DHHC9介导的GLUT1 S-棕榈酰化促进胶质母细胞瘤糖酵解和肿瘤发生

DHHC9-mediated GLUT1 S-palmitoylation promotes glioblastoma glycolysis and tumorigenesis.

作者信息Zhenxing Zhang, Xin Li, Fan Yang, Chao Chen, Ping Liu, Yi Ren, Pengkai Sun, Zixiong Wang, Yongping You, Yi-Xin Zeng, Xinjian Li
PMID34620861
发布时间2021-10-07
DOI10.1038/s41467-021-26180-4

实验完整度

高

含体外细胞、纯化蛋白体外实验、动物移植瘤模型及68例患者标本,并有功能与机制验证

主要模型

U87人胶质母细胞瘤细胞系 T98G人胶质母细胞瘤细胞系 正常人类星形胶质细胞(NHAs) 原位颅内注射U87细胞的裸鼠移植瘤模型 GBM患者肿瘤标本(68例)

重点核对

2-BP处理浓度50 μM、8 h,用于U87和T98G细胞 alkynyl palmitic acid代谢标记50 μM、4 h,结合click反应和链霉亲和素pull-down检测GLUT1棕榈酰化 DHHC9敲除后以WT rDHHC9或催化失活rDHHC9 C169S回补,检测GLUT1棕榈酰化与质膜定位 GLUT1敲除后以WT rGLUT1或rGLUT1 C207S回补,检测棕榈酰化、质膜定位及糖酵解 颅内注射5×10^5 U87细胞至4周龄雌性裸鼠,每组5只用于生物发光成像,每组10只用于生存分析

摘要

葡萄糖转运体GLUT1是一种跨膜蛋白,通过易化扩散负责许多组织细胞对葡萄糖的摄取。质膜(PM)定位对GLUT1摄取葡萄糖至关重要。然而,GLUT1质膜定位的机制仍不清楚。我们发现GLUT1在Cys207位点发生棕榈酰化,且S-棕榈酰化是维持GLUT1质膜定位所必需的。此外,我们鉴定DHHC9是负责这一关键翻译后修饰的棕榈酰转移酶。敲除DHHC9或将GLUT1 Cys207突变为丝氨酸,可消除GLUT1的棕榈酰化和质膜分布,并损害糖酵解、细胞增殖和胶质母细胞瘤(GBM)肿瘤发生。此外,DHHC9表达与GBM标本中GLUT1质膜定位正相关,并提示GBM患者预后不良。这些发现强调,DHHC9介导的GLUT1 S-棕榈酰化对GBM肿瘤发生过程中的葡萄糖供应至关重要。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
GLUT1质膜定位的机制是什么,以及该机制是否影响胶质母细胞瘤的糖酵解和肿瘤发生。
核心机制
DHHC9作为棕榈酰转移酶催化GLUT1 Cys207位S-棕榈酰化,维持GLUT1质膜定位,促进葡萄糖摄取和糖酵解,从而促进GBM细胞增殖、集落形成和肿瘤发生。
主要证据
在U87和T98G细胞中,2-BP处理或GLUT1 C207S突变降低GLUT1棕榈酰化并使其从质膜转位至胞质;DHHC9敲除或催化失活突变体回补实验证明DHHC9介导GLUT1棕榈酰化;体外纯化蛋白实验证明DHHC9/GCP16直接棕榈酰化GLUT1 Cys207;GLUT1或DHHC9敲除抑制糖酵解、增殖和集落形成,WT回补可恢复而C207S或C169S突变体不能;颅内移植瘤实验显示敲除DHHC9或GLUT1抑制肿瘤生长并延长生存,WT回补可逆转;68例GBM标本中DHHC9表达与GLUT1质膜定位正相关并与总生存期相关。
研究意义
研究揭示S-棕榈酰化调控GLUT1质膜定位,扩展了翻译后修饰调控蛋白生物学功能的层面,并提示DHHC9可能作为GBM预后指标及癌细胞特异性糖酵解抑制的潜在靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

