构建铜绿假单胞菌伤口感染模型并评估ExoT对炎症反应的影响
验证ExoT是否在伤口中抑制IL-1β和IL-18产生及白细胞浸润。
用PA103、PAK野生型及ExoT、ExoS、ExoU缺失突变株感染C57BL/6小鼠全层切除伤口,24小时后检测IL-1β、IL-18、白细胞浸润和MPO阳性中性粒细胞。
CrkII/Abl phosphorylation cascade is critical for NLRC4 inflammasome activity and is blocked by Pseudomonas aeruginosa ExoT.
包含BMDMs体外模型、基因敲除小鼠伤口感染模型、临床分离株验证,并有siRNA/抑制剂/回补等功能与机制验证。
C57BL/6小鼠全层切除伤口感染模型 小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) 铜绿假单胞菌PA103和PAK菌株及其T3SS等基因突变株 铜绿假单胞菌伤口临床分离株WI-14和WI-16
伤口感染剂量:每伤口1000个细菌(10 μL生理盐水) BMDMs感染复数(M.O.I):10–20,感染时间1–2小时 Imatinib体内给药:100 mg/kg腹腔注射,于伤口和感染前48、24、2小时给药 PKCδ抑制剂Rottlerin预处理浓度5 µM,处理90分钟 Abl抑制剂Imatinib体外预处理浓度30 µM,处理90分钟
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证ExoT是否在伤口中抑制IL-1β和IL-18产生及白细胞浸润。
用PA103、PAK野生型及ExoT、ExoS、ExoU缺失突变株感染C57BL/6小鼠全层切除伤口,24小时后检测IL-1β、IL-18、白细胞浸润和MPO阳性中性粒细胞。
确定哪种caspase-1依赖性炎症小体亚型介导对铜绿假单胞菌的识别。
用野生型或ExoT缺失铜绿假单胞菌感染BMDMs,通过ELISA检测IL-1β/IL-18,Western blot检测caspase-1激活,免疫荧光检测NLRC4/ASC斑点;并使用caspase-1、caspase-11及NLRP1b、NLRP3、NLRC4、AIM2、Pyrin敲除BMDMs。
评估NLRC4炎症小体在伤口中对细菌清除的作用。
用PA103及其T3SS突变株感染C57BL/6、ASC−/−、Caspase-1−/−和NLRC4−/−小鼠伤口,24小时后通过系列稀释涂板测定细菌载量。
确定PKCδ是否介导NLRC4 Ser533磷酸化并激活NLRC4炎症小体。
在NLRC4−/− BMDMs中回补野生型NLRC4或NLRC4/S533A突变体,或用PKCδ siRNA或Rottlerin处理BMDMs,感染铜绿假单胞菌后检测NLRC4磷酸化、caspase-1激活和IL-1β/IL-18产生。
区分ExoT的GAP和ADPRT结构域在抑制NLRC4炎症小体中的作用。
用表达ExoT或ADPRT/GAP结构域突变体的铜绿假单胞菌感染BMDMs,检测PKCδ/NLRC4磷酸化、caspase-1激活、IL-1β/IL-18产生和caspase-1/ASC斑点。
确定CrkII和Abl是否参与NLRC4炎症小体激活的磷酸化级联。
用Crk siRNA或Abl siRNA敲低BMDMs,或用Abl抑制剂Imatinib处理,或使用Ablflox/floxLysM Cre+ BMDMs,感染铜绿假单胞菌后检测PKCδ/NLRC4磷酸化、caspase-1激活和IL-1β/IL-18产生;Co-IP检测CrkII、Abl、PKCδ、NLRC4相互作用。
评估Abl激酶在伤口中对NLRC4炎症小体激活和铜绿假单胞菌感染控制的作用。
C57BL/6小鼠腹腔注射Imatinib或PBS,然后伤口感染PA103 ΔUΔT株,24小时后检测Abl/PKCδ/NLRC4磷酸化、caspase-1激活、IL-1β/IL-18、白细胞浸润、MPO和细菌载量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 超纯LPS | Invivogen | -- |
| Lipofectamine RNAiMAX试剂 | Invitrogen | -- | |
| Rottlerin | -- | -- | |
| 伊马替尼 | -- | -- | |
| FAK抑制剂1,2,4,5-苯四胺四盐酸盐 | -- | -- | |
| Src抑制剂PP2 | -- | -- | |
| Lck抑制剂TC-S7003 | -- | -- | |
| Fyn抑制剂AZD0530 | -- | -- | |
| Lyn抑制剂Lyn肽抑制剂 | -- | -- | |
| Z-VAD | -- | -- | |
| ELISA | IL-1β ELISA试剂盒 | Invitrogen | -- |
| IL-18 ELISA试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| Western blot | 抗caspase-1 (P20)抗体 | AdipoGen | AG20B0042C100 |
| 抗ASC多克隆抗体(AL177) | AdipoGen | AG25B0006C100 | |
| Crk小鼠单克隆抗体克隆22 | BD | 610035 | |
| NLRC4抗体 | Abcam | ab201792 | |
