Brca2L2431P 敲入小鼠的构建与基因型分析
建立模拟人类 BRCA2 L2510P 变异的小鼠模型并验证其遗传背景。
通过基因打靶将 Brca2 外显子 15 第 2431 位密码子由 CTG 突变为 CCA,获得 Brca2LP/+ 小鼠,并与 Brca2KO/+ 或 Dss1KO/+ 小鼠杂交获得不同基因型;通过 Southern 印迹和 PCR 进行基因分型。
BRCA2-DSS1 interaction is dispensable for RAD51 recruitment at replication-induced and meiotic DNA double strand breaks.
包含基因敲入小鼠模型、MEF/AF细胞、减数分裂细胞、造血重建及CRISPR-Cas9 HR报告系统等多层级功能与机制验证
Brca2L2431P 基因敲入小鼠 小鼠胚胎成纤维细胞(MEF) 小鼠成年成纤维细胞(AF) 小鼠精母细胞减数分裂铺展
Brca2LP/LP 和 Brca2LP/KO 小鼠的出生比例及胚胎期存活情况 MEF 在 10 Gy IR 后 1、3、5、7 小时的 RAD51 foci 和 RPA32 foci 动态 MEF 在 30 nM 喜树碱或 10 nM 奥拉帕利处理 24 小时后的 RAD51 foci 及染色体畸变 精母细胞减数分裂前期 I 的 RAD51 foci 数量及 γH2AX 动态 链霉亲和素融合 Cas9 介导的生物素化供体 DNA 对 HR 效率的挽救程度
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立模拟人类 BRCA2 L2510P 变异的小鼠模型并验证其遗传背景。
通过基因打靶将 Brca2 外显子 15 第 2431 位密码子由 CTG 突变为 CCA,获得 Brca2LP/+ 小鼠,并与 Brca2KO/+ 或 Dss1KO/+ 小鼠杂交获得不同基因型;通过 Southern 印迹和 PCR 进行基因分型。
确定 BRCA2-DSS1 相互作用破坏对小鼠生理和肿瘤发生的影响。
统计不同基因型小鼠的出生比例、体重、生存曲线;对小鼠进行 8 Gy γ 辐射并监测生存;解剖并组织病理学分析肿瘤发生情况。
评估突变对造血干细胞和祖细胞在增殖压力下的功能影响。
从 16.5 dpc 胚胎肝脏分离细胞,进行集落形成实验;将胎肝细胞移植到致死剂量辐射(10 Gy)的受体小鼠,观察生存和重建能力;进行二次骨髓移植。
在细胞水平评估 BRCA2-DSS1 相互作用破坏对增殖和基因组稳定性的影响。
从 13.5 dpc 胚胎制备 MEF,绘制生长曲线,流式分析细胞周期;用 100 nM MMC 处理并分析染色体畸变。
检测突变细胞在同源重组修复 IR 诱导 DSB 时 RAD51 招募和 RPA32 清除是否缺陷。
MEF 接受 10 Gy IR,在 1、3、5、7 小时固定并进行免疫荧光染色,计数 γH2AX 阳性细胞中 RAD51 或 RPA32 foci 阳性比例。
验证 BRCA2-DSS1 相互作用破坏是否影响减数分裂 DSB 修复。
从 4–6 周龄雄性小鼠制备精母细胞铺展,免疫荧光检测 SCP3、γH2AX 和 RAD51;统计每个精母细胞的 RAD51 foci 数量及 late pachytene 阶段 γH2AX 持续情况。
模拟减数分裂中同源 DNA 靠近 DSB 的情境,检测 BRCA2-DSS1 相互作用是否仍为 RAD51 装载所必需。
MEF 或 AF 用 30 nM 喜树碱或 10 nM 奥拉帕利处理 24 小时,免疫荧光检测 RAD51 foci;用 EdU 标记和 γH2AX 共染确认 DSB 发生于 S 期;分析染色体畸变。
验证将同源供体 DNA 置于 DSB 附近能否挽救 BRCA2L2510P 细胞的 HR 缺陷。
在含 29 bp 缺失的 blasticidin 抗性基因的 Brca2KO/KO mESC 中表达 BRCA2WT 或 BRCA2L2510P,共转染 Cas9-mSA、sgRNA 和生物素化或未生物素化的供体 DNA,计数 blasticidin 抗性集落。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM 培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶 EDTA 溶液 | Gibco | 15400-054 | |
| Knockout DMEM 培养基 | -- | -- | |
| 集落形成实验 | MethoCult 培养基 | stem cell technologies | M3231 |
| 碘硝基四唑氯化物 | sigma | I10406 | |
