建立G2期阻滞细胞模型并观察细胞命运
确定G2期阻滞细胞是进入有丝分裂还是发生全基因组倍增。
用CDK2/4/6抑制剂PF-06873600处理G2期细胞24小时诱导G2期阻滞,撤药后通过活细胞成像追踪Geminin和Cdt1 degron,结合DNA含量分析。
E2F activity determines mitosis versus whole-genome duplication in G2-arrested cells.
结合活细胞成像、固定细胞免疫荧光、FISH、基因敲除/敲低及多种细胞系和药物处理,进行功能与机制验证
MCF-10A非转化人乳腺上皮细胞 RPE1细胞 HS68细胞 MDA-MB-231和MCF-7乳腺癌细胞
G2期阻滞模型:CDK2/4/6抑制剂PF-06873600(500 nM)处理24小时诱导G2期阻滞 APC/C活性状态分类:基于Geminin-degron和Cdt1-degron活细胞报告系统 E2F活性检测:E2F1和Cdc25A mRNA FISH Rb磷酸化(S807/811)与总Rb比值作为CDK2/4/6活性指标 p53敲除对DNA损伤诱导的CDK2/4/6抑制和APC/C再激活的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定G2期阻滞细胞是进入有丝分裂还是发生全基因组倍增。
用CDK2/4/6抑制剂PF-06873600处理G2期细胞24小时诱导G2期阻滞,撤药后通过活细胞成像追踪Geminin和Cdt1 degron,结合DNA含量分析。
验证E2F活性是否决定G2期阻滞细胞中APC/C的再激活状态。
在CDK2/4/6抑制后,根据APC/C再激活状态分类细胞,检测E2F靶基因E2F1和Cdc25A mRNA水平;敲除Rb,敲低Emi1或Cdh1,以及诱导Emi1AxxA突变体表达,观察APC/C再激活和细胞命运。
探究APC/C再激活如何影响CDK2活性和Rb磷酸化,以及撤药后对CDK4/6活性的需求。
活细胞成像追踪CDK4/6和CDK2活性,结合固定细胞免疫荧光检测cyclin A、p21和Rb磷酸化;撤药后使用CDK4/6抑制剂palbociclib测试细胞周期重新进入。
确定促有丝分裂信号是否通过c-Myc影响E2F活性和APC/C再激活。
改变促有丝分裂原浓度,检测E2F1和Cdc25A mRNA水平;siRNA敲低c-Myc或多西环素诱导c-Myc过表达,检测E2F靶基因和APC/C再激活。
探究CDK2是否通过磷酸化FoxM1调控cyclin B1表达和有丝分裂进入。
使用CDK4/6抑制剂palbociclib和CDK2抑制剂tagtociclib处理细胞,免疫荧光检测FoxM1 T600磷酸化;活细胞成像追踪cyclin B1动态。
确定间歇性CDK2/4/6抑制是否促进全基因组倍增和侵袭性生长。
对非转化细胞和乳腺癌细胞进行间歇性CDK2/4/6抑制(24小时用药+24小时停药,重复0-3轮),检测DNA含量、多核形成和细胞增殖。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco | 11039047 |
| 马血清 | Gibco | 16050122 | |
| 表皮生长因子 | Proteintech | HZ-1326 | |
| 胰岛素 | Sigma | I1882 | |
| 霍乱毒素 | Sigma | C8052 | |
| 氢化可的松 | Sigma | H0888 | |
| 胎牛血清 | Gibco | 10-437-028 | |
| 潮霉素B | InvivoGen | ant-hg | |
| DMEM培养基 | Genesee Scientific | 25-500 | |
| 牛血清白蛋白 | Millipore | A3311 | |
| 胰蛋白酶-EDTA溶液 | Gibco | 25-510 | |
| 质粒构建 | pLenti-DHB-mVenus-p2a-mCherry-Rb-IRES-blasticidin质粒 | Addgene | 126679 |
| pCW57.1载体 | Addgene | 50661 | |
| 细胞系构建 | pCMV-VSV-G质粒 | Addgene | 8454 |
| pRSV-rev质粒 | Addgene | 12253 | |
| pMDLg/pRRE质粒 | Addgene | 12251 | |
| PEI转染试剂 | -- | -- | |
| 0.45微米过滤装置 | Millipore | SLHA033SB | |
| 100 kDa超滤离心管 | Millipore | UFC910024 | |
| 嘌呤霉素 | InvivoGen | ant-pr-1 | |
| 杀稻瘟菌素 | InvivoGen | ant-bl-1 | |
| 新霉素 | Thermo Scientific | BP673-5 | |
| 药物处理 | 二甲基亚砜 | Sigma | D2438 |
| 帕博西尼 | Selleck Chemicals | S1116 | |
| PF-06873600 | Cayman Chemicals | 35502 | |
| 依托泊苷 | Sigma | E1383 | |
| 茴香霉素 | Sigma | A9789 | |
| tagtociclib | ChemieTek | CT-PF0710 | |
| PD166285 | Tocris Bioscience | 3785 | |
| AZ20 | MedChemExpress | HY-15557 | |
| 多西环素 | Sigma-Aldrich | D9891 | |
