评估PTH1R–β-arrestin复合物构型
确定β-arrestin1和2与PTH1R结合时是否偏好不同的结合界面和复合物构型。
在HEK-WT和ΔQ-GRK细胞中,用NanoBRET招募实验检测PTH(1-34)刺激下β-arrestin1/2野生型及dFLR突变体与PTH1R的结合;并用共聚焦显微镜观察β-arrestin-YFP、PTH1R-CFP和Rab5-mCherry的共定位。
β-arrestin1 and 2 exhibit distinct phosphorylation-dependent conformations when coupling to the same GPCR in living cells.
包含活细胞BRET构象传感器、GRK敲除细胞、磷酸化缺陷受体突变体及下游功能验证等多层级实验。
HEK293细胞(HEK-WT) GRK2/3/5/6四重敲除HEK293细胞(ΔQ-GRK) β-arrestin1/2双敲除HEK293细胞 PTH1R野生型及磷酸化缺陷突变体(PD1、PD2)
β-arrestin1/2野生型及dFLR突变体在HEK-WT和ΔQ-GRK细胞中的NanoBRET招募实验 PTH1R-WT、PD1、PD2与β-arrestin1/2及dFLR突变体的浓度依赖性招募 β-arrestin1/2-FlAsH构象变化生物传感器在PTH(1-34)刺激下的BRET信号 PTH1R-WT、PD1、PD2在HEK-WT、β-arrestin1/2双敲除和ΔQ-GRK细胞中的内化及早期转运BRET实验 PTH(1-34)刺激后ERK1/2磷酸化的Western blot分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定β-arrestin1和2与PTH1R结合时是否偏好不同的结合界面和复合物构型。
在HEK-WT和ΔQ-GRK细胞中,用NanoBRET招募实验检测PTH(1-34)刺激下β-arrestin1/2野生型及dFLR突变体与PTH1R的结合;并用共聚焦显微镜观察β-arrestin-YFP、PTH1R-CFP和Rab5-mCherry的共定位。
开发能检测β-arrestin1和2在活细胞中构象变化的NanoLuc/FlAsH生物传感器。
在β-arrestin1和2的N端和C端结构域外部环区插入FlAsH结合基序(F1-F10),C端融合NanoLuc;转染HEK-WT细胞并共表达PTH1R,用FlAsH标记后检测PTH(1-34)诱导的BRET变化。
确定同一GPCR激活是否诱导β-arrestin1和2不同的构象变化。
用所有F1-F10生物传感器检测PTH1R-WT激活后β-arrestin1和2的构象变化,计算饱和配体浓度下的Δ net BRET变化,并映射到晶体结构。
评估近端和远端C端磷酸化簇对β-arrestin1和2招募的差异影响。
在HEK-WT和ΔQ-GRK细胞中,用NanoBRET招募实验检测β-arrestin1/2野生型及dFLR突变体对PTH1R-WT、PD1、PD2的浓度依赖性招募;并在ΔQ-GRK细胞中过表达单个GRK2、3、5或6。
确定不同PTH1R磷酸化状态是否诱导β-arrestin1和2特异的构象重排。
用β-arrestin1/2-FlAsH构象传感器检测PTH1R-WT、PD1、PD2在HEK-WT中以及PTH1R-WT在ΔQ-GRK中诱导的构象变化。
确定不同PTH1R磷酸化状态是否导致β-arrestin介导的内化和ERK1/2信号差异。
用NanoLuc标记的PTH1R-WT/PD1/PD2与CAAX-YFP或FYVE-mNeonGreen进行BRET内化实验;用Western blot检测PTH(1-34)刺激后ERK1/2磷酸化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 分子克隆 | NanoLuc基因 | Promega | -- |
| Halo标签基因 | Promega | -- | |
| 细胞培养 | Dulbecco改良Eagle培养基 | Sigma-Aldrich | D6429 |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | F7524 | |
| 青霉素和链霉素 | Sigma-Aldrich | P0781 | |
| Lonza MycoAlert支原体检测试剂盒 | Lonza | LT07-318 | |
| 转染 | Effectene转染试剂 | Qiagen | -- |
| BRET实验 | Halo配体(618) | Promega | G980A |
| furimazine | Promega | N157A | |
| 多聚-D-赖氨酸包被96孔板 | Brand | 781965 | |
| BRET检测 | Synergy Neo2酶标仪 | Biotek | -- |
| Western blot | 聚乙烯亚胺 | Sigma-Aldrich | 408727 |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Roche | 04693132001, 04906845001 | |
| vinculin抗体 | BIOZOL | BZL03106 | |
| pERK(磷酸化p44/42)抗体 | Cell signaling technology | 9106 | |
| 总ERK(p44/42)抗体 | Cell signaling technology | 9107 | |
| 山羊抗兔抗体 | SeraCare | 5220-0336 | |
| 山羊抗小鼠抗体 | SeraCare | 5220-0341 | |
| FlAsH标记 | FlAsH | -- | -- |
| 1,2-乙二硫醇 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| NanoBRET招募实验 | 细胞类型(HEK-WT或ΔQ-GRK)、转染质粒比例(PTH1R-HaloTag 1.5 μg,β-arrestin-NanoLuc 0.375 μg)、Halo-ligand(618)稀释比例1:2000、furimazine稀释比例1:35000、PTH(1-34)浓度梯度 阅读提示:Methods中“Intermolecular bioluminescence resonance energy transfer (BRET)”小节及Fig. 1图注 |
| 构象变化BRET实验 | 转染质粒量(无标签PTH1R 1.2 μg,β-arrestin-FlAsH-NanoLuc 0.12 μg)、FlAsH标记浓度250 nM、标记时间60分钟、EDT浓度12.5 μM、刺激浓度3 μM PTH(1-34) 阅读提示:Methods中“Intramolecular BRET”小节及Fig. 2、Fig. 3图注 |
| 共聚焦显微镜 | 转染质粒量(PTH1R-CFP 1 μg,β-arrestin-YFP 0.5 μg,Rab5-mCherry 0.5 μg)、刺激浓度100 nM PTH(1-34)、刺激时间15分钟、显微镜型号Leica SP8及成像参数 阅读提示:Methods中“Confocal microscopy”小节及Fig. 1图注 |
| Western blot检测ERK磷酸化 | 细胞接种量600,000、转染质粒量4 μg、PEI浓度10 μg/ml、血清饥饿4小时、PTH(1-34)刺激浓度100 nM及时间20分钟、抗体稀释比例 阅读提示:Methods中“Western blot”小节及Fig. 6图注 |
| 受体磷酸化突变体设计 | PTH1R-PD1突变位点(S498A、S500A、S501A、S502A、S504A),PTH1R-PD2突变位点(S510A、T512A、S513A、T515A) 阅读提示:Fig. 4图注及Results中“β-arrestin1 and 2 exhibit different requirements of C-terminal receptor phosphorylation for high-affinity binding”小节 |