| NLRC4抗体 | Millipore Sigma | 06-112-5MI | |
| 磷酸化NLRC4 (Ser533)多克隆抗体 | ECM Biosciences | NP5411 | |
| 磷酸化NLRC4 (Ser533)小鼠抗人/鼠克隆4B7B7 | Invitrogen | PIMA531846 | |
| PKCδ多克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 2058 | |
| 磷酸化PKCδ (Tyr311)抗体 | Cell Signaling Technology | 2055 | |
| 小鼠IL-1β抗体 | R&D systems | AF-401-NA | |
| 小鼠(MOPC-21) mAb IgG1同型对照 | Cell Signaling Technology | 4097 | |
| NLRC4多克隆抗体 | Invitrogen | PA5-72908 | |
| 抗c-Abl (24-11)抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-23 | |
| 驴抗山羊IgG二抗(HRP) | Novus Biologicals | NBP1-74815 | |
| β-Actin (13E5)兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 4970 | |
| 抗髓过氧化物酶抗体 | Abcam | ab9535 | |
| 抗ABL1 (磷酸化Y245)抗体 | Abcam | ab193223 | |
| HRP标记抗兔IgG抗体 | Cell Signaling Technology | 7074 S | |
| HRP标记抗小鼠IgG抗体 | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| GAPDH兔多克隆抗体 | Proteintech | 1094-I-AP | |
| 免疫共沉淀 | 直接和经典免疫沉淀试剂盒 | Pierce | -- |
| 抗Flag抗体 | Millipore Sigma | F1804 | |
| 抗GFP抗体 | Abcam | AB5450 | |
| 免疫荧光 | 山羊抗小鼠IgG (H+L)二抗Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A-11001 |
| 山羊抗兔IgG (H+L)二抗Texas Red | Invitrogen | T-6391 | |
| DAPI核染料 | -- | -- | |
| 免疫组化 | 抗髓过氧化物酶抗体 | Abcam | ab9535 |
| 动物实验 | 伊马替尼 | -- | -- |
| 组织消化 | 胶原酶D | -- | -- |
| 细胞培养 | NLRC4/S533A载体 | Cell Biolabs | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠伤口感染模型 | 细菌剂量:每伤口1000个细菌;小鼠品系和年龄:约7周龄C57BL/6;检测时间:感染后24小时;每组小鼠数:N=5–8 阅读提示:Methods中Wounding and wound infection小节及Fig. 1图注 |
| BMDMs感染实验 | M.O.I:10–20;感染时间:1–2小时;LPS预处理:2–6小时;BMDMs来源小鼠品系 阅读提示:Methods中Bone marrow-derived macrophages (BMDMs)小节及Fig. 2–6图注 |
| 抑制剂处理BMDMs | PKCδ抑制剂Rottlerin浓度5 µM,预处理90分钟;Abl抑制剂Imatinib浓度30 µM,预处理90分钟;其他酪氨酸激酶抑制剂浓度及处理时间 阅读提示:Methods中Bone marrow-derived macrophages (BMDMs)小节及Fig. 3、Fig. 6图注 |
| siRNA敲低实验 | Crk siRNA转染48小时;PKCδ siRNA转染48小时;Abl siRNA转染24小时;siRNA终浓度100 nM;感染M.O.I 20,2小时 阅读提示:Methods中Protein depletion by siRNA transfection小节及Fig. 3、Fig. 5、Fig. 6图注 |
| Imatinib体内给药实验 | Imatinib剂量100 mg/kg,腹腔注射;给药时间:伤口和感染前48、24、2小时;细菌剂量:每伤口1000个细菌;检测时间:感染后24小时;每组小鼠数:N=8(部分N=5) 阅读提示:Methods中Wounding and wound infection小节及Fig. 7图注 |
| NLRC4回补实验 | NLRC4−/− BMDMs回补野生型NLRC4或NLRC4/S533A;感染M.O.I 20,2小时;检测指标:caspase-1激活、IL-1β/IL-18 阅读提示:Methods中Nlrc4−/− cells’ reconstitution小节及Fig. 3a–c图注 |
| 免疫荧光检测炎症小体斑点 | BMDMs感染M.O.I 10–20,1小时;固定:4% PFA 20分钟;抗体稀释度;每个重复≥7个随机视野 阅读提示:Methods中Fluorescence microscopy小节及Fig. 2i–j、Fig. 4e–f图注 |