确认GLUT1发生S-棕榈酰化并影响质膜定位

验证GLUT1是否被棕榈酰化以及该修饰是否维持其质膜定位。

用2-BP处理U87和T98G细胞,通过免疫荧光、细胞分级和alkynyl palmitic acid代谢标记结合click反应及链霉亲和素pull-down检测GLUT1棕榈酰化和质膜定位;用APE实验半定量棕榈酰化水平。

2

鉴定GLUT1棕榈酰化位点Cys207

确定GLUT1棕榈酰化的具体半胱氨酸位点及其对质膜定位的必要性。

将GLUT1各半胱氨酸突变为丝氨酸,用alkynyl palmitic acid掺入实验筛选位点;在GLUT1敲除细胞中回补WT rGLUT1或rGLUT1 C207S,检测棕榈酰化和质膜定位。

3

筛选并验证DHHC9为GLUT1棕榈酰转移酶

鉴定负责GLUT1棕榈酰化的PAT及其催化活性依赖性。

构建靶向PAT的gRNA进行CRISPR筛选,用shRNA敲低DHHC9,Co-IP和GST pull-down检测DHHC9与GLUT1相互作用,split-GFP和免疫荧光检测共定位;在DHHC9敲除细胞中回补WT rDHHC9或rDHHC9 C169S,检测GLUT1棕榈酰化和质膜定位。

4

体外直接棕榈酰化实验

验证DHHC9/GCP16是否直接催化GLUT1 Cys207棕榈酰化。

将纯化的WT DHHC9/GCP16或DHHC9 C169S/GCP16与纯化的WT GLUT1或GLUT1 C207S在palmitoyl alkyne-CoA或palmitoyl-CoA存在下孵育,通过click反应和APE检测棕榈酰化。

5

评估DHHC9-GLUT1棕榈酰化对糖酵解和细胞功能的影响

验证该修饰对葡萄糖摄取、糖酵解、增殖和集落形成的作用。

在DHHC9敲除或GLUT1敲除的U87和T98G细胞中回补WT或突变体,检测2-DG摄取、糖酵解速率、葡萄糖消耗、乳酸产生、细胞增殖和集落形成。

6

体内验证肿瘤发生

验证DHHC9介导的GLUT1棕榈酰化对GBM肿瘤生长和生存的影响。

将表达荧光素酶的U87细胞(DHHC9或GLUT1敲除并回补WT或突变体)颅内注射至裸鼠,生物发光成像监测肿瘤生长,记录生存时间,IHC检测Ki67和cleaved PARP1,检测肿瘤组织2-DG摄取和GLUT1棕榈酰化。