| 小鼠干细胞因子 | PeproTech | -- | |
| 人血小板生成素 | PeproTech | -- | |
| 人 Flt3 配体 | PeproTech | -- | |
| 小鼠白细胞介素-6 | PeproTech | -- | |
| 小鼠白细胞介素-3 | PeproTech | -- | |
| 乳腺整体染色 | 胭脂红明矾 | Sigma | C1022 |
| 成纤维细胞制备 | 胶原酶 | sigma | C7657 |
| 细胞周期分析 | Fxcycle PI/RNase 溶液 | Invitrogen | F10797 |
| 染色体畸变分析 | 秋水仙胺 | KaryoMAX | 15210-016 |
| 免疫荧光 | 多聚-D-赖氨酸包被盖玻片 | neuvitro | GG-12 |
| γH2AX 抗体 | Millipore | JBW301 | |
| RAD51 抗体 | Millipore | PC130 | |
| 53BP1 抗体 | NovusBio | NB100-304 | |
| RPA32 抗体 | Cell Signaling Technology | 2208 | |
| Alexa Fluor 抗小鼠 594 | Invitrogen | A11005 | |
| 抗兔 488 | Invitrogen | A11034 | |
| DAPI | Sigma | 11190301 | |
| 抗淬灭封片剂 | Invitrogen | P36930 | |
| DNA纤维实验 | 小鼠抗 BrdU 抗体 | Becton Dickinson | 347580 |
| 大鼠抗 BrdU 抗体 | Abcam | ab6326 | |
| 抗小鼠 AlexaFluor488 | Invitrogen | A21202 | |
| 抗大鼠 AlexaFluor594 | Invitrogen | A11007 | |
| EdU标记 | 生物素叠氮化物 | -- | -- |
| 抗生物素抗体 | Bethyl | A150-109A | |
| 组织学 | 原位细胞死亡检测试剂盒 | Roche | 11684817910 |
| 减数分裂染色体分析 | 兔抗 SCP3 抗体 | Abcam | ab15093 |
| 小鼠抗 SCP3 抗体 | Santa Cruz | sc-74568 | |
| HR实验 | FUGENE 转染试剂 | Promega | E2311 |
| CMV-Cas9-MSA 质粒 | Addgene | 103882 | |
| U6-sgRNA/EF1a-mCherry 载体 | Addgene | 114199 | |
| Topo-TA 载体中的供体 blasticidin 序列 | Invitrogen | 450641 | |
| Label-IT 生物素标记试剂盒 | Mirus Bio | 3425 | |
| 杀稻瘟菌素 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| IR诱导DSB后的RAD51/RPA32 foci分析 | 辐射剂量10 Gy;检测时间点1、3、5、7小时;RAD51 foci阳性判定为≥5个foci与γH2AX共定位 阅读提示:Methods免疫荧光部分及Fig. 4图注 |
| 喜树碱或奥拉帕利诱导复制相关DSB | 喜树碱30 nM处理24小时;奥拉帕利10 nM处理24小时;EdU标记浓度1 mM 阅读提示:Methods免疫荧光和EdU标记部分及Fig. 5图注 |
| 减数分裂精母细胞RAD51 foci分析 | 小鼠年龄4–6周;抗体稀释比例SCP3 1:500、γH2AX 1:500、RAD51 1:250;RAD51 foci计数标准 阅读提示:Methods减数分裂染色体分析部分及Fig. 4e,f图注 |
| 造血祖细胞集落形成与骨髓移植 | 胎肝细胞接种数25,000个/毫升MethoCult;移植细胞数1×10^6个/0.2 ml;受体辐射剂量10 Gy 阅读提示:Methods胎肝细胞集落形成实验和胎肝细胞移植部分及Fig. 2图注 |
| 链霉亲和素-Cas9 HR实验 | 转染质粒量:Cas9-MSA 5 µg、sgRNA 5 µg、供体DNA 1 µg;blasticidin筛选浓度15 µg/ml处理5天 阅读提示:Methods链霉亲和素标记Cas9的HR实验部分及Fig. 6图注 |
| 小鼠基因型与遗传背景 | Brca2L2431P突变位点及遗传背景(C57BL/6J纯背景或混合背景);Dss1+/−小鼠来源 阅读提示:Methods小鼠生成与基因分型部分及Supplementary Table 2 |