构建巨噬细胞特异性慢病毒载体
实现肿瘤抗原和细胞因子在肝脏巨噬细胞中的选择性表达
使用Mrc1启动子及miR-122-5p和miR-126-3p靶序列构建慢病毒载体,表达IiOVA、IFNα、IL-12等。
In vivo armed macrophages curb liver metastasis through tumor-reactive T-cell rejuvenation.
包含多种肝转移小鼠模型、体外细胞实验、scRNA-seq、空间转录组及功能验证,并有机制验证。
MC38.OVA结直肠癌肝转移小鼠模型 B16-F10黑色素瘤肝转移小鼠模型 AKTPF结直肠癌肝转移小鼠模型 C57BL/6小鼠
LV剂量:TA或IL-12 LV为107 TU/小鼠,IFNα LV为108 TU/小鼠 给药时间:预防性实验在肿瘤接种前14天,治疗性实验在肿瘤接种后3、5或7天 肿瘤细胞接种量:MC38.OVA 100,000细胞/小鼠,B16-F10 20,000细胞/小鼠,AKTPF 30,000细胞/小鼠 检测终点:肿瘤重量、MRI体积、流式细胞术分析T细胞表型 分组:Control、IiOVA、OVA.Ifna、OVA.Il12、OVA.Combo等
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
实现肿瘤抗原和细胞因子在肝脏巨噬细胞中的选择性表达
使用Mrc1启动子及miR-122-5p和miR-126-3p靶序列构建慢病毒载体,表达IiOVA、IFNα、IL-12等。
评估肝脏巨噬细胞表达肿瘤抗原能否诱导保护性免疫
小鼠静脉注射IiOVA LV,14天后肝内接种MC38.OVA细胞,检测肿瘤生长和T细胞反应。
测试肿瘤抗原与IFNα、IL-12联合治疗已建立肝转移的效果
小鼠肝内接种MC38.OVA细胞,7天后静脉注射IiOVA LV单独或联合IFNα、IL-12 LV,检测肿瘤重量和T细胞表型。
解析联合治疗对肝脏和肿瘤免疫细胞转录组的影响
分选CD45+细胞进行scRNA-seq和TCR测序,分析抗原呈递、T细胞耗竭和细胞间相互作用。
确定CD8+ T细胞在治疗效果中的必要性
使用抗体清除CD4+、CD8+或NK细胞,评估对肿瘤生长和T细胞表型的影响。
测试平台对天然肿瘤相关抗原和新抗原的效果
使用表达TRP-2的B16-F10黑色素瘤模型和表达预测新抗原的AKTPF结直肠癌模型,评估联合治疗疗效。
研究联合治疗能否恢复对免疫检查点抑制剂的响应
在B16-F10和MC38.OVA肝转移模型中,联合使用Trp2.Combo或OVA.Combo与抗PD1抗体,评估肿瘤生长和T细胞反应。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 慢病毒载体生产 | Phusion高保真DNA聚合酶 | Thermo Scientific | F-530XL |
| 质粒构建 | NucleoSpin凝胶和PCR纯化试剂盒 | Macherey-Nagel | 740609.50 |
| 质粒提取 | Wizard Plus SV微量质粒DNA纯化系统试剂盒 | Promega | A1330 |
| 质粒大量提取 | Nucleobond Xtra Maxi EF质粒大量提取试剂盒 | Macherey-Nagel | 740424.50 |
| 基因组DNA提取 | Maxwell RSC 48仪器 | Promega | AS8500 |
| Maxwell RSC培养细胞DNA试剂盒 | Promega | AS1620 | |
| 组织DNA提取 | DNeasy血液和组织试剂盒 | Qiagen | 69504 |
| 微滴数字PCR | QX200微滴数字PCR系统 | Biorad | -- |
| ddPCR探针预混液(无dUTP) | Biorad | 1863024 | |
| 基因表达分析 | miRNeasy微量试剂盒 | Qiagen | 217084 |
| 逆转录 | SuperScript IV VILO逆转录试剂 | Invitrogen | 11756050 |
| 细胞培养 | IMDM培养基 | Corning | 10-016-CV |
| 胎牛血清 | HyClone | SH30066.03 | |
| Advanced DMEM/F12培养基 | Gibco | 12634-010 | |
| GlutaMAX补充剂 | Thermo Scientific | 35050061 | |
| 肿瘤接种 | 基质胶 | BD Biosciences | -- |
| Geltrex基质胶 | Life Technologies | A1413301 | |
| 动物实验 | 异氟烷 | Iso-Vet | 104331020 |
| 血浆细胞因子检测 | 小鼠IFNα全亚型高灵敏度ELISA试剂盒 | pbl Assay Science | -- |
| Legend MAX小鼠IL-12(p70) ELISA试剂盒 | Biolegend | -- | |
| Bio-Plex Pro小鼠细胞因子23重检测 | Biorad | M60009RDPD | |
| 转氨酶检测 | ALT定量试剂盒 | Instrumentation Laboratory | -- |
| AST定量试剂盒 | Instrumentation Laboratory | -- | |
| 磁共振成像 | 钆塞酸二钠(普美显) | Bayer Schering Pharma | -- |
| 抗体注射 | 体内用抗小鼠PD-1单克隆抗体 | BioXCell | BE0146 |
| 体内用抗小鼠CD4单克隆抗体 | BioXCell | BE0003-1 | |
| 体内用抗小鼠CD8a单克隆抗体 | BioXCell | BE0004-1 | |
| 体内用抗小鼠NK1.1单克隆抗体 | BioXCell | BE0036 | |
| 流式细胞术 | LIVE/DEAD可固定蓝色死细胞染色试剂盒 | Invitrogen | -- |
| True-Nuclear转录因子缓冲液套装 | BioLegend | -- | |
| 负载SIINFEKL的MHC I类四聚体 | NIH tetramer core facility | -- | |
| FACSymphony A5细胞分析仪 | BD Biosciences | -- | |
| 流式分选 | BD FACSAria Fusion流式细胞分选仪 | BD | -- |
| 免疫荧光 | Hoechst 33342 | Thermo Scientific | 62249 |
| Fluoromount-G封片剂 | SouthernBiotech | 0100-01 | |
| SP8闪电共聚焦显微镜 | Leica Microsystems | -- | |
| RNA测序 | miRNeasy plus迷你试剂盒 | Qiagen | 74134 |
| 单细胞RNA测序 | Next GEM单细胞5' GEM试剂盒v2 | Chromium 10x | -- |
| 单细胞小鼠TCR扩增试剂盒 | Chromium 10x | -- | |
| 空间转录组 | MERSCOPE仪器 | Vizgen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 慢病毒载体注射 | LV剂量(TA或IL-12 LV 107 TU/小鼠,IFNα LV 108 TU/小鼠)、注射体积(200 μL)、注射途径(尾静脉) 阅读提示:Methods 'Intravenous injection of LV'小节 |
| 肝内肿瘤接种 | 细胞量(MC38.OVA 100,000细胞/小鼠,B16-F10 20,000细胞/小鼠)、注射体积(5 μL)、基质胶比例 阅读提示:Methods 'MC38.OVA/B16-F10 tumor implant'小节 |
| 脾内肿瘤接种 | 细胞量(AKTPF 30,000细胞/小鼠)、注射体积(50 μL)、基质胶类型 阅读提示:Methods 'AKTPF tumor implant'小节 |
| 抗体清除实验 | 抗体剂量(0.2 mg/小鼠)、注射途径(腹腔)、给药频率(每周两次) 阅读提示:Methods 'Monoclonal antibody injection'小节 |
| 流式细胞术分析 | TEX定义为EOMES+ PD1high,PEX定义为TBET+ PD1int 阅读提示:Methods 'Flow cytometry'小节 |