7

临床样本相关性分析

评估DHHC9表达与GLUT1质膜定位及GBM患者预后的关系。

对68例GBM患者标本进行DHHC9和GLUT1免疫组化染色,评分并分析相关性;结合临床因素进行生存分析和多因素分析。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
GLUT1兔单克隆抗体Abcamab115730
GAPDH小鼠单克隆抗体Abcamab8245
ATP1A1兔单克隆抗体Abcamab76020
微管蛋白兔单克隆抗体Abcamab176560
Ki67兔单克隆抗体Abcamab92742
GCP16小鼠单克隆抗体Santa Cruz Biotechnologysc-101278
GLUT3小鼠单克隆抗体Santa Cruz Biotechnologysc-74399
正十二烷基-β-D-麦芽糖苷Santa Cruz Biotechnologysc-281071
正壬基-β-D-吡喃葡萄糖苷Santa Cruz Biotechnologysc-281084
Flag标签小鼠单克隆抗体SigmaF3165
GLUT1 pS226兔多克隆抗体SigmaABN991
镍亲和凝胶SigmaP6611
抗Flag M2亲和凝胶SigmaA2220
2-脱氧-D-葡萄糖SigmaD8375
棕榈酸SigmaP0500
二硫苏糖醇SigmaD9779
亮抑酶肽SigmaL2884
2-溴十六烷酸Sigma21604
羟胺Sigma159417
Palmostatin BSigma178501
N-乙基马来酰亚胺Sigma04260
mPEG-马来酰亚胺5 kDaSigma63187
三(2-羧乙基)膦Sigma646547
结晶紫SigmaC0775
GST小鼠单克隆抗体Cell Signaling Technology2624
HA标签兔单克隆抗体Cell Signaling Technology3724
钙联蛋白兔单克隆抗体Cell Signaling Technology2679
cleaved PARP兔单克隆抗体Cell Signaling Technology5625
AKT pT308兔单克隆抗体Cell Signaling Technology13038
AKT兔单克隆抗体Cell Signaling Technology4691
DHHC9兔多克隆抗体Thermo Fisher ScientificPA5-56868
10 kDa离心柱Thermo Fisher Scientific88513
链霉亲和素琼脂糖珠Thermo Fisher ScientificSA10004
无EDTA蛋白酶抑制剂混合物Thermo Fisher ScientificA32965
Alexa Fluor 594标记的霍乱毒素B亚基Thermo Fisher ScientificC34777
辣根过氧化物酶标记山羊抗小鼠二抗Thermo Fisher ScientificG-21040
辣根过氧化物酶标记山羊抗兔二抗Thermo Fisher ScientificG-21234
Alexa Fluor 488标记山羊抗兔二抗Thermo Fisher ScientificA-11008
Alexa Fluor 594标记山羊抗兔二抗Thermo Fisher ScientificA-11012
Lipofectamine 3000转染试剂Invitrogen--
棕榈酰炔基辅酶ACayman15968
炔基花生四烯酸Cayman10538
炔基棕榈酸Click Chemistry Tools1165
炔基肉豆蔻酸Click Chemistry Tools1164
炔基硬脂酸Click Chemistry Tools1166
生物素吡啶甲基叠氮化物Click Chemistry Tools1167
D-[5-3H]-葡萄糖PerkinElmer--
葡萄糖摄取试剂盒PromegaJ1342
葡萄糖检测试剂盒SigmaGAGO20
乳酸检测试剂盒PromegaJ5022
Dulbecco改良Eagle培养基----
牛小牛血清HyClone--
正常人星形胶质细胞LonzaCC-2565
质膜/胞内质膜蛋白提取试剂盒Abcamab65400
pMD2.G包装质粒Addgene12259
psPAX2包装质粒Addgene12260
VECTASTAIN ABC试剂盒Vector Laboratories--
D-荧光素Cayman Chemical--
4',6-二脒基-2-苯基吲哚Thermo Fisher Scientific--
ProLong Gold抗淬灭封片剂Thermo Fisher Scientific--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
GLUT1棕榈酰化检测
alkynyl palmitic acid浓度50 μM、标记时间4 h、HAM处理与否;细胞裂解液中需含palmostatin B 1 μM和NEM 50 mM
阅读提示:Methods“Metabolic labeling, click reaction, and streptavidin pulldown”及Fig. 1c、1d图注
2-BP处理与质膜定位
2-BP浓度50 μM、处理时间8 h;CTB-Alexa Fluor 594浓度1 μg/ml、孵育5 min、37 °C
阅读提示:Fig. 1a、1b图注及Results第一部分
DHHC9-GLUT1体外棕榈酰化
DHHC9/GCP16各100 ng、GLUT1 2 μg、palmitoyl alkyne-CoA 10 μM、25 °C孵育1 h;DHHC9催化失活位点为C169S
阅读提示:Methods“In vitro protein acyltransferase (PAT) assay”及Fig. 3a、3b图注
糖酵解功能检测
2-DG 1 mM处理10 min;D-[5-3H]葡萄糖10 μCi、5.5 mM葡萄糖孵育1 h;无血清DMEM处理6 h(乳酸)或16 h(葡萄糖消耗);数据为三次独立实验均值±SD
阅读提示:Fig. 4a–d图注及Methods“Glycolytic rate assays”“Glucose uptake assay”“Measurements of glucose consumption and lactate production”
颅内移植瘤实验
细胞数5×10^5、注射体积5 μl、4周龄雌性athymic nude小鼠;成像每组5只、生存分析每组10只;注射后28天取材;2-DG 500 mg/kg腹腔注射处死前6 h
阅读提示:Methods“Xenograft study”、Fig. 5a、5b图注
临床标本相关性分析
68例GBM患者标本;DHHC9和GLUT1质膜染色评分0–8;高低分组界值0–4与5–8;多因素分析校正年龄、性别和全切除状态
阅读提示:Methods“Immunohistochemical staining”、Fig. 6a–c图注及Supplementary Table 1