由功能失调的组织非特异性碱性磷酸酶引起的低磷酸酯酶症的结构病理学

The structural pathology for hypophosphatasia caused by malfunctional tissue non-specific alkaline phosphatase.

作者信息Yating Yu, Kewei Rong, Deqiang Yao, Qing Zhang, Xiankun Cao, Bing Rao, Ying Xia, Yi Lu, Yafeng Shen, Ying Yao, Hongtao Xu, Peixiang Ma, Yu Cao, An Qin
PMID37422472
发布时间2023-07-08
DOI10.1038/s41467-023-39833-3

实验完整度

高

包含晶体结构、冷冻电镜结构、体外酶活、细胞矿化及TNAP敲除细胞等多层级功能验证

主要模型

Hi5昆虫细胞表达的重组hTNAP18–500蛋白 HEK293T细胞过表达TNAP突变体 MC3T3-E1成骨细胞系 Alpl−/−小鼠颅骨来源前成骨细胞

重点核对

hTNAP18–500蛋白表达系统中Hi5细胞感染后96小时收获,Expi293F细胞转染后96小时收获 磷酸酶活性检测使用10 mM pNPP底物,37°C测定405 nm吸光度,n=3至6个生物学独立样本 成骨诱导培养基含100 nM地塞米松、50 μM抗坏血酸和4 mM β-甘油磷酸钠,每3天换液 矿化检测于诱导后第14天或第21天进行Alizarin Red和Von Kossa染色 JTALP001处理浓度为100 nM,重组TNAP蛋白处理浓度为600 ng/ml

摘要

低磷酸酯酶症(HPP)是一种代谢性骨病,表现为骨和牙齿组织发育异常。HPP患者由于组织非特异性碱性磷酸酶(TNAP)的缺陷或功能障碍而表现出矿化不足和骨量减少,TNAP催化细胞外含磷酸分子水解,促进羟基磷灰石在细胞外基质中的沉积。尽管已鉴定出数百种致病性TNAP突变,但HPP的详细分子病理学仍不清楚。在此,为解决这一问题,我们确定了接近原子分辨率的人TNAP晶体结构,并将主要致病突变映射到结构上。我们的研究揭示了TNAP出人意料的八聚体结构,该结构由二聚体TNAP的四聚化产生,可能稳定TNAP在细胞外环境中的存在。此外,我们利用冷冻电镜证明TNAP激动剂抗体(JTALP001)通过结合八聚体界面与TNAP形成稳定复合物。给予JTALP001可增强成骨细胞矿化,并促进重组TNAP在TNAP敲除成骨细胞中恢复的矿化。我们的发现阐明了HPP的结构病理学,并突出了TNAP激动剂抗体在成骨细胞相关骨疾病中的治疗潜力。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
HPP相关TNAP突变导致功能缺陷的结构基础是什么,以及能否通过靶向TNAP寡聚界面恢复其功能?
核心机制
TNAP形成八聚体架构,其寡聚界面(界面S和L)的突变可破坏酶稳定性与活性;TNAP激动剂抗体JTALP001通过结合八聚体界面S,稳定TNAP活性形式并增强磷酸酶活性。
主要证据
晶体结构显示TNAP八聚体及二聚体界面、催化中心;冷冻电镜显示JTALP001 scFv与TNAP二聚体1:1结合并覆盖界面S;体外酶活实验显示界面突变体活性降低,JTALP001可增强野生型及界面突变体活性但不能恢复二聚体界面突变体R450C或活性中心突变体T167M的活性;细胞矿化实验显示JTALP001促进hMSCs矿化并增强TNAP介导的Alpl−/−前成骨细胞矿化。
研究意义
阐明了HPP的结构病理学,提供了基于突变位点的分子分型策略,并提示TNAP激动剂抗体JTALP001对成骨细胞相关骨疾病具有治疗潜力。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

hTNAP18–500蛋白表达与纯化

获得具有磷酸酶活性的重组hTNAP蛋白用于结构和功能研究

将人ALPL基因(18–500氨基酸)克隆至杆状病毒或哺乳动物表达载体,在Hi5昆虫细胞或Expi293F细胞中过表达,经镍亲和层析和Superdex 200尺寸排阻色谱纯化。

2

hTNAP晶体结构解析

确定TNAP高分辨率结构以映射致病突变

在酸性和碱性pH条件下筛选晶体,通过分子置换(以PDB 1EW2为初始模型)解析结构,并迭代精修。

3

致病突变体磷酸酶活性检测

验证二聚体界面、催化中心、钙结合位点及八聚体界面突变对TNAP活性的影响

在HEK293T细胞中过表达野生型或突变体hTNAP18–500,收集培养基检测pNPP水解活性,并以Western blot校准表达量。

4

JTALP001 scFv复合物冷冻电镜结构解析

确定TNAP激动剂抗体与TNAP的结合表位

将Hi5细胞纯化的hTNAP18–500与scFv以2.5:1摩尔比4°C孵育30分钟,经尺寸排阻色谱分离复合物,制备冷冻电镜样品并收集数据,解析复合物结构至2.96 Å。

5

成骨细胞矿化功能验证

评估重组TNAP突变体及JTALP001对成骨细胞分化和矿化的影响

在MC3T3-E1细胞、人骨髓间充质干细胞(hMSCs)和Alpl−/−小鼠颅骨来源前成骨细胞中进行成骨诱导,分别加入野生型或突变体TNAP蛋白、Fc片段或JTALP001,通过Alizarin Red和Von Kossa染色评估矿化。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
pFast-Bac Dual载体Invitrogen--
pcDNA3.4载体----
PEI MAX转染试剂Polysciences--
镍螯合树脂Smart-Lifesciences--
Superdex 200 Increase 10/300 GL色谱柱GE Healthcare--
Infinite M200 Pro NanoQuant酶标仪TECAN--
地塞米松Sigma--
抗坏血酸Sigma--
β-甘油磷酸钠Sigma--
茜素红S溶液OriCell--
Von Kossa染色试剂盒GENMED--
小鼠ALPL抗体R&D SystemsAF2910
β-actin小鼠单克隆抗体AffinityT0022
HRP标记抗小鼠IgG抗体CST7076P2
HRP标记抗兔IgG抗体CST7074P2
DyLight 800标记抗小鼠IgG抗体CST5257
HRP标记兔抗山羊IgG抗体Abcamab6741
HRP标记DYKDDDDK标签单克隆抗体ProteinTechHRP-66008
Alexa 633标记山羊抗人IgG二抗ThermoA21091
Vitrobot Mark IV冷冻制样仪FEI--
Titan Krios透射电子显微镜FEI--
K3相机Gatan--
Wyatt Dawn Heleos II多角度光散射检测器Wyatt Technology--
Wyatt Optilab T-rEX示差折光检测器Wyatt Technology--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
hTNAP蛋白表达与纯化
表达系统(Hi5昆虫细胞或Expi293F细胞)、收获时间(感染/转染后96小时)、纯化缓冲液pH与盐浓度
阅读提示:Methods中Protein expression and purification小节
晶体生长与结构解析
酸性条件沉淀剂PEG3350浓度与pH、碱性条件PEG4000浓度与添加剂、冷冻保护剂种类与浓度
阅读提示:Methods中Crystallization小节及Supplementary Table 1
致病突变体磷酸酶活性检测
pNPP终浓度(10 mM)、反应温度(37°C)、检测波长(405 nm)、生物学重复数(n=3至6)
阅读提示:Methods中Alkaline phosphatase (ALP) activity assays and staining小节及图1、2、3、4图注
JTALP001 scFv复合物冷冻电镜
hTNAP与scFv摩尔比(2.5:1)、孵育时间与温度、电镜数据收集参数(放大倍数、像素尺寸、总剂量)
阅读提示:Methods中Preparation of hTNAP18–500-scFv complex及cryo-EM sample preparation, data collection, and processing小节
成骨细胞矿化实验
细胞接种密度(30,000 cells/孔)、成骨诱导培养基成分与浓度、重组TNAP蛋白浓度(600 ng/ml)、JTALP001浓度(100 nM)、染色时间点(第14天或第21天)
阅读提示:Methods中Osteogenic differentiation assays小节及图5、6图注