鉴定EBG1基因及其对细胞壁完整性和致病性的作用
明确EBG1在稻瘟病菌细胞壁重塑和致病过程中的功能。
构建EBG1缺失突变体和互补菌株,检测菌丝生长、产孢、孢子萌发、附着胞形成、细胞壁胁迫敏感性、致病性及EBG1表达模式。
Plant immunity suppression by an exo-β-1,3-glucanase and an elongation factor 1α of the rice blast fungus.
包含体外酶活、酵母双杂交、烟草瞬时表达、水稻和活体接种等多层级功能与机制验证
稻瘟病菌Magnaporthe oryzae野生型P131及基因缺失突变体 水稻(Oryza sativa)品种LTH、NBT、ZH11、Kitaake及OsSerk2 RNAi株系 大麦(Hordeum vulgare)品种E9 本氏烟草(Nicotiana benthamiana)
Δebg1和Δef1α突变体在CFW(100 μg/ml)和CR(200 μg/ml)条件下的细胞壁完整性表型 喷雾接种孢子浓度(5×10^4或3×10^4 spores/ml)和离体叶鞘注射浓度(1×10^5 spores/ml) DAB染色时间(30 hpi)和DPI处理浓度(0.5 μM,12 hpi) Ebg1-6His酶活反应条件(pH 5.0,50°C,2 h,0.2%底物) ROS burst检测中Ebg1-6His(80 μg/ml)或β-1,3-glucan(20 μg/ml)的浓度
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确EBG1在稻瘟病菌细胞壁重塑和致病过程中的功能。
构建EBG1缺失突变体和互补菌株,检测菌丝生长、产孢、孢子萌发、附着胞形成、细胞壁胁迫敏感性、致病性及EBG1表达模式。
确定Ebg1是否为分泌蛋白及其在侵染菌丝中的定位。
构建EBG1-GFP和EBG1-6His表达菌株,观察荧光定位,利用免疫印迹检测培养滤液和菌丝中的Ebg1,并用酵母转化酶分泌实验验证信号肽功能。
验证Ebg1为外切-β-1,3-葡聚糖酶并确定其底物特异性。
从培养滤液纯化Ebg1-6His,与昆布多糖、昆布寡糖、β-1,3-葡聚糖、纤维素和几丁质孵育,HPLC和葡萄糖氧化酶法检测水解产物。
检验Ebg1是否独立于酶活触发植物免疫反应。
在烟草中瞬时表达EBG1及其截短/突变体观察细胞死亡,用纯化蛋白处理水稻叶片检测ROS burst和MAPK激活,并通过VIGS沉默NbBAK1及OsSerk2 RNAi株系验证受体依赖性。
寻找与Ebg1互作的真菌蛋白并解析其抑制Ebg1触发免疫的机制。
以EBG1-ΔSP为诱饵筛选稻瘟病菌侵染水稻叶片cDNA文库,Y2H和Co-IP验证互作,BiFC和共定位观察,并在烟草和水稻中检测EF1α对Ebg1诱导免疫的抑制作用。
验证EF1α在侵染过程中对致病性和宿主ROS积累的作用。
构建Δef1α突变体和互补菌株,检测致病性、ROS积累;构建EF1α启动子驱动的EBG1E378Q/E476Q过表达菌株,检测致病性和ROS。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 基因敲除与互补 | DIG High Prime DNA标记和检测起始试剂盒II | Roche | -- |
| Q5定点突变试剂盒 | NEB | -- | |
| 蛋白纯化 | TALON金属亲和树脂 | Clontech | -- |
| Vivaflow 50超滤装置 | Sartorius Stedim Biotech | -- | |
| Amicon Ultra-15超滤管 | Millipore | -- | |
| Amicon Ultra-4超滤管 | Millipore | -- | |
| 蛋白定量 | Bradford蛋白定量试剂盒 | Thermo-Fisher Scientific | -- |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | -- | |
| HPLC分析 | Dionex ICS3000离子色谱系统 | Dionex | -- |
| CarboPac PA10色谱柱 | Dionex | -- | |
| 昆布六糖 | Megazyme | -- | |
| 昆布五糖 | Megazyme | -- | |
| 昆布四糖 | Megazyme | -- | |
| 昆布三糖 | Megazyme | -- | |
| 昆布二糖 | Megazyme | -- | |
| 昆布多糖 | Sigma-Aldrich | L9634 | |
| 酶活测定 | 葡萄糖氧化酶检测试剂盒 | Megazyme | -- |
| β-1,3-葡聚糖 | Sigma-Aldrich | 89862 | |
| 纤维素 | Sigma-Aldrich | S3504 | |
