NSs在细胞中形成核纤维
验证NSs是否在多种细胞系中形成核纤维
用wt RVFV感染十种细胞系,免疫荧光和共聚焦显微镜观察NSs纤维。
NSs amyloid formation is associated with the virulence of Rift Valley fever virus in mice.
包含细胞系、小鼠模型及多种显微和生化验证,并有功能验证。
Vero细胞 HeLa细胞 A549细胞 BALB/c小鼠
细胞系:Vero、HeLa、A549等,MOI~5感染16小时 小鼠:BALB/cByJ,9周龄雄性,腹腔或颅内接种100 pfu NSs突变体:C39S/C40S、C149S、C178S、C194S Thioflavin-S染色和SDD-AGE分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证NSs是否在多种细胞系中形成核纤维
用wt RVFV感染十种细胞系,免疫荧光和共聚焦显微镜观察NSs纤维。
确定NSs纤维的淀粉样性质
STED、TEM和CLEM观察NSs纤维的形态和尺寸。
验证NSs聚集体是否具有淀粉样特性
ThS染色和去垢剂溶解度实验。
确定哪些半胱氨酸残基参与纤维形成
构建半胱氨酸点突变病毒,感染细胞并观察聚集体形态。
分析NSs聚集的动态
固定细胞和时间序列显微镜观察聚集体数量和大小变化。
确定胞质聚集体的超微结构
STED和TEM观察胞质聚集体。
验证NSs是否在没有其他病毒蛋白时形成纤维
转染NSs表达质粒,观察聚集体。
确定NSs结构对IFN抑制的影响
用突变体病毒感染细胞,检测IFN-β mRNA和PKR蛋白。
验证NSs在体内形成淀粉样纤维
小鼠腹腔接种RVFV,免疫组化和ThS染色脑组织。
评估NSs对神经毒力的贡献
小鼠颅内接种RVFV或ΔNSs,监测生存和病毒复制。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Thermo Fisher Scientific产品 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| ThS染色 | 硫黄素S | Sigma Aldrich | -- |
| 免疫印迹 | 抗PKR兔多克隆抗体 | Proteintech | 18244-1-AP |
| 抗α-微管蛋白单克隆抗体B512 | Sigma Aldrich | -- | |
| 抗β-肌动蛋白单克隆抗体AC74 | Sigma Aldrich | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| qRT-PCR | SsoAdvanced SYBR green | BioRad | -- |
| iSCRIPT逆转录酶 | BioRad | -- | |
| RNA提取 | NucleoSpin RNA提取试剂盒 | Macherey-Nagel | -- |
| 核分离 | Nuclei EZ Prep试剂盒 | Sigma Aldrich | -- |
| 超声破碎 | Bioruptor Plus超声破碎仪 | Diagenode | -- |
| 免疫印迹 | Nu-PAGE Novex 10% Bis-Tris凝胶 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| iBlot转膜栈 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| SuperSignal | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ECF | GE Healthcare Life Science | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞感染 | MOI和感染时间:MOI ~5,感染后16小时;不同实验有变化 阅读提示:Methods: Cell infection和Figure legends |
| 小鼠感染 | 接种剂量和途径:腹腔100 pfu或颅内10-100 pfu;小鼠年龄和性别:9周龄雄性BALB/cByJ 阅读提示:Methods: Mouse infection |
| ThS染色 | ThS浓度:0.05%用于细胞,1%用于组织;透化条件 阅读提示:Methods: Confocal spinning-disc microscopy和Imaging of mouse brain tissues |
| SDD-AGE | SDS浓度:2%,温度:22-95°C,DTT浓度:10 mM 阅读提示:Methods: Protein analysis |