| EdU染色 | 5-乙炔基-2'-脱氧尿苷 | Sigma | 900584 |
| 核染色 | Hoechst 33342染料 | Thermo Scientific | 62249 |
| 药物处理 | 新制癌菌素 | Sigma | N9162 |
| Zeocin | Invitrogen | 46-0509 | |
| 免疫荧光 | 兔抗磷酸化Rb (S807/811)抗体 | Cell Signaling Technology | 8516 |
| 鼠抗Rb (4H1)抗体 | Cell Signaling Technology | 9309 | |
| 兔抗53BP1抗体 | Cell Signaling Technology | 4937 | |
| 兔抗p21抗体 | Cell Signaling Technology | 2947 | |
| 兔抗磷酸化Chk1 (S317)抗体 | Cell Signaling Technology | 12302 | |
| 兔抗磷酸化Chk2 (T68)抗体 | Cell Signaling Technology | 2661 | |
| 兔抗磷酸化FoxM1 (T600) (D9M6G)抗体 | Cell Signaling Technology | 14655 | |
| 鼠抗磷酸化组蛋白H3 (Se10) (G63)抗体 | Cell Signaling Technology | 9706 | |
| 鼠抗磷酸化H2AX (S139) (γH2AX)抗体 | Millipore | 05-636 | |
| 鼠抗Cyclin A (B-8)抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-271682 | |
| Alexa Fluor 488标记的山羊抗兔IgG (H+L)二抗 | Invitrogen | A32731 | |
| Alexa Fluor 568标记的山羊抗兔IgG (H+L)二抗 | Invitrogen | A11036 | |
| Alexa Fluor 488标记的山羊抗鼠IgG (H+L)二抗 | Invitrogen | A32723 | |
| Alexa Fluor 568标记的山羊抗鼠IgG (H+L)二抗 | Invitrogen | A11031 | |
| siRNA转染 | DharmaFECT1转染试剂 | Horizon Discovery | T-2001 |
| Opti-MEM培养基 | Gibco | 31985070 | |
| 免疫荧光 | 96孔板 | Cellvis | P96-1.5 P |
| HEPES | Sigma | H3537 | |
| Triton X-100 | Sigma | T8787 | |
| EdU检测 | 硫酸铜 | Sigma | C1297 |
| 抗坏血酸钠 | Sigma | A4034 | |
| AFDye 647吡啶甲基叠氮化物 | Click Chemistry Tools | 1300 | |
| RNA FISH | ViewRNA ISH细胞检测试剂盒 | Thermo Scientific | QVC00001 |
| ACTB探针 | Thermo Scientific | VA1-10351-VC | |
| E2F1探针 | Thermo Scientific | VA1-12108-VC | |
| Cdc25A探针 | Thermo Scientific | VA1-15814-VC |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| G2期阻滞诱导与细胞命运追踪 | CDK2/4/6抑制剂PF-06873600浓度500 nM,处理时间24小时;活细胞成像追踪Geminin-degron和Cdt1-degron;细胞系MCF-10A 阅读提示:Methods药物与化学品部分、Figure 2图注及Results对应段落 |
| E2F活性与APC/C再激活分类 | 根据APC/C再激活状态分类的时间点(处理后24小时);mRNA FISH检测E2F1和Cdc25A;Rb敲除、Emi1敲低、Cdh1敲低的实验条件 阅读提示:Figure 3图注及Results对应段落、Methods siRNA转染部分 |
| CDK2-Rb反馈环路与CDK4/6依赖性 | CDK2/4/6抑制剂撤药后使用palbociclib 1 µM;CDK4/6和CDK2活性报告系统;cyclin A和p21免疫荧光检测 阅读提示:Figure 4图注及Results对应段落、Methods免疫荧光部分 |
| 促有丝分裂信号与c-Myc调控E2F | 促有丝分裂原去除或不同浓度刺激;c-Myc siRNA敲低或多西环素诱导过表达;E2F1和Cdc25A mRNA检测 阅读提示:Figure 5图注及Results对应段落、Methods细胞培养和siRNA转染部分 |
| CDK2对FoxM1磷酸化和cyclin B1的调控 | CDK2抑制剂tagtociclib 1 µM、CDK4/6抑制剂palbociclib 1 µM处理1小时;p-FoxM1 (T600)免疫荧光;内源性荧光标记cyclin B1活细胞成像 阅读提示:Figure 6图注及Results对应段落、Methods免疫荧光和活细胞成像部分 |
| 间歇性CDK2/4/6抑制对基因组稳定性和生长的影响 | PF-06873600 500 nM或palbociclib 1 µM,24小时用药+24小时停药,重复0-3轮;DNA含量和EdU染色;细胞增殖监测28天 阅读提示:Figure 7图注及Results对应段落、Methods细胞培养部分 |