| 虾壳几丁质 | Sigma-Aldrich | C9752 | |
| 农杆菌浸润 | pENTR定向TOPO克隆试剂盒 | Invitrogen | -- |
| Gateway LR Clonase II酶混合物 | Invitrogen | -- | |
| Western blot | 抗HA抗体 | Sigma-Aldrich | -- |
| 抗Flag抗体 | Sigma-Aldrich | A8592 | |
| RNA提取与RT-qPCR | KK Fast植物总RNA提取试剂盒 | Zoman Biotechnology | -- |
| HiScript II第一链cDNA合成试剂盒 | Vazyme | -- | |
| 2×RealStar Green Power Mixture含ROXII | GenStar | -- | |
| Co-IP | 抗GFP亲和树脂 | Chromotek | gta-20 |
| 抗Flag M2亲和树脂 | Sigma-Aldrich | F2426 | |
| Western blot | 抗肌动蛋白抗体 | ABclonal | AC009 |
| 抗HA抗体 | Sigma | H3663 | |
| 抗His抗体 | Abmart | 10E2 | |
| 抗p44/42抗体 | Cell signaling | 9101 | |
| 抗GFP抗体 | Abclonal | AE012 | |
| 抗GST抗体 | EASYBIO | BE7012 | |
| MAPK检测 | 磷酸化p42/44 MAPK抗体 | CST | -- |
| 抗肌动蛋白抗体 | Abclonal | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞壁完整性检测 | CFW浓度100 μg/ml、CR浓度200 μg/ml、培养温度28°C、培养时间5天 阅读提示:Methods 'Strains and culture conditions'及Fig. 1a,b图注 |
| 致病性测试 | 孢子浓度5×10^4或3×10^4 spores/ml、喷雾接种、5 dpi观察、水稻品种LTH/NBT、大麦品种E9 阅读提示:Methods 'Virulence test and infection process observation'及Fig. 1d,e、Fig. 5g,h图注 |
| 侵染过程观察 | 水稻叶鞘注射浓度1×10^5 spores/ml、观察时间18/24/30/36 hpi、显微镜型号Nikon 90i 阅读提示:Methods 'Virulence test and infection process observation'及Fig. 1f–i图注 |
| ROS检测与DPI处理 | DAB浓度1 mg/ml、pH 3.8、染色8 h、DPI浓度0.5 μM、DPI添加时间12 hpi 阅读提示:Methods 'DAB staining and exogenous DPI and Ebg1 treatments'及Fig. 1j–m图注 |
| Ebg1酶活测定 | 底物浓度0.2%、Ebg1-6His用量1.5 μg、缓冲液100 mM磷酸钠pH 5.0、反应温度50°C、反应时间2 h 阅读提示:Methods 'Enzymatic activity assay'及Fig. 3d,e图注 |
| ROS burst检测 | Ebg1-6His浓度80 μg/ml、β-1,3-glucan或glucose浓度20 μg/ml、检测时间35 min或60 min、水稻品种ZH11/Kitaake 阅读提示:Methods 'ROS burst and MAPK activation assay'及Fig. 3f、Fig. 4d,e、Fig. 5f图注 |
| 烟草细胞死亡检测 | 农杆菌浸润OD600=0.5、浸润缓冲液含10 mM MgCl2、10 mM MES pH 5.6、200 μM乙酰丁香酮、5 dpi或7 dpi拍照 阅读提示:Methods 'Agrobacterium tumefaciens infiltration assay in N. benthamiana'及Fig. 4b、Fig. 5e图注 |
| Y2H互作验证 | 诱饵pGBKT7-EBG1-ΔSP、prey pGADT7-EF1α、酵母菌株Y2H-Gold、SD-Leu-Trp-His-筛选、X-α-gal检测 阅读提示:Methods 'Yeast two-hybrid (Y2H) assay'及Fig. 5b图注 |
| Co-IP验证 | EBG1-GFP和EF1α-3Flag共转化P131、培养滤液总蛋白、anti-GFP和anti-Flag树脂、洗脱条件 阅读提示:Methods 'Co-immunoprecipitation assay and western blotting'及Fig. 5c图注 |