -- |
| 4X Laemmli缓冲液 | Bio-Rad | -- | |
| PVDF膜(0.2 μm) | Bio-Rad | -- | |
| Trans-Blot Turbo转膜系统 | Bio-Rad | -- | |
| Precision Plus蛋白标准品 | Bio-Rad | -- | |
| 抗肌动蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | MAB1501 | |
| 抗HA抗体 | Cell Signaling | C29F4 | |
| 抗MFN2抗体 | Abcam | 56889 | |
| 抗PDHA1抗体 | Abcam | 110334 | |
| 抗CD63抗体 | BD Bioscience | 556,019 | |
| 抗CD9抗体 | Millipore | cbl162 | |
| 抗钙网蛋白抗体 | Abcam | 22683 | |
| HRP偶联二抗 | Jackson ImmunoResearch | 115-035-003 | |
| Clarity Western ECL底物 | Bio-Rad | -- | |
| ImageQuant LAS 400成像仪 | GE Healthcare Life Sciences | -- | |
| 蛋白保护实验 | 蛋白酶K | Ambion | AM2542 |
| Nano-Glo活细胞检测试剂 | Promega | N2012 | |
| iD3 SpectraMax酶标仪 | Molecular Devices | -- | |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 摄取和递送实验 | Nano-Glo试剂 | Promega | N1120 |
| 白色96孔板 | ThermoFischer | -- | |
| 白底透明底96孔板 | Thermofisher | -- | |
| HBSS缓冲液 | ThermoFisher | -- | |
| 胞质递送实验 | 重组LgBiT | Promega | -- |
| 共聚焦显微镜 | 红色葡聚糖 | ThermoFisher | -- |
| LLOME | Sigma-Aldrich | L7393-500MG | |
| 抗EEA1抗体 | Cell Signaling | 2411S | |
| 抗LAMP1抗体 | Cell Signaling | 15665S | |
| 抗HA抗体 | Cell Signaling | C29F4 | |
| AlexaFluor 488或546二抗 | ThermoFisher | -- | |
| ProLong Diamond抗淬灭封片剂 | Invitrogen | -- | |
| LSM 880共聚焦显微镜 | ZEISS | -- | |
| 纳米颗粒追踪分析 | ZetaView x20纳米颗粒追踪分析仪 | Particle Metrix | -- |
| 线粒体基因组扩增 | 质粒小量提取试剂盒 | Macherey Nagel | -- |
| Phusion Plus DNA聚合酶试剂盒 | ThermoFisher | F630S | |
| 1Kb plus DNA分子量标准 | ThermoFisher | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 转运中间体分离 | 条件培养基收集时间、离心速度与时间、浓缩柱型号、SEC柱型号及洗脱体积 阅读提示:Methods中Transport intermediate isolation小节 |
| 蛋白保护实验 | Proteinase K浓度、β-OG或Triton X-100浓度、处理温度与时间 阅读提示:Methods中Protease Protection Assay小节及图2E图注 |
| 线粒体摄取定量 | 受体细胞类型与融合度、输入NLuc活性单位、孵育温度与时间、洗涤次数 阅读提示:Methods中Mitochondrial uptake and delivery assay小节及图3A-D图注 |
| 胞质递送分裂NLuc互补实验 | 供体与受体细胞HiBiT/LgBiT组合、转染时间、孵育时间、NLuc检测试剂 阅读提示:Methods中Mitochondrial cytosolic delivery assay小节及图5C、图6B图注 |
| 共聚焦共定位分析 | 线粒体孵育时间、dextran浓度、LLOMe浓度与处理时间、抗体稀释比例、ROI分析标准 阅读提示:Methods中Confocal microscopy小节及图4、图7图注 |