CA-PKA小鼠的生成与表征
验证组成性活化的PKAcαR在胃间质中的表达及PKA活性增加。
生成Six2-Cre+/-PKAcαRfl/wt小鼠,并通过免疫印迹检测PKAcα水平,通过免疫荧光检测p-CREB以评估PKA活性。
Elevated Protein Kinase A Activity in Stomach Mesenchyme Disrupts Mesenchymal-epithelial Crosstalk and Induces Preneoplasia
该研究包括基因工程小鼠模型、谱系示踪、组织学、免疫荧光、免疫印迹、mRNA测序及生物信息学分析,涵盖表型、分子和机制验证,证据层级独立且相互支持。
Six2-Cre+/-PKAcαRfl/wt (CA-PKA) 小鼠 Six2-Cre+/-R-tdTomatofl/wt 小鼠
CA-PKA小鼠中Six2-Cre介导的PKAcαR表达仅限于胃间质 6周龄和12月龄CA-PKA小鼠胃体组织学改变(壁细胞减少、黏液细胞增生、囊性腺体) mRNA测序结果(7-8月龄,4个对照和4个突变体) BMP信号下调(通过GREM1上调和p-SMAD1/5降低),ERK1/2激活(p-ERK升高) 炎症标志物(ARG1+细胞、CD3+ T细胞、p-STAT3)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证组成性活化的PKAcαR在胃间质中的表达及PKA活性增加。
生成Six2-Cre+/-PKAcαRfl/wt小鼠,并通过免疫印迹检测PKAcα水平,通过免疫荧光检测p-CREB以评估PKA活性。
确定Six2-Cre在胃中的表达区域。
将Six2-Cre小鼠与tdTomato报告小鼠交配,通过共染色RFP与ACTA2或ECAD确认tdTomato表达仅限于间质。
观察CA-PKA小鼠胃黏膜的病理变化。
对6周龄和12月龄对照和突变小鼠的胃组织进行苏木精-伊红染色,评估黏膜结构、细胞组成、炎症浸润和腺体异常。
定量评估胃黏膜各类细胞的变化。
使用凝集素(UEA1、GSII)和细胞标记物(MUC5B、ATP4A、MIST1、CHGA)进行共免疫荧光和免疫印迹,分析壁细胞、主细胞、黏液颈细胞、内分泌细胞的变化。
确认CA-PKA小鼠胃黏膜是否发生SPEM及肠化生。
使用TFF2/GSII、GIF/GSII共标检测SPEM;使用PAS/AB染色评估酸性黏液;检测VIL1、PIGR和MUC2表达。
揭示CA-PKA小鼠胃体的分子特征。
对7-8月龄小鼠胃体进行mRNA测序,分析差异表达基因,进行GO、KEGG和Reactome通路分析,并验证炎症和化生相关基因。
确认慢性炎症和STAT3信号激活。
通过免疫荧光检测ARG1(髓源性抑制细胞)、CD3(T细胞)和p-STAT3,并分析mRNA测序中炎症相关基因表达。
评估细胞增殖和去分化程度。
通过免疫荧光检测PCNA和SOX9,免疫印迹检测PCNA和CD44水平,并分析生长因子和细胞焦亡/坏死性凋亡相关基因表达。
探究PKA激活对BMP和ERK信号的影响。
通过免疫印迹检测GREM1、p-SMAD1/5、p-ERK水平,通过共免疫荧光检测p-SMAD1/5/9和p-ERK的分布。
鉴定CA-PKA小鼠中扩增的基质细胞类型。
使用RFP(tdTomato)与ACTA2、VIM、PDGFRA共标,分析Six2+祖细胞来源的基质细胞在对照和突变小鼠中的分布和扩增。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 小鼠构建与繁殖 | Six2-Cre | Jackson Laboratory | 009606 |
| Ai9 (RCL-tdTomato) | Jackson Laboratory | 007909 | |
| 组织化学 | 阿尔辛蓝 | -- | -- |
| 免疫印迹 | RIPA裂解液 | Alfa Aesar | AAJ62524AE |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Thermo Fisher | 78425 | |
| Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce | 23225 | |
| Supersignal west dura延长持续时间底物 | Pierce | -- | |
| mRNA测序 | TRIzol试剂 | -- | -- |
| RNA Nano 6000分析试剂盒 | Agilent Technologies | -- | |
| Bioanalyzer 2100系统 | Agilent Technologies | -- | |
| NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒(Illumina) | NEB | -- | |
| cBot簇生成系统 | Illumina | -- | |
| PE簇试剂盒cBot-HS | Illumina | -- | |
| 免疫荧光 | ARG1 | Cell Signaling | 93668 |
| 免疫荧光/免疫印迹 | ATP4A | Sigma | HPA039154 |
| 免疫荧光 | CD3 | Cell Signaling | 78588 |
| 免疫印迹 | CD44 | Proteintech | 15675-1-AP |
| 免疫荧光 | CHGA | Proteintech | 23342-1-AP |
| ECAD | BD Bioscience | 610181 | |
| 免疫荧光/免疫印迹 | P-CREB | Cell Signaling | 9198 |
| P-ERK | Cell Signaling | 4370 | |
| 免疫荧光 | GIF | Sigma | HPA040774 |
| 免疫印迹 | GKN1 | Proteintech | 19344-1-AP |
| GREM1 | R&D | AF956-SP | |
| 免疫荧光 | MIST1 | Cell Signaling | 14896 |
| MUC2 | Genetex | GTX100664 | |
| 免疫荧光/免疫印迹 | MUC5B | Sigma | HPA008246 |
| PCNA | Cell Signaling | 13110 | |
| 免疫荧光 | PDGFRA | Cell Signaling | 3174 |
| 免疫印迹 | PIGR | R&D | AF2800-SP |
| 免疫荧光 | RFP | Rockland | 600-401-379 |
| RFP | Rockland | 200-101-379 | |
| P-STAT3 | Cell Signaling | 9145 | |
| P-SMAD1/5/9 | Sigma | AB3848-I | |
| 免疫印迹 | P-SMAD1/5 | Cell Signaling | 9516 |
| SMAD5 | Cell Signaling | 12534 | |
| 免疫荧光 | SMA | Sigma | A5228 |
| VIL1 | Proteintech | 16488-1-AP | |
| VIM | Cell Signaling | 5741 | |
| 生物素标记的加纳籽凝集素II (GSII) | Vector Lab | BK-3000 | |
| 荧光素标记的双花扁豆凝集素 (DBA) | Vector Labs | FL-1031 | |
| 罗丹明标记的荆豆凝集素I (UEA I) | Vector Labs | RL-1062-2 | |
| DyLight 488链霉亲和素 | Vector Labs | SA-5488-1 | |
| 免疫印迹 | 抗兔IgG HRP连接抗体 | Cell Signaling | 7074 |
| 抗兔IgG HRP连接抗体 | Cell Signaling | 7076 | |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488标记的AffiniPure驴抗小鼠IgG (H+L) | Jackson Immunoresearch | 715-545-150 |
| 驴抗兔IgG (H+L)高度交叉吸附二抗,Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A-21206 | |
| 驴抗大鼠IgG (H+L)高度交叉吸附二抗,AlexaFluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A21208 | |
| Alexa Fluor 594标记的AffiniPure驴抗山羊IgG (H+L) | Jackson Immunoresearch | 705-585-003 | |
| 驴抗兔IgG (H+L)高度交叉吸附二抗,AlexaFluor 594 | Thermo Fisher Scientific | A21207 | |
| 驴抗小鼠IgG (H+L)高度交叉吸附二抗,AlexaFluor 594 | Thermo Fisher Scientific | A21203 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | CA-PKA小鼠基因型为Six2-Cre+/-PKAcαRfl/wt,对照为Six2-Cre+/-PKAwt/wt或Six2-Cre-/-PKAcαRfl/wt;年龄为6周龄和8-12月龄;至少3只雄性和雌性小鼠。 阅读提示:Methods - Mice |
| 组织学染色 | 胃组织固定、包埋、切片厚度(4μm);HE染色、AB染色(1% AB in 3% acetic acid pH 2.5)、PAS/AB染色(0.5% PAS)。 阅读提示:Methods - Histology and Co-IF Microscopy |
| 免疫荧光 | 抗原修复:柠檬酸盐缓冲液(10 mM citrate, 0.1% Tween-20, pH 9.0)95°C 30分钟;封闭:驴血清1小时;一抗孵育12-18小时;二抗孵育1小时。 阅读提示:Methods - Histology and Co-IF Microscopy |
| 免疫印迹 | 组织裂解:RIPA缓冲液加蛋白酶抑制剂;蛋白定量:BCA法;SDS-PAGE电泳;转膜;封闭:5%脱脂牛奶TBST;一抗孵育;HRP二抗孵育;化学发光检测。 阅读提示:Methods - Immunoblotting |
| mRNA测序 | 样本:7-8月龄小鼠胃体,对照组n=4,突变组n=4;RNA提取:TRIzol;文库制备:NEBNext Ultra RNA Library Prep Kit for Illumina;测序平台:Illumina。 阅读提示:Methods - mRNA Sequencing and Bioinformatics Analysis |
| 生物信息学分析 | 差异表达分析:DESeq2,padj < 0.05;GO富集分析:clusterProfiler;KEGG/Reactome通路分析:clusterProfiler。 阅读提示:Methods - Bioinformatics and Statistical Analysis |