应激靶癌细胞驱动CAR T细胞和实体瘤微环境的非遗传重编程

Stressed target cancer cells drive nongenetic reprogramming of CAR T cells and solid tumor microenvironment.

作者信息Yufeng Wang, David L Drum, Ruochuan Sun, Yida Zhang, Feng Chen, Fengfei Sun, Emre Dal, Ling Yu, Jingyu Jia, Shahrzad Arya, Lin Jia, Song Fan, Steven J Isakoff, Allison M Kehlmann, Gianpietro Dotti, Fubao Liu, Hui Zheng, Cristina R Ferrone, Alphonse G Taghian, Albert B DeLeo, Marco Ventin, Giulia Cattaneo, Yongxiang Li, Youssef Jounaidi, Peigen Huang, Cristina Maccalli, Hanyu Zhang, Cheng Wang, Jibing Yang, Genevieve M Boland, Ruslan I Sadreyev, LaiPing Wong, Soldano Ferrone, Xinhui Wang
PMID37714830
发布时间2023-09-15
DOI10.1038/s41467-023-41282-x

实验完整度

高

包含体外应激癌细胞、CAR T共培养功能验证、多种异种移植和人源化小鼠体内模型及JAK抑制剂机制验证

主要模型

SUM159和SUM149三阴性乳腺癌细胞系原位异种移植NSG小鼠模型 PANC-1胰腺导管腺癌原位/皮下异种移植NSG小鼠模型 人源化NSG小鼠(植入人PBMC)荷SUM159肿瘤模型 TNBC-PDX原位异种移植NSG小鼠模型

重点核对

体外应激处理:DSF/Cu(0.2 µM/1 µM)处理24 h后12 Gy IR;体内瘤内注射DSF/Cu(1.5 µM/1 µM)后次日12 Gy局部IR CAR T共培养E:T比1:3或1:2,重复共培养最多3轮 体内CAR T输注剂量文中未明确说明(提及5×10^6 B7-H3 CAR T细胞/mouse用于JAKi实验) JAKi ruxolitinib 60 mg/kg腹腔注射每日一次连续5天,于CAR T输注后1天或5天开始 肿瘤体积>2 cm或光子数>1×10^10时终止实验

摘要

嵌合抗原受体T细胞(CAR T)疗法对实体瘤的疗效不佳,原因在于CAR T细胞肿瘤浸润、体内扩增、持久性和效应功能不足,以及耗竭、靶癌细胞固有的靶抗原异质性或抗原丢失,和免疫抑制性肿瘤微环境(TME)。在此,我们描述了一种广泛适用的非遗传方法,可同时解决CAR T作为实体瘤疗法的多重挑战。该方法通过将CAR T细胞暴露于经细胞应激诱导剂双硫仑(DSF)和铜(Cu)(DSF/Cu)加电离辐射(IR)处理的应激靶癌细胞来重编程CAR T细胞。重编程后的CAR T细胞获得早期记忆样特征、强效细胞毒性、增强的体内扩增、持久性并减少耗竭。经DSF/Cu和IR应激的肿瘤也在人源化小鼠中重编程并逆转免疫抑制性TME。重编程的CAR T细胞来源于健康供者或转移性女性乳腺癌患者的外周血单个核细胞,在多种异种移植小鼠模型中诱导强劲、持久的记忆性和治愈性抗实体瘤反应,确立了通过应激肿瘤来赋能CAR T作为实体瘤有前景疗法的概念验证。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
能否通过非遗传方式,利用DSF/Cu和IR应激的靶癌细胞同时重编程CAR T细胞和实体瘤免疫抑制微环境,从而克服CAR T治疗实体瘤的多重障碍。
核心机制
DSF/Cu+IR诱导靶癌细胞发生免疫原性细胞死亡和内质网应激,释放DAMPs及促炎细胞因子/趋化因子,至少部分通过激活CAR T细胞中的JAK/STAT信号轴,驱动CAR T细胞向早期记忆样表型转化并逆转免疫抑制性TME。
主要证据
体外RNA-seq、Western blot、qRT-PCR和流式细胞术显示应激癌细胞上调应激相关基因和促炎因子并增加靶抗原表达;重复共培养中重编程CAR T细胞TSCM/TCM比例升高、扩增和细胞毒性增强;多种异种移植和人源化小鼠模型中重编程CAR T细胞诱导肿瘤完全消退、持久记忆反应和TME促炎因子升高;JAK抑制剂ruxolitinib可完全消除重编程CAR T/TME介导的体内抗肿瘤效应。
研究意义
该非遗传策略可同时克服CAR T治疗实体瘤的多个主要障碍,在多种实体瘤模型中实现完全排斥并诱导长期免疫记忆,为增强CAR T对实体瘤疗效提供了概念验证。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

体外应激靶癌细胞并验证应激反应

确认DSF/Cu+IR能在靶癌细胞中诱导细胞应激和免疫原性细胞死亡相关改变。

用DSF/Cu(0.2 µM/1 µM)处理SUM159等癌细胞24 h后给予12 Gy IR,通过RNA-seq、GSEA、Western blot、qRT-PCR和流式细胞术检测内质网应激、ROS、炎症反应基因及TRAILR和靶抗原表达。

2

体外共培养重编程CAR T细胞并评估表型转换

验证应激靶癌细胞能否驱动CAR T细胞向早期记忆样表型转化。

将应激或未应激靶癌细胞与健康供者或乳腺癌患者PBMC来源的B7-H3或CSPG4 CAR T细胞共培养,用流式细胞术检测CD45RA/CD62L定义的TSCM、TCM、TEM、TEFF比例,并用RNA-seq分析记忆相关基因。

3

评估重编程CAR T细胞的体外扩增和细胞毒性

验证重编程CAR T细胞是否获得更强的扩增能力和杀伤功能。

在重复共培养中计数CAR T细胞和残留肿瘤细胞,用ELISA检测上清IFN-γ和TNF-α,并在6、24、48 h时间点评估杀伤。

4

体内瘤内DSF/Cu+局部IR重编程CAR T细胞并评估抗肿瘤效果

验证体内应激肿瘤能否重编程系统性输注的CAR T细胞并诱导持久抗实体瘤反应。

在SUM159、SUM149、PANC-1等异种移植NSG小鼠模型中,瘤内注射DSF/Cu后次日局部IR,再静脉输注CAR T细胞,监测肿瘤体积、生存、CAR T浸润和记忆表型,并进行肿瘤再挑战。

5

体外预重编程CAR T细胞(ex vivo RP)的体内验证

评估在无法进行瘤内注射和IR时,体外重编程CAR T细胞是否仍具有体内抗肿瘤活性。

将B7-H3 CAR T细胞与经DSF/Cu+IR预应激的PANC-1细胞共培养48 h,磁珠分选CD3+ CAR T细胞后输注至PANC-1原位荷瘤小鼠,监测肿瘤和再挑战反应。

6

人源化小鼠中评估TME重编程

验证应激肿瘤能否在具备人免疫细胞的环境中逆转免疫抑制性TME。

在荷SUM159肿瘤的NSG小鼠中植入健康供者人PBMC建立人源化模型,给予DSF/Cu+IR和B7-H3 CAR T细胞,检测肿瘤内CD3+CD45+细胞、CAR T细胞、耗竭标志物及细胞因子/趋化因子。

7

JAK/STAT机制验证

验证应激癌细胞诱导的CAR T细胞重编程是否依赖JAK/STAT信号轴。

检测共培养后CAR T细胞中p-JAK1、p-JAK2、p-STAT3、p-STAT5和BCL-2水平,并用JAK抑制剂ruxolitinib或momelotinib处理,评估TCM比例、体外杀伤及体内抗肿瘤效应。

8

患者来源PBMC CAR T细胞的治疗验证

评估转移性乳腺癌患者来源的重编程CAR T细胞的临床相关性疗效。

从20例转移性乳腺癌患者PBMC制备B7-H3 CAR T细胞,经应激靶细胞重编程后输注至SUM159原位荷瘤小鼠,比较肿瘤体积、生存、CAR T扩增和记忆表型;另用一例患者PBMC在TNBC-PDX模型中验证。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
RPMI 1640培养基----
Dulbecco改良Eagle培养基----
胎牛血清----
双硫仑----
铜----
CD3-PE-Cy7抗体Biolegend300420
CD8-APC-Cy7抗体Biolegend344714
CD4-FITC抗体Biolegend357406
CD45RA-PE/Cyanine5抗体Biolegend304110
CD62L-PE抗体Biolegend304806
PD-1-APC抗体Biolegend329907
LAG-3-APC抗体Biolegend369212
TIM3-Pacific Blue抗体Biolegend345042
CTLA-4-BV605抗体Biolegend369610
Zombie Red可固定活力检测试剂盒Biolegend423110
磷酸化eIF2α抗体Cell Signaling Technology3398
磷酸化IRE1α抗体InvitrogenPA585647
Bcl-2抗体Cell Signaling Technology15071S
β-肌动蛋白抗体Cell Signaling Technology3700
磷酸化Stat5抗体Cell Signaling Technology9356S
磷酸化Stat3抗体Cell Signaling Technology9145S
磷酸化Jak1抗体Cell Signaling Technology74129
磷酸化Jak2抗体Cell Signaling Technology3771
CD3抗体Miltenyi Biotec130-093-387
CD28抗体BD Biosciences556620
RetroNectinTakara Bio Inc.--
白细胞介素-7PeproTech--
白细胞介素-15PeproTech--
RNeasy Mini试剂盒Qiagen--
FastStart SYBR Green预混液Roche--
M-MLV逆转录酶Life Technologies--
Pierce BCA蛋白定量试剂盒Thermo Fisher Scientific--
RIPA裂解液Thermo Fisher Scientific--
酶联免疫吸附试剂盒Biolegend--
定制25重Luminex检测 PanelThermo Fisher Scientific--
CountBright绝对计数微球Thermo Fisher--
CD3+ T细胞DynabeadsThermo Fisher11033
IV型胶原酶Sigma-Aldrich--
脱氧核糖核酸酶ISigma-Aldrich--
VECTASTAIN ABC试剂盒Vector Laboratories--
DAB底物Dako--
JAK抑制剂鲁索替尼----
JAK抑制剂莫美替尼----
X-RAD 320生物辐照仪Precision X-ray Inc.--
Perkin-Elmer IVIS100成像系统Perkin-Elmer--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
体外应激靶癌细胞
DSF/Cu浓度(0.2 µM/1 µM)、处理24 h、12 Gy IR、细胞接种密度
阅读提示:Methods中In vitro stressing of target cells小节
CAR T细胞共培养重编程
E:T比(1:2或1:3)、共培养时间(48-72 h)、重复共培养轮次、靶细胞类型
阅读提示:Methods中In vitro co-culture experiments和Repetitive co-culture assay小节
体内瘤内DSF/Cu+局部IR
DSF/Cu剂量(1.5 µM/1 µM)、注射体积200 µL、IR剂量12 Gy、IR时间(次日)
阅读提示:Methods中In vivo stressing of tumors by intratumoral delivery of DSF/Cu and IR小节
体内CAR T输注
CAR T细胞输注剂量文中未明确说明(JAKi实验为5×10^6 B7-H3 CAR T细胞/mouse)、给药途径(尾静脉)、分组n=5 mice/group
阅读提示:Methods中Systemic CAR T therapy小节和In vivo solid tumor mouse models小节
JAK抑制剂体内实验
ruxolitinib剂量60 mg/kg、腹腔注射每日一次连续5天、开始时间(CAR T后1天或5天)
阅读提示:Methods中In vivo evaluation of JAK inhibitor on stressed tumor-reprogrammed CAR T/TME小节
人源化小鼠模型
人PBMC接种量20×10^6/小鼠、接种途径尾静脉、治疗起始肿瘤体积约350 mm3、取样时间第5天和第10天
阅读提示:Methods中Humanized mouse model小节和Results对应段落
患者来源PBMC CAR T实验
患者数量n=20、PBMC TSCM比例范围1.01%-9.51%、分组n=20、PDX模型组n=6-7
阅读提示:Results中Robust and long-sustained therapeutic responses小节及Methods中Generation of CAR T cells小节