鉴定梗死巨噬细胞中整合素表达动态
探究心肌梗死后巨噬细胞整合素表达谱的变化
比较正常心脏、梗死后3天和7天巨噬细胞的整合素基因表达,并进行流式和免疫荧光验证ITGA5蛋白表达时间过程
Protective effects of macrophage-specific integrin α5 in myocardial infarction are associated with accentuated angiogenesis.
采用两种巨噬细胞特异性敲除小鼠模型、体外骨髓巨噬细胞、scRNA-seq及RNA-seq,并进行功能与机制验证
LyzM-Cre; ITGA5 fl/fl小鼠(Myα5KO) CX3CR1-CreER; ITGA5 fl/fl小鼠(iMaα5KO) CSF1R-EGFP报告小鼠 小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMMs)
Myα5KO和iMaα5KO小鼠在冠状动脉结扎后7天和28天进行超声心动图评估LVEDV、LVESV和LVEF CD31免疫组化定量梗死区、边界区和远端区微血管密度 α-SMA免疫荧光定量成熟包被微血管密度 抗ITGA5中和抗体(clone HMa5-1,10 µg/ml)处理BMMs 24小时后检测Vegfa mRNA和VEGFA蛋白 PI3K抑制剂LY294002(20 µM)和FAK抑制剂PF-573228(5 µM)处理BMMs后检测Vegfa表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究心肌梗死后巨噬细胞整合素表达谱的变化
比较正常心脏、梗死后3天和7天巨噬细胞的整合素基因表达,并进行流式和免疫荧光验证ITGA5蛋白表达时间过程
验证ITGA5在巨噬细胞中的特异性缺失及其对基础心脏功能的影响
使用LyzM-Cre和CX3CR1-CreER两种驱动子构建条件性敲除小鼠,通过Western blot和qPCR验证敲除效率,超声心动图评估基线心功能
确定巨噬细胞ITGA5是否保护梗死心脏免受不良重构
对敲除小鼠和对照小鼠进行永久冠状动脉结扎,通过超声心动图评估心室重构,通过组织形态学定量瘢痕大小
探究ITGA5缺失是否影响巨噬细胞浸润、肌成纤维细胞密度和胶原沉积
通过流式细胞术和免疫荧光定量梗死区髓系细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和T细胞;通过α-SMA免疫荧光和天狼星红染色评估肌成纤维细胞和胶原
检验巨噬细胞ITGA5是否调控梗死后血管新生
通过CD31免疫组化定量微血管密度,通过α-SMA免疫荧光定量成熟包被微血管密度,比较梗死区、边界区和远端区
探究梗死巨噬细胞异质性及Itga5高表达亚群的特征
对CSF1R-EGFP小鼠对照心脏和梗死后7天心脏分选CSF1R+细胞进行scRNA-seq,鉴定细胞亚群并分析整合素基因表达
确定介导ITGA5促血管新生作用的巨噬细胞来源分子
对Myα5KO和对照梗死巨噬细胞进行血管新生PCR array,对ITGA5中和抗体处理的BMMs进行RNA-seq和ELISA,验证VEGFA及其他介质的表达变化
鉴定介导ITGA5诱导Vegfa合成的细胞内激酶通路
对体内和体外RNA-seq数据进行IPA分析筛选候选通路,使用药理学抑制剂(p38、Erk1/2、Erk5、PI3K、FAK)处理BMMs并检测Vegfa表达,通过Western blot验证通路激活
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 他莫昔芬诱导 | 他莫昔芬 | Sigma | T5648 |
| 组织固定 | 锌-福尔马林固定液 | Anatech | -- |
| CD31免疫组化 | 抗CD31抗体 | Cell Signaling Technology | 77699 |
| 免疫组化二抗 | 生物素化抗兔抗体 | Vectorlabs | BA-1000 |
| 免疫组化检测 | Vectastain ELITE ABC-HRP试剂盒 | Vector Laboratories Inc. | PK6100 |
| α-SMA免疫荧光 | 抗α-SMA抗体 | Sigma | F3777 |
| ITGA5免疫荧光 | 抗ITGA5抗体 | Abcam | ab150361 |
| GFP免疫荧光 | 抗GFP抗体 | Abcam | ab6662 |
| 巨噬细胞免疫荧光 | 抗Mac-2抗体 | Cedarlane | CL8942AP |
| 流式细胞术 | 抗CD16/32抗体 | BD Pharmingen | 553142 |
| DAPI | Thermo Fisher Scientific | MP01306 | |
| 巨噬细胞中和实验 | 抗ITGA5中和抗体(克隆HMa5-1) | Biolegend | 103910 |
| 中和实验对照 | 同型匹配IgG对照 | Biolegend | 400902 |
| 细胞培养 | 集落刺激因子-1 | R&D systems | -- |
| 纤连蛋白 | Sigma | F1141 | |
| 信号通路抑制 | SB203580 | Selleckchem | S1076 |
| U0126 | Cell Signaling Technology | 9903 | |
| PD98059 | Cell Signaling Technology | 9900 | |
| XMD8-92 | Selleckchem | S7525 | |
| BIX02189 | Selleckchem | S1531 | |
| LY294002 | Selleckchem | S1105 | |
| PF-573228 | Sigma | PZ0117 | |
| RNA提取 | QIAzol裂解试剂 | Qiagen | 79306 |
| 逆转录 | iScript逆转录预混液试剂盒 | Bio-Rad Laboratories | 1708840 |
| qPCR | SsoFast EvaGreen预混液 | Bio-Rad Laboratories | 1725204 |
| PCR array | RT2 Profiler小鼠血管新生PCR芯片 | Qiagen | PAMM-024ZE-4 |
| RNA提取 | RNeasy迷你试剂盒 | Qiagen | 74104 |
| RNA-seq建库 | NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒(Illumina) | NEB | -- |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | Thermofisher | 89900 |
| Halt蛋白酶抑制剂混合物 | Thermofisher | 78429 | |
| 抗p-AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 抗p-FAK抗体 | Cell Signaling Technology | 3283 | |
| 抗FAK抗体 | Cell Signaling Technology | 3285 | |
| ELISA | VEGFA酶联免疫吸附测定试剂盒 | R&D | MMV00 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 心肌梗死模型建立 | 小鼠品系、性别、年龄(3-4月龄)、结扎时间点(24小时、3天、7天、28天)、手术 blinded 设计 阅读提示:Methods 'Mouse model of non-reperfused myocardial infarction' |
| 巨噬细胞特异性ITGA5敲除 | Cre驱动子(LyzM-Cre或CX3CR1-CreER)、他莫昔芬剂量(100 mg/kg/day,连续5天)、敲除验证方法 阅读提示:Methods 'Generation of myeloid cell-specific and macrophage-specific ITGA5 KO mice' 及 Supplementary Fig. 5、12、13 |
| 超声心动图评估 | 测量时间点(基线、7天、28天)、参数(LVEDV、LVESV、LVEF)、 blinded 分析 阅读提示:Methods 'Echocardiography' 及 Fig. 2、6 |
| 组织学与血管密度定量 | 切片间隔(250 µm)、每个样本分析视野数(至少10个)、抗体货号、 blinded 定量 阅读提示:Methods 'Immunohistochemistry and assessment of microvascular density' 及 Fig. 5 |
| 体外BMMs中和实验 | 抗ITGA5抗体浓度(10 µg/ml)、处理时间(24小时)、纤连蛋白预包被、抑制剂浓度(LY294002 20 µM, PF-573228 5 µM) 阅读提示:Methods 'Isolation, culture, and stimulation of mouse bone marrow macrophages' 及 Fig. 10 |
| scRNA-seq分析 | 细胞分选策略(EGFP+/Ly6G-)、样本数量(对照3个合并,梗死3个独立)、测序平台与深度 阅读提示:Methods 'Fluorescence-activated cell sorting (FACS) of infarct macrophages and single cell RNA-sequencing (scRNA-seq)' |