建立早期运动小鼠模型并评估长期免疫保护
验证早期游泳训练能否在停止训练后长期减轻LPS诱导的脓毒症
1月龄雄性小鼠游泳训练3个月,停止训练11个月后15月龄时腹腔注射LPS诱导脓毒症,评估脓毒症评分、体重、体温、血糖、血细胞计数、血清细胞因子及肝肺组织病理。
Early-life exercise induces immunometabolic epigenetic modification enhancing anti-inflammatory immunity in middle-aged male mice.
含小鼠运动模型、代谢组学、BMDM体外验证、AAV8肝敲低及ChIP-seq表观机制验证
1月龄雄性C57BL/6J小鼠游泳训练模型 LPS诱导脓毒症小鼠模型 骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) 小鼠原代肝细胞
游泳训练:1月龄开始,60分钟/天,5天/周,持续12周,随后停止训练11个月 LPS攻击:15月龄小鼠单次腹腔注射2 mg/kg LPS,观察0-72小时 哌啶酸处理:6周龄小鼠腹腔注射200 μg/kg,LPS前1小时和LPS后24小时各一次 BMDM处理:哌啶酸5、10、20 μM预处理1小时,LPS 100 ng/ml刺激6小时 AAV8敲低:14月龄小鼠尾静脉注射1.3×10^12 vg AAV8-Crym-shRNA,4周后LPS攻击
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证早期游泳训练能否在停止训练后长期减轻LPS诱导的脓毒症
1月龄雄性小鼠游泳训练3个月,停止训练11个月后15月龄时腹腔注射LPS诱导脓毒症,评估脓毒症评分、体重、体温、血糖、血细胞计数、血清细胞因子及肝肺组织病理。
寻找介导早期运动长期免疫益处的关键代谢物
对4月龄和15月龄Exe与Sed小鼠血清及15月龄肝脏进行非靶向LC-MS代谢组学分析,OPLS-DA筛选差异代谢物,靶向LC-MS验证哌啶酸浓度。
确认哌啶酸能否模拟早期运动的抗炎和抗脓毒症效应
6周龄雄性小鼠腹腔注射哌啶酸(200 μg/kg)于LPS前1小时和后24小时,评估血细胞计数、脓毒症评分、体重体温血糖恢复、血清细胞因子及肝肺组织病理。
探究哌啶酸抗炎作用是否通过抑制mTORC1信号
分离BMDMs,用不同浓度哌啶酸和LPS处理,qRT-PCR检测炎症因子mRNA,RNA-seq和KEGG/GSEA分析,Western blot检测mTORC1下游磷酸化,并用雷帕霉素联合处理验证。
确认肝脏Crym表达上调对哌啶酸升高和免疫保护的必要性
14月龄Exe和Sed小鼠尾静脉注射AAV8-Crym-shRNA或scramble-shRNA,4周后LPS攻击,检测肝脏Crym蛋白、血清和肝脏哌啶酸浓度、血细胞计数、脓毒症恢复、血清细胞因子及组织病理。
揭示早期运动如何持久上调肝脏Crym表达
检测DNA甲基化、组蛋白修饰,ChIP-seq和ChIP-qPCR分析Crym启动子H3K4me3富集,筛选H3K4甲基转移酶,在原代肝细胞中过表达或敲低SETD1A验证其对Crym表达和H3K4me3富集的调控。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| LPS诱导脓毒症 | 超纯大肠杆菌O55:B5菌株脂多糖 | Merck | S8776 |
| 血糖检测 | ACCU-CHEK performa血糖仪及试纸 | -- | -- |
| 血细胞计数 | Element Ht5自动血液分析仪 | Heska | -- |
| 细胞因子检测 | 小鼠细胞因子阵列Panel A试剂盒 | R&D Systems | ARY006 |
| TNF ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-E04741 | |
| IL-1β ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-E08054 | |
| IL-1Ra ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-E10395 | |
| 组织病理染色 | 油红O | Merck | O0625 |
| 组织包埋 | O.C.T.包埋剂 | Tissue-Tek, Sakura | 4583 |
| 免疫荧光 | 大鼠抗小鼠F4/80抗体 | Abcam | ab6640 |
| 代谢组学分析 | 超高效液相色谱系统 | Agilent Technologies | 1290 |
| 哌啶酸定量 | ACQUITY UPLC-Xevo TQ-S液质联用系统 | Waters Corp. | -- |
| RNA提取 | TRI试剂 | Merck | T9424 |
| 逆转录 | Evo M-MLV逆转录试剂盒 | Accurate Biology | AG11706 |
| qRT-PCR | Hieff qPCR SYBR Green试剂盒 | YESEN Biology | 11201 |
| 蛋白提取 | 放射免疫沉淀分析裂解缓冲液 | Beyotime | P0013B |
| 无EDTA蛋白酶抑制剂混合物,100× | AntiProtech | APT006 | |
| 磷酸酶抑制剂混合物,100× | AntiProtech | APT008 | |
| 蛋白定量 | 二辛可宁酸蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0012 |
| Western blot检测 | Pierce增强化学发光蛋白质印迹检测试剂盒 | Thermo Fisher | 32106 |
| Western blot | 磷酸化mTOR (Ser2448)抗体 | Cell Signaling Technology | 5536 |
| mTOR抗体 | Cell Signaling Technology | 2983 | |
| 磷酸化p70S6K (Thr389)抗体 | Cell Signaling Technology | 9234 | |
| 总p70S6K抗体 | Cell Signaling Technology | 2708 | |
| 磷酸化S6核糖体蛋白 (Ser240/244)抗体 | Cell Signaling Technology | 2215 | |
| 总S6核糖体蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2217 | |
| H3K4me3抗体 | Cell Signaling Technology | 9751 | |
| H3K27me3抗体 | Cell Signaling Technology | 9733 | |
| H3K27ac抗体 | Cell Signaling Technology | 8173 | |
| 组蛋白H3抗体 | Cell Signaling Technology | 4499 | |
| α-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2125 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 4970 | |
| Aass抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-365417 | |
| Crym抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-376687 | |
| Pycr1抗体 | Abcam | ab279385 | |
| SETD1A抗体 | Proteintech | 67936-1-lg | |
| BMDM培养 | DMEM培养基 | HyClone | SH30021.01B |
| 胎牛血清 | HyClone | SH30070.03 | |
| BMDM分化 | 重组鼠M-CSF | Merck | SRP3221 |
| BMDM培养 | 青霉素/链霉素,100× | Solarbio life science | P400 |
| ChIP | SimpleChIP酶法染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling Technology | 9002 |
| 抗H3K4me3抗体 | Cell Signaling Technology | 9751 | |
| 阳性对照抗H3抗体 | Cell Signaling Technology | 4620 | |
| 阴性对照正常兔IgG | Cell Signaling Technology | 2729 | |
| ChIP-seq | VAHTS Universal DNA文库构建试剂盒(Illumina V3) | Vazyme | ND607 |
| DNA甲基化测序 | DNeasy血液与组织试剂盒 | Qiagen | 69506 |
| Methylation-Gold试剂盒 | ZYMO | -- | |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 早期运动小鼠模型 | 小鼠品系(C57BL/6J)、性别(雄性)、开始年龄(1月龄)、游泳方案(60分钟/天,5天/周,12周)、停止训练时长(11个月) 阅读提示:Methods中Animals and the exercise protocol小节及Fig. 1a |
| LPS脓毒症模型 | LPS血清型(O55:B5)、剂量(2 mg/kg)、给药途径(腹腔注射)、检测时间点(0-72小时) 阅读提示:Methods中Sepsis model and clinical severity assessment小节及Fig. 1a |
| 哌啶酸处理 | 哌啶酸剂量(200 μg/kg)、给药途径(腹腔注射)、给药时间(LPS前1小时和后24小时)、小鼠年龄(6周龄) 阅读提示:Fig. 3a及Results中Pipecolic acid administration relieves LPS-induced sepsis小节 |
| BMDM体外实验 | 哌啶酸浓度(5、10、20 μM)、预处理时间(1小时)、LPS浓度(100 ng/ml)、刺激时间(6小时) 阅读提示:Fig. 4图注及Results中Pipecolic acid attenuates LPS-induced cytokine response小节 |
| AAV8介导的Crym敲低 | AAV8血清型、注射剂量(1.3×10^12 vg)、注射年龄(14月龄)、注射后等待时间(4周)、shRNA靶序列 阅读提示:Methods中Viral transfection and RNA interference小节及Fig